ЭВОЛЮЦИЯ ВИРУСОВ РАСТЕНИЙ:АДАПТАЦИЯ К ХОЗЯЕВАМ И К ВЕКТОРАМ


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Вирусы являются облигатными молекулярными патогенами. Для размножения, в том числе синтеза нуклеиновых кислот и белков, вирусу необходимы живые клетки-хозяева. Цикл инфекции вирусов в растениях включает три основных фазы: i) репликация, ii) перемещение из клетки в клетку через плазмодесмы, и iii) дальний транспорт в различные части растений. В ходе этих стадий на инфекционный цикл вирусов оказывает влияние генетическая изменчивость их хозяев, в результате чего вирус должен «приспосабливаться» к незначительным или крупным различиям во взаимодействиях между вирусом и хозяином. Для таких «приспособлений» необходимы мутации в вирусном геноме. многие вирусы растений также зависят от организмов-переносчиков для заражения новых растений-хозяев. Изменения в вирусном геноме для лучшей «адаптации» к хозяину не должны нарушать способность организма-переносчика передавать вирусное потомство. Адаптацию хозяина и адаптацию организма-переносчика, таким образом, можно рассматривать как основные факторы, оказывающие влияние на эволюцию вирусов растений

Об авторах

Яари Валконен

Университет Хельсинки, Хельсинки, Финляндия

Список литературы

  1. Ala-Poikela M., Svensson e., Rojas A. et al., 2005. Genetic diversity and mixed infections of begomoviruses in tomato, pepper and cucurbit crops in Nicaragua//Plant Pathol. Vol. 54. P. 448-459.
  2. Atabekov J., Dobrov E., Karpova O., Rodionova N., 2007. Potato virus X: structure, disassembly and reconstitution//Mol. Plant. Pathol. Vol. 8. P. 667-675.
  3. Bilgin D.D., Liu Y., Schiff M., Dinesh-Kumar S. P., 2003. P58IPK, a plant ortholog of double-stranded RNA-dependent protein kinase PKR inhibitor, functions in viral pathogenesis//Devel. Cell. Vol. 4. P. 651-661.
  4. Chare E.R., Holmes E.C., 2004. Selection pressures in the capsid genes of plant RNA viruses reflect mode of transmission//J. Gen. Virol. Vol. 85. P. 3149-3157.
  5. Cuellar W.J., Tairo F., Kreuze, J.F., Valkonen J.P.T., 2008. Analysis of gene content in sweet potato chlorotic stunt virus RNA1 reveals the presence of the p22 RNA silencing suppressor in only a few isolates: implications for viral evolution and synergism//J. Gen. Virol. Vol. 89. P. 573-582.
  6. De la Iglesia F., elena S. F., 2007. Fitness declines in Tobacco etch virus upon serial bottleneck transfers//J. Virol. Vol. 81. P. 4941-4947.
  7. Delatte H., Holota H., Moury B. et al., 2007. Evidence for a founder effect after introduction of Tomato yellow leaf curl virus -Mild in an insular environment//J. Mol. Evol. Vol. 65. P. 112-118.
  8. Ding S. W., Voinnet O., 2007. Antiviral immunity directed by small RNAs//Cell. Vol. 130. P. 413-426.
  9. Djikeng A., Halpin R., Kuzmickas R. et al., 2008. Viral genome sequencing by random priming methods//BMC Genomics. Vol. 9, article number 5.
  10. Dolja V. V., Kreuze J. F., Valkonen J. P. T., 2006. Comparative and functional genomics of closteroviruses//Virus Res. Vol. 117. P. 38-51.
  11. Domingo E., Holland J. J., 1997. RNA virus mutations and fitness for survival//Annu. Rev. Microbiol. Vol. 51. P. 151-178.
  12. Duijsings D., Kormelink R., Goldbach R., 2001. In vivo analysis of the TSWV cap-snatching mechanism: single base complementarity and primer length requirements//EMBO J. Vol. 20. P. 2545-2552.
  13. Eigenbrode S. D., Ding H. J., Shiel P., Berger P. H., 2002. Volatiles from potato plants infected with potato leafroll virus attract and arrest the virus vector, Myzus persicae (Homoptera: Aphididae)//Proc. Royal. Soc. London Ser. B Biol. Sci. Vol. 269. P. 455-460.
  14. Fauquet C. M., Mayo M. A., Maniloff J. et al., 2005. (eds). Virus Taxonomy: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier Academic Press, San Diego, CA, USA.
  15. García-Arenal F., Fraile A., Malpiga J. M., 2001. Variability and genetic structure of plant virus populations//Annu. Rev. Phytopathol. Vol. 39. P. 157-186.
  16. Germundsson A., Valkonen J. P. T., 2006. P1and VPg-transgenic plants show similar resistance to Potato virus A and may compromise long distance movement of the virus in plant sections expressing RNA silencing-based resistance//Virus Res. Vol. 116. P. 208-213.
