SIDERA TIBETICA (HYMENOCHAETALES, BASIDIOMYCOTA), A NEW SPECIES TO RUSSIA

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The first findings of recently described polypore fungus Sidera tibetica are revealed in the Caspian lowland forests of the Samursky National Park in the Republic of Dagestan, Russia. Basidiomata collected on Pinus brutia var. eldarica were studied by both light microscopy and molecular methods. Detailed information on new localities and habitats of Sidera tibetica as well as the collection numbers of specimens deposited in the Mycological Herbarium of the Komarov Botanical Institute of RAS (LE) are provided. Two complete sequences of ITS1–5.8S–ITS2 nuclear ribosomal DNA for Caucasian specimens of S. tibetica have been obtained and submitted to the GenBank database. Newly generated sequences are formed a separate well-supported clade in the Maximum Likelihood phylogenetic analysis together with all available ITS nrDNA sequences of S. tibetica originated from Belarussian and Chinese collections including the reference sequence from a holotype.

About the authors

S. V. Volobuev

Komarov Botanical Institute of the Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: sergvolobuev@binran.ru
Russia, 197022, St. Petersburg

References

  1. Bolshakov S.Yu., Volobuev S.V., Ezhov O.N. et al. Aphyllophoroid fungi of the European part of Russia: a checklist / Eds. S.Yu. Bolshakov, S.V. Volobuev. ETU Publishing house, SPb., 2022 (in Russ.).
  2. Du R., Wang L., Zhou M. et al. A new species of Sidera (Hymenochaetales, Basidiomycota) from tropical Asia. Phytotaxa. 2019. V. 387 (2). P. 165–171. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.387.2.9
  3. Du R., Wu F., Gate G.M. et al. Taxonomy and phylogeny of Sidera (Hymenochaetales, Basidiomycota): four new species and keys to species of the genus. MycoKeys. 2020. V. 68. P. 115–135. https://doi.org/10.3897/mycokeys.68.53561
  4. Gardes M., Bruns T.D. ITS primers with enhanced specificity for basidiomycetes – application to the identification of mycorrhizae and rusts. Molec. Ecol. 1993. V. 2 (2). P. 113–118. https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.1993.tb00005.x
  5. Index Fungorum. CABI Bioscience, 2023. http://www.indexfungorum.org. Accessed 20.06.2023.
  6. Katoh K., Rozewicki J., Yamada K.D. MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization. Briefings in Bioinformatics. 2019. V. 20. P. 1160–1166. https://doi.org/10.1093/bib/bbx108
  7. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molec. Biol. Evol. 2018. V. 35 (6). P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  8. Larsson K.-H., Parmasto E., Fischer M. et al. Hymenochaetales: a molecular phylogeny for the hymenochaetoid clade. Mycologia. 2006. V. 98 (6). P. 926–936. https://doi.org/10.1080/15572536.2006.11832622
  9. Litvinskaya S., Murtazaliev R. Vegetation diversity of the Russian part of the Caucasus in the era of climate change. In: M. Öztürk et al. (eds). Climate change impacts on high-altitude ecosystems. Springer, Cham, 2015. P. 523–544.
  10. Liu Z.B., Zhou H.M., Liu H.G. et al. Taxonomy and phylogeny of Sidera (Hymenochaetales, Rickenella clade) from China and North America revealing two new species. MycoKeys. 2023. V. 96. P. 173–191. https://doi.org/10.3897/mycokeys.96.100743
  11. Liu Z.B., Zhou M., Wu F. et al. Two new species of Sidera (Hymenochaetales, Basidiomycota) from Southwest China. J. Fungi. 2022. V. 8. Art. 385. https://doi.org/10.3390/jof8040385
  12. Liu Z.B., Zhou M., Yuan Y. et al. Global diversity and taxonomy of Sidera (Hymenochaetales, Basidiomycota): four new species and keys to species of the genus. J. Fungi. 2021. V. 7. Art. 251. https://doi.org/10.3390/jof7040251
  13. Lodge D.J., Ammirati J.F., O’Dell T.E. et al. Terrestrial and lignicolous macrofungi. In: Biodiversity of fungi. Inventory and monitoring methods. Elsevier Academic Press, L. etc., 2004. P. 127–172.
  14. Miettinen O., Larsson K.-H. Sidera, a new genus in Hymenochaetales with poroid and hydnoid species. Mycological Progress. 2011. V. 10. P. 131–141. https://doi.org/10.1007/s11557-010-0682-5
  15. Novikova N.M., Polyanskaya A.V. Samursky liana forests: the challenge of biodiversity conservation in a developing water industry. Moscow, 1994 (in Russ.).
  16. POWO. 2023. Plants of the World Online. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. http://www.plantsoftheworldonline.org. Accessed 25.07.2023.
  17. Rosenthal L.M., Larsson K.-H., Branco S. et al. Survey of corticioid fungi in North American pinaceous forests reveals hyperdiversity, underpopulated sequence databases, and species that are potentially ectomycorrhizal. Mycologia. 2017. V. 109 (1). P. 115–127. https://doi.org/10.1080/00275514.2017.1281677
  18. Trifinopoulos J., Nguyen L.T., von Haeseler A. et al. W-IQ-TREE: a fast online phylogenetic tool for maximum likelihood analysis. Nucleic Acids Research. 2016. V. 44 (W1). P. W232–W235. https://doi.org/10.1093/nar/gkw256
  19. Volobuev S.V. Antrodia hyalina (Polyporales, Basidiomycota), new species to the Caucasus. Botanical Journal of the North Caucasus. 2021. V. 1. P. 28–34. https://doi.org/10.33580/24092444_2021_1_28
  20. Volobuev S.V. Aphyllophoroid fungi of the “Samurskiy” National Park (Dagestan). Mikologiya i fitopatologiya. 2020. V. 54 (4). P. 235–243. https://doi.org/10.31857/S002636482004011X
  21. Volobuev S.V., Shakhova N.V. Monitoring of protected fungal species in Samursky national park. Botanical Journal of the North Caucasus. 2022. V. 2. P. 7–13. https://doi.org/10.33580/24092444_2022_2_7
  22. Vondrák J., Svoboda S., Zíbarová L. et al. Alcobiosis, an algal-fungal association on the threshold of lichenisation. Sci Rep. 2023. V. 13. Art. 2957. https://doi.org/10.1038/s41598-023-29384-4
  23. Xu T.M., Sun Y.F., Liu S. et al. Ceriporiopsis tianshanensis (Polyporales, Agaricomycetes) and Sidera tianshanensis (Hymenochaetales, Agaricomycetes), two new species of wood-inhabiting fungi from Xinjiang, Northwest China. MycoKeys. 2023. V. 98. P. 1–18. https://doi.org/10.3897/mycokeys.98.102552
  24. Большаков С.Ю., Волобуев С.В., Ежов О.Н. и др. (Bolshakov et al.) Афиллофороидные грибы европейской части России: аннотированный список видов / отв. ред. С.Ю. Большаков, С.В. Волобуев. СПб.: Изд-во СПбГЭТУ “ЛЭТИ”, 2022. 578 с.
  25. Новикова Н.М., Полянская А.В. (Novikova, Polyanskaya) Самурские лиановые леса: проблема сохранения биоразнообразия в условиях развивающегося водного хозяйства. М.: РАСХН, 1994. 106 с.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download
2.

Download (4MB)
Indexing metadata
3.

Download (1MB)
Indexing metadata
4.

Download (1MB)
Indexing metadata

Copyright (c) 2023 S.V. Volobuev

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».