Выделение, очистка и кристаллизация ГТФазы Era из золотистого стафилококка

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Изучение кристаллической структуры белков является важным инструментом для разработки новых лекарств. Наиболее трудоемким этапом в получении структурных данных является выращивание хорошо дифрагирующих кристаллов белка. Представлены выделение, очистка и кристаллизация белка ГТФаза Era из патогенной бактерии золотистого стафилококка (Staphylococcus aureus). ГТФаза Era в клетках бактерий является одним из факторов сборки рибосомы. Фермент отвечает за рост и деление клетки, однако его структура мало изучена. Получены кристаллы белка Era из Staphylococcus aureus, которые могут быть использованы в дальнейших структурных исследованиях методом монокристального рентгеноструктурного анализа.

Ключевые слова

Об авторах

Э. А. Клочкова

Казанский (Приволжский) федеральныйKazan Federal University, Kazan, 420008 Russia университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

Д. Р. Исламов

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. Д. Биктимиров

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. В. Рогачев

Московский физико-технический институт; Объединенный институт ядерных исследований

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Долгопрудный; Россия, Дубна

Ш. З. Валидов

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. Г. Бикмуллин

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. В. Симакин

Институт общей физики им. А.М. Прохорова РАН

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Москва

Г. С. Петерс

Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Москва

М. М. Юсупов

Институт генетики, молекулярной и клеточной биологии

Email: k.usachev@kpfu.ru
Франция, Илькирш-Граффенштаден

К. С. Усачев

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

Список литературы

  1. Stijn Blot R.N., Vandewoude K., Colardyn F. // N. Engl. J. Med. 1998. V. 339 (27). P. 2025. https://doi.org/10.1056/nejm199812313392716
  2. Jeljaszewicz J., Mlynarczyk G., Mlynarczyk A. // Int. J. Antimicrob. Agents. 2000. V. 16 (4). P. 473. https://doi.org/10.1016/S0924-8579(00)00289-2
  3. Fierobe L., Decré D., Mùller C. et al. // Clin. Infect. Dis. 1999. V. 29 (5). P. 1231. https://doi.org/10.1086/313454
  4. Shajani Z., Sykes M.T., Williamson J.R. // Annu. Rev. Biochem. 2011. V. 80. P. 501. https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-062608-160432
  5. Kaczanowska M., Rydén-Aulin M. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2007. V. 71 (3). P. 477. https://doi.org/10.1128/MMBR.00013-07
  6. Усачев К.С., Юсупов М.М., Валидов Ш.З. // Биохимия. 2020. Т. 85 (11). С. 1690. https://doi.org/10.1134/S0006297920110115
  7. Stern S., Powers T., Changchien L.I.-M., Noller H.F. // Science. 1989. V. 244 (4906). P. 783. https://doi.org/10.1126/science.2658053
  8. Davis J.H., Williamson J.R. // Philos. Trans. R. Soc. 2017. V. 372 (1716). Art. 20160181. https://doi.org/10.1098/rstb.2016.0181
  9. Bourne H.R. // Philos. Trans. R. Soc. 1995. V. 349 (1329). P. 283. https://doi.org/10.1098/rstb.1995.0114
  10. Tu C., Zhou X., Tropea J. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2009. V. 106 (35). P. 14843. https://doi.org/10.1073/pnas.0904032106
  11. Simon Goto, Akira Muto, Hyouta Himeno // J. Biochem. 2013. V. 153 (5). P. 403. https://doi.org/10.1093/jb/mvt022
  12. Ji X. // Postepy Biochem. 2016. V. 62 (3). P. 335.
  13. Xiaomei Zhou, Howard K. Peters III, Xintian Li et al. // J. Bacteriol. 2020. V. 202. P. 21. https://doi.org/10.1128/JB.00342-20
  14. Ren H., Liang Y., Li R. et al. // Acta Cryst. D. 2004. V. 60. P. 1292. https://doi.org/10.1107/S0907444904010467
  15. Meulenbroek E., Pannu N. // Acta Cryst. F. 2011. V. 68. P. 45. https://doi.org/10.1107/S1744309111045842
  16. Murugova T.N., Vlasov A.V., Ivankov O.I. et al. // J. Optoelectron. Adv. Mater. 2015. V. 17. P. 1397.
  17. Kabsch W. // Xds. Acta Cryst. D. 2010. V. 66. P. 125. https://doi.org/10.1107/S0907444909047337
  18. Chen X., Chen S.-M., Powell B. et al. // FEBS Lett. 1999. V. 445. P. 425. https://doi.org/10.1016/S0014-5793(99)00178-7
  19. Manalastas-Cantos K., Konarev P.V., Hajizadeh N.R. et al. // J. Appl. Cryst. 2021. V. 54. P. 343. https://doi.org/10.1107/S1600576720013412
  20. Jumper J., Evans R., Pritzel A. et al. // Nature. 2021. V. 596 (7873). P. 583.
  21. Chen X., Court D.L., Ji X. // PNAS. 1999. V. 15 (96). P. 8396. https://doi.org/10.1073/pnas.96.15.8396

Дополнительные файлы


© Российская академия наук, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».