GENETIC ESTIMATION OF SNAIL LYMNAEA STAGNALIS POPULATIONS FROM REGIONS WITH DIFFERENT ANTHROPOGENIC LOAD AS A FIRST STEP IN GENETIC MONITORING


Cite item

Full Text

Abstract

The paper deals with carrying out molecular-genetic typing of populations of snail Lymnaea stagnalis from regions with a different ecological load (the lake Perstok and zatoka of the river Pripyat, Belarus). By means of interpopulation analysis of frequencies of RAPD-fragments, frequencies of zero alleles of RAPD-loci and genetic similarity index we established that these populations are genetically identical because there are no significant distinctions of genetic variability neither between individuals within a population, nor between populations. Results of the cluster analysis and the population analysis also have confirmed that populations of snails are genetically closely related. However the snail population of the lake Perstok is genetically more homogeneous.

About the authors

Oksana Yu Koneva

Institute of Genetics and Cytology of the NASB, Minsk, Republic of Belarus

Email: koneva@tut.by

References

  1. Булат С. А., Мироненко Н. В., Жолкевич Ю. Г. 1995. Генетическая структура почвенной популяции гриба Fusarium oxysporum Schlechtend.: Fr.: Молекулярная реидентификация вида и генетическая дифференциация изолятов методом полимеразной цепной реакции с универсальными праймерами (УП-ПЦР)//Генетика. Т. 31, № 3, С. 315-323.
  2. Голубев А. П., Сикорский В. Г., Калинин В. Н. и др., 2007. Динамика радиоактивного загрязнения экосистем разнотипных водоемов белорусского сектора зоны отчуждения Чернобыльской АЭС//Радиационная биология. Радиоэкология. T. 47, № 3. C. 322-332.
  3. Дромашко С. Е., Конева О. Ю. 2010. Генетическая паспортизация пород белорусского карпа//Наука и инновации. № 11 (93). С. 36-40.
  4. Хедрик Ф., 2003. Генетика популяций. М.: Техносфера. 592 с.
  5. Хрусталёва А. М. 2007. Генетическая дифференциация нерки (Оncorhynchus Nerka) азиатских стад: Автореф. дис. … канд. биол. наук. М., 25 с.
  6. Abdel-Hamid A.-Z., Rawi S. M., Arafa A. F. 2006. Identification of a genetic marker associated with the resistance to Schistosoma mansoni infection using random amplified polymorphic DNA analysis//Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. Vol. 101. No 8. P. 863-868.
  7. Aranishi F., Okimoto T. 2004. Genetic relationship between cultured populations of Pacific oyster revealed by RAPD analysis//Journal of Applied Genetics. Vol. 45. No 4. P. 435-443.
  8. Elo K., Ivanoff S., Vuorinen J. A., Piironen J. 1997. Inheritance of RAPD markers and detection of interspecific hybridization with brown trout and Atlantic salmon//Aquaculture. Vol. 152. P. 55-65.
  9. Golubev A. P., Afonin V., Maksimova S., Androsov V. 2005. The current state of pond snail Lymnaea stagnalis populations from water reservoirs of the Chernobyl nuclear accident zone//Radioprotection. Vol. 40. Suppl. 1. P. S511-S517.
  10. Holthausen R., Czaplewski R. L., DeLorenzo D. et al., 2005. Strategies for monitoring terrestrial animals and habitats. General Technical Report RMRS-GTR‑161. Fort Collins, CO: U. S. Department of Agriculture, Forest Service, Rocky Mountain Research Station. 34 p.
  11. Kurtz J. C., Jackson L. E., Fisher W. S. 2001. Strategies for evaluating indicators based on guidelines from the Environmental Protection Agency's Office of Research and Development//Ecological Indicators. Vol. 1. P. 49-60.
  12. Manly B. F. J. 1985. The statistics of natural selection on animal populations. London: Chapman & Hall. 440 p.
  13. Мonitoring and indicators of forest biodiversity in Europe -form ideas to operationality. 2004/Marchetti M. (ed.). EFI Proceedings. No. 51. 526 p.
  14. Morin C., Breuil C., Bernier L. 2004. Genetic Variability and Structure of Canadian Populations of the Sapstain Fungus Ceratocystis resinifera//Phytopathology. Vol. 94. No. 12. P. 1323-1330.
  15. Nei M., Li W.‑H. 1979. Genetics Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases//Proceedings of the National Academy of Sciences of USA. Vol. 76. No 10, P. 5269-5273.
  16. Nei M. 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals//Genetics. Vol. 89. P. 583-590.
  17. Nei M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press. 512 p.
  18. Saitoh K. 1998. Genetic variation and local differentiation in the Pacific cod Gadus macrocephalus around Japan revealed by mtDNA and RAPD markers//Fisheries Science. Vol. 64. P. 673-679.
  19. Schwartz M. K., Luikart G., Waples R. S. 2007. Genetic monitoring as a promising tool for conservation and management//Trends in Ecology and Evolution. Vol. 22. No 1. P. 25-33.
  20. Slatkin M., Barton N. H., 1989. A comparison of three indirect methods for estimatingaverage levels of gene flow//Evolution. Vol. 43. P. 1349-1368.
  21. Weir B. S., Reynolds J., Dodds K. G. 1990. The variance of sample heterozygosity//Theoretical Population Biology. Vol. 37. No 1. P. 235-253.
  22. Welsh J., McClelland M. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers//Nucleic Acids Research. Vol. 18. No 24. P. 7213-7218.
  23. Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J. et al., 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers//Nucleic Acids Research, Vol. 18, No 22. P. 6531-6535.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Koneva O.Y.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».