A study of genetic markers of human height


Cite item

Full Text

Abstract

A population study of polymorphisms of EFEMP1, ZBTB38, HHIP, LCORL, ADAMTSL3, CDH13, JAZF1, IGF1R, GHSR, CABLES1, IFNG, VDR3, and IGFBP3 genes, which possibly influence human height, was carried out using PCR-RFLP. Population frequencies of alleles and genotypes for these genes were established. A correlation between the rs572169 variant of GSHR gene and male height was found . We suggest a model for prediction of human height on the basis of logistic regression method. The obtained data indicate a possibility to assess human height on the basis of genetic markers.

About the authors

Andrey S Glotov

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: anglotov@mail.ru

Elena S Vashukova

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: vi_lena@list.ru

Oleg S Glotov

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: olglotov@mail.ru д. 3

Roman V Kurilov

Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF

Email: roma.kur@gmail.com

Irina V Tarkovskaia

Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF

Email: irena.88@inbox.ru

Ekaterina Y Ditkina

LLC BioGlot, St. Petersburg, RF

Email: 197341, Санкт-Петербург, Коломяжский пр., д. 28, к. 2, пом. 31-Н, лит. А

Irina V Pugacheva

LLC BioGlot, St. Petersburg, RF

Email: 197341, СПб, Коломяжский пр., д. 28, к. 2, пом. 31-Н, лит. А

Olga L Belonog

LLC BioGlot, St. Petersburg, RF

Email: 197341, СПб, Коломяжский пр., д. 28, к. 2, пом. 31-Н, лит. А

Irina A Makhrova

LLC BioGlot, St. Petersburg, RF

Email: 197341, Санкт-Петербург, Коломяжский пр., д. 28, к. 2, пом. 31-Н, лит. А

Vladimir S Pakin

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: iagmail@ott.ru

Mikhail V Aseev

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: micas@mail.ru

Tatyana E Ivashchenko

D.O. Ott Research Institute of Obstetrics, Gynecology and Reproductology , Saint-Petersburg, RF

Email: tivashchenko2011@mail.ru

References

  1. Аульченко Ю. С., 2010. Разработка и применение методов полногеномного анализа генетических ассоциаций сложных признаков: Докт. дис. Новосибирск, 291 c.
  2. Баранов В. С., 2009. Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины. СПб: Изд-во Н-Л. 528 с.
  3. Инге-Вечтомов С. Г., 2010. Генетика с основами селекции. СПб.: Изд-во Н-Л. 720 с.
  4. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Д., 1984. Молекулярное клонирование. М.: Мир. 480 с.
  5. Budowle B., van Daal A., 2008. Forensically relevant SNP classes // BioTechniques 25th Anniversary. Vol. 44. N 5. P. 603–610.
  6. Gudbjartsson D., Walters G., Thorleifsson G. et al., 2008. Many sequence variants affecting diversity of adult human height // Nat. Genet. Vol. 40. P. 609–615.
  7. Lettre G., Jackson A., Gieger C. et al., 2008. Identification of ten loci associated with height highlights new biological pathways in human growth // Nat. Genet. Vol. 40. P. 584–591.
  8. Liu F., van Duijn K., Vingerling J. R. et al., 2010. Eye color and the prediction of complex phenotypes from genotypes // Current Biology. Vol. 19. N 5. P. 192–193.
  9. McCullagh P., Nelder J., 1989. Generalized Linear Models. Second Edition. — Chapman & Hall / CRC. 512 P.
  10. Pritchard J. K., 2001. Are rare variants responsible for susceptibility to complex disease? // Am. J. Hum. Genet. Vol. 69. P. 124–137.
  11. Reich D. E., Lander E. S., 2001. On the allelic spectrum of human disease // Trends Genet. Vol. 17. N 9. P. 502–510.
  12. Riedl S., Hughes I., Harris M. et al., 2012. GH secretagogue receptor gene polymorphisms are associated with stature throughout childhood // Eur. J. Endocrinol. Vol. 166. N 6. P. 1079–1085.
  13. Sanna S., Jackson A. U., Nagaraja R. et al., 2008. Common variants in the GDF5-UQCC region are associated with variation in human height // Nat. Genet. Vol. 40. P. 198–203.
  14. URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1056 (дата обращения: 15.09.2012).
  15. URL: http://www.R — project.org. Development Core Team (Виртуальная среда для компьютеризованной статистики). Дата обращения: 15.09.2012.
  16. Weedon M. N., Lango H., Lindgren C. M. et al., 2008. Genome-wide association analysis identifies 20 loci that influence adult height // Nat. Genet. Vol. 40. N 5. P. 575–583.
  17. Wright A. F., Hastie N. D., 2001. Complex genetic diseases: controversy over the Croesus code // Genome Biol. Vol. 8. N 2. Comment 2007.1–comment 2007.8.
  18. Xu S., Hu Z., 2010. Generalized Linear Model for Interval Mapping of Quantitative Trait Loci // Theor. Appl. Genet. Vol. 121. N 1. P. 47–63.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Glotov A.S., Vashukova E.S., Glotov O.S., Kurilov R.V., Tarkovskaia I.V., Ditkina E.Y., Pugacheva I.V., Belonog O.L., Makhrova I.A., Pakin V.S., Aseev M.V., Ivashchenko T.E.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».