Разработка и апробация теста для оценки статуса эндометрия на основе технологии RNAampliSeq

Обложка


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. Примерно две трети всех неудач имплантации обусловлены нарушением рецептивности эндометрия. Отсутствие имплантации может быть связано с нарушением формирования имплантационного окна, которое встречается примерно у 25–30 % женщин с неудачами применения вспомогательных репродуктивных технологий в анамнезе. Фаза рецептивности у таких пациенток может быть сдвинута по срокам, иметь короткую продолжительность или не формироваться. В настоящий момент существует несколько коммерческих тестов для определения рецептивности эндометрия, основанных на транскриптомных данных. Однако разные тесты значительно отличаются друг от друга по набору исследуемых генов, а точный механизм рецептивности эндометрия до конца не изучен.

Цель — создание и апробация собственного теста на основе технологии RNAampliSeq для определения статуса эндометрия и окна имплантации.

Материалы и методы. Ранее нами была создана RNAampliSeq-панель, содержащая 421 ген. С ее использованием проанализирована дифференциальная экспрессия этих генов в 38 образцах эндометрия пролиферативной и рецептивной фаз.

Результаты. Исследованные образцы формируют четко различимые кластеры с рецептивным и пролиферативным эндометрием. 271 ген из нашей панели дифференциально экспрессируется в разных фазах цикла.

Заключение. Создана и апробирована модель, позволяющая четко различать пролиферативный и рецептивный эндометрий и выявлять пациенток с нарушенной физиологией менструального цикла.

Об авторах

Ольга Викторовна Малышева

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: omal99@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8626-5071
SPIN-код: 1740-2691

канд. биол. наук

Россия, Санкт-Петербург

Елена Сергеевна Вашукова

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: vi_lena@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-6996-8891
SPIN-код: 2811-8730

канд. биол. наук

Россия, Санкт-Петербург

Александр Мкртичевич Гзгзян

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: agzgzyan@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-3917-9493
SPIN-код: 6412-4801

д-р мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Ляиля Харрясовна Джемлиханова

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: dzhemlikhanova_l@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6842-4430
SPIN-код: 1691-6559

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Ксения Владимировна Объедкова

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: iagmail@ott.ru
ORCID iD: 0000-0002-2056-7907
SPIN-код: 2709-2890

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Анастасия Константиновна Попова

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: stassi1997@mail.ru
ORCID iD: 0009-0008-3512-2557
Россия, Санкт-Петербург

Александр Aнатольевич Ткаченко

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: castorfiber@list.ru
ORCID iD: 0000-0001-7985-0216
Россия, Санкт-Петербург

Мария Александровна Шалина

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Автор, ответственный за переписку.
Email: amarus@inbox.ru
ORCID iD: 0000-0002-5921-3217
SPIN-код: 6673-2660

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Мария Игоревна Ярмолинская

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: m.yarmolinskaya@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6551-4147
SPIN-код: 3686-3605

д-р мед. наук, профессор РАН

Россия, Санкт-Петербург

Андрей Сергеевич Глотов

Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта

Email: anglotov@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-7465-4504
SPIN-код: 1406-0090

