РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ФАГОВЫХ ГЕНОВ СРЕДИ ШТАММОВ STREPTOCOCCUS PYOGENES СЕРОТИПА М49


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В данной работе методами гибридизации и полимеразной цепной реакции проведен молекулярно-генетический анализ распространенности профаговых генов среди штаммов S. pyogenes серотипа М49. Выявлены группы генов умеренных бактериофагов, как наиболее характерные, так и наименее характерные для штаммов исследуемого серотипа. Обнаружено значительное сходство наборов профаговых генов у штаммов, выделенных в близких географических регионах и вызывающих сходные патологические процессы. Выявлена ассоциация генов определенных фаговых интеграз и генов, кодирующих факторы патогенности.

Об авторах

Екатерина Михайловна ПОЛЯКОВА

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН», Санкт-Петербург

Email: ekaterinapolvakova@rambler.ru
Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, д. 12

J J FERRETTI

Университет г. Оклахомы, США

А В ДМИТРИЕВ

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН», Санкт-Петербург

Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, д. 12

А А ТОТОЛЯН

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН», Санкт-Петербург

академик РАМН Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, д. 12

А И СУВОРОВ

ГУ «Научно-исследовательский институт экспериментальной медицины СЗО РАМН», Санкт-Петербург

Санкт-Петербург, 197376, ул. Академика Павлова, д. 12

Список литературы

  1. Полякова Е., Гао В., Янг Я., Суворов., Тотолян А. Молекулярно-генетическое сравнение штаммов Streptococcus pyogenes типов етті и етт12 по набору профаговых генов // ЖМЭИ. 2001. № 2. С. 18-24.
  2. Beres S.B., Sylva G.L., Barbian K.D. et al. Genome sequence of a serotype М3 strain of group A Streptococcus: phage-encoded toxins, the high-virulence phenotype, and clone emergence // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 15. P. 10078-10083.
  3. Beres S.B., Musser J.M. Contribution of exogenous genetic elements to the group A Streptococcus metagenome // PLoS ONE. 2007. Vol. 2. № 8. e800.
  4. Brussovv H., Canchaya C., and Hardt W.D. Phages and the evolution of bacterial pathogens: from genomic rearrangements to lysogenic conversion // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004. Vol. 68. № 3. P. 560-602.
  5. Ekelund K., Skinhoj P., Madsen J. et al. Reemergence of emml and a changed superantigen profile for group A streptococci causing invasive infections: results from a nationwide study // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. №4. P. 1789-1796.
  6. Feuetti J.J., McShan W.M., Ajdic D. et al. Complete Genome Sequence of an Ml Strain of Streptococcus pyogenes // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2001. Vol. 98. P. 4658^1663.
  7. Goshom S.C., Schlievert P.M. Bacteriophage association of streptococcal pyrogenic exotoxin type C // J. Bacteriol. 1989. Vol. 171. № 8. P. 3068-3073.
  8. Green N.M., Beres S.B., Graviss E.A. et al. Genetic diversity among type emm28 group A Streptococcus strains causing invasive infections and pharyngitis // J. Clin. Microbiol. 2005. Vol. 43. № 8. P. 4083-4091.
  9. Ikcbe T., Endo M., Ueda Y. et al. The genetic properties of Streptococcus pyogenes emm49 genotype strains recently emerged among severe invasive infections in Japan // Jpn. J. Inf. Dis. 2004. Vol. 57. № 4. P. 187- 188.
  10. Jing H., Ning В., Hao H. et al. Epidemiological analysis of group A streptococci recovered from patients in China//Med. Microbiol. 2006. Vol. 55. № 8. P. 1101 - 1107.
  11. Maniatis T., Fritsch E.F. and Sambrook J. Molecular cloning: a laboratory manual // Cold Spring Harbor. Labor. Press. NY., 1982.
  12. Nakagawa I., Kurokawa К., Yamashita A. et al. Genome sequence of an М3 strain of Streptococcus pyogenes reveals a large-scale genomic rearrangement in invasive strains and new insights into phage evolution // Genome Res. 2003. Vol. 13. № 6A. P. 1042-1055.
  13. Polyakova E., Suvorov A., Gao W., Yang H., Feretti J. GAS strain from various sources have specific and different phage genes profiles //Article ofXVII LISSSD. 2008. P 248.
  14. Smoot J.C., Barbian K.D., Gompel J.J. et al. Genome sequence and comparative microarray analysis of serotype M18 group A Streptococcus strains associated with acute rheumatic fever outbreaks // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. Vol. 99. № 7. P 4668^1673.
  15. Sumby P, Porceila S.F., Madrigal A.G. et al. Evolutionary origin and emergence of a highly successful clone of serotype Ml group a Streptococcus involved multiple horizontal gene transfer events // J. Infect. Dis. 2005. Vol. 192. № 5. P. 771-782.
  16. Suvorov A.N., Polyakova E.M., McShan W.M. Bacteriophage content of M49 strains of Streptococcus pyogenes // FEMS Microbiol. Lett. 2009. Vol. 294. № 1. P. 9-15.
  17. Vlaminckx B.J., Schuren F.H., Montijn R.C. et al. Determination of the relationship between group A streptococcal genome content, M type, and toxic shock syndrome by a mixed genome microarray // Infect. Immunol. 2007. Vol. 75. № 5. P. 2603-2611.
  18. Wahl R.U., Liitticken R., Stanzel S. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pyogenes infections in Germany, 1996-2002: results from a voluntary laboratory surveillance system // Clin. Microbiol. Infect. 2007. Vol. 13. № 12. P. 1173-1178.
  19. Yu C., Ferretti J. Molecular epidemiologic analysis of the type A streptococcal exotoxin (erythrogenic toxin) gene (speA) in clinical Streptococcus pyogenes strains // Infect. Immunol. 1989. Vol. 57. № 12. P. 3715-3719.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ПОЛЯКОВА Е.М., FERRETTI J.J., ДМИТРИЕВ А.В., ТОТОЛЯН А.А., СУВОРОВ А.И., 2011

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».