Междисциплинарные подходы для решения задач селекции и генетики растений: к юбилею академика Н.А. Колчанова

Обложка
  • Авторы: Хлесткина Е.К.1,2, Хлесткин В.К.2,3
  • Учреждения:
    1. Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова
    2. Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук
    3. Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных — филиал Федерального исследовательского центра животноводства — ВИЖ им. акад. Л.К. Эрнста
  • Выпуск: Том 20, № 1 (2022)
  • Страницы: 61-68
  • Раздел: Методология экологической генетики
  • URL: https://journals.rcsi.science/ecolgenet/article/view/105794
  • DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen105794
  • ID: 105794

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Николай Александрович Колчанов известен в первую очередь как основатель российской биоинформатики и системной компьютерной биологии, признанный специалист мирового уровня в этом направлении. Отличительные особенности стратегии, выбранной академиком Колчановым в отношении фундаментальных и практических задач, — это комплексный взгляд на проблему и умение сформировать междисциплинарную команду для ее решения. Краткий обзор посвящен системному практико-ориентированному подходу в области генетики, геномики, биоинформатики и селекции растений, которым в деятельности Н.А. Колчанова уделено особое внимание в последние годы. Отражена взаимосвязь этой деятельности с утверждением значимых правовых актов в области генетики. Приводятся аналитические срезы публикационной активности коллективов, вовлеченных в эту деятельность, отражающие время активного развития новых трендов и мультидисциплинарный характер исследований.

Об авторах

Елена Константиновна Хлесткина

Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова; Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: director@vir.nw.ru
ORCID iD: 0000-0002-8470-8254
SPIN-код: 3061-1429
Scopus Author ID: 6603368411
ResearcherId: T-2734-2017

д-р биол. наук, профессор, директор

Россия, Санкт-Петербург; Новосибирск

Вадим Камильевич Хлесткин

Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук; Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных — филиал Федерального исследовательского центра животноводства — ВИЖ им. акад. Л.К. Эрнста

Email: khlestkin@bionet.nsc.ru
ORCID iD: 0000-0001-9605-8028
SPIN-код: 6367-2970
Scopus Author ID: 56368129500

