Historical Genetics

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

New developments in the field of genomic technologies has engendered novel opportunities for the genetic researches of historical and archaeological sites, thus giving rise to a new field of genetic science, which we have previously proposed to designate as historical genetics. Historical genetics is the scientific study of the history of humankind and ancient objects based on DNA analysis. Ancient DNA preserved in archaeological, museum and archival samples is a unique source of information that allows the integration of genetic data with archaeological and historical information, as well as historical identifications that were previously unavailable for research. The purpose of this article is twofold: firstly, to provide an overview of historical genetics using the example of applying ancient DNA analysis methodologies in our own research; and secondly, to consider the main promising areas of research in this field of science. These include a large-scale scientific project to study the genetic history of ancient populations within the framework of an interdisciplinary scientific consortium of leading Russian scientific institutions.

About the authors

E. I. Rogaev

Scientific Center of Genetics and Life Sciences, Sirius University; Chan Medical School of the University of Massachusetts, Department of Psychiatry

Author for correspondence.
Email: contact@rogaevlab.ru
Sirius Federal Territory, Krasnodarsky Krai, village Sirius, 354340 Russia; Shrewsbury, 01545 USA

References

  1. Prufer K., de Filippo C., Grote S. et al. A high-coverage Neandertal genome from Vindija Cave in Croatia // Science. 2017. V. 358. № 6363. P. 655–658. https://doi.org/10.1126/science.aao1887
  2. Mafessoni F., Grote S., de Filippo C. et al. A high-coverage Neandertal genome from Chagyrskaya Cave // PNAS USA. 2020. V. 117. № 26. P. 15132–15136. https://doi.org/10.1073/pnas.2004944117
  3. Reich D., Green R., Kircher M. et al. Genetic history of an archaic hominid group from Denisova cave in Siberia // Nature. 2010. № 468. P. 1053–1060. https://doi.org/10.1038/nature09710
  4. Furholt M. Mobility and social change: Understanding the European neolithic period after the archaeogenetic revolution // J. Archaeol. Res. 2021. № 29. P. 481–535. https://doi.org/10.1007/s10814-020-09153-x
  5. Lazaridis I., Patterson N., Anthony D. et al. The genetic origin of the Indo-Europeans // Nature. 2025. № 639. P. 132–142. https://doi.org/10.1038/s41586-024-08531-5
  6. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Moliaka Y.K. et al. Genomic identification in the historical case of the Nicholas II royal family // PNAS USA. 2009. V. 106. № 13. P. 5258–5263. https://doi.org/10.1073/pnas.0811190106
  7. Rogaev E.I., Grigorenko A.P., Faskhutdinova G. et al. Genotype analysis identifies the cause of the “royal disease” // Science. 2009. V. 326. № 5954. P. 817. https://doi.org/10.1126/science.1180660
  8. Андреева Т.В., Манахов А.Д., Кунижева С.С., Рогаев Е.И. Генетическое свидетельство аутентичности локона волос, представленного как реликвия в музейном портрете цесаревича Алексея, сына последнего российского императора // Биохимия. 2021. № 86. С. 1818–1825. https://doi.org/10.31857/S032097252112006X
  9. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Сошкина А.Д. и др. Методологии выделения древней ДНК из костной ткани для геномного анализа: подходы и практические рекомендации // Генетика. 2022. Т. 58. № 9. С. 979–998. https://doi.org/10.31857/S001667582209003X
  10. Prufer K., Stenzel U., Hofreiter M. et al. Computational challenges in the analysis of ancient DNA // Genome Biol. 2010. V. 11. № 5. https://doi.org/10.1186/gb-2010-11-5-r47
  11. Rogaev E.I., Moliaka Y.K., Malyarchuk B.A. et al. Complete mitochondrial genome and phylogeny of pleistocene mammoth Mammuthus primigenius // PLoS Biol. 2006. V. 4. № 3. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0040073
  12. Andreeva T.V., Manakhov A.D., Gusev F.E. et al. Genomic analysis of a novel neandertal from Mezmaiskaya Cave provides insights into the genetic relationships of middle palaeolithic populations // Sci. Rep. 2022. V. 12. P. 13016. https://doi.org/10.1038/s41598-022-16164-9
  13. Андреева Т.В., Жилин М.Г., Малярчук А.Б. и др. Археогеномиз человека из слоя верхневолжской культуры – наибольшее генетическое сходство с восточно-европейскими охотниками-собирателями и древними представителями мезолита/неолита Европы // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. № 1(64). С. 113–125. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-64-1-10
  14. Andreeva T.V., Soshkina A.D., Gusev F.E. et al. Genetic history of Scythia // Sci. Adv. 2025 V. 11. P. 8179. http://doi.org/10.1126/sciadv.ads8179
  15. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Григоренко А.П. и др. Археогенетический анализ индивида из захоронения с территории древнего Ярославского Кремля // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2021. № 265. С. 294–308. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.265.294-308
  16. Андреева Т.В., Добровольская М.В., Седов В.В. и др. Люди из каменного саркофага № 11 Юрьева монастыря: генетическая история на основе митохондриальных геномов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2023. № 270. С. 418–437. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.270.418-437
  17. Андреева Т.В., Малярчук А.Б., Родинкова В.Е. и др. Индивидуальный вектор времени из Куриловки: первые археогенетические данные // Рос. археология. 2023. № 3. С. 57–71. https://doi.org/10.31857/S0869606323030030
  18. Рождественских Е.В., Манахов А.Д., Андреева Т.В. и др. Юноша с хорьком из средневекового могильника Минино на Кубенском озере: археогенетическая идентификация // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2024. № 274. С. 348–368. https://doi.org/10.25681/IARAS.0130-2620.274.348-368
  19. Сыроватко А.С., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Индивид из куранного погребения XII в. на Средней Оке – опыт комплексного археолого-генетического исследования // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2024. Т. 2. № 65. С. 123–136. https://doi.org/10.20874/2071-0437-2024-65-2-10
  20. Сошкина А.Д., Андреева Т.В., Кунижева С.С. и др. Генетическое исследование музейного антропологического образца из городского захоронения Старой Рязани XI–XIII веков // Генетика. 2025. Т. 61. № 6. С. 706–716. https://doi.org/10.1134/S1022795425700231
  21. Альперович А.И., Сошкина А.Д., Андреева Т.В. и др. Генетический портрет индивида из средневекового некрополя «Патриарший сад» (г. Владимир) с редкой погребальной обрадностью – каменной подушкой // Вестник археол., антропол. и этнографии. 2025 (в печати).
  22. Рождественских Е.В., Андреева Т.В., Малярчук А.Б. и др. Митогеномный анализ представителя черняховской культуры в Среднем Поднестровье и его генетическая связь со славянами в контексте палеоантропологических данных // Вавилов. журн. генет. и селекции. 2025 (в печати).
  23. Малярчук А.Б., Кузнецова И.Л., Андреева Т.В. и др. Оценка возможности геномного исследования кремлированных археологических образцов // Краткие сообщ. Ин-та археологии. 2025 (в печати).
  24. Niiranen L., Leciej D., Edlund H. et al. Epigenomic modifications in modern and ancient genomes // Genes (Basel). 2022. V. 13. № 2. https://doi.org/10.3390/genes13020178
  25. Малярчук А.Б., Андреева Т.В., Кузнецова И.Л. и др. Геномика древних патогенов: первые успехи и перспективы // Биохимия. 2022. № 87. С. 242–258. https://doi.org/10.1134/S000629792030051

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).