Комбинация мутаций генов otu и Rif1 позволяет анализировать сателлитную ДНК в политенных хромосомах герминальных клеток яичников Drosophila melanogaster
- Авторы: Колесникова Т.Д.1, Нохова А.Р.2, Шацких А.С.3, Кленов М.С.4, Жимулев И.Ф.1
-
Учреждения:
- ФГБУН “Институт молекулярной и клеточной биологии” Сибирского отделения Российской академии наук
- Новосибирский государственный университет
- Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
- Институт молекулярной генетики РАН
- Выпуск: Том 515, № 1 (2024)
- Страницы: 19-24
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/2686-7389/article/view/262819
- DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738924020048
- EDN: https://elibrary.ru/WFYUYA
- ID: 262819
Цитировать
Аннотация
Политенные хромосомы дрозофилы – классическая модель для цитогенетических исследований. Однако гетерохроматиновые районы хромосом обычно недореплицированы, что препятствует их анализу. Мутации гена Rif1 приводят к дополнительной репликации гетерохроматиновых последовательностей, включая сателлитную ДНК, в клетках слюнных желез. В настоящей работе мы исследовали влияние мутации Rif1 на представленность гетерохроматина в политенных хромосомах, которые формируются в герминальных питающих клетках яичников при мутации гена otu. Мы вывели линию otu11; Rif11 и обнаружили, что на фоне мутации Rif1 в клетках яичников происходит дополнительная политенизация прицентромерных районов, в том числе появляются крупные хроматиновые блоки, образованные сателлитной ДНК. Таким образом, эффекты мутации Rif1 оказались схожи в герминальных клетках и клетках слюнных желез. Система otu11; Rif11 открывает новые возможности для изучения факторов, ассоциированных с гетерохроматином, в процессе оогенеза.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Т. Д. Колесникова
ФГБУН “Институт молекулярной и клеточной биологии” Сибирского отделения Российской академии наук
Автор, ответственный за переписку.
Email: doliolida@gmail.com
Россия, Новосибирск
А. Р. Нохова
Новосибирский государственный университет
Email: doliolida@gmail.com
Россия, Новосибирск
А. С. Шацких
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Email: doliolida@gmail.com
Россия, Москва
М. С. Кленов
Институт молекулярной генетики РАН
Email: doliolida@gmail.com
Россия, Москва
И. Ф. Жимулев
ФГБУН “Институт молекулярной и клеточной биологии” Сибирского отделения Российской академии наук
Email: doliolida@gmail.com
академик
Россия, НовосибирскСписок литературы
- Marsano R.M., Giordano E., Messina G., et al. A New Portrait of Constitutive Heterochromatin: Lessons from Drosophila melanogaster // Trends Genet. 2019. V. 35. P. 615–631.
- Zhimulev I.F. Polytene Chromosomes, Heterochromatin, and Position Effect Variegation // Adv. Genet. 1998. V. 37. P. 1–555.
- Munden A., Rong Z., Sun A., et al. Rif1 inhibits replication fork progression and controls DNA copy number in Drosophila // eLife. 2018. V.7. e39140.
- Kolesnikova T.D., Kolodyazhnaya A.V., Pokholkova G.V., et al. Effects of Mutations in the Drosophila melanogaster Rif1 Gene on the Replication and Underreplication of Pericentromeric Heterochromatin in Salivary Gland Polytene Chromosomes // Cells. 2020. V. 9. P. 1501.
- McLaughlin J.M., Bratu D.P. Drosophila melanogaster Oogenesis: An Overview // Methods Mol Biol. 2015. V. 1328. P. 1-20.
- King R.C., Riley S.F., Cassidy, J.D., et al. Giant polytene chromosomes from the ovaries of a Drosophila mutant // Science. 1981. V. 212. P. 441–443.
- Mal’ceva N.I., Gyurkovics H., Zhimulev I.F. General characteristics of the polytene chromosome from ovarian pseudonurse cells of the Drosophila melanogaster otu11 and fs(2)B mutants // Chromosome. 1995. Res. Int. J. Mol. Supramol. Evol. Asp. Chromosome Biol. V. 3. P. 191–200.
- Heino T.I. Polytene chromosomes from ovarian pseudonurse cells of the Drosophila melanogaster otu mutant. I. Photographic map of chromosome 3 // Chromosoma. 1989. V. 97. P. 363–373.
- Dej K.J., Spradling A.C. The endocycle controls nurse cell polytene chromosome structure during Drosophila oogenesis // Dev. Camb. Engl. 1999. V. 126. P. 293–303.
- Mal’ceva N.I., Zhimulev I.F. Extent of polytene in the pericentric heterochromatin of polytene chromosomes of pseudonurse cells of otu (ovarian tumor) mutants of Drosophila melanogaster // Mol. Gen. Genet. 1993. V. 240. P. 273–276.
- Koryakov D.E., Domanitskaya E.V., Belyakin S.N., et al. Abnormal tissue-dependent polytenization of a block of chromosome 3 pericentric heterochromatin in Drosophila melanogaster // J. Cell Sci. 2003. V. 116. P. 1035–1044.
- Garavís M., Méndez-Lago M., Gabelica V., et al. The structure of an endogenous Drosophila centromere reveals the prevalence of tandemly repeated sequences able to form i-motifs // Sci. Rep. 2015. V. 5. P. 13307.
- Yang F., Xi R. Silencing transposable elements in the Drosophila germline // Cell Mol Life Sci. 2017. V. 74. P. 435–448.
- Sato K., Siomi M.C. The piRNA pathway in Drosophila ovarian germ and somatic cells // Proc Jpn Acad Ser B Phys Biol Sci. 2020. V. 96. P. 32–42.
- Wei X., Eickbush D.G., Speece I., et al. Heterochromatin-dependent transcription of satellite DNAs in the Drosophila melanogaster female germline // Elife. 2021. V. 10. e62375.