канд. хим. наук, директор

Россия, Новосибирск; г. Пушкин, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Heinemeyer T., Wingender E., Reuter I., et al. Databases on transcriptional regulation: TRANSFAC, TRRD and COMPEL // Nucleic Acids Res. 1998. Vol. 26, No. 1. P. 362–367. doi: 10.1093/nar/26.1.362
  2. Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., et al. Transcription Regulatory Regions Database (TRRD): its status in 2000 // Nucleic Acids Res. 2000. Vol. 28, No. 1. P. 298–301. doi: 10.1093/nar/28.1.298
  3. Ivanisenko V.A., Pintus S.S., Grigorovich D.A., Kolchanov N.A. PDBSiteScan: a program for searching for active, binding and posttranslational modification sites in the 3D structures of proteins // Nucleic Acids Res. 2004. Vol. 32, No. S2. P. W549–W554. doi: 10.1093/nar/gkh439
  4. Ivanisenko V.A., Pintus S.S., Grigorovich D.A., Kolchanov N.A. PDBSite: a database of the 3D structure of protein functional sites // Nucleic Acids Res. 2005. Vol. 33, No. S1. P. D183–D187. doi: 10.1093/nar/gki105
  5. Kolpakov F.A., Ananko E.A., Kolesov G.B., Kolchanov N.A. GeneNet: a gene network database and its automated visualization // Bioinformatics. 1998. Vol. 14, No. 6. P. 529–537. doi: 10.1093/bioinformatics/14.6.529
  6. Ananko E.A., Podkolodny N.L., Stepanenko I.L., et al. GeneNet: a database on structure and functional organisation of gene networks // Nucleic Acids Res. 2002. Vol. 30, No. 1. P. 398–401. doi: 10.1093/nar/30.1.398
  7. bionet.nsc.ru [интернет]. Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: https://www.bionet.nsc.ru/
  8. nrckigc.ru [интернет]. Курчатовский геномный центр [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: https://nrckigc.ru/
  9. docs.cntd.ru. Электронный фонд правовых и нормативно-технических документов [интернет]. Письмо ФАНО России от 14 июля 2016 года № 007-18.2-11/МК-502 [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: https://docs.cntd.ru/document/456079505/
  10. ckp-rf.ru [интернет]. Научно-технологическая инфраструктура Российской Федерации: центры коллективного пользования научным оборудованием и уникальные научные установки [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: https://ckp-rf.ru/
  11. pm.cytogen.ru [интернет]. Проектный офис управления биоресурсными коллекциями [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: http://pm.cytogen.ru/
  12. Лашин С.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., и др. Информационная система по биоресурсным коллекциям институтов ФАНО России // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2018. Т. 22, № 3. С. 386–393. doi: 10.18699/VJ18.360
  13. Колчанов Н.А. Биоресурсные коллекции институтов Министерства науки и высшего образования: опыт инвентаризации и развития // Сборник тезисов Международного конгресса «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы»; Июнь 18–22, 2019. Санкт-Петербург: Издательство ВВМ, 2019. С. 399. Режим доступа: https://events.spbu.ru/eventsContent/events/2018/vogis/VII%20VSGB%20Congress%20Abstracts%202019.pdf
  14. minobrnauki.gov.ru [интернет]. Протокол № 2021-1930-ФП5-9/3 [дата обращения: 29.12.2021]. Доступ по ссылке: https://minobrnauki.gov.ru/upload/iblock/72e/ezs426e0fpjhm3tdytbpgx01rubwklr3.PDF
  15. Хлесткина Е.К. Генетические ресурсы России: от коллекций к биоресурсным центрам // Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2022. Т. 183, № 1. С. 9–30. doi: 10.30901/2227-8834-2022-1-9-30
  16. Колчанов Н.А., Кочетов А.В., Салина Е.А., и др. Состояние и перспективы использования маркер-ориентированной и геномной селекции растений // Вестник Российской академии наук. 2017. Т. 87, № 4. С. 348–354. doi: 10.7868/S0869587317040107
  17. Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G., et al. A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root // BMC Syst Biol. 2010. Vol. 4. ID98. doi: 10.1186/1752-0509-4-98
  18. Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Novoselova E.S., et al. Combined in silico / in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance // Ann Bot. 2012. Vol. 110, No. 2. P. 349–360. doi: 10.1093/aob/mcs069
  19. Omelyanchuk N.A., Wiebe D.S., Novikova D.D., et al. Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots // Sci Rep. 2017. Vol. 7. ID2489. doi: 10.1038/s41598-017-02476-8
  20. Genaev M.A., Doroshkov A.V., Pshenichnikova T.A., et al. Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image-processing technique // Planta. 2012. Vol. 236. P. 1943–1954. doi: 10.1007/s00425-012-1751-6
  21. Слынько Н.М., Горячковская Т.Н., Шеховцов С.В., и др. Биотехнологический потенциал новой технической культуры — мискантус сорт Сорановский // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17, № 4/1. P. 765–771.
  22. Khlestkin V.K., Peltek S.E., Kolchanov N.A. Review of direct chemical and biochemical transformations of starch // Carbohydr Polym. 2018. Vol. 181. P. 460–476. doi: 10.1016/j.carbpol.2017.10.035
  23. Хлесткин В.К., Пельтек С.Е., Колчанов Н.А. Гены-мишени для получения сортов картофеля (Solanum tuberosum L.) с заданными свойствами крахмала (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2017. Т. 52, № 1. С. 25–36. doi: 10.15389/agrobiology.2017.1.25eng

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Распределение публикаций Н.А. Колчанова по отраслям знаний (по версии Web of Science). Доступ по ссылке: https://www.webofscience.com/wos/woscc/basic-search. Дата обращения: 31.12.2021

Скачать (139KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Динамика публикационной активности ИЦиГ СО РАН по направлению биоинформатики растений (а) и индивидуальный авторский вклад в эту публикационную активность (b): поиск в базе данных Scopus по алгоритму AF-ID (Institute of Cytology and Genetics Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences 60068684) AND ( ( plant ) ) AND ( bioinformatics ). Доступ по ссылке: https://www.scopus.com/. Дата обращения: 29.12.2021

Скачать (94KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Динамика публикационной активности ИЦиГ СО РАН по исследованию картофеля (a) и распределение публикаций по отраслям знаний (b): поиск в базе данных Scopus по алгоритму AF-ID ( Institute of Cytology and Genetics Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences 60068684 ) AND ( potato ). Режим доступа: https://www.scopus.com/. Дата обращения: 29.12.2021

Скачать (108KB)
Метаданные
5. Рис. 4. Академик Н.А. Колчанов на демонстрационных посевах картофеля во время Объединенного научного мероприятия Научно-практическая конференция «Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля» (31.07–01.08.2017) и «День поля: Эколого-географическое и производственное испытание новых сортов картофеля» (01.08–02.08.2017), проводимого в Новосибирске в рамках подготовки подпрограммы «Развитие селекции и семеноводства картофеля в Российской Федерации» Федеральной научно-технической программы развития сельского хозяйства на 2017–2025 годы». (Фото любезно предоставлено В.С. Ковалем, ИЦиГ СО РАН.)

Скачать (195KB)
Метаданные

© ООО "Эко-Вектор", 2022


 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах