Assessment of the state population gene pool of specially protected species Helicopsis striata (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) using DNA-markers

Cover Page

Cite item

Full Text

Abstract

With the use of DNA-markers (RAPD and ISSR) the gene pool of nineteen populations of specially protected relict species Helicopsis striata (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) in Southern Mid-Russian Upland was studied. These results demonstrate a high degree of subdivision of populations (Фst = 0,404, Gst = 0,358) and increased levels of homozygosity in a number of groups that live in the industrial zone and the steppe habitats. The significant correlation between the level of gene flow and geographic distances between populations (R = 0,571 ± 0,052) was found, this corresponds to isolation by distance model. The values of the effective number was calculated on the basis of index units. They were significantly lower than the effective number of not protected species of snail.

About the authors

Edward Anatoljevich Snegin

Belgorod national research university

Email: snegin@bsu.edu.ru
Dr. Biol. Sci., senior lecturer, head of department of biocenology and ecological genetics

References

  1. Динамика популяционных генофондов при антропогенных воздействиях (2004). Под ред. Ю. П. Алтухова. М.: Наука.
  2. Красная книга Белгородской области. Редкие и исчезающие растения, грибы, лишайники и животные (2004). Под ред. А. В. Присного. Белгород.
  3. Крамаренко С. С., Крамаренко А. С. (2010) Аллозимный и RAPD полиморфизм наземных моллюсков Brephulopsis cilindrica (Enidae) в природных и урбанизированных местообитаниях юга Украины.Видовые популяции и сообщества в антропогенно трансформированных ландшафтах: состояние и методы его диагностики. Материалы XI международной научно-практической конференции. Белгород: ИПЦ Политерра, C. 210-211.
  4. Майр Э. Зоологический вид и эволюция (1968). М.: Мир.
  5. Николаев В. А. (1973) Наземные моллюски Среднерусской возвышенности. Дисс… канд. биол. наук. Орел, 240 с.
  6. Снегин Э. А. (2002) Использование видов наземных моллюсков в качестве индикаторов реликтовых ценозов. Вестник Житомирского педагогического университета. Вып. 10: С. 128-129.
  7. Снегин Э. А. (2010) Оценка состояния популяционных генофондов наземных моллюсков в условиях влияния горно-обогатительных комбинатов на примере Bradybaena fruticum Müll. (Gastropoda, Pulmonata). Экологическая генетика. 2010; Т. VIII. № 2. С. 45-55.
  8. Снегин Э. А. (2011 а) Генетическая структура популяций модельных видов наземных моллюсков в условиях урбанизированного ландшафта на примере Сhondrula tridens Müll. (Gastropoda, Pulmonata). кологическая генетика. 2011. Т. IX (2): С. 54-64.
  9. Снегин Э. А. (2011 б) Анализ генетической изменчивости популяций наземного моллюска Bradybaena fruticum Müll. с использованием RAPD и ISSR маркеров. Научные ведомости БелГУ Сер. Естественные науки. № 15 (110). Вып. 16. С. 37-43.
  10. Снегин Э. А. (2012) Пространственные и временные аспекты эколого-генетической структуры популяций беспозвоночных животных (на примере наземных моллюсков и насекомых юга Среднерусской возвышенности): Дис… докт. биол. наук. Белгород: НИУ БелГУ, 394 с.
  11. Снегин Э. А. (2013) Анализ генетической изменчивости популяций наземного моллюска Сhondrula tridens Müll. (Gastropoda, Pulmonata) с использованием RAPD и ISSR маркеров. Экологическая генетика. T. XI. № 3. С. 37-47.
  12. Снегин Э. А., Сычев А. А. (2011) Оценка жизнеспособности популяций особо охраняемого вида Helicopsis striata Müller (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) в условиях юга Среднерусской возвышенности. Теоретическая и прикладная экология. № 2: С. 84-93.
  13. Шилейко А. А. (1978) Наземные моллюски надсемейства Helicoidea. Фауна СССР. Моллюски. Л.: Наука. Т 3 (6): 384 с.
  14. Ewens W. (1972) The sampling theory of selectively neutral alleles. Theor. Pop. Biol. N 3. P. 87-112.
  15. Excoffier L., Smouse P. E., Quattro J. M. (1992) Analysis of molecular variance inferred from metric distances among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data. Genetics. N 131: Р. 479-491.
  16. Ložek V. (1980) Z červené knihy našich měkkýšů - suchomilka Helicopsis striata. Živa Academia Praha. V. 28 (6): P. 223.
  17. Manly B. F. J. (1985) The Statistics of Natural Selection on Animal Populations. London: Chapman and Hall.
  18. Nei M. (1972) Genetic distance between populations.The American Naturalist. V. 106 (949): P. 283-292.
  19. Nei M. (1975) Molecular population genetics and evolution. Amsterdam.
  20. Peakall R., Smouse P. E. (2001) GenAlEx V5: Genetic Analisis in Excel. Population genetic software for teaching and reseach. Australion National University, Canberra, Australia. http://www.anu.edu.au./BoZo/GenAlEx/.
  21. Slatkin M. (1993) Isolation by distance in equilibrium and non - equilibrium populations. Evolution. V. 47 (1): P. 294-279.
  22. Sparks B. W. (1953) The former occurrence of both Helicella striata (Müller) and H. geyeri (Soós) in England. Journal of Conchology. 1953. V. 23: P. 372-378.
  23. Stępczak K. (1999) Aktualny stan występowania Helicopsis striata (O. F. Müller, 1774) w dolinie Odry (Mollusca: Gastropoda) w Polsce. Bad. Fizjogr. Pol. Zach. V. 46: P. 7-21.
  24. Tamura K., Peterson D., Peterson N. et al. (2011) MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods. Molecular Biology and Evolution. http://www.kumarlab.net/publications.
  25. Watterson G. (1978) The homozygosity test of neutrality. Genetics. V. 88: P. 405-417.
  26. Welsh J., McClelland M. (1990) Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Research. V. 18 (22): P. 7213-7219
  27. Wright S. (1943) Isolation by distance. Genetics. Vol. 28: P. 114-138.
  28. Wright S. (1951) The genetical structure of populations. Ann. Eugenics. 1951. N 15. Р. 323-354.
  29. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. (1994) Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) - anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics. V. 20 (2): P. 176-181.
  30. Yeh F. C.; Yang R., Boyle T. J. et al. (2000) POPGENE 32, Microsoft Window-based Freeware for Population Genetic Analysis, Version 1.32; Molecular Biology and Biotechnology Centre, Univ. of Alberta: Edmonton, Canada. http://www.ualberta.ca/~fyeh/popgene_download.html.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2015 Snegin E.A.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».