Сверхэкспрессия генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенные транскрипционныефакторы, вызывает нонсенс-супрессиюу дрожжей Saccharomyces cerevisiae
- Авторы: Нижников А.А.1, Кондрашкина А.М.2, Антонец К.С.2, Галкин А.П.1
-
Учреждения:
- Санкт-Петербургский филиал Института общей генетики им. Н. И. Вавилова (Российская академия наук)
- СПбГУ
- Выпуск: Том 11, № 1 (2013)
- Страницы: 49-58
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/article/view/2395
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen11149-58
- ID: 2395
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ключевые слова
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Антон Александрович Нижников
Санкт-Петербургский филиал Института общей генетики им. Н. И. Вавилова (Российская академия наук)
Email: ant.nizhnikov@gmail.com
м. н. с., лаборатория генетического моделирования заболеваний человека и животных, аспирант кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ
Александра Михайловна Кондрашкина
СПбГУ
Email: alex_sandra2502@mail.ru
студент кафедры генетики и биотехнологии
Кирилл Сергеевич Антонец
СПбГУ
Email: kir_ant@mail.ru
студент кафедры генетики и биотехнологии. СПбГУ
Алексей Петрович Галкин
Санкт-Петербургский филиал Института общей генетики им. Н. И. Вавилова (Российская академия наук)
Email: apgalkin@mail.ru
к. б. н., заведующий лабораторией генетического моделирования заболеваний человека и животных, заместитель директора
Список литературы
- Захаров И. А., Кожин С. А., Кожина Т. Н., Фёдорова И. В, 1984. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов // Л.: Наука., 143 с.
- Инге-Вечтомов С. Г., Адрианова В. М., 1970. Рецессивные суперсупрессоры дрожжей //Генетика. Т. 6. С. 103–115.
- Инге-Вечтомов С. Г., Тиходеев О. Н., Карпова Т. С., 1988. Селективные системы для получения рецессивных рибосомных супрессоров у дрожжей-сахаромицетов // Генетика. Т. 24. С. 1159–1165.
- Нижников А. А., Магомедова З. М., Сайфитдинова А. Ф. и др., 2011. Выявление генов, кодирующих потенциально амилоидогенные белки, участвующих в регуляции нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Эколог. генетика. Т. 9. С. 79–86.
- Рубель А. А., Сайфитдинова А. Ф., Лада А. Г. и др., 2008. Дрожжевой шаперон Hsp104 регулирует экспрессию генов на посттранскрипционном уровне //Мол. биол. Т. 42. № 1. С. 123–130.
- Alberti S., Halfmann R., King O. et al., 2009. A systematic survey identifies prions and illuminates sequence features of prionogenic proteins // Cell. Vol. 137. P. 146–158.
- Benn C. L., Sun T., Sadri-Vakili G. et al., 2008. Huntingtin modulates transcription, occupies gene promoters in vivo, and binds directly to DNA in a polyglutamine-dependent manner // J. Neurosci. Vol. 28. P. 10720–10733.
- Chernoff Y. O., Newnam G. P., Kumar J. et al., 2012. Evidence for a “protein mutator” in yeast: role of the Hsp70-related chaperone Ssb in formation, stability and toxicity of the [PSI] prion // Mol. Cell. Biol. Vol. 19. P. 8103–8112.
- Chiti F., Dobson C. M., 2006. Protein misfolding, functional amyloid, and human disease // Ann. Rev. Biochem. Vol. 75. P. 333–366.
- Cong S. Y., Pepers B. A., Zhou T. T. et al., 2012. Huntingtin with an expanded polyglutamine repeat affects the Jab1-p27 (Kip1) pathway // Neurobiol. Dis. Vol. 46. P. 673–681.
- Crow E. T., Li L., 2011. Newly identified prions in budding yeast, and their possible functions // Semin. Cell Dev. Biol. Vol. 22. P. 452–459.
- Dagkessamanskaya A., Ter-Avanesyan M., Mager W. H., 1997. Transcriptional regulation of SUP35 and SUP45 in Saccharomyces cerevisiae // Yeast. Vol. 13. P. 1265–1274.
