Микробиология


ISSN (print)
: 0026-3656 

Журнал «Микробиология» публикует экспериментальные и теоретические статьи по всем фундаментальным проблемам микробиологии.

Издание размещает краткие сообщения и обзоры современных достижений в различных областях микробиологии, рецензии на новые книги, хронику научной жизни микробиологического сообщества.

Свидетельство о регистрации СМИ: № 0110237 от 09.02.1993

Учредители

  • Российская академия наук
  • Институт микробиологии РАН

Главный редактор

  • Пименов Николай Викторович, доктор биологических наук

Периодичность / доступ

6 выпусков в год / подписка

Входит в 

Белый список (2 уровень), перечень ВАК, РИНЦ

Присутствие в других базах данных: переводная версия в WOS, RSCI, переводная версия в Scopus

  • Объем номера (уч.-изд. л.): 15,5
  • Год основания: 1932
  • Рубрика: Биологические науки
  • Импакт-фактор (2020): 1,156
  • Подписной индекс: 70540
  • Периодичность: 6


Impact Factor 1,027


Текущий выпуск

Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 94, № 5 (2025)

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРЫ

Ксеротолерантные микроорганизмы-продуценты экзополисахаридов и потенциал их использования в агротехнологиях
Кондрашева К.В., Якимов М.М., Коно В.Л., Гаврилов С.Н., Калёнов С.В., Тожиева М.Б., Давранов К.Д.
Аннотация
Деградация сельскохозяйственных земель составляет существенную экологическую проблему в масштабах Земли, усугубляющуюся глобальными климатическими изменениями и масштабным применением минеральных удобрений. Одним из перспективных решений этой проблемы является разработка и активное введение в практику “микробных удобрений”, стимулирующих рост сельскохозяйственных растений и обеспечивающих функции удерживания влаги и питательных веществ в почве. Важнейшим свойством таких микроорганизмов является способность к продукции экзополисахаридов (ЭПС) с высокой гигроскопичностью, сорбционными и барьерными свойствами. В настоящее время микробные ЭПС нашли широкое применение в самых различных областях человеческой деятельности, однако их использование в агротехнологиях все еще ограничено. Среди наиболее перспективных продуцентов ЭПС сельскохозяйственного назначения можно выделить обширную группу ксеротолерантных прокариот, способных активно развиваться при низкой активности воды в среде и использовать продукцию ЭПС в качестве основного механизма защиты от высушивания и солевого стресса. В обзоре мы обобщаем имеющиеся сведения о продуцентах ЭПС сельскохозяйственного назначения и оцениваем потенциал использования аридных экосистем для поиска и выделения новых ксеротолерантных продуцентов ЭПС, перспективных для разработки агротехнологий для устойчивого сельского хозяйства в регионах с аридным климатом. Особое внимание мы уделяем малоизученным ксеротолерантным микробным сообществам аридных экосистем Средней Азии.
Микробиология. 2025;94(5):363-374
pages 363-374 views
Эндофит Bacillus subtilis 26д – четыре десятилетия исследований и перспективы применения
Хайруллин Р.М., Кутлубаев А.А.
Аннотация
В статье впервые приведены данные об истории открытия и изучения эндофитной бактерии Bacillus subtilis 26Д (ВНИИСХМ 128) – основы биофунгицида Фитоспорин-М, используемого в растениеводстве России более 30 лет. Приведен краткий анализ термина “эндофит” по отношению к бактериям, статистика научных отечественных публикаций об эндофитных бактериях. Рассмотрены культурально-морфологические и биохимические свойства штамма, биологическая активность по отношению к фитопатогенным грибам и бактериям, хозяйственно полезным микроорганизмам, растениям и животным. Описаны свойства модифицированных штаммов эндофита и перспективы его использования.
Микробиология. 2025;94(5):375-388
pages 375-388 views

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

α-галактозидазы и α-N-ацетилгалактозаминидазы планктомицетов: происхождение и генетическое разнообразие
Наумов Д.Г.
Аннотация
Бактерии филума Planctomycetota населяют широкий спектр природных и антропогенных местообитаний. Их очень крупные геномы обладают высоким гликолитическим потенциалом, обусловленным широким ассортиментом кодируемых гликозил-гидролаз. Настоящая работа посвящена исследованию генетического разнообразия потенциальных α-галактозидаз и α-N-ацетилгалактозаминидаз у планктомицетов. Анализ геномных и метагеномных последовательностей выявил наличие у планктомицетов генов, кодирующих белки всех ранее известных семейств гликозил-гидролаз, содержащих экспериментально охарактеризованные ферменты двух указанных типов. Филогенетический анализ продемонстрировал множественные горизонтальные переносы этих генов из бактерий различных филумов. Подробно рассмотрены белки, закодированные в геномах типовых штаммов Humisphaera borealis и Paludisphaera mucosa.
Микробиология. 2025;94(5):389-397
pages 389-397 views
Возможная роль микробных сообществ донных отложений озера Байкал в формировании аутигенных сидеритов, аномально обогащенных изотопом 13C
Букин С.В., Ломакина А.В., Погодаева Т.В., Хлыстов О.М., Земская Т.И., Крылов А.А.
Аннотация

Осаждение аутигенных карбонатов в процессе диагенеза донных отложений зачастую является побочным результатом жизнедеятельности микроорганизмов, а изотопные характеристики таких карбонатных минералов определяются эффектами фракционирования изотопов углерода в ходе ферментативных реакций. Методом метабаркодинга гена 16S рРНК оценен состав микробных сообществ, а также проанализирован химический состав поровых вод донных отложений трех грязевых вулканов озера Байкал, содержащих сидериты (FeCO3), аномально обогащенные изотопом 13С (δ13С +7.24…+35.02‰ VPDB), механизмы образования которых в настоящее время неизвестны. Полученные данные согласуются с гипотезой о том, что осаждение сидеритов может быть ассоциировано с локальными зонами активной биогенной деструкции органического вещества, но предположено, что в данном процессе роль микробных сообществ может сводиться к восстановлению до сидерита кристаллических форм оксигидроксидов Fe(III) или пополнению пула Fe(II), а не растворенного неорганического углерода (DIC). При этом фактором, обусловливающим осаждения аутигенных сидеритов, обогащенных изотопом 13С, может являться поступление с потоком глубинного флюида DIC или газообразного CO2, изотопные характеристики которых в значительной степени будут определять значения δ13С карбонатов в осадках грязевых вулканов озера Байкал.

Микробиология. 2025;94(5):398-416
pages 398-416 views
Состав микробных сообществ донных отложений Печорского моря в зоне разрабатываемых нефтяных месторождений
Пыркин В.О., Гавирова Л.А., Строева А.Р., Дгебуадзе П.Ю., Шестаков А.И., Клюкина А.А., Меркель А.Ю., Бонч-Осмоловская Е.А.
Аннотация
Целью данного исследования было определение таксономического состава микробных сообществ в пробах из донных отложений Печорского моря и оценка потенциальной способности деградировать углеводороды (УВ) и нефть. В качестве критерия такой способности было выбрано увеличение относительной численности представителей отдельных групп микроорганизмов в накопительных культурах, полученных с различными углеводородами как единственным источником углерода и энергии. С помощью высокопроизводительного секвенирования V4 фрагмента гена 16S рРНК был определен состав микроорганизмов в образцах донных отложений и в накопительных культурах, полученных в присутствии сырой нефти, н-нонана, н-октадекана, пристана, циклогексана, бифенила, а также в контрольных культурах, полученных в средах, не содержащих УВ. В накопительных культурах с УВ были обнаружены бактерии родов Microbacterium, Janibacter, Nocardioides, Rhodococcus, Demequina, Arthrobacter, Novosphingobium, Erythrobacter, Altererythrobacter, Planococcus, а также неидентифицированные представители семейств Sphingomonadaceae и Flavobacteriaceae, не обнаруживаемые при NGS-секвенировании фрагментов генов 16S рРНК в соответствующих природных образцах и контрольных накопительных культурах.
Микробиология. 2025;94(5):417-425
pages 417-425 views
Метаболический потенциал грибов Pseudogymnoascus spp.
Антипова Т.В., Желифонова В.П., Дубовик В.Р., Лукина Е.Г., Ху Ц., Кочкина Г.А., Берестецкий А.О.
Аннотация
Проанализированы биосинтетические кластеры генов (БКГ) биосинтеза вторичных метаболитов у штаммов Pseudogymnoascus spp. с помощью программы antiSMASH (грибная версия). Впервые показано, что геномы грибов Pseudogymnoascus содержат несколько десятков БКГ биосинтеза вторичных метаболитов. Из них примерно 30% составляли кластеры генов биосинтеза известных метаболитов с подобием 9‒100%. При культивировании 8 штаммов Pseudogymnoascus spp. в минеральной среде обнаружено 13 метаболитов. У пяти штаммов в спектре наблюдалось по 3‒4 соединения, а у трех штаммов происходил биосинтез сидерофора десферритриацетилфузигена. Показано, что вторичные метаболиты, синтезируемые штаммами Pseudogymnoascus spp., обладают потенциальной биологической активностью. Наибольшей антибактериальной, антифунгальной, фитотоксической и энтомотоксичной активностью обладали вторичные метаболиты штаммов ВКМ F-4513 и F-4517, выделенных из многолетнемерзлых отложений Арктики.
Микробиология. 2025;94(5):426-436
pages 426-436 views
Изменение чувствительности к ультрафиолету и радиации микроорганизмов рода Bacillus в условиях гипомагнитного поля
Фиалкина С.В., Осипова П.Д., Лебедев В.М., Спасский А.В., Юров Д.С., Поддубко С.В., Орлов О.И.
Аннотация
В результате проведенных работ получены данные о модулирующем эффекте гипомагнитного поля (ГМП) при воздействии ультрафиолета или радиации на бактериальные клетки. После воздействия физических стресс-факторов бактериальные споры восстанавливали в гипомагнитной камере (ГМК), позволяющей ослабить магнитное поле Земли почти в 1000 раз. Полученные результаты демонстрируют повышенную выживаемость, формирование более крупных колоний на питательной среде при восстановлении клеток в условиях ГМП после воздействия ультрафиолета или радиации. Следовательно, происходит более высокая скорость роста и размножения бактериальной популяции в гипомагнитных условиях. На молекулярном уровне наблюдался повышенный уровень экспрессии генов, участвующих в репарации ДНК и ответе на окислительный стресс, что может обеспечивать более высокую скорость восстановления повреждений, накопленных в бактериальных клетках после воздействия импульсного ультрафиолета или радиации. Выявлено, что в условиях ГМП активированы гены системы репарации по типу соединения негомологичных концов (NHEJ) и эксцизионной репарации (BER), антиоксидантного фермента каталазы, но снижена экспрессия генов, участвующих в SOS-ответе. Несмотря на то, что само ГМП не оказывало очевидного влияния на жизнеспособность бактериальных клеток, оно явно повышало их способность восстанавливаться после воздействия ультрафиолета или радиации. Представленные результаты указывают на роль гипомагнитного поля как модулятора стрессовых ответов у микроорганизмов, что важно для понимания возможности их выживания и адаптации в экстремальных условиях космоса.
Микробиология. 2025;94(5):437-446
pages 437-446 views
Внутривидовой полиморфизм дрожжей Saccharomyces paradoxus: географические популяции
Боровкова А.Н., Туаева А.Ю., Наумова Е.С.
Аннотация

На территории Сибирского ботанического сада Томского государственного университета из коры дубов Quercus robur и почвы под ними были изолированы 28 штаммов дрожжей Saccharomyces. На основании секвенирования домена D1/D2 и ITS1-участка рДНК три штамма были отнесены к виду S. cerevisiae, а остальные к виду S. paradoxus. С помощью мультигенного филогенетического анализа ядерных генов (NEJ1, EST2, HDF1, HDF2) изучено генетическое родство западносибирских штаммов и дрожжей S. paradoxus из европейской, дальневосточной, североамериканской и гавайской популяций. Согласно полученным результатам, западносибирские штаммы относятся к европейской популяции. По-видимому, граница между европейской и дальневосточной популяциями дрожжей S. paradoxus проходит восточнее Томской области.

Микробиология. 2025;94(5):447-460
pages 447-460 views
Влияние азотного и фосфорного стресса на рост и состав жирных кислот микроводоросли VISCHERIA CALAMINARIS (EUSTIGMATOPHYCEAE)
Кривова З.В., Мальцева С.Ю., Миннуллин Д.Д., Куликовский М.С., Мальцев Е.И.
Аннотация

Исследовано влияние азотного и фосфорного стресса на рост и профиль жирных кислот эустигматофитовой водоросли Vischeria calaminaris (Trzcinska et Pawlik-Skowronska) Kryvenda, Rybalka, Wolf et Friedl. Выделенный из почвы насаждения белой акации штамм MZ–E6 – первая находка Vischeria calaminaris на территории Европейской России. Таксономическая идентификация осуществлялась на основании морфологического анализа и филогенетической реконструкции с использованием нуклеотидных последовательностей гена 18S рРНК. В эксперименте использовали ступенчатое изменение концентраций азота (от 0 до 0.6 г/л) и фосфора (от 0 до 0.3 г/л) в среде BBM. Культивирование штамма MZ–E6 в течение 20 дней продемонстрировало накопление сухой биомассы в диапазоне 3.36–4.48 г/л с максимальным показателем при умеренном ограничении содержания азота (0.15 г/л). Во всех вариантах эксперимента доминантными жирными кислотами были пальмитиновая, пальмитолеиновая, олеиновая и эйкозапентаеновая – на их долю приходилось 84.67–87.02% от суммы жирных кислот. Установлено, что фосфорный стресс приводит к более существенным изменениям состава жирных кислот по сравнению с азотным. Показано, что эффективной стратегией является культивирование штамма Vischeria calaminaris MZ–E6 на среде BBM с концентрацией азота 0.2 г/л и фосфора 0.11 г/л: это позволяет получить достаточные количества биомассы (4.19 г/л) с высоким содержанием насыщенных и полиненасыщенных жирных кислот (более 66% в сумме).

Микробиология. 2025;94(5):461-475
pages 461-475 views
Рост-стимулирующий потенциал бактерий HERBASPIRILLUM RHIZOSPHAERAE в отношении проростков пшеницы (TRITICUM AESTIVUM L.)
Величко Н.С., Федоненко Ю.П.
Аннотация

Развитие устойчивого земледелия требует снижения химической нагрузки на агроэкосистемы. Одним из экологических подходов является использование биопрепаратов на основе ризобактерий, стимулирующих рост растений. Инокуляция бактериями Herbaspirillum rhizosphaerae UMS-37T ранних проростков пшеницы (Triticum aestivum L.) приводила к увеличению длины корней и побегов, а также оказывала влияние на содержание пролина, малонового диальдегида, оксида азота и активность каталазы в проростках, что свидетельствует об индукции механизмов системной устойчивости растений. Штамм H. rhizosphaerae UMS-37T демонстрировал выраженную фунгицидную активность в отношении полевых штаммов мицелиальных грибов рода Fusarium. Результаты данной работы могут быть использованы в разработке экологически безопасных и конкурентоспособных в адаптивном земледелии биопрепаратов, способных активизировать защитные системы растений и контролировать фузариоз важнейших сельскохозяйственных культур.

Микробиология. 2025;94(5):476-485
pages 476-485 views

КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ

Влияние эстрадиола на чувствительность Staphylococcus aureus 209P к тетрациклину in vitro
Логинова Н.А., Меткина А.А., Ганнесен А.В., Мартьянов С.В.
Аннотация

В настоящей работе впервые показан совместный ингибиторный эффект гормона эстрадиола и антибиотика тетрациклина в отношении типового штамма Staphylococcus aureus 209 P. Совместное добавление гормона и антибиотика приводит к значительному увеличению времени удвоения культуры по сравнению с образцами с тетрациклином (0.05 мкг/мл) без добавления гормона. Совместный эффект соединений наиболее выражен против планктонной культуры на начальных этапах роста, но в то же время сохраняется и в отношении биопленок. Почти во всех случаях эстрадиол оказывает наибольший эффект в концентрациях, превышающих физиологическую (2.2 × 10−10 М) на один и два порядка.

Микробиология. 2025;94(5):486-492
pages 486-492 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».