Organelle DNA variation in potato species


Cite item

Full Text

Abstract

The genetic diversity of 34 species of the genus Solanum was studied using chloroplast (cp) DNA and mitochondrial (mt) DNA specific PCR primers. 11 cpDNA haplotypes and 16 mtDNA haplotypes were discovered. Traditional botanical taxonomy of potato species was not supported by cpDNA data. Cladistic relationships of 34 species support their geographical and genome differentiation. A derived clades contains E-, B- and A-genome species of the section Petota suggesting a coevolution of chloroplast and nuclear genomes.

About the authors

Olga U Antonova

N. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RF

Email: olgaant326@googlemail.com

Tatyana A Gavrilenko

N. I. Vavilov Institute of Plant Industry, Saint-Petersburg, RF

Email: tatjana9972@yandex.ru; t.a.gavrilenko@vir.nw.ru

References

  1. Букасов С.М. Межвидовая гибридизация картофеля.//Известия акад. наук СССР. -1938. -Т. 13. -С. 711-732.
  2. Букасов С.М. Принципы систематики картофеля.//Труды по прикл. ботанике, генетике и селекции. -1978. -Т. 62, Вып. 1.-С. 3-8.
  3. Bastia T., Scotti N., Cardi T. Organelle DNA analysis of Solanum and Brassica somatic hybrids by PCR with «universal primers».//Theor. Appl. Genet. -2001. -Vol. 102. -P. 1265-1272.
  4. Bryan G.J., McNicoll J., Ramsay G., Meyer R.C., DeJong W.S. Polymorphic simple sequences repeat markers in chloroplast genomes of Solanaceous plants.//Theor. Appl. Genet. -1999. -Vol. 99 -P. 859-867.
  5. Correll D.S. The potato and its wild relatives.//Contr. Texas. Res. Found. Bot. Stud. -1962. -Vol. 4 -P. 1-606.
  6. Demesure B., Sodzi N., Petit R.J. A set of universal primers for amplification of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants.//Molecular Ecology. -1995. -Vol. 4. -P. 129-131.
  7. Glendenning, D.R. The genepool of modern potato varieties.//Paper presented in the joint meeting Eucarpia-EAPR "The development and identification of superior potato genotypes; limitations and prospects for the future». -England: Cambridge, Dec. 16-20, 1985.
  8. Hawkes J.G. The potato: evolution, biodiversity and genetic resources. -London: Belhaven Press, 1990.
  9. Hosaka K. Successive domestication and evolution of the Andean potatoes as revealed by chloroplast DNA restriction endonuclease analysis.//Theor. Appl. Genet. -1995. -Vol. 90. -P. 356-363.
  10. Hosaka K., Ogihara Y., Matsubayashi M., Tsunewaki K. Phylogenetic relationship between the tuberous Solanum species as revealed by restriction endonuclease analysis of chloroplast DNA.//Jpn. J. Genet. -1984 -Vol. 59. -P. 349-369.
  11. Lössl A., Adler N., Horn R., Frei U., Wenzel G. Chondriometype characterization of potato: mt α, β, γ, ε and novel plastid mitochondrial configurations in somatic hybrids.//Theor. Appl. Genet. -1999. -Vol. 98. -P. 1-10.
  12. Lössl A., Götz M., Braun A., Wenzel G. Molecular markers for cytoplasm in potato: male sterility and contribution of different plastid mitochondrial configurations to starch production.//Euphytica.-2000. -Vol. 116. -P. 221-230.
  13. Mendoza H.A., Hayne F.L. Genetic relationship among potato cultivars grown in the United States.//Hortscience. -1974. -Vol. 9. -P. 328-330.
  14. Ochoa C.M. The potatoes of South America: Bolivia. -Cambridge: Cambridge Univ. Press, 1990.
  15. Spooner D.M., Sytsma K.J. Reexamination of series relationships of Mexican and Central American wild potatoes (Solanum sect. Petota): evidence from chloroplast DNA restriction site variation.//Systematic Botany. -1992 -Vol. 17. -P. 432-448.
  16. Spooner D.M., Anderson G.J. and Jansen R.K. Chloroplast DNA evidence for the interrelatioships of tomatoes, potatoes and pepinos (Solanaceae).//Am. J. of Botany. -1993. -Vol. 80. -P. 676-688.
  17. Spooner D.M. Hiymans J. Potato systematics and germplasm collecting, 1989-2000.//Theor. Appl. Genet. -2001. -Vol. 78. -P. 237-268, 395.
  18. Spooner D.M., Hettascheid W.L.A., Van den Berg R.G., Bran-denburg W.A. Plant nomenclature and taxonomy an norticultural and agronomic perspective.//Horticultural. -2003.
  19. SPSS (Data analysis software system), Version 11.5.//2002 -http://www.spss.ru.
  20. Sukhotu T., Kamijima O., Hosaka K. Nuclear and chloroplast DNA differentiation in Andean potatoes.//Genome. -2004. -Vol. 47. -P. 46-56.
  21. Wienand U., Feix G. Zein specific restriction enzyme fragments of maize DNA.//FEBS Letters. -1980. -Vol. 116. -P. 14-16.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2006 Antonova O.U., Gavrilenko T.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».