- Derkatch I. L., Bradley M. E., Hong J. Y., Liebman S. W., 2001. Prions affect the appearance of other prions: The story of [PIN] // Cell. Vol. 106. P. 171–182.
- Derkatch I. L., Bradley M. E., Zhou P. et al., 1997. Genetic and environmental factors affecting the de novo appearance of the [PSI+] prion in Saccharomyces cerevisiae // Genetics. Vol. 147. P. 507–519.
- Hanahan D., 1985. DNA Cloning: A Practical Approach. // IRL Press, 109 p.
- Harrison P. M., Gerstein M., 2003. A method to assess compositional bias in biological sequences and its application to prion-like glutamine/asparagine-rich domains in eukaryotic proteomes // Genome Biology. Vol. 4. E. 40.
- Kaiser C., Michaelis S., Mitchell A., 1994. Methods in yeast genetics // NY: Cold Spring Harbor Lab. Press, 364 p.
- Lee T. I., Rinaldi N. J., Robert F. et al., 2002. Transcriptional regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae // Science. Vol. 298. P. 799–804.
- Nizhnikov A. A., Magomedova Z. M., Rubel A. A. et al., 2012. [NSI+] determinant has a pleiotropic phenotypic manifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes // Curr. Genetics. Vol. 58. P. 35–47.
- Ong W., Ibrahim M., Town M., Johnson J., 1997. Functional differences among the six Saccharomyces cerevisiae tRNATrp genes // Yeast. Vol. 13. P. 1357–1362.
- Ono B., Yoshida R., Kamiya K., Sugimoto T., 2005. Suppression of termination mutations caused by defects of the NMD machinery in Saccharomyces cerevisiae // Genes Genet. Syst. Vol. 80. P. 311–316.
- Osherovich L. Z., Weissman J. S., 2001. Multiple Gln/Asn-rich prion domains confer susceptibility to induction of the yeast [PSI+] prion // Cell. Vol. 106. P. 183–194.
- Rogoza T., Goginashvili A., Rodionova S. et al., 2010. Non-Mendelian determinant [ISP+] in yeast is a nuclear-residing prion form of the global transcriptional regulator Sfp1 // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 107. P. 10573–10577.
- Saifitdinova A. F., Nizhnikov A. A., Lada A. G. et al., 2010. [NSI+]: a novel non-Mendelian suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae. Curr. Genet. Vol. 56. P. 467–478.
- Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T., 1989. Molecular cloning. A laboratory manual // N. Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press., 1626 p.
- Sherman F., Fink G. R., Hancks J. B., 1986. Methods in yeast genetics // N. Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press., 367 p.
- Stansfield I., Jones K. M., Kushnirov V. V. et al., 1995. The products of the SUP45 (eRF1) and SUP35 genes interact to mediate translation termination in Saccharomyces cerevisiae // EMBO J. Vol. 14. P. 4365–4373.
- Ter-Avanesyan M. D., Dagkesamanskaya A. R., Kushnirov V. V., Smirnov V. N., 1994. The SUP35 omnipotent suppressor gene is involved in the maintenance of the non-Mendelian determinant [PSI+] in the yeast Sacchoromyces cerevisiae // Genetics. Vol. 137. P. 671–676.
- Weiss W. A., Edelman I., Culbertson M. R., Friedberg E. C., 1987. Physiological levels of normal tRNA (CAGGln) can effect partial suppression of amber mutations in the yeast Saccharomyces cerevisiae // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 84. P. 8031–8034.
- Wickner R. B., 1994. [URE3] as an altered Ure2 protein: evidence for a prion analog in Saccharomyces cerevisiae // Science. Vol. 264. P. 566–569.
- Workman C. T., Mac H. C., McCuine S., 2006. A systems approach to mapping DNA damage response pathways // Science. Vol. 19. P. 1054–1059.
- Zhouravleva G., Frolova L., Le Goff X. et al., 1995. Termination of translation in eukaryotes is governed by two interacting polypeptide chain release factors, eRF1 and eRF3 // EMBO J. Vol. 14. P. 4065–4072.