Генетическая структура популяций особоохраняемого вида проломника козо-полянского (Androsace kozo-poljanskii Ovсz.) в условиях юга Среднерусской возвышенности на основе ДНК-маркеров

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

На основе ДНК-маркеров (ISSR) изучено состояние генофондов десяти популяций (438 особей) особоохраняемого реликтового вида растений проломника козо-полянского (Androsace kozo-poljanskii Ovсz. seu Androsace villosa subsp. koso-poljanskii Fed.) в условиях юга Среднерусской возвышенности. Полученные данные демонстрируют низкий уровень генетической гетерогенности популяций (Ish = 0,217 ± 0,011; He = 0,131 ± 0,007), а также, несмотря на географическую изоляцию, слабую степень их генетической разобщенности (Фst = 0,136, Gst = 0,091). Анализ мультилокусных генотипов (методами Chao1-bc и 1st order jackknife) позволил выявить группы с потенциально большим и низким количеством генетических комбинаций. Отмечена низкая корреляция между логарифмами уровня потока генов и географических дистанций между популяциями (r = -0,276 ± 0,141), что свидетельствует о нарушении модели изоляции расстоянием и усилении роли стабилизирующего отбора. Выдвигается гипотеза о преимущественном расселении изучаемого вида в прошлом по речным долинам. Значения эффективной численности (Ne), вычисленные на основе индексов подразделенности и уравнения регрессии, находились в диапазоне 4,9-20,4 особи.

Об авторах

Эдуард Анатольевич Снегин

Белгородский государственный национальный исследовательский университет

Email: snegin@bsu.edu.ru
д-р биол. наук, доцент, заведующий кафедрой экологии, физиологии и биологической эволюции

Елена Андреевна Снегина

Белгородский государственный национальный исследовательский университет

Email: sneginа@bsu.edu.ru
лаборант кафедры экологии, физиологии и биологической эволюции

Татьяна Александровна Новомлинская

Белгородский государственный национальный исследовательский университет

Email: sneginа@bsu.edu.ru
магистрант кафедры экологии, физиологии и биологической эволюции

Список литературы

  1. Виноградов Н.П., Голицын С.В. «Сниженные Альпы» и тимьянники Среднерусской возвышенности // Ботанический журн. - 1954. - Т. 39. - № 3. - С. 423-430. [Vinogradov NP, Golitsyn SV. Snizhennye-alpy-i-timyanniki-srednerusskoj-vozvyshennosti. Botanical Journal. 1954;39(3):423-430. (In Russ).]
  2. Голицын С.В. К флоре восточного крыла Верхнего Поосколья // Ботанический журнал СССР. - 1956. - № 10. - С. 1428-1438. [Golitsyn SV. To the flora of the eastern wing of the Upper Prioskolie. Botanical Journal of the USSR. 1956(10):1428-1438. (In Russ).]
  3. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях / Под ред. Ю.П. Алтухова. - М.: Наука, 2004. [The population dynamics of the gene pools in the anthropogenic impacts. Ed by Y.P. Altukhova. Moscow: Nauka; 2004. (In Russ).]
  4. Шмальгаузен И.И. Факторы эволюции. Теория стабилизирующего отбора. - М.: Наука, 1968. [Shmal’gauzen II. The factors of evolution. The theory of stabilizing selection. Moscow: Nauka; 1968. (In Russ).]
  5. Burnham KP, Overton WS. Estimation of the size of a closed population when capture probabilities vary among animals. Biometrika. 1978;(65):625-633.
  6. Chao A. Species richness estimation. In: Balakrishnan N, Read CB, Vidakovic B, editors. Encyclopedia of Statistical Science. New York: Wiley; 2005. P. 7907-7916.
  7. Chao А, Shen T-J. SPADE. 2009. http://chao.stat.nthu.edu.tw.
  8. Excoffier L, Smouse PE, Quattro JM. Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics. 1992;(131):479-491.
  9. Ewens W. The sampling theory of selectively neutral alleles. Theor Pop Biol. 1972;(3):87-112.
  10. Manly BFJ. The Statistics of Natural Selection on Animal Populations. London: Chapman and Hall; 1985.
  11. Nei M. Genetic distance between populations. The American Naturalist. 1972;106(949):283-292.
  12. Nei M. Molecular population genetics and evolution. Amsterdam;1975.
  13. Peakall R, Smouse PE. GenAlEx V5: Genetic Analisis in Excel. Population genetic software for teaching and reseach. Australion National University, Canberra, Australia. 2001. http://www.anu.edu.au./BoZo/GenAlEx/.
  14. Slatkin M. Isolation by distance in equilibrium and non - equilibrium populations. Evolution. 1993;47(1):294-279.
  15. Silvertown J, Lovett Doust J. Introduction to plant population biology. Blackwell Scientific. Oxford; 1993; 210 p.
  16. Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution. 2011. http://www.kumarlab.net/publications.
  17. Watterson G. The homozygosity test of neutrality. Genetics. 1978;88:405-417.
  18. Wright S. Isolation by distance. Genetics. 1943;28:114-138.
  19. Wright S. The genetical structure of populations. Ann. Eugenics. 1951;(15):323-354.
  20. Yeh FC, Yang R, Boyle TJ, et al. POPGENE 32, Microsoft Window-based Freeware for Population Genetic Analysis, Version 1.32; Molecular Biology and Biotechnology Centre, University of Alberta: Edmonton, Canada. 2000. http://www.ualberta.ca/~fyeh/popgene_download.html.
  21. Zietkiewicz E, Rafalski A, Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) - anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. 1994;20(2):176-181.

© Снегин Э.А., Снегина Е.А., Новомлинская Т.А., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах