1H-ЯМР-СПЕКТРОСКОПИЯ ПЛАЗМЫ КРОВИ ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ИЗМЕНЕНИЙ В МЕТАБОЛИЗМЕ ПРИ РАЗВИТИИ САРКОМЫ М-1 У КРЫС
- Авторы: Егоров А.Е1, Быков А.С1, Пономарева Т.И2, Молчанов М.В1, Панкратова Н.М3, Панкратов А.Н3, Аракелян А.Г1, Корякин С.Н4, Тимченко М.А1
-
Учреждения:
- Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
- Филиал Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
- Институт математических проблем биологии РАН – филиал Федерального исследовательского центра «Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук»
- Медицинский радиологический научный центр имени А.Ф. Цыба – филиал Национального медицинского исследовательского радиологического центра Министерства здравоохранения Российской Федерации
- Выпуск: Том 69, № 4 (2024)
- Страницы: 856-867
- Раздел: Биофизика cложныx cиcтем
- URL: https://journals.rcsi.science/0006-3029/article/view/264950
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0006302924040178
- EDN: https://elibrary.ru/NFUWPX
- ID: 264950
Цитировать
Аннотация
Ключевые слова
Об авторах
А. Е Егоров
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
А. С Быков
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Т. И Пономарева
Филиал Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наукПущино, Россия
М. В Молчанов
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
Н. М Панкратова
Институт математических проблем биологии РАН – филиал Федерального исследовательского центра «Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук»Пущино, Россия
А. Н Панкратов
Институт математических проблем биологии РАН – филиал Федерального исследовательского центра «Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук»Пущино, Россия
А. Г Аракелян
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАНПущино, Россия
С. Н Корякин
Медицинский радиологический научный центр имени А.Ф. Цыба – филиал Национального медицинского исследовательского радиологического центра Министерства здравоохранения Российской ФедерацииОбнинск, Россия
М. А Тимченко
Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН
Email: maria_timchenko@mail.ru
Пущино, Россия
Список литературы
- Vignoli A., Ghini V., Meoni G., Licari C., Takis P. G., Tenori L., Turano P., and Luchinat C. High-throughput metabolomics by 1D NMR. Angewandte Chemie (Int. ed. in English), 58 (4), 968–994 (2019). doi: 10.1002/anie.201804736
- Larkin J. R., Anthony S., Johanssen V. A., Yeo T., Sealey M., Yates A. G., Smith C. F., Claridge T. D. W., Nicholson B. D., Moreland J. A., Gleeson F., Sibson N. R., Anthony D. C., and Probert F. Metabolomic biomarkers in blood samples identify cancers in a mixed population of patients with nonspecific symptoms. Clin. Cancer Res., 28 (8), 1651–1661 (2022). doi: 10.1158/1078-0432.CCR-21-2855
- Casadei-Gardini A., Del Coco L., Marisi G., Conti F., Rovesti G., Ulivi P., Canale M., Frassineti G. L., Foschi F. G., Longo S., Fanizzi F. P., and Giudetti A. M. 1H-NMR based serum metabolomics highlights different specific biomarkers between early and advanced hepatocellular carcinoma stages. Cancers, 12 (1), 241 (2020). doi: 10.3390/cancers12010241
- Singh A., Prakash V., Gupta N., Kumar A., Kant R., and Kumar D. Serum metabolic disturbances in lung cancer investigated through an elaborative NMR-based serum metabolomics approach. ACS Omega, 7 (6), 5510–5520 (2022). doi: 10.1021/acsomega.1c06941
- Florou V., Nascimento A. G., Gulia A., and de Lima Lopes G. Jr. Global health perspective in sarcomas and other rare cancers. American Society of Clinical Oncology Educational Book (Am. Soc. of Clin. Oncol. Annu. Meet.), 38, 916–924 (2018). doi: 10.1200/EDBK_200589
- Casali P. G., Abecassis N., Aro H. T., Baue S., Biagini R., Bielack S., Bonvalot S., Boukovinas I., Bovee J. V. M. G., Brodowicz T., Broto J. M., Buonadonna A., De Alava E., Dei Tos A. P., Del Muro X. G., Dileo P., Eriksson M., Fedenko A., Ferraresi V., Ferrari A., Ferrari S., Frezza A. M., Gasperoni S., Gelderblom H., Gil T., Grignani G., Gronchi A., Haas R. L., Hassan B., Hohenberger P., Issels R., Joensuu H., Jones R. L., Judson I., Jutte P., Kaal S., Kasper B., Kopeckova K., Krakorova D. A., Le Cesne A., Lugowska I., Merimsky O., Montemurro M., Pantaleo M.A., Piana R., Picci P., Piperno-Neumann S., Pousa A.L., Reichardt P., Robinson M. H., Rutkowski P., Safwat A. A., Schoffski P., Sleijfer S., Stacchiotti S., Sundby Hall K., Unk M., Van Coevorden F., van der Graaf W. T. A., Whelan J., Wardelmann E., Zaikova O., and Blay J. Y. ESMO Guidelines Committee and EURACAN. Soft tissue and visceral sarcomas: ESMO-EURACAN clinical practice guidelines for diagnosis, treatment and follow-up. Annals Oncol., 29 (Suppl. 4), iv51–iv67 (2018). doi: 10.1093/annonc/mdy096
- Chen K., Zhu C., Cai M., Fu D., Cheng B., Cai Z., Li G., and Liu J. Integrative metabolome and transcriptome profiling reveals discordant glycolysis process between osteosarcoma and normal osteoblastic cells. J. Cancer Res. Clin. Oncol., 140 (10), 1715–1721 (2014). doi: 10.1007/s00432-014-1719-y
- Das S., Chatterjee N., Bose D., Banerjee S., Jha T., and Saha K. D. Leishmanial sphingolipid induces apoptosis in Sarcoma 180 cancer cells through regulation of tumour growth via angiogenic switchover. Tumour Biol., 36 (4), 3109–3118 (2015). doi: 10.1007/s13277-014-2947-0
- Lou S., Balluff B., Cleven A. H. G., Bovee J. V. M. G., and McDonnell L. A. Prognostic metabolite biomarkers for soft tissue sarcomas discovered by mass spectrometry imaging. J. Am. Soc. Mass Spectrometry, 28 (2), 376–383 (2017). doi: 10.1007/s13361-016-1544-4
- Shungu D. C., Bhujwalla Z. M., Li S. J., Rose L. M., Wehrle J. P., and Glickson J. D. Determination of absolute phosphate metabolite concentrations in RIF-1 tumors in vivo by 31P-1H-2H NMR spectroscopy using water as an internal intensity reference. Magnetic Resonance in Medicine, 28 (1), 105–121 (1992). doi: 10.1002/mrm.1910280111
- Zhang Z., Qiu Y., Hua Y., Wang Y., Chen T., Zhao A., Chi Y., Pan L., Hu S., Li J., Yang C., Li G., Sun W., Cai Z., and Jia W. Serum and urinary metabonomic study of human osteosarcoma. J. Proteome Res., 9 (9), 4861–4868 (2010). doi: 10.1021/pr100480r
- Lopez-Garrido L., Banuelos-Hernandez A. E., PerezHernandez E., Tecualt-Gomez R., Quiroz-Williams J., Ariza-Castolo A., Becerra-Martinez E., and PerezHernandez N. Metabolic profiling of serum in patients with cartilage tumours using 1H-NMR spectroscopy: A pilot study. Magnetic Resonance in Chemistry, 58 (1), 65–76 (2020). doi: 10.1002/mrc.4925
- Южаков В. В., Севанькаева Л. Е., Ульяненко С. Е., Яковлева Н. Д., Кузнецова М. Н., Цыганова М. Г., Фомина Н. К., Ингель И. Э. и Лычагин А. А. Эффективность фракционированного воздействия γизлучения и быстрых нейтронов на саркому М-1. Радиац. биология. Радиоэкология, 53 (3), 267-279 (2013). doi: 10.7868/S0869803113020148, EDN: QBHSLV
- Kimhofer T. Metabom8 (Version 1.0.0) [Computer software] (2021). URL: https://github.com/tkimhofer/metabom8 (дата обращения: 10.06.2023).
- Dieterle F., Ross A., Schlotterbeck G., and Senn H. Probabilistic quotient normalization as robust method to account for dilution of complex biological mixtures. Application in 1H NMR metabonomics. Anal. Chem., 78 (13), 4281–4290 (2006). doi: 10.1021/ac051632c
- Trygg J., Holmes E., and Lundstedt T. Chemometrics in metabonomics. J. Proteome Res., 6 (2), 469–479 (2007). doi: 10.1021/pr060594q
- Metz C. E. Basic principles of ROC analysis. Seminars in Nuclear Medicine, 8 (4), 283–298 (1978). doi: 10.1016/s0001-2998(78)80014-2
- Esperanca-Martins M., Fernandes I., Soares do Brito J., Macedo D., Vasques H., Serafim T., Costa L., and Dias S. Sarcoma metabolomics: current horizons and future perspectives. Cells, 10 (6), 1432 (2021). doi: 10.3390/cells10061432
- Lai H. S., Lee J. C., Lee P. H., Wang S. T., and ChenW. J. Plasma free amino acid profile in cancer patients. Seminars in Cancer Biology, 15 (4), 267–276 (2005). doi: 10.1016/j.semcancer.2005.04.003
- Altman B. J., Stine Z. E., and Dang C. V. From Krebs to clinic: glutamine metabolism to cancer therapy. Nature Reviews. Cancer, 16 (10), 619–634 (2016). doi: 10.1038/nrc.2016.71
- Xie H., Zhang K., Wei Y., Ruan G., Zhang H., Li S., Song Y., Chen P., Liu L., Wang B., and Shi H. The association of serum betaine concentrations with the risk of new-onset cancers: results from two independent nested case-control studies. Nutrition & Metabolism, 20 (1), 46 (2023). doi: 10.1186/s12986-023-00755-y
- Gruber J., Tang S. Y., Jenner A. M., Mudway I., Blomberg A., Behndig A., Kasiman K., Lee C. Y., Seet R. C., Zhang W., Chen C., Kelly F. J., and Halliwell B. Allantoin in human plasma, serum, and nasallining fluids as a biomarker of oxidative stress: avoiding artifacts and establishing real in vivo concentrations. Antioxidants & Redox Signaling, 11 (8), 1767–1776 (2009). doi: 10.1089/ars.2008.2364