Гаплотипическое разнообразие природных популяций комаров рода Anopheles (Diptera, Culicidae) Северного Вьетнама

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Малярия на территории Вьетнама до настоящего времени остается актуальной проблемой. Видовой состав комаров рода Anopheles — основных переносчиков малярии — и численность их популяций оказывают критическое влияние на вероятность развития эпидемии. Проведен анализ изменчивости BOLD-фрагмента митохондриального гена cox1 в выборках комаров рода Anopheles на территории Северного Вьетнама. Идентифицированы комары, относящиеся к видовым комплексам Anopheles sinensis, Anopheles vagus, Anopheles barbirostris. Нуклеотидная изменчивость в пределах комплекса не превышает 2 %. Дифференциации на подвиды в пределах комплексов не выявлено. Наиболее массовым видом в сборах является Anopheles sinensis — основной переносчик возбудителя трехдневной малярии, что позволяет прогнозировать успешность местной передачи Plasmodium vivax в случае появления носителей малярии в этом районе.

Об авторах

Тхи Хыонг Ву

Московский государственный областной университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: Vuhuongmgou@gmail.com

аспирант

Россия, 141014, Московская область, г. Мытищи, ул. Веры Волошиной, д. 24

Борис Витальевич Андрианов

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: andrianovb@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-0064-4696

