Protein and amino acid fluorescence analysis as a method for evaluating bactericidal effectiveness

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The degradation of albumin and its constituent amino acids tryptophan, tyrosine, and phenylalanine under the influence of corona discharge cold plasma, pulsed radiation of hot plasma, and 253.7-nm UV light from a mercury lamp has been studied. The concentration of products before and after treatment was determined by measuring the fluorescence yield. The reaction mechanisms leading to protein degradation are oxidation, nitration, and reduction of disulfide bonds. The degree of protein and amino acid degradation is compared with the effect of hydrogen peroxide. The possibility of assessing the bactericidal effectiveness based on fluorescence yield is discussed.

About the authors

I. M. Piskarev

Moscow State University

Author for correspondence.
Email: i.m.piskarev@gmail.com

Skobeltsyn Research Institute of Nuclear Physics

Russian Federation, Moscow

References

  1. Shlapakova, T.I., Kostin, R.K., and Tyagunova, E.E. // Russ. J. Bioorg. Chem., 2020, vol. 46, № 5, p. 657.
  2. Bruggeman, P.J., Kushner, M.J., Locke, B.R. et al. // Plasma Sources Sci. Technol., 2016, vol. 25, p. 053002.
  3. Weltman, K.D., Kolb, J.F., Holub, M. et al. // Plasma Process. Polym., 2018, vol. 16, № 1, p. e1800118.
  4. Rezaei, F., Vanraes, P., Nikiforov, A. et al. // Materials, 2019, vol. 12, p. 2751.
  5. Van Gils, C.A.J., Hofmann, S., and Boekema, B.K.H.L. // J. Phys. D: Appl. Phys., 2013, vol. 46, p. 175203.
  6. Wood, J.P. and Adrion, A.C., Environ. Sci. // Technol., 2019, vol. 53, № 8, p. 4045.
  7. Estifaee, P., Su, X., Yannam, S.K. et al. // Sci. Rep., 2019, vol. 9, p. 2326.
  8. Pattison, D.I., Rahmanto, A.S., and Davies, M. // Photochem. Photobiol. Sci., 2012, vol. 11, p. 38.
  9. Antoshina, D.V., Balandin, S.V., and Ovchinnikova, T.V. // Biochemistry (Moscow), 2022, vol. 87, № 11, p. 1327.
  10. Matin, R., Yousefzadeh, S., Ahmad, E. et al. // Food Chem. Toxicol., 2018, vol. 116, p. 129.
  11. Scappini, F., Capobianco, M.L., Casadei, F. et al. // Int. J. Astrobiol., 2007, vol. 6, № 4, p. 281.
  12. Piskarev, I.M. // High Energy Chem., 2020, vol. 54, № 3, p. 205.
  13. Piskarev, I.M. // IEEE Trans. Plasma Sci., 2021, vol. 49, № 4, p. 1363.
  14. Piskarev, I.M., Astaf’eva, K.A., and Ivanova, I.P. // Sovrem. Tekhnol. Med., 2018, vol. 10, № 2, p. 90.
  15. Piskarev, I.M. // Plasma Chem. Plasma Process., 2021, vol. 41, p. 1347.
  16. Lobachev, V.L. and Rudakov, E.S. // Usp. Khim., 2006, vol. 75, № 5, p. 422.
  17. Luo, Y.-R. Handbook of Bond Dissociation Energies in Organic Compounds, Boca Raton: CRC, 2003.
  18. Corpas, F.J., Gonzalez-Gordo, S., and Palma, J.M. // Plant Stress, 2021, vol. 2, p. 10006.
  19. Ivanova, I.P. and Piskarev, I.M. // High Energy Chem., 2022, vol. 56, № 5, p. 339.
  20. Mandal, B. and Basu, B. // RSC Adv., 2014, vol. 4, p. 13854.
  21. Chung, W.K., Russell, B., and Yang, Y. et al. // Biotechnol. Bioeng., 2017, vol. 114, p. 1264.
  22. Bechtel, T.J. and Weerapana, E. // Proteomics, 2017, vol. 17, № 6, p. 1.
  23. Piskarev, I.M., Ivanova, I.P., Trofimova, S.V., and Burkhina, O.E. // High Energy Chem., 2015, vol. 49, № 1, p. 72.
  24. Davoudi, M., Ehrampoush, M.H., Vakili, T. et al. // Int. J. Environ. Health Eng., 2012, vol. 1, № 2, p. 1.
  25. Khurshidi, H., Rafig, M., Nazir, F. et al. // Pure Appl. Biol., 2019, vol. 8, № 4, p. 2238.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».