RAPD analysis the genome polymorphism Actinidia Lindley, (Actinidiacea), growing in the territory of Russia


Cite item

Full Text

Abstract

RAPD The RAPD analysis of biodiversity in Actinidia species grown in Russia has been performed. Genome variability levels of A. kolomikta, A. arguta, A. potygama species were 0.01-0.15, 0.05-0.12 and 0.02-0.07, respectively. The maximum genetic distances have been determined between A. kotomiktaand A. arguta accessions (0.29-0.40). Close relationship have been shown between A. girald//, A. purpurea and A. arguta accessions which was comparable to intaspecific diversity analyzed in Actinidiaspecies. For the first time genetic diversity in Russian Actinidia cultivars has been investigated.

About the authors

Elena V Malaeva

Volgograd Regional Botanical Garden, Volgograd, Volgograd Oblast, RF

Email: e.malaeva@mail.ru

Natalia N Ryzhova

Centre Bioengineering RAS, Moscow, RF

Email: rynatalia@yandex.ru

Olga I Molkanova

Tsytsin Main Moscow Botanical Garden, Moscow, RF

Email: new_tech_@mail.ru

Elena Z Kochieva

Centre Bioengineering RAS, Moscow, RF

Email: ekochieva@yandex.ru

References

  1. Воробьев Д. П., 1968. Декоративные деревья и кустарники Дальнего Востока. -Л.: Наука, 227 с.
  2. Денисов Н. И., 2007. К систематическому обзору деревянистых лиан российского Дальнего Востока//Бюллетень Ботанического сада института ДВО РАН. Вып. 1.№ 1.С. 44-50.
  3. Крлбасина Э. И., 2000. Актинидии и лимонник в России. -Москва: Высшая школа, 264 с.
  4. Крропачинский И. Ю., Встовская Т. Н., 2002. Древесные растения Азиатской России. -Новосибирск: Наука, 707 с.
  5. Харкевич С. С., Качура Н. Н., 1981. Редкие виды растений Дальнего Востока и их охрана. -Москва: Наука, 231 с.
  6. Chat J. L., Jauregul В., Petit R. J., Nadot S., 2004. Reticulate evolution in kiwifruit (Actlndla, Actlnldlaceae) identified by comparing their maternal and paternal phytogenies//American Journal of Botany. Vol. 91. N5. P. 736-747.
  7. Cesoniene L., Daubaras R, Gelvonauskis В., 2005. Characterization of kolomikta kiwi (Actinidia kolomikta) genetic diversity by RAPD fingerprinting//Biologija. N3. P. 1-5.
  8. Cesoniene L., Daubaras R., Gelvonauskis В., 2007. Evaluation of genetic diversity and genetic relationships among female Lithuanian accessions of Kolomikta kiwi//Journal of Fruit and Ornamental Plant Research. Vol. 15. P. 95-102.
  9. Crowhurst R. N., Gleave A. P., MacRae E. A. et al., 2008. Analysis of expressed sequence tags from Actinidia:applications of a cross species EST database for gene discovery in the areas of flavor, health, color and ripening//BMC Genomics. Vol.9. P. 351. (<http://>-www.biomedcentral.com/l471 <http://www.biomedcentral.com/l471>2164/9/351).
  10. Cui Z., Huang H., Xingguo X., 2002. Actinidia in China. -China Agricultural Science and Technology Press, Beijing, People's Republic of China.
  11. Dunn S. Т., 1911. A revision of the genus Actinidia Lindl.//Journal of the Linnean Society of London, Botany. Vol. 39. P. 394-410.
  12. Edwards S. K., Johonstone C, Thompson C, 1991. Simple and rapid method for the preparation of plant genomic DNA for PCR-analysis//Nucleic Acids Res. Vol. 19. N6. P. 1349.
  13. Ferguson A. R., Huang H. W., 2007. Genetic resources of kiwifruit: domestication and breeding//Hort Rev. Vol. 33. P. 1-121.
  14. Fraser L. G., Harvey С. F., Crowhurst R. N., De Silva H. N., 2004. EST-derived microsatellites from Actinidia species and their potential for mapping//TheorAppl Genet. Vol. 108. N6. P. 1010-1016.
  15. Fraser L. G.,McNeilage M.A., Tsang G.K.,Harvey C. F., De Silva H. N., 2005. Cross-species amplification of microsatellite loci within the dioecious, polyploid genus Actinidia (Actinidiaceae)//TheorAppl Genet. Vol. 112. P. 149-157.
  16. Huang H., Zuozhou L., Jianqiang L., 2002. Phylogenetic relationships in Actinidia as reavealed by RAPD analysis//J. Amer. Soc. Hort. Sci. Vol. 127. N 5. P. 759-766.
  17. Li H.L., 1952. A taxonomic review of the genus Actinidia//Journal of the Arnold Arboretum, Harvard University. Vol. 33. P. 1-61.
  18. Li J.,Huang H.,Sang T., 2002. Molecular phylogeny and infrageneric classification of Actinidia (Actinidiaceae)//Systematic Botany. Vol. 27. P.408-415.
  19. Liang C. F., Ferguson A. R., 1986. The botanical nomenclature of the kiwifruit and related taxa//New Zealand Journal of Botany. Vol. 24. P. 183-184.
  20. Liu Y., Li Z., Zhang P., Jiang Z., Huang H., 2006. Spatial genetic structure in natural populations of two closely related Actinidia species (Actinidiaceae) as revealed by SSR-analysis//Biodiversity Science. Vol. 14. N 5. R 421-434.
  21. Prado M. J., Rome S., Novo M., Rev M., Herrera M. Т., Gonzales M. V., 2006. Molecular characterization of three commercial cultivars and a new pollinator in Kiwifruit//Hort Science. Vol. 41. N 1. P. 90-95.
  22. Van den Berg R. G., Bryan G. J., del Rio A., Spooner D. M., 2002. Reduction of species in the wild potato Solanum section Petota series Longipedicellata: AFLR RAPD and chloroplast SSR data//Theor Appl Genet. Vol. 105. P. 1109-1114.
  23. Sneath P. H A., Sokal R. R., 1973. Numerical taxonomy -the principles and practice of numerical classification. -San Francisco: W. H. Freeman & Co, 573 p.
  24. Van de Peer Y., De Wachter R., 1994. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary for the Microsoft Windows environment//Comput. Appl. Biosci. Vol. 10. P. 569-570.
  25. Zhang Т., Li Z., Liu Y., Jiang Z., Huang H., 2007. Genetic diversity, gene introgression and homoplasy in sympatric populations of the genus Actinidia as revealed by chloroplast microsatellite markers//Biodiversity Science. Vol. 15. N l.P.1-22.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2008 Malaeva E.V., Ryzhova N.N., Molkanova O.I., Kochieva E.Z.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».