Синергический эффект воздействия экзогенного P53 и бутирата натрия на выживаемость опухолевых клеток
- Авторы: Ковалeв Р.А.1, Семенова Е.В.1, Штам Т.А.1,2, Бурдаков В.С.1, Варфоломеева Е.Ю.1
-
Учреждения:
- Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»
- Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»
- Выпуск: Том 25, № 3 (2025)
- Страницы: 96-107
- Раздел: Оригинальные исследования
- URL: https://journals.rcsi.science/MAJ/article/view/380140
- DOI: https://doi.org/10.17816/MAJ641838
- EDN: https://elibrary.ru/TREHKG
- ID: 380140
Цитировать
Аннотация
Обоснование. Белок P53 — транскрипционный фактор, регулирующий экспрессию генов, ассоциированных со множеством клеточных функций, включая остановку клеточного цикла, апоптоз, пролиферацию клеток, репарацию ДНК и др. Статус многофункционального онкосупрессора делает P53 привлекательной и многообещающей мишенью для терапии рака.
Цель исследования. Анализ влияния комбинированного воздействия трансфекции плазмиды, кодирующей ген p53 (генетический метод), ингибитора гистоновых деацетилаз бутирата натрия (эпигенетическое регулирование) и сокультивирования с экзосомами, секретируемыми клетками с диким типом P53 (моделирование межклеточной коммуникации) на выживаемость клеточных линий различных опухолей человека.
Методы. Исследование проведено на четырех перевиваемых клеточных линиях: клетках линий HeLa (эпителиоидная карцинома шейки матки) и HT-1080 (фибросаркома), несущих ген p53 дикого типа, а также клетках линий K562 (хроническая миелогенная лейкемия) и Gl-V (первичная культура клеток глиомы), дефектных по гену p53 (P53–/–). Трансфекцию клеток проводили созданной в лаборатории клеточной биологии НИЦ «Курчатовский институт» плазмидой P53-GFP, кодирующей белок P53, несущий на N-конце зеленый флуоресцентный белок (GFP). Успешное прохождение трансфекции отслеживали по экспрессии белка P53-GFP с помощью конфокального микроскопа. Уровень содержания белка P53 в клетках определяли методом вестерн-блоттинга. Для количественной оценки пролиферации и параметров клеточного цикла в условиях ингибирования деацетилаз в культуральную среду добавляли бутират натрия (NaBu) до конечной концентрации 2,5 мМ. Анализ проводили с помощью автоматического счетчика клеток, техники проточной цитометрии, либо по способности клеток образовывать колонии. Экзосомы выделяли из накопленной кондиционированной среды методом ультрацентрифугирования.
Результаты. При использовании только одного из вышеперечисленных подходов результат в значительной степени зависел от статуса P53 в анализируемых опухолевых клетках. Комбинация коррекции эпигенетического профиля посредством ингибирования активности деацетилаз с генетической регуляцией или с экзосомами от клеток с диким типом P53 продемонстрировала значительный синергический эффект и увеличение эффективности подавления роста опухолевых клеток в несколько раз по сравнению с использованием монотерапии.
Заключение. По-видимому, стратегия совместного использования генетических методов, эпигенетической корректировки и особенностей межклеточной коммуникации, влияющих на различные части регуляторной сети P53, позволит существенно усилить эффективность противоопухолевой терапии, нацеленной на P53.
Об авторах
Роман Александрович Ковалeв
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»
Email: kovalev_ra@pnpi.nrcki.ru
ORCID iD: 0000-0003-2214-0269
SPIN-код: 1386-2357
Россия, Гатчина, Ленинградская обл.
Елена Вячеславовна Семенова
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»
Email: semenova_el.spb@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-0852-6595
SPIN-код: 2758-6825
канд. биол. наук
Россия, Гатчина, Ленинградская обл.Татьяна Александровна Штам
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»; Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт»
Email: Shtam_ta@pnpi.nrcki.ru
ORCID iD: 0000-0003-0651-4785
SPIN-код: 3738-8187
канд. биол. наук
Россия, Гатчина, Ленинградская обл.; МоскваВладимир Станиславович Бурдаков
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»
Email: Burdakov_vs@pnpi.nrcki.ru
ORCID iD: 0000-0001-6025-7367
SPIN-код: 8832-9047
Россия, Гатчина, Ленинградская обл.
Елена Юрьевна Варфоломеева
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Национального исследовательского центра «Курчатовский институт»
Автор, ответственный за переписку.