д-р биол. наук, ведущий научный сотрудник

Россия, 119991, г. Москва, ГСП-1, ул. Губкина, 3

Татьяна Викторовна Горелова

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова

Email: tagor08@mail.ru

канд. биол. наук, старший научный сотрудник

Россия, 119991, г. Москва, ГСП-1, ул. Губкина, 3

Михаил Иванович Гордеев

Московский государственный областной университет

Email: gordeev_mikhail@mail.ru

д-р биол. наук, заведующий кафедрой

Россия, 141014, Московская область, г. Мытищи, ул. Веры Волошиной, д. 24

Список литературы

  1. Fang Y, Shi WQ, Zhang Y. Molecular phylogeny of Anopheles hyrcanus group members based on ITS2 rDNA. Parasit Vectors. 2017;10(1):417. doi: 10.1186/s13071-017-2351-x.
  2. Fang Y, Shi WQ, Zhang Y. Molecular phylogeny of Anopheles hyrcanus group (Diptera: Culicidae) based on mtDNA COI. Infect Dis Poverty. 2017;6(1):61. doi: 10.1186/s40249-017-0273-7.
  3. Zhang HG, Lv MH, Yi WB, et al. Species diversity can be overestimated by a fixed empirical threshold: insights from DNA barcoding of the genus Cletus (Hemiptera: Coreidae) and the meta-analysis of COI data from previous phylogeographical studies. Mol Ecol Resour. 2017;17(2):314-323. doi: 10.1111/1755-0998.12571.
  4. Hebert PD, Cywinska A, Ball SL, deWaard JR. Biological identifications through DNA barcodes. Proc Biol Sci. 2003;270(1512):313-321. doi: 10.1098/rspb.2002.2218.
  5. Khrabrova NV, Andreeva YV, Sibataev AK, et al. Mosquitoes of Anopheles hyrcanus (Diptera, Culicidae) Group: Species Diagnostic and Phylogenetic Relationships. Am J Trop Med Hyg. 2015;93(3):619-622. doi: 10.4269/ajtmh.14-0207.
  6. Wang G, Li C, Guo X, et al. Identifying the main mosquito species in China based on DNA barcoding. PLoS One. 2012;7(10): e47051. doi: 10.1371/journal.pone.0047051.
  7. Cywinska A, Hunter FF, Hebert PD. Identifying Canadian mosquito species through DNA barcodes. Med Vet Entomol. 2006;20(4):413-424. doi: 10.1111/j.1365-2915.2006.00653.x.
  8. Chan A, Chiang LP, Hapuarachchi HC, et al. DNA barcoding: complementing morphological identification of mosquito species in Singapore. Parasit Vectors. 2014;7:569. doi: 10.1186/s13071-014-0569-4.
  9. Feng X, Huang L, Lin L, et al. Genetic diversity and population structure of the primary malaria vector Anopheles sinensis (Diptera: Culicidae) in China inferred by cox1 gene. Parasit Vectors. 2017;10(1):75. doi: 10.1186/s13071-017-2013-z.
  10. Choochote W, Min GS, Intapan PM, et al. Evidence to support natural hybridization between Anopheles sinensis and Anopheles kleini (Diptera: Culicidae): possibly a significant mechanism for gene introgression in sympatric populations. Parasit Vectors. 2014;7:36. doi: 10.1186/1756-3305-7-36.
  11. Liang J, Sharakhova MV, Lan Q, et al. A standard cytogenetic map for Anopheles sinensis and chromosome arm homology between the subgenera Anopheles and Cellia. Med Vet Entomol. 2014;28 Suppl 1:26-32. doi: 10.1111/mve.12048.
  12. Liang J, Cheng B, Zhu G, et al. Structural divergence of chromosomes between malaria vectors Ano pheles lesteri and Anopheles sinensis. Parasit Vectors. 2016;9(1):608. doi: 10.1186/s13071-016-1855-0.
  13. Dhiman S, Yadav K, Rabha B, et al. Evaluation of Insecticides Susceptibility and Malaria Vector Potential of Anopheles annularis s. l. and Anopheles vagus in Assam, India. PLoS One. 2016;11(3): e0151786. doi: 10.1371/journal.pone.0151786.
  14. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. – М.: Мир, 1984. [Maniatis T, Fritch EF, Sambrook J. Molecular cloning. Moscow: Mir; 1984. (In Russ.)]
  15. Sinka ME, Bangs MJ, Manguin S, et al. The dominant Anopheles vectors of human malaria in the Asia-Pacific region: occurrence data, distribution maps and bionomic precis. Parasit Vectors. 2011;4:89. doi: 10.1186/1756-3305-4-89.
  16. Folmer O, Black M, Hoeh W, et al. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Mol Mar Biol Biotechnol. 1994;3(5):294-299.
  17. Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets. Mol Biol Evol. 2016;33(7):1870-1874. doi: 10.1093/molbev/msw054.
  18. Leigh JW, Bryant D, Nakagawa S. popart: full-feature software for haplotype network construction. Methods Ecol Evol. 2015;6(9):1110-1116. doi: 10.1111/2041-210x.12410.
  19. Clement M, Posada D, Crandall KA. TCS: a computer program to estimate gene genealogies. Mol Ecol. 2000;9(10):1657-1659. doi: 10.1046/j.1365-294x.2000.01020.x.
  20. Gu ZC, Shang LY, Chen JS, et al. The role of Anopheles anthropophagus in malaria transmission in Xinyang City of Henan Province. Zhongguo Ji Sheng Chong Xue Yu Ji Sheng Chong Bing Za Zhi. 2001;19(4):221-224.
  21. Zhu G, Xia H, Zhou H, et al. Susceptibility of Ano pheles sinensis to Plasmodium vivax in malarial outbreak areas of central China. Parasit Vectors. 2013;6:176. doi: 10.1186/1756-3305-6-176.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Кладограмма комаров рода Anopheles, полученная на основе анализа изменчивости фрагмента гена cox1 длиной 649 п. н. На ветвях филограммы приведены имена образцов. Филограмма Neighbor-Joining построена с помощью метода (p-dis tance) с bootstrap-поддержкой — 1000 реплик в программе MEGA 7. Место сбора образца помечено фигурой перед именем: Лаокай, Шонла, Иэньбай, Куангнинь, Бакзянг. Описание образцов ДНК комаров, характеризующих индивидуальных особей, приведено в табл. 1. Дерево построено по методу ближайших соседей (NJ). Величина бутстрэп-поддержки кластеризации таксонов указана рядом с узлами филограммы. Дерево построено в масштабе — число нуклеотидных замен на сайт. Длина контрольного отрезка соответствует 1 % нуклеотидной изменчивости. В качестве контроля приведены нуклеотидные последовательности комаров Anopheles из группы hyrcanus и видовых комплексов Anopheles vagus и Anopheles barbirostris. Для выделения этих последовательностей на филограмме показаны GenBank ID. В качестве внешней группы взята последовательность cox1 Drosophila yakuba

Скачать (71KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Медианная сеть митохондриальных гаплотипов An. Cinensis, построенная в программе PopArt на основании нуклеотидного полиморфизма фрагмента гена cox1 длиной 649 п. н. Штрихи отмечают мутационные события. Размер кружков пропорционален числу синонимичных гаплотипов

Скачать (106KB)
Метаданные

© Ву Т., Андрианов Б.В., Горелова Т.В., Гордеев М.И., 2018

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах