Dqa1 gene variability in wild and domestic reindeer (Rangifer tarandus) of the Asian part of Russia

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Modern tendencies to intensification of breeding of domestic farm animals including reindeer necessitate a detailed study of genetic variability in candidate genes associated with meat productivity. At present, the primary task is to search for molecular genetic markers for identification and selection of individuals with desired characteristics. One such potential candidate gene is the DQA1 gene. It is hypothesized that individual genes of the immune system may influence the growth performance of animals. Variability in the DQA1 gene region has been associated with cattle size and beef production in many studies. Principal component analysis on DQA1 variability united wild and domestic reindeer in Yakutia, which implies gene flow between local breeds of domesticated reindeer and wild populations, and the formation of similar adaptation mechanisms. However, significant differences were found between wild and Evenki reindeer of the Amur region, which may reflect the influence of domestication processes on the Evenki breed.

作者简介

E. Konorov

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences; Gorbatov Federal Research Center for Food Systems, Russian Academy of Sciences

Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia; Moscow, 109316 Russia

K. Kurbakov

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences; Gorbatov Federal Research Center for Food Systems, Russian Academy of Sciences

Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia; Moscow, 109316 Russia

M. Semina

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia

V. Voronkova

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia

A. Onokhov

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences

Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia

K. Layshev

Vavilov Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences; Center for Interdisciplinary Research of Food Security Problems

编辑信件的主要联系方式.
Email: casqy@yandex.ru
Moscow, 119991 Russia; St. Petersburg, Pushkin, 196608 Russia

参考

  1. Al-Waith H.K., Al-Anbari N.N., Mohamed T.R. Relationship of the DQA1 gene polymorphism with productive performance in Holstein cattle // Plant Archives. 2018. V. 18. P. 2636–2640. https://doi.org/10.5555/20203001636
  2. Kim H., Caetano-Anolles K., Seo M. et al. Prediction of genes related to positive selection using whole- genome resequencing in three commercial pig breeds // Genomics Inform. 2015. V. 13. P. 137–145. https://doi.org/10.5808/GI.2015.13.4.137
  3. Vandre R.K., Gowane G.R., Sharma A.K., Tomar S.S. Immune responsive role of MHC class II DQA1 gene in livestock // Livest. Res. Int. 2014. V. 2. P. 1–7.
  4. Park Y.H., Joo Y.S., Park J.Y. et al. Characterization of lymphocyte subpopulations and major histocompatibi- lity complex haplotypes of mastitis-resistant and susceptible cows // J. Veter. Sci. 2004. V. 5. № 1. P. 29–39. https://doi.org/10.4142/jvs.2004.5.1.29
  5. Vandre R.K., Sharma A.K., Gowane G.R. et al. Trend of association of BoLA-DQA1 alleles with FMDV vaccine elicited immune response in crossbred cattle // Indian J. Anim. Sci. 2014. V. 84. № 6. P. 619–623. https://doi.org/10.56093/ijans.v84i6.41569
  6. Cronin M.A., Renecker L., Pierson B.J., Patton J.C. Genetic variation in domestic reindeer and wild caribou in Alaska // Animal Genetics. 1995. V. 26. № 6. P. 427–434. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1995.tb02695.x
  7. Kennedy L.J., Modrell A., Groves P. et al. Genetic diversity of the major histocompatibility complex class II in Alaskan caribou herds // Int. J. Immunogenetics. 2011. V. 38. № 2. P. 109–119. https://doi.org/10.1111/j.1744-313X.2010.00973.x
  8. Lukacs M., Nymo I.H., Madslien K. et al. Functional immune diversity in reindeer reveals a high Arctic population at risk // Front. in Ecol. and Evol. 2023. V. 10. https://doi.org/10.3389/fevo.2022.1058674
  9. Muuttoranta K., Holand Ø., Røed K.H. et al. Genetic variation in meat production related traits in reindeer (Rangifer t. tarandus) // Rangifer. 2014. V. 34. № 1. P. 21–36. https://doi.org/10.7557/2.34.1.2753
  10. Николаев С.В., Матюков В.С., Филатов А.В. Изменения микросателлитного профиля в опытном стаде северных оленей ненецкой породы // Междунар. вестник ветеринарии. 2023. № 3. С. 275–283. https://doi.org/10.52419/issn2072-2419.2023.3.275
  11. Сёмина М.Т., Каштанов С.Н., Бабаян О.В. и др. Анализ генетического разнообразия и популяционной структуры ненецкой аборигенной породы северных оленей на основе микросателлитных маркеров // Генетика. 2022. Т. 58. № 8. С. 954–966. https://doi.org/ 10.31857/S0016675822080069
  12. Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Solovieva A.D. et al. Genome-wide SNP analysis reveals the genetic diversity and population structure of the domestic reindeer population (Rangifer tarandus) inhabiting the indigenous tofalarlands of southern Siberia // Diversity. 2022. V. 14. № 11. P. 900.
  13. Kholodova M.V., Baranova A.I., Mizin I.A. et al. A genetic predisposition to chronic wasting disease in the reindeer Rangifer tarandus in the Northern European part of Russia // Biology Bulletin. 2019. V. 46. P. 555–561. https://doi.org/10.1134/S1062359019060074
  14. Курбаков К.А., Коноров Е.А., Семина М.Т., Столповский Ю.А. Распространение ассоциированных с болезнью хронического изнурения аллелей гена PRNP у диких и домашних северных оленей Rangifer tarandus на территории России // Генетика. 2022. Т. 58. № 2. С. 163–168. https://doi.org/10.31857/S0016675822020102
  15. Keane O.M., Dodds K.G., Crawford A.M., McEwan J.C. Transcriptional profiling of Ovis aries identifies Ovar-DQA1 allele frequency differences between nematode-resistant and susceptible selection lines // Phy- siol. Genomics. 2007. V. 30. № 3. P. 253–261.
  16. Ye J., Coulouris G., Zaretskaya I. et al. Primer-BLAST: А tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction // BMC Bioinformatics. 2012. V. 13. № 1. P. 1–11. https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-134
  17. Kluesner M.G., Nedveck D.A., Lahr W.S. et al. EditR: A method to quantify base editing from Sanger sequen- cing // The CRISPR J. 2018. V. 1. № 3. P. 239–250. https://doi.org/10.1089/crispr.2018.0014
  18. Edgar R.C. MUSCLE: Multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput // Nucl. Acids Res. 2004. V. 32. № 5. P. 1792–1797. https://doi.org/10.1093/nar/gkh340
  19. Kumar S., Stecher G., Li M. et al. MEGA X: Мolecular evolutionary genetics analysis across compu- ting platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. № 6. P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  20. Lê S., Josse J., Husson F. FactoMineR: Аn R pac- kage for multivariate analysis // J. Stat. Software. 2008. V. 25. P. 1–18. https://doi.org/ 10.18637/jss.v025.i01
  21. Svishcheva G., Babayan O., Sipko T. et al. Genetic differentiation between coexisting wild and domestic reindeer (Rangifer tarandus L. 1758) in Northern Eu- rasia // Genet. Resources. 2022. V. 3. № 6. P. 1–14. https://doi.org/10.46265/genresj.UYML5006

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».