ИСПОЛЬЗОВАНИЕ АБЕРРАНТНО МЕТИЛИРОВАННЫХ ГЕНОВ SEPT9 И VIM ДЛЯКЛИНИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Определение эпигенетических нарушений имеет большое значение для ранней диагностики колоректального рака (КРР). Для получения модели диагностической тест-системы с высокими показателями чувствительности и специфичности мы определяли частоту метилирования в генах SEPT9 и VIM. При анализе эпигенетических нарушений нами также учитывались мутации в генах семейства RAS. В нашей работе подтверждается наличие аберрантного метилирования в генах SEPT9 и VIM в клетках опухоли. ДНК образцов опухоли была достоверно чаще метилирована, чем ДНК образцов прилежащей ткани (P =8,67E-19 для гена SEPT9 и P=8,68E-19 для гена VIM). В группе пациентов, имеющих мутации в генах KRAS или NRAS, ДНК опухолевых образцов достоверно чаще метилирована в генe SEPT9 (P=0.0018), в отличие от ДНК опухолевых образцов пациентов, не несущих данных мутаций. Нами было продемонстрировано, что использование совокупности маркеров метилирования позволяет улучшить чувствительность тест- систем, используемых в диагностике КРР.

Об авторах

Ольга Игоревна Бровкина

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: brov.olia@gmail.com
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Марат Гордиевич Гордиев

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: marat7925@gmail.com
заведующий Молекулярно-диагностической лабораторией ГАУЗ «Республиканский клинический онкологический диспансер МЗ Республики Татарстан»

Дмитрий Сергеевич Ходырев

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: DmKh008@gmail.com
кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Алексей Георгиевич Никитин

ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: avialn@gmail.com
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией генетики ЦБМТ ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Александр Вячеславович Аверьянов

ФГБУ ФНКЦ ФМБА России

Email: averyanovav@mail.ru
заведующий отделением пульмонологии ФНКЦ ФМБА России,руководитель Центра биомедицинских технологий, д.м.н.

Список литературы

  1. Jones P.A., Baylin S.B. 2007. The Epigenomics of Cancer. Cell. 2007;128: 683-692.
  2. Wild N., Andres H., Rollinger W., et al. A combination of serum markers for the early detection of colorectal cancer. Clin Cancer Res. 2010;16(24):6111-21. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-10-0119.
  3. Leon S.A., Shapiro B., Sklaroff D.M., Yaros M.J. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy. Cancer Res. 1977;37: 646-650.
  4. Russell S.E.H., Hall P.A. Do septins have a role in cancer? Br. J. Cancer. 2005;93: 499-503.
  5. Kinoshita M., Noda M. Roles of septins in the mammalian cytokinesis machinery. Cell Struct Funct. 2001;26: 667-670.
  6. Joo E., Tsang C.W., Trimble W.S. Septins: traffic control at the cytokinesis intersection. Traffic Cph. Den. 2005;6: 626-634.
  7. McDade S.S., Hall P.A., Russell S.E.H. Translational control of SEPT9 isoforms is perturbed in disease. Hum Mol Genet. 2007;16: 742-752.
  8. Estey M.P., Di Ciano-Oliveira C., Froese C.D., Bejide M.T., Trimble W.S. Distinct roles of septins in cytokinesis: SEPT9 mediates midbody abscission. J Cell Biol. 2010;191: 741-749.
  9. Zou H., Harrington J.J., Shire A.M., et al. Highly methylated genes in colorectal neoplasia: implications for screening. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007 Dec;16(12):2686-96.
  10. Brenner D.E., Rennert G. Fecal DNA biomarkers for the detection of colorectal neoplasia: attractive, but is it feasible? J Natl Cancer Inst. 2005; 97: 1107-9.
  11. Schneider K.U., Dietrich D., Fleischhacker M., et al. Correlation of SHOX2 Gene Amplification and DNA Methylation in Lung Cancer Tumors. BMC Cancer. 2011 Mar 22;11:102. doi: 10.1186/1471-2407-11-102.
  12. Mikeska T., Craig J.M. DNA Methylation Bio-markers: Cancer and Beyond. Genes. 2014;5:821-864.
  13. Linardou H., Briasoulis E., Dahabreh I.J., et al. 2011. All about KRAS for clinical oncology practice: gene profile, clinical implications and laboratory recommendations for somatic mutational testing in colorectal cancer. Cancer Treat. Rev. 2011;37: 221-233.
  14. Ying H.-Q., Wang F., He B.-S., et al. The involvement of Kras gene 3’-UTR polymorphisms in risk of cancer and influence on patient response to anti-EGFR therapy in metastatic colorectal cancer: a meta-analysis. OncoTargets Ther. 2014;7: 1487-1496.
  15. Кит О.И., Водолажский Д.И., Дваденко К.В., et al. 2016. Аберрантное метилирование промоторных участков генов APC, CDH13 и MGMT у больных колоректальным раком. Сибирский Онкологический Журнал. 2016;15: 48-55.
  16. Cerottini J.P., Caplin S., Saraga E., Givel J.C., Benhattar J. The type of K-ras mutation determines prognosis in colorectal cancer. Am J Surg. 1998;175: 198-202.
  17. Беляева А.В. Мутации в гене K-RAS у больных колоректальным раком. Автореф. дис. ...канд. мед. наук. Спб.: 2012.- 27 с.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Ходырев Д.С., Никитин А.Г., Аверьянов А.В., 2016

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».