Pooling Endocervical Samples for Chlamydia Trachomatis Diagnosis by Polymerase Chain Reaction: Cost Saving Strategy for Epidemiological and Screening Studies

Cover Page


Cite item

Abstract

The technique of pooling endocervical samples for PCR detection of C. trachomatis was developed and compared with individual testing. The efficiency of pooling strategy was evaluated for its accuracy and cost saving ability. Population prevalence based on pooled data was estimated. 1. 500 endocervical samples were tested individually and pooled by 5 (300 pools) and 10 (150 pools) specimens. The sensitivity and specificity of PCR was not affected by pooling either by 5 or by 10 samples. The estimated prevalence was 6. 1% (95% CI: 4,5-7,7) and 6,0% (95% CI: 4,3-7,) for pooling by 5 and 10, respectively. The prevalence of 6. 6% determined by individual testing (99 of 1. 500) was within 95% CI of the estimated prevalence for pooling by 5 and 10. The used pooling strategy has resulted in 53. 3 and 44. 0% cost savings, when endocervical samples were pooled by 5 and 10, respectively. Thus, pooling endocervical samples for detection of C. trachomatis is an accurate and cost saving approach for realization of large-scale studies.

About the authors

E. V. Shipitsina

Research Institute of Obstetrics and Gynecology named after D.O. Ott, Russian Academy of Medical Sciences; Institute of Clinical Bacteriology, Uppsala University Sweden

Author for correspondence.
Email: info@eco-vector.com
Russian Federation, Saint Petersburg; Uppsala

A. M. Savitsheva

Research Institute of Obstetrics and Gynecology named after D.O. Ott, Russian Academy of Medical Sciences; Institute of Clinical Bacteriology, Uppsala University Sweden

Email: info@eco-vector.com
Russian Federation, Saint Petersburg; Uppsala

M. A. Bashmakova

Research Institute of Obstetrics and Gynecology named after D.O. Ott, Russian Academy of Medical Sciences; Institute of Clinical Bacteriology, Uppsala University Sweden

Email: info@eco-vector.com
Russian Federation, Saint Petersburg; Uppsala

К. V. Shalepo

Research Institute of Obstetrics and Gynecology named after D.O. Ott, Russian Academy of Medical Sciences; Institute of Clinical Bacteriology, Uppsala University Sweden

Email: info@eco-vector.com
Russian Federation, Saint Petersburg; Uppsala

M. Domeika

Research Institute of Obstetrics and Gynecology named after D.O. Ott, Russian Academy of Medical Sciences; Institute of Clinical Bacteriology, Uppsala University Sweden

Email: info@eco-vector.com
Sweden, Saint Petersburg; Uppsala

References

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2002 Eсо-Vector



Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».