ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АБЕРРАНТНО МЕТИЛИРОВАННЫХ ГЕНОВ SEPT9 И VIM ДЛЯКЛИНИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Определение эпигенетических нарушений имеет большое значение для ранней диагностики колоректального рака (КРР). Для получения модели диагностической тест-системы с высокими показателями чувствительности и специфичности мы определяли частоту метилирования в генах SEPT9 и VIM. При анализе эпигенетических нарушений нами также учитывались мутации в генах семейства RAS. В нашей работе подтверждается наличие аберрантного метилирования в генах SEPT9 и VIM в клетках опухоли. ДНК образцов опухоли была достоверно чаще метилирована, чем ДНК образцов прилежащей ткани (P =8,67E-19 для гена SEPT9 и P=8,68E-19 для гена VIM). В группе пациентов, имеющих мутации в генах KRAS или NRAS, ДНК опухолевых образцов достоверно чаще метилирована в генe SEPT9 (P=0.0018), в отличие от ДНК опухолевых образцов пациентов, не несущих данных мутаций. Нами было продемонстрировано, что использование совокупности маркеров метилирования позволяет улучшить чувствительность тест- систем, используемых в диагностике КРР.

Об авторах

Ольга Игоревна Бровкина

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: brov.olia@gmail.com
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Марат Гордиевич Гордиев

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: marat7925@gmail.com
заведующий Молекулярно-диагностической лабораторией ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ Республики Татарстан»

Дмитрий Сергеевич Ходырев

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: DmKh008@gmail.com
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Алексей Георгиевич Никитин

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: avialn@gmail.com
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Александр Вячеславович Аверьянов

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: averyanovav@mail.ru
заведующий отделением пульмонологии ФНКЦ ФМБА России,руководитель Центра биомедицинских технологий, д.м.н.

Список литературы

  1. Jones P.A., Baylin S.B. 2007. The Epigenomics of Cancer. Cell. 2007;128: 683-692.
  2. Wild N., Andres H., Rollinger W., et al. A combination of serum markers for the early detection of colorectal cancer. Clin Cancer Res. 2010;16(24):6111-21. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-10-0119.
  3. Leon S.A., Shapiro B., Sklaroff D.M., Yaros M.J. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy. Cancer Res. 1977;37: 646-650.
  4. Russell S.E.H., Hall P.A. Do septins have a role in cancer? Br. J. Cancer. 2005;93: 499-503.
  5. Kinoshita M., Noda M. Roles of septins in the mammalian cytokinesis machinery. Cell Struct Funct. 2001;26: 667-670.
  6. Joo E., Tsang C.W., Trimble W.S. Septins: traffic control at the cytokinesis intersection. Traffic Cph. Den. 2005;6: 626-634.
  7. McDade S.S., Hall P.A., Russell S.E.H. Translational control of SEPT9 isoforms is perturbed in disease. Hum Mol Genet. 2007;16: 742-752.
  8. Estey M.P., Di Ciano-Oliveira C., Froese C.D., Bejide M.T., Trimble W.S. Distinct roles of septins in cytokinesis: SEPT9 mediates midbody abscission. J Cell Biol. 2010;191: 741-749.
  9. Zou H., Harrington J.J., Shire A.M., et al. Highly methylated genes in colorectal neoplasia: implications for screening. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007 Dec;16(12):2686-96.
  10. Brenner D.E., Rennert G. Fecal DNA biomarkers for the detection of colorectal neoplasia: attractive, but is it feasible? J Natl Cancer Inst. 2005; 97: 1107-9.
  11. Schneider K.U., Dietrich D., Fleischhacker M., et al. Correlation of SHOX2 Gene Amplification and DNA Methylation in Lung Cancer Tumors. BMC Cancer. 2011 Mar 22;11:102. doi: 10.1186/1471-2407-11-102.
  12. Mikeska T., Craig J.M. DNA Methylation Bio-markers: Cancer and Beyond. Genes. 2014;5:821-864.
  13. Linardou H., Briasoulis E., Dahabreh I.J., et al. 2011. All about KRAS for clinical oncology practice: gene profile, clinical implications and laboratory recommendations for somatic mutational testing in colorectal cancer. Cancer Treat. Rev. 2011;37: 221-233.
  14. Ying H.-Q., Wang F., He B.-S., et al. The involvement of Kras gene 3’-UTR polymorphisms in risk of cancer and influence on patient response to anti-EGFR therapy in metastatic colorectal cancer: a meta-analysis. OncoTargets Ther. 2014;7: 1487-1496.
  15. Кит О.И., Водолажский Д.И., Дваденко К.В., et al. 2016. Аберрантное метилирование промоторных участков генов APC, CDH13 и MGMT у больных колоректальным раком. Сибирский Онкологический Журнал. 2016;15: 48-55.
  16. Cerottini J.P., Caplin S., Saraga E., Givel J.C., Benhattar J. The type of K-ras mutation determines prognosis in colorectal cancer. Am J Surg. 1998;175: 198-202.
  17. Беляева А.В. Мутации в гене K-RAS у больных колоректальным раком. Автореф. дис. ...канд. мед. наук. Спб.: 2012.- 27 с.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Ходырев Д.С., Никитин А.Г., Аверьянов А.В., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).