Email: Varfolomeeva_EY@pnpi.nrcki.ru
ORCID iD: 0000-0003-3287-4709
SPIN-код: 9426-1667
Scopus Author ID: 6701723593
канд. биол. наук
Россия, Гатчина, Ленинградская обл.Список литературы
- Brown CJ, Lain S, Verma CS, et al. Awakening guardian angels: drugging the p53 pathway. Nat Rev Cancer. 2009;9(12):862–873. doi: 10.1038/nrc2763 EDN: YVPHQB
- Levine AJ, Oren M. The first 30 years of p53: growing ever more complex. Nat Rev Cancer. 2009;9(10):749–758. doi: 10.1038/nrc2723 EDN: NABKIR
- Goh AM, Coffill CR, Lane DP. The role of mutant p53 in human cancer. J Pathol. 2011;223(2):116–126. doi: 10.1002/PATH.2784
- Vousden KH, Prives C. Blinded by the light: the growing complexity of p53. Cell. 2009;137(3):413–431. doi: 10.1016/j.cell.2009.04.037 EDN: MMQMUR
- Li XL, Zhou J, Chen ZR, et al. P53 mutations in colorectal cancer – molecular pathogenesis and pharmacological reactivation. World J Gastroenterol. 2015;21(1):84–93. doi: 10.3748/wjg.v21.i1.84 EDN: YVUYCN
- Makarov EM, Shtam TA, Kovalev RA, et al. The rare nonsense mutation in p53 triggers alternative splicing to produce a protein capable of inducing apoptosis. PLoS One. 2017;12(9):e0185126. doi: 10.1371/journal.pone.0185126 EDN: XNSKIQ
- Ventura A, Kirsch DG, McLaughlin ME, et al. Restoration of p53 function leads to tumour regression in vivo. Nature. 2007;445(7128):661–665. doi: 10.1038/nature05541 EDN: YYSOQD
- Xue W, Zender L, Miething C, et al. Senescence and tumour clearance is triggered by p53 restoration in murine liver carcinomas. Nature. 2007;445(7128):656–660. doi: 10.1038/nature05529 EDN: YYDQQL
- Lane DP, Cheok CF, Lain S. P53-based cancer therapy. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2010;2(9):a001222. doi: 10.1101/cshperspect.a001222
- Turner BM. Reading signals on the nucleosome with a new nomenclature for modified histones. Nat Struct Mol Biol. 2005;12(2):110–112. doi: 10.1038/nsmb0205-110
- Semenova EV, Filatov MV. Genetic and epigenetic markers of gliomas. Cell and Tissue Biology. 2013;7(4):303–313. doi: 10.1134/S1990519X13040123 EDN: RFNTSH
- Ohashi M, Kanai F, Ueno H, et al. Adenovirus mediated p53 tumour suppressor gene therapy for human gastric cancer cells in vitro and in vivo. Gut. 1999;44(3):366–371. doi: 10.1136/gut.44.3.366
- Terui T, Murakami K, Takimoto R, et al. Induction of PIG3 and NOXA through acetylation of p53 at 320 and 373 lysine residues as a mechanism for apoptotic cell death by histone deacetylase inhibitors. Cancer Res. 2003;63(24):8948–8954.
- Bandyopadhyay D, Mishra A, Medrano E. Overexpression of histone deacetylase 1 confers resistance to sodium butyrate-mediated apoptosis in melanoma cells through a p53-mediated pathway. Cancer Res. 2004;64(21):7706–7710. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-03-3897
- Marouco D, Garabadgiu AV, Melino G, et al. Lysine-specific modifications of p53: a matter of life and death? Oncotarget. 2013;4(10):1556–1571. doi: 10.18632/oncotarget.1436 EDN: SKYFPH
- Xie C, Wu B, Chen B, et al. Histone deacetylase inhibitor sodium butyrate suppresses proliferation and promotes apoptosis in osteosarcoma cells by regulation of the MDM2-p53 signaling. Onco Targets Ther. 2016;9:4005–4013. doi: 10.2147/OTT.S105418
- Kovalev RA, Shtam TA, Karelov DV, et al. Histone deacetylase inhibitors cause TP53-dependent induction of p21/Waf1 in tumor cells with TP53. Cell and Tissue Biology. 2015;9(3):191–197. doi: 10.1134/S1990519X15030086 EDN: UEWFIZ
- Kovalev RA, Shtamm TA, Ibatulin FM, et al. Anti-tumor therapy possibilities of epigenetic trend on models in vitro. Problems in oncology. 2012;58(6):800–807. EDN: RCAZAP
- Sossai P. Butyric acid: what is the future for this old substance? Swiss Med Wkly. 2012;142:w13596. doi: 10.4414/smw.2012.13596
- Mu D, Gao Z, Guo H, et al. Sodium butyrate induces growth inhibition and apoptosis in human prostate cancer DU145 cells by up-regulation of the expression of annexin A1. PLoS One. 2013;8(9):e74922. doi: 10.1371/journal.pone.0074922
