Molecular passportization of clones of karelian birch using PCRwith semi-specific primers


Cite item

Full Text

Abstract

Using 4 clones of Karelian birch (Betula pendula Roth var caretica Merckl.) from the collection of the karelian birch of the laboratory of genetics of Research Institute of Forest Genetics and Breeding, Voronezh, one normal tree of Betula pendula Roth, and one tree of B. pubescens Ehrh., collected from the nature, we have analyzed the possibility of application of PCR with semi-specific primers for molecular typing. We found primers with high percentage of polymorphic markers. These primers could be recommended for molecular typing of birch.

Keywords

About the authors

Tatyana V Matveeva

Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF

Email: olgunja_@mail.ru 199034, Saint-Petersburg, Universitetskaya nab, 7/9. Russia

Оlga S Mashkina

Voronezh State University, Voronezh, Voronezh Oblast, RF

Yuriy N Isakov

Research Institute of Forest Genetics and Breeding, Voronezh, Voronezh Oblast, RF

Ludmila A Lutova

Saint-Petersburg State University., Saint-Petersburg, RF

Email: olgunja_@mail.ru 199034, Saint-Petersburg, Universitetskaya nab, 7/9. Russia

References

  1. Баранов О. Ю., 2002. Изучение уровня генетической изменчивости и дифференциации среди форм берез//Проблемы лесоведения и лесоводства: сб. науч. трудов. ин-та леса НАН Беларуси. Вып. 55. Гомель: ИЛ НАН Беларуси. С. 143-147.
  2. Баранов О. Ю., Марковская Ю. А., 2003. Особенности генетической структуры березы карельской по гену Gpi-2//Проблемы лесоведения и лесоводства: сб. науч. трудов. ин-та леса НАН Беларуси. Вып. 50. Гомель: ИЛ НАН Беларуси. С. 181 -185.
  3. Бутова Г. П., Табацкая Т. М., Скробова Л. Л., 1990. Способ микроклонального размножения карельской березы//А. с. N 1597386 AIС N5/00 опубл. 7.10.90. Бюл. № 37.
  4. Ветчинникова Л. В., 2005. Карельская береза и другие редкие представители рода Betula L. М.: Наука, 269 с.
  5. Гостимский С. А., Кркаева 3. Г., Коновалов Ф. А., 2005. Изучение организации и изменчивости генома растений с помощью молекулярных маркеров//Генетика. Т. 41. С. 480-492.
  6. Машкина О. С., Табацкая Т. М., 2005. Рекомендации по сохранению и воспроизводству методами биотехнологии ценных генотипов карельской березы, осины, тополя белого и сереющего. Воронеж: НИИЛГиС,29с.
  7. Машкина О. С., Табацкая Т. М., Стародубцева Л. М., 1999. Длительное микрочеренкование для массового клонального размножения карельской березы и тополя//Физиология растений. Т. 46, С. 950-953.
  8. Самсонова А. Е., Машкина О. С., Исаков Ю. Н., 2001.Эндогенные регуляторы роста иукореняемость различных генотипов карельской березы при микро-клональном размножении//Организация и регуля ция физиолого-биохимических процессов: Сб. науч. тр. Воронеж: ВГУ. С. 97-102.
  9. Терентьев П. В., Ростова Н. С., 1979. Практикум по биометрии. Л.: Из-во ЛГУ, С. 151.
  10. Хлёсткина Е. К., Салина Е.А., 2006. SNP-маркеры: методы анализа, способы разработки и сравнительная характеристика на примере мягкой пшеницы. Генетика. Т. 42, № 6. С. 725-736.
  11. Gomel M., Wisnewska I., Rafalski A., 2002. Semi-specific PCR for the evaluation of diversity among cultivars of wheat and triticale//Cellular and Molecular Biology Tetters. Vol. 7. P. 577-582
  12. Ни J., van Eysden J., Quiros С. Е., 1995. Generation of DNA-based markers in specific genome regions by two-primer RAPD reactions//PCR Methods Appl. Vol. 4. P. 346-351.
  13. Matveeva T V.,LutovaL.A., WoodD.,NesterE. W., 2003. Search for sequences homologous to Agrobacterium T-DNA in different plant genomes//Biology of Plant-Microbe Interactions. Vol. 4. R 526-529
  14. Przetakewicz J., Nadolska-Orczyk A., Orczyk W., 2002.The use of RAPD and semi-random markers to verify somatic hybrids between diploid lines of Solanum tuberosum L.//Cellular and Molecular Biology Letters, Vol. 7. P. 671-676
  15. Van der Peer Y., de Wachter R., 1994. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment//Comput. Applic. Biosci. Vol. 10, P. 569-570
  16. Welsh J., McClelland., 1991.Genomic fingerprinting genomes using arbitrary primed PCR and matrix of pairwise combinations of primers//NAR. Vol. 19, P. 5275-5279.
  17. Whilliams J. G. K, Kubelik A. R., Livak К. J. el at, 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers.//NAR. Vol. 18, P. 6531-6535.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2008 Matveeva T.V., Mashkina О.S., Isakov Y.N., Lutova L.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».