Increase of efficiency of QSAR — the analysis of carcinogenic activity of halogeneted hydrocarbons


Cite item

Full Text

Abstract

The new principle of analysis of structureactivity of carcinogenic compounds is offered. It is basis on use a compound structural descriptors representing a combination untied among themselves of structural fragments of a molecule. The computer program is developed, allowing to generate every possible structural fragments of molecules of chemical compounds and their  combinations and to carry out selection of the compound descriptors statistically significantly influencing their biological activity. In work it is used the samples consisting of 89 halogeneted hydrocarbons for which their carcinogenic activity on rodents is investigated.

About the authors

Aleksey V Tarasov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Serikbay K Abilev

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Email: serikbai@mail.ru

Ramis M Velibekov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Valentin A Tarasov

N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS, Moscow, RF

Email: vat.vigg@mail.ru

References

  1. Худолей В.В. Канцерогены: характеристики, закономерности, механизмы действия. -СПб.: НИИ Химии СПбГУ, 1999. -419 с.
  2. Cunningham A.R., Klopman G., Rosenkranz H.S. Iden ti fi cation of structural features and associated mechanisms of action for car cinogens in rats//Mutation Res. -1998. -Vol. 405. -P. 9-28.
  3. Rosenkranz H.S., Cunningham A.R., Klopman G. Identi fi cation of 2D geometric descriptor associated with nongenotoxic car ci nogens and estrogens and antiestrogens//Mutagenesis. -1996. -Vol. 11. -P. 95-100.
  4. Харчевникова Н.В., Жолдакова З.И., Журков В.С. Теоретическое обоснование связи структура-генотоксичность для млекопитающих и бактерий в ряду галогензамещенных алифатических соединений с короткой цепью//Вестн. РАМН. -1997. -№ 12. -С. 8-13.
  5. Hansch C., Leo A. QSAR. Part I. Fundamentals and applications in chemistry and biology//American. Chem. Soc. -Washington, D, 1995.
  6. Fujita T. Recent success stories leading to commercializable bio active compounds with the aid of traditional QSAR procedures//QSAR. -1997. -Vol. 16. -P. 107-112.
  7. Benigni R. The first US National Toxicology Program com pa ra tive exercise on the prediction of rodent carcinogenicity: de fi ni ti ve results//Mutation Res. -1997. -Vol. 387. -P. 35-45.
  8. Benigni R., Zito R. The second National Toxicology Program com parative exercise on the prediction of rodent car ci no ge ni ci ty: definitive results//Mutation Res. -2004. -Vol. 566. -P. 49-63.
  9. Тарасов В.А., Асланян М.М., Абилев С.К. Принципы формализованной количественной оценки опасности химических соединений для человека//Генетика. -1999. -Т. 35. -С. 1585-1599.
  10. Тарасов В.А., Тарасов А.В., Любимова И.К., Асланян М.М. Проблема количественной оценки опасности химических соединений в генетической токсикологии//Усп. совр. биол. -2002.-Т. 122, № 2. -С. 136-147.
  11. Баскин И.И., Палюлин В.А. Зефиров Н.С. Применение искусственных нейронных сетей в химических и биохимических исследованиях//Вестн. Моск. ун-та. Сер. 2: Химия. -1999. -Т. 40, № 5. -С. 323-326.
  12. Баскин И.И., Гальберштам Н.М., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. NASAWIN -программный комплекс для изучения соотношения структура-свойство в химии//Тр. VII Всерос. конф. «Нейрокомпьютеры и их применение» с Международным участием. -М., 2001. -С. 419-422.
  13. Klopman G., Frierson M., Rosenkranz H. The structural basis of the mutagenicity of chemicals in Salmonella typhimurium: The Gene-Tox Data Base//Mutation Res. -1990. -Vol. 128. -P 1-50.
  14. Klopman G., Rozenkranz H.S. Approaches to SAR in car ci no ge nesis and mutagenesis. Prediction of carcinogenicity/mutagenicity using MULTICASE//Mutation Res. -1994. -Vol. 305. -P. 33-46.
  15. Benigni R., Passerini L. Carcinogenicity of the aromatic amines: from the structure-activity relationships to mechanisms of ac tion and risk assessment//Mutation Res. -2002. -Vol. 511. -P. 191-203.
  16. Tuppurainen K., Lotjonen S., Laatikainen R., Vartiainen T., Maran U., Strandberg M., Tamm T. About the mutagenicity of chlorine-substituted furanones and halopropenales. A QSAR study using molecular orbital indices//Mutation Res. -1991. -Vol. 247. -P. 97-102

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2005 Tarasov A.V., Abilev S.K., Velibekov R.M., Tarasov V.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».