  17. Gray S. M., Caillaud M. C., Burrows M., Smith D. M., 2007. Transmission of two viruses that cause Barley Yellow Dwarf is controlled by different loci in the aphid, Schizaphis graminum//J. Insect Sci. Vol. 7, article no. 25.
  18. Jackson A. O., Dietzgen R. G., Goodin M. M. et al., 2005. Biology of plant rhabroviruses. Annu. Rev. Phytopathol. 43. P. 623-660.
  19. Kreuze J. F., Savenkov E. I., Li X. et al., 2005. Viral class 1 RNA seIII involved in suppression of RNA silencing//J. Virol. Vol. 79. P. 7227-7238.
  20. Lefeuvre P., Lett J. M., Reynaud B., Martin D. P., 2007. Avoidance of protein fold disruption in natural virus recombinants//PLoS Pathogens. Vol. 3. P. 1782-1789.
  21. Lough T. J., Lucas W. J., 2006. Integrative plant biology: Role of phloem long-distance macromolecular trafficking//Annu. Rev. Plant Biol. Vol. 57. P. 203-232.
  22. Lucas W. J., 2006. Plant viral movement proteins: Agents for cell-to-cell trafficking of viral genomes//Virology. Vol. 344. P. 169-184.
  23. Lucas W. J., Lee J. Y., 2004. Plant cell biology -Plasmodesmata as a supracellular control network in plants//Nature Rev. Mol. Cell Biol. Vol. 5. P. 712-726
  24. Moury B., Fabre F., Senoussi R., 2007. Estimation of the number of virus particles transmitted by an insect vector//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 104. P. 17891-17896.
  25. Ng J. C. K., Falk B. W., 2006. Virus-vector interactions mediating nonpersistent and semipersistent transmission of plant viruses//Annu. Rev. Phytopathol. Vol. 44. P. 183-212.
  26. Rajamäki M. L., Mäki-Valkama T., Mäkinen K., Valkonen J. P. T., 2004. Infection with potyviruses//Plant-Pathogen Interactions/Ed. N. J. Talbot, Sheffield, UK: Blackwell Publishing. P. 68-91.
  27. Rajamäki M-L., Valkonen J. P. T., 2002. Viral genome-linked protein (VPg) controls accumulation and phloem-loading of a potyvirus in inoculated potato leaves//Mol. Plant-Microbe Interact. Vol. 15. P. 138-149.
  28. Robaglia C., Caranta C., 2006. Translation initiation factors: a weak link in plant RNA virus infection//Trends Plant Sci. Vol. 11. P. 40-45.
  29. Rojas M. R., Hagen C., Lucas W. J., Gilbertson R. L., 2005. Exploiting chinks in the plant's armor: Evolution and emergence of geminiviruses//Annu. Rev. Phytopathol. Vol. 43. P. 361-394.
  30. Savenkov E. I., Valkonen J. P. T., 2001. Potyviral helper component-proteinase expressed in transgenic plants enhances titers of Potato leaf roll virus but does not alleviate its phloem-limitation//Virology. Vol. 283. P. 285-293.
  31. Singh R. P., Valkonen J. P. T., Gray S. M. et al., 2008. Discussion paper: The naming of Potato virus Y strains infecting potato//Arch. Virol. Vol. 153. P. 1-13.
  32. Taraporewala Z. F., Culver J. N., 1996. Identification of an elicitor active site within the three-dimensional structure of the tobacco mosaic tobamovirus coat protein//Plant Cell. Vol. 8. P. 169-178.
  33. Tomitaka Y., Ohshima K., 2006. A phylogeographical study of the Turnip mosaic virus population in East Asia reveals an 'emergent' lineage in Japan//Mol. Ecol. Vol. 15. P. 4437-4457.
  34. Tugume A. K., Mukasa S. B., Valkonen J. P. T., 2008. Natural wild hosts of Sweet potato feathery mottle virus show spatial differences in virus incidence and virus-like diseases in Uganda//Phytopathology, Vol. 98, P. 640-652.
  35. Ueda S., Masuta C., Uyeda I., 1997. Hypothesis on particle structure and assembly of rice dwarf phytoreovirus: interactions among multiple structural proteins//J. Gen. Virol. Vol. 78. P. 3135-3140.
  36. Uzest M., Gargani D., Drucker M. et al., 2007. A protein key to plant virus transmission at the tip of the insect vector stylet//Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 104. P. 17959-17964.
  37. Weber H., Pfitzner, A. J. P., 1998. Tm-22 resistance in tomato requires recognition of the carboxy terminus of the movement protein of tomato mosaic virus//Mol. Plant-Microbe Interact. Vol. 11. P. 498-503.
  38. Worobey M., Holmes e. C., 1999. Evolutionary aspects of recombination in RNA viruses//J. Gen. Virol. Vol. 80. P. 2535-2543.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Валконен Я., 2008

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».