Отправить статью по E-mail Контактное ингибирование пролиферации сопровождается экспрессией PHF10D субъединицы ремоделирующего хроматин комплекса PBAF в клеточных линиях мыши и человека
- Авторы: Симонов Ю.П.1, Татарский В.В.2, Георгиева С.Г.1, Сошникова Н.В.1,3
-
Учреждения:
- Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
- Институт биологии гена Российской академии наук
- Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
- Выпуск: Том 514, № 1 (2024)
- Страницы: 111-116
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rcsi.science/2686-7389/article/view/258957
- DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738924010211
- EDN: https://elibrary.ru/KDLLXE
- ID: 258957
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Аннотация
Белок PHF10 входит в состав хроматин-ремоделирующего комплекса PBAF, регулирующего экспрессию широкого спектра генов в развивающемся и взрослом организме. PHF10 экспрессируется в виде нескольких изоформ, отличающихся доменной структурой. Изоформа PHF10A, содержащая С- концевой DPF-домен необходима для экспрессии генов пролиферации, функции остальных изоформ менее изучены. В данной работе мы установили, что при контактном ингибировании пролиферации клеток мыши и человека, прекращается экспрессия изоформы PHF10A и вместо нее экспрессируется изоформа PHF10D, не содержащая DPF-домен и 46 N-концевых аминокислот. Функция коротких PHF10D изоформ может быть связана с установлением межклеточных контактов.
Ключевые слова
Полный текст
Об авторах
Ю. П. Симонов
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
Email: so2615nat@gmail.com
Department of Transcription Factors
Россия, МоскваВ. В. Татарский
Институт биологии гена Российской академии наук
Email: so2615nat@gmail.com
Россия, Москва
С. Г. Георгиева
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
Email: so2615nat@gmail.com
академик РАН
Россия, МоскваН. В. Сошникова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
Автор, ответственный за переписку.
Email: so2615nat@gmail.com
Department of Transcription Factors
Россия, Москва; МоскваСписок литературы
- Chen K., Yuan J., Sia Y., Chen Z. Mechanism of action of the SWI/SNF family complexes // Nucleus. 2023. V. 14.
- Local A., Huang H., Albuquerque C. P., Singh N., Lee A. Y., Wang W., Wang C., Hsia J. E., Shiau A. K., Ge K., Corbett K. D., Wang D., Zhou H., Ren B. Identification of H3K4me1-associated proteins at mammalian enhancers // Nat. Genet. 2018. V. 50. P. 73–82.
- Chugunov A. O., Potapova N. A., Klimenko N. S., Tatarskiy V. V., Georgieva S. G., Soshnikova N. V. Conserved Structure and Evolution of DPF Domain of PHF10-The Specific Subunit of PBAF Chromatin Remodeling Complex // Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22.
- Brechalov A. V., Georgieva S. G., Soshnikova N. V. Mammalian cells contain two functionally distinct PBAF complexes incorporating different isoforms of PHF10 signature subunit // Cell Cycle. 2014. V. 13. P. 1970–1979.
- Lessard J., Wu J. I., Ranish J. A., Wan M., Winslow M. M., Staahl B. T., Wu H., Aebersold R., Graef I. A., Crabtree G. R. An essential switch in subunit composition of a chromatin remodeling complex during neural development // Neuron. 2007. V. 55. P. 201–215.
- Viryasova G. M., Tatarskiy Jr V. V., Sheynov A. A., Tatarskiy E. V., Sud’ina G.F., Georgieva S. G., Soshnikova N. V. PBAF lacking PHD domains maintains transcription in human neutrophils // Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Res. 2019. V. 1866. P. 118525.
- Soshnikova N. V., Azieva A. M., Klimenko N., Khamidullina A. I., Feoktistov A. V., Sheynov A. A., Brechalov A. V., Tatarskiy V. V., Georgieva S. G. A novel chromatin-remodeling complex variant, dcPBAF, is involved in maintaining transcription in differentiated neurons // Front. Cell Dev. Biol. 2023. V. 11. P. 1271598.
- Eagle H., Levine E. M. Growth regulatory effects of cellular interaction // Nature. 1967. V. 213. P. 1102–1106.
- McClatchey A.I., Yap A. S. Contact inhibition (of proliferation) redux // Curr. Opin. Cell Biol. 2012. V. 24. P. 685–694.
- Fan Y., Meyer T. Molecular control of cell density-mediated exit to quiescence // Cell Rep. 2021. V. 36. P. 109436.
- Benaud C. M., Dickson R. B. Adhesion-regulated G1 cell cycle arrest in epithelial cells requires the downregulation of c-Myc // Oncogene. 2001. V. 20. P. 4554–4567.
- Gumbiner B. M., Kim N.-G. The Hippo-YAP signaling pathway and contact inhibition of growth // J. Cell Sci. 2014. V. 127. P. 709–717.
- Aragona M., Panciera T., Manfrin A., Giulitti S., Michielin F., Elvassore N., Dupont S., Piccolo S. A mechanical checkpoint controls multicellular growth through YAP/TAZ regulation by actin-processing factors // Cell. 2013. V. 154. P. 1047–1059.
- Zeng Q., Hong W. The emerging role of the hippo pathway in cell contact inhibition, organ size control, and cancer development in mammals // Cancer Cell. 2008. V. 13. P. 188–192.
- Banga S. S., Peng L., Dasgupta T., Palejwala V., Ozer H. L. PHF10 is required for cell proliferation in normal and SV40-immortalized human fibroblast cells // Cytogenet. Genome Res. 2009. V. 126. P. 227–242.
Дополнительные файлы
Доп. файлы
Действие
1.
JATS XML
2.
Рис. 1. (а) Схематичное изображение комплекса PBAF. Разными цветами указаны разные субъединицы и обозначены модули комплекса (адаптировано из [1]). (б) Доменная организация изоформ PHF10. Обозначены различные домены. Зеленым, синим и оранжевым указаны последовательности, которыми отличаются изоформы.
Скачать (448KB)
3.
Рис. 2. (а) Мышиные эмбриональные фибробласты MEF через 1, 3, 4 и 5 дней после пассажа на 60 мм чашки Петри. (б) Вестерн-блоттинг изоформ Phf10 (указаны справа на верхней панели), субъединиц комплекса PBAF: Baf180, Brg1, Baf155 в лизатах MEF, отобранных в различной плотности. Окрашивание антителами к b-тубулину использо- вали в качестве контроля нанесения. Изменение экспрессии Циклина Д1 (CyclinD1) и P27 характеризует свойство клеток пролиферировать. (в) Изменение уровня мРНК изоформ Phf10, содержащих DPF-домен (Phