Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 94, № 4 (2025)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

ОБЗОРЫ

Биопленки как предполагаемая базовая форма существования микроорганизмов: современные представления

Плакунов В.К., Журина М.В., Мартьянов С.В., Ганнесен А.В.

Аннотация

В обзоре анализируются современные сведения о процессах формирования микробных биопленок, как закрепленных на биотических и абиотических поверхностях, так и возникающих в результате автоагрегации и коагрегации в толще жидкости. Подробно описаны физико-химические явления, протекающие при распознавании клетками микроорганизмов поверхности раздела фаз. Детально описаны компоненты внеклеточного полимерного матрикса биопленок, регуляция их образования, структурное значение для архитектуры биопленок и защитная роль при воздействии биоцидов (в том числе антибиотиков) и прочих неблагоприятных факторов внешней среды. Рассмотрены подходы к управлению формированием микробных биопленок. Подвергнута анализу предложенная в литературе новая схема формирования микробных биопленок, включающая три этапа вместо пяти.

Микробиология. 2025;94(4):303-329
pages 303-329 views

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ СТАТЬИ

Оценка эффективности криоконсервации микроводорослей и цианобактерий на примере штаммов из Всероссийской коллекции микроорганизмов

Редькина В.В., Темралеева А.Д.

Аннотация

Проведена оценка эффективности криоконсервации цианобактерий и микроводорослей разных таксономических групп, включая харофитовые, хлорофитовые и гетероконтофитовые микроводоросли, на примере 24 штаммов альгологической части фонда Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ). Для сравнительного исследования были отобраны культуры микроводорослей, отличающихся клеточными размерами, морфологической организацией таллома, способом размножения, наличием и размером слизистых оболочек, способностью к образованию покоящихся клеток. Апробированы два варианта криопротекторов (метанол и диметилсульфоксид), два типа питательных сред (скошенный агар и жидкая среда), а также три способа определения выживаемости организмов после криоконсервации. Показано, что двуступенчатый протокол криоконсервации с использованием обоих криопротекторов (метанол и диметилсульфоксид) был успешно применен для всех 24 исследованных штаммов вне зависимости от их таксономической принадлежности и морфологических признаков. По итогам эксперимента была разработана стандартная операционная процедура криоконсервации микроводорослей и цианобактерий, включающая жидкую культуральную среду с диметилсульфоксидом, а также одновременно два способа определения выживаемости штаммов после криоконсервации – рост в жидкой среде и штрихи на агаре. Предложенный протокол обеспечивает не только сохранение жизнеспособности клеток и возможности дальнейшего использования штамма в качестве морфологически и генетически репрезентативного образца, но и минимизирует временные и ресурсные затраты, а также риск контаминации культур.

Микробиология. 2025;94(4):330-340
pages 330-340 views

Влияние биогенных полиаминов на аккумуляцию рифампицина в клетках Escherichia coli

Ахова А.В., Нестерова Л.Ю., Ткаченко А.Г.

Аннотация

Роль биогенных полиаминов в регуляции проницаемости клеточной оболочки бактерий для антибиотиков, транспортируемых через пориновые каналы, хорошо известна. Возможность их влияния на транспорт антибиотиков, проникающих в бактериальную клетку непориновым путем, например, рифампицина, остается неизученной. В данной работе исследовано влияние внутриклеточного содержания путресцина, спермидина и кадаверина на эффективность аккумуляции рифампицина, чувствительность к нему бактерий, степень гидрофобности клеточной поверхности, а также влияние полиаминов на экспрессию marRAB-оперона. Ни один из трех исследованных полиаминов не оказывал влияния на скорость транспорта рифампицина в клетку на первых этапах процесса (2 мин). При более длительной экспозиции (60 мин) проявлялся защитный эффект кадаверина, присутствие которого в клетке обеспечивало снижение аккумуляции рифампицина. Кадаверин оказывал непосредственное влияние на гидрофобность клеток Escherichia coli: его отсутствие повышало гидрофобность клеточной поверхности. Наблюдалась прямая зависимость между степенью гидрофобности клеточной поверхности и эффективностью аккумуляции рифампицина. Полиамины сами по себе не влияли на уровень экспрессии marRAB-оперона, но модулировали его экспрессию, индуцированную добавкой салицилата. Путресцин не оказывал влияния, спермидин снижал, а кадаверин повышал уровень экспрессии. В целом, биосинтез полиаминов играет роль в адаптации бактерий к воздействию рифампицина, поскольку штаммы, неспособные синтезировать кадаверин или путресцин и спермидин, были более чувствительны по сравнению со штаммами дикого типа. Особую роль в защите от действия рифампицина играет кадаверин, отсутствие которого в клетках повышает их чувствительность к антибиотику.

Микробиология. 2025;94(4):341-350
pages 341-350 views

КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ

Геномное картирование РНК‒ДНК гибридов Escherichia coli

Олейникова К.Ю., Рузов А.С., Жигалова Н.А.

Аннотация

Нами впервые картированы РНК‒ДНК гибриды в геноме прокариот. Используя метод иммунопреципитации с антителами S9.6 (S9.6-DRIP) с последующим полногеномным секвенированием, мы нашли 219 уникальных пиков РНК‒ДНК гибридов в геноме Escherichia coli ТОР10. Данные пики относились к 219 разным генам и оказались распределены в основном в кодирующих областях генома (88.12%). Анализ отдельных генов, содержащих РНК‒ДНК гибриды, показал, что они кодируют ферменты, участвующие в важных энергетических и метаболических процессах прокариот, таких, например, как синтез липоевой кислоты.

Микробиология. 2025;94(4):351-355
pages 351-355 views

Разработка протокола трансформации Lacticaseibacillus paracasei RG

Дудик П.С., Армянинова Д.К., Гончаренко А.В.

Аннотация

Молочнокислые бактерии, традиционно используемые в пищевой промышленности, рассматриваются в качестве платформы для создания рекомбинантных штаммов для экспрессии и доставки протективно-значимых антигенов и других биологически активных молекул в желудочно-кишечный тракт сельскохозяйственных животных и человека. Одним из препятствий для получения рекомбинантных штаммов молочнокислых бактерий является их низкая эффективность трансформации плазмидной ДНК. В качестве объекта исследований был выбран пробиотический штамм Lacticaseibacillus paracasei RG, безопасный и способный преодолевать кислотный барьер желудка. Было исследовано влияние условий выращивания, подготовки компетентных клеток и режима электропорации на эффективность трансформации L. paracasei RG вектором pTRKH2, в результате чего создан протокол эффективной трансформации L. paracasei RG рекомбинантной ДНК.

Микробиология. 2025;94(4):356-360
pages 356-360 views

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».