- Bukreeva EI, Aksenov ND, Bardin AA, et al. Effect of histone deacetylase inhibitor sodium butyrate (NAB) on transformants E1A+cHa-Ras expressing wild type p53 with suppressed transactivation function. Cell and Tissue Biology. 2009;3(5)445–453. doi: 10.1134/S1990519X09050071 EDN: MWVYFF
- Guo H, Choudhury Y, Yang J, et al. Antiglioma effects of combined use of a baculovirual vector expressing wild-type p53 and sodium butyrate. J Gene Med. 2011;13(1):26–36. doi: 10.1002/jgm.1522
- Minucci S, Pelicci PG. Histone deacetylase inhibitors and the promise of epigenetic (and more) treatments for cancer. Nat Rev Cancer. 2006;6(1):38–51. doi: 10.1038/nrc1779
- Yoo CB, Jones PA. Epigenetic therapy of cancer: past, present and future. Nat Rev Drug Discov. 2006;5(1):37–50. doi: 10.1038/nrd1930
- Yu J, Qiu S, Ge Q, et al. A novel SAHA-bendamustine hybrid induces apoptosis of leukemia cells. Oncotarget. 2015;6(24):20121–20131. doi: 10.18632/oncotarget.4041
- Qiu L, Kelso MJ, Hansen C, et al. Anti-tumour activity in vitro and in vivo of selective differentiating agents containing hydroxamate. Br J Cancer. 1999;80(8):1252–1258. doi: 10.1038/sj.bjc.6690493 EDN: BRCOFB
- Lee JH, Choy ML, Ngo L, et al. Histone deacetylase inhibitor induces DNA damage, which normal but not transformed cells can repair. Proc Natl Acad Sci USA. 2010;107(33):14639–14644. doi: 10.1073/pnas.1008522107
- Grange C, Tapparo M, Collino F, et al. Microvesicles released from human renal cancer stem cells stimulate angiogenesis and formation of lung premetastatic niche. Cancer Res. 2011;71(15):5346–5356. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-11-0241
- Kobayashi M, Salomon C, Tapia J, et al. Ovarian cancer cell invasiveness is associated with discordant exosomal sequestration of Let-7 miRNA and miR-200. J Transl Med. 2014;12:4. doi: 10.1186/1479-5876-12-4 EDN: BOYCBW
- Kovalev RA, Burdakov VS, Varfolomeeva EY, et al. Exosomes influence the engraftment of tumor cell lines in athymic mice BALB/c nude. Biosci Biotech Res Commun. 2018;11(4):535–554. doi: 10.21786/bbrc/11.4/1
- Raimondo F, Morosi L, Chinello C, et al. Advances in membranous vesicle and exosome proteomics improving biological understanding and biomarker discovery. Proteomics. 2011:11(4):709–720. doi: 10.1002/pmic.201000422
- Ung TH, Madsen HJ, Hellwinkel JE, et al. Exosome proteomics reveals transcriptional regulator proteins with potential to mediate downstream pathways. Cancer Sci. 2014;105(11):1384–1392. doi: 10.1111/cas.12534
- Yu S, Cao H, Shen B, et al. Tumor-derived exosomes in cancer progression and treatment failure. Oncotarget. 2015;6(35):37151–37168. doi: 10.18632/oncotarget.6022
- Webber J, Yeung V, Clayton A. Extracellular vesicles as modulators of the cancer microenvironment. Semin Cell Dev Biol. 2015;40:27–34. doi: 10.1016/j.semcdb.2015.01.013
- Jørgensen MM, Bæk R, Varming K. Potentials and capabilities of the extracellular vesicle (EV) array. J Extracell Vesicles. 2015;4:26048. doi: 10.3402/jev.v4.26048
- Fujita Y, Yoshioka Y, Ochiya T. Extracellular vesicle transfer of cancer pathogenic components. Cancer Sci. 2016;107(4):385–390. doi: 10.1111/cas.12896
- Shtam TA, Kovalev RA, Varfolomeeva EY, et al. Exosomes are natural carriers of exogenous siRNA to human cells in vitro. Cell Commun Signal. 2013;11:88. doi: 10.1186/1478-811X-11-88 EDN: QPDDMM
- Burdakov VS, Kovalev RA, Pantina RA, et al. Exosomes transfer p53 between cells and can suppress growth and proliferation of p53-negative cells. Cell and Tissue Biology. 2018;12(1):20–26. doi: 10.1134/S1990519X18010030 EDN: XXNGHJ
- Urata YN, Takeshita F, Tanaka H, et al. Targeted knockdown of the kinetochore protein D40/Knl-1 inhibits human cancer in a p53 status-independent manner. Sci Rep. 2015;5:13676. doi: 10.1038/srep13676
- Neubauer A, He M, Schmidt CA, et al. Genetic alterations in the p53 gene in the blast crisis of chronic myelogeneous leukemia: analysis by polymerase chain reaction based techniques. Leukemia. 1993;7(4):593–600.
- Belloc F, Dumain P, Boisseau MR, et al. A flow cytometric method using Hoechst 33342 and propidium iodide for simultaneous cell cycle analysis and apoptosis determination in unfixed cells. Cytometry. 1994;17(1):59–65. doi: 10.1002/cyto.990170108
- Naryzhny SN. Blue Dry Western: Simple, economic, informative, and fast way of immunodetection. Anal Biochem. 2009;392(1):90–95. doi: 10.1016/j.ab.2009.05.037
- Kastenhuber ER, Lowe SW. Putting p53 in context. Cell. 2017;170(6):1062–1078. doi: 10.1016/j.cell.2017.08.028
- Zhang S, Carlsen L, Hernandez Borrero L, et al. Advanced strategies for therapeutic targeting of wild-type and mutant p53 in cancer. Biomolecules. 2022;12(4):548. doi: 10.3390/biom12040548 EDN: TXXOPI
- Tchelebi L, Ashamalla H, Graves PR. Mutant p53 and the response to chemotherapy and radiation. Subcell Biochem. 2014;85:133–159. doi: 10.1007/978-94-017-9211-0_8
- Saldaña-Meyer R, Recillas-Targa F. Transcriptional and epigenetic regulation of the p53 tumor suppressor gene. Epigenetics. 2011;6(9):1068–1077. doi: 10.4161/epi.6.9.16683
- Hao Q, Lu H, Zhou X. A potential synthetic lethal strategy with PARP inhibitors: Perspective on ‘Inactivation of the tumor suppressor p53 by long noncoding RNA RMRP’. J Mol Cell Biol. 2021;13(9):690–692. doi: 10.1093/jmcb/mjab049 EDN: ZINWII
- Tazawa H, Kagawa S, Fujiwara T. Advances in adenovirus-mediated p53 cancer gene therapy. Expert Opin Biol Ther. 2013;13(11):1569–1583. doi: 10.1517/14712598.2013.845662
- Pagliaro LC, Keyhani A, Williams D, et al. Repeated intravesical instillations of an adenoviral vector in patients with locally advanced bladder cancer: a phase I study of p53 gene therapy. J Clin Oncol. 2003;2(11):22247–2253. doi: 10.1200/JCO.2003.09.138
- Gabrilovich DI. INGN 201 (Advexin): adenoviral p53 gene therapy for cancer. Expert Opin Biol Ther. 2006;6(8):823–832. doi: 10.1517/14712598.6.8.823
- Valente JFA, Queiroz JA, Sousa F. p53 as the focus of gene therapy: past, present and future. Curr Drug Targets. 2018;19(15):1801–1817. doi: 10.2174/1389450119666180115165447 EDN: JXIQGH
- Kijima M, Yoshida M, Sugita K, et al. Trapoxin, an antitumor cyclic tetrapeptide, is an irreversible inhibitor of mammalian histone deacetylase. J Biol Chem. 1993;268(30):22429–22435.
- Hsi LC, Xi X, Lotan R, et al. The histone deacetylase inhibitor suberoylanilide hydroxamic acid induces apoptosis via induction of 15-lipoxygenase-1 in colorectal cancer cells. Cancer Res. 2004;64(23):8778–8781. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-04-1867
- Takimoto R, Kato J, Terui T, et al. Augmentation of antitumor effects of p53 gene therapy by combination with HDAC inhibitor. Cancer Biol Ther. 2005;4(4):421–428. doi: 10.4161/cbt.4.4.1620
- Lain S, Hollick JJ, Campbell J, et al. Discovery, in vivo activity, and mechanism of action of a small-molecule p53 activator. Cancer Cell. 2008;13(5):454–463. doi: 10.1016/j.ccr.2008.03.004
Дополнительные файлы