д-р биол. наук

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Achache H., Revel A. Endometrial receptivity markers, the journey to successful embryo implantation // Hum. Reprod. Update. 2006. Vol. 12. No. 6. P. 731–746. doi: 10.1093/humupd/dml004
  2. Haouzi D., Dechaud H., Assou S., et al. Insights into human endometrial receptivity from transcriptomic and proteomic data // Reprod. Biomed Online. 2012. Vol. 24. No. 1. P. 23–34. doi: 10.1016/j.rbmo.2011.09.009
  3. Lessey B.A., Young S.L. What exactly is endometrial receptivity? // Fertil. Steril. 2019. Vol. 111. No. 4. P. 611–617. doi: 10.1016/j.fertnstert.2019.02.009
  4. Bai X., Zheng L., Li D., et al. Research progress of endometrial receptivity in patients with polycystic ovary syndrome: a systematic review // Reprod. Biol. Endocrinol. 2021. Vol. 19. No. 1. P. 122. doi: 10.1186/s12958-021-00802-4
  5. Enciso M., Aizpurua J., Rodríguez-Estrada B., et al. The precise determination of the window of implantation significantly improves ART outcomes // Sci. Rep. 2021. Vol. 11. No. 1. P. 3420. doi: 10.1038/s41598-021-92955-w
  6. Díaz-Gimeno P., Horcajadas J.A., Martínez-Conejero J.A., et al. A genomic diagnostic tool for human endometrial receptivity based on the transcriptomic sDiazignature // Fertil. Steril. 2011. Vol. 95. No. 1. P. 50–60. doi: 10.1016/j.fertnstert.2010.04.063
  7. Ruiz-Alonso M., Blesa D., Simón C. The genomics of the human endometrium // Biochim. Biophys. Acta. 2012. Vol. 1822. No. 12. P. 1931–1942. doi: 10.1016/j.bbadis.2012.05.004
  8. Ruiz-Alonso M., Blesa D., Díaz-Gimeno P., et al. The endometrial receptivity array for diagnosis and personalized embryo transfer as a treatment for patients with repeated implantation failure // Fertil. Steril. 2013. Vol. 100. No. 3. P. 818–824. doi: 10.1016/j.fertnstert.2013.05.004
  9. Кибанов М.В., Махмудова Г.М., Гохберг Я.А. Поиск идеального маркера для оценки рецептивности эндометрия: от гистологии до современных молекулярно-генетических подходов // Альманах клинической медицины. 2019. Т. 47. № 1. C. 12–25. doi: 10.18786/2072-0505-2019-47-005
  10. Coutifaris C., Myers E.R., Guzick D.S., et al; NICHD National Cooperative Reproductive Medicine Network. Histological dating of timed endometrial biopsy tissue is not related to fertility status // Fertil. Steril. 2004. Vol. 82. No. 5. P. 1264–1272. doi: 10.1016/j.fertnstert.2004.03.069
  11. Murray M.J., Meyer W.R., Zaino R.J., et al. A critical analysis of the accuracy, reproducibility, and clinical utility of histologic endometrial dating in fertile women // Fertil. Steril. 2004. Vol. 81. No. 5. P. 1333–1343. doi: 10.1016/j.fertnstert.2003.11.030
  12. Ruiz-Alonso M., Valbuena D., Gomez C., et al. Endometrial Receptivity Analysis (ERA): data versus opinions // Hum. Reprod. Open. 2021. Vol. 2021. No. 2. doi: 10.1093/hropen/hoab011
  13. Altmäe S., Koel M., Võsa U., et al. Meta-signature of human endometrial receptivity: a meta-analysis and validation study of transcriptomic biomarkers // Sci. Rep. 2017. Vol. 7. No. 1. P. 10077. doi: 10.1038/s41598-017-10098-3
  14. Haouzi D., Entezami F., Torre A., et al. Customized frozen embryo transfer after identification of the receptivity window with a transcriptomic approach improves the implantation and live birth rates in patients with repeated implantation failure // Reprod. Sci. 2021. Vol. 28. No. 1. P. 69–78. doi: 10.1007/s43032-020-00252-0
  15. Gómez E., Ruíz-Alonso M., Miravet J., et al. Human endometrial transcriptomics: implications for embryonic implantation // Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2015. Vol. 5. No. 7. doi: 10.1101/cshperspect.a022996
  16. Predeus A.V., Vashukova E.S., Glotov A.S., et al. Next-generation sequencing of matched ectopic and eutopic endometrium identifies novel endometriosis-related genes. Russ. J. Genet. 2018. Vol. 54. No. 11. P. 1358–1365. doi: 10.1134/S1022795418110133
  17. Altmäe S., Esteban F.J., Stavreus-Evers A., et al. Guidelines for the design, analysis and interpretation of ‘omics’ data: focus on human endometrium // Hum. Reprod. Update. 2014. Vol. 20. No. 1. P. 12–28. doi: 10.1093/humupd/dmt048
  18. Horcajadas J.A., Pellicer A., Simón C. Wide genomic analysis of human endometrial receptivity: new times. New opportunities // Hum. Reprod. Update. 2007. Vol. 13. No. 1. P. 77–86. doi: 10.1093/humupd/dml046
  19. Zhang L., Liu X., Liu J., et al. The developmental transcriptome landscape of receptive endometrium during embryo implantation in dairy goats // Gene. 2017. Vol. 633. P. 82–95. doi: 10.1016/j.gene.2017.08.026.
  20. Franasiak J.M., Burns K.A., Slayden O., et al. Endometrial CXCL13 expression is cycle regulated in humans and aberrantly expressed in humans and Rhesus macaques with endometriosis // Reprod. Sci. 2015. Vol. 22. No. 4. P. 442–451. doi: 10.1177/1933719114542011
  21. Ohye H., Sugawara M. Dual oxidase, hydrogen peroxide and thyroid diseases // Exp. Biol. Med. (Maywood). 2010. Vol. 235. No. 4. P. 424–433. doi: 10.1258/ebm.2009.009241
  22. Pathak B.R., Breed A.A., Apte S., et al. Cysteine-rich secretory protein 3 plays a role in prostate cancer cell invasion and affects expression of PSA and ANXA1 // Mol. Cell Biochem. 2016. Vol. 411. No. 1–2. P. 11–21. doi: 10.1007/s11010-015-2564-2
  23. Su M.T., Huang J.Y., Tsai H.L., et al. A common variant of PROK1 (V67I) acts as a genetic modifier in early human pregnancy through down-regulation of gene expression // Int. J. Mol. Sci. 2016. Vol. 17. No. 2. P. 162. doi: 10.3390/ijms17020162
  24. Macdonald L.J., Sales K.J., Grant V., et al. Prokineticin 1 induces Dickkopf 1 expression and regulates cell proliferation and decidualization in the human endometrium // Mol. Hum. Reprod. 2011. Vol. 17. No. 10. P. 626–636. doi: 10.1093/molehr/gar031
  25. Chen L., Xiao D., Tang F., et al. CAPN6 in disease: an emerging therapeutic target (Review) // Int. J. Mol. Med. 2020. Vol. 46. No. 5. P. 1644–1652. doi: 10.3892/ijmm.2020.4734
  26. Allegra A., Marino A., Coffaro F. et al. Is there a uniform basal endometrial gene expression profile during the implantation window in women who became pregnant in a subsequent ICSI cycle? // Hum. Reprod. 2009. Vol. 24. No. 10. P. 2549–2257. doi: 10.1093/humrep/dep222
  27. Talbi S., Hamilton A.E., Vo K.C., et al. Molecular phenotyping of human endometrium distinguishes menstrual cycle phases and underlying biological processes in normo-ovulatory women // Endocrinology. 2006. Vol. 147. No. 3. P. 1097–1121. doi: 10.1210/en.2005-1076
  28. Liu L.J., Liao J.M., Zhu F. Proliferating cell nuclear antigen clamp associated factor, a potential proto-oncogene with increased expression in malignant gastrointestinal tumors // World J. Gastrointest. Oncol. 2021. Vol. 13. No. 10. P. 1425–1439. doi: 10.4251/wjgo.v13.i10.1425
  29. Xu Z., Ye J., Bao P., et al. Long non-coding RNA SNHG3 promotes the progression of clear cell renal cell carcinoma via regulating BIRC5 expression // Transl. Cancer. Res. 2021. Vol. 10. No. 10. P. 4502–4513. doi: 10.21037/tcr-21-1802
  30. Jin Z., Peng F., Zhang C., et al. Expression, regulating mechanism and therapeutic target of KIF20A in multiple cancer // Heliyon. 2023. Vol. 9. No. 2. doi: 10.1016/j.heliyon.2023.e13195

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Приложение
Скачать (197KB)
Метаданные
3. Рис. 1. Анализ главных компонент экспрессионных профилей в образцах пролиферативного и рецептивного эндометрия

Скачать (176KB)
Метаданные
4. Рис. 2. Анализ главных компонент экспрессионных профилей в образцах эндометрия пациенток с аденомиозом и без аденомиоза

Скачать (127KB)
Метаданные
5. Рис. 3. MA-график среднего значения статистически значимо дифференциально экспрессируемых генов в образцах рецептивного и пролиферативного эндометрия (p < 0,05)

Скачать (144KB)
Метаданные
6. Рис. 4. Иерархическая кластеризация 38 образцов эндометрия. Образцы представлены по вертикали, а значения экспрессии — по горизонтали. Цвет указывает на интенсивность значений экспрессии генов (красный — высокая, синий — низкая)

Скачать (474KB)
Метаданные

© Эко-Вектор, 2023

Ссылка на описание лицензии: https://eco-vector.com/for_authors.php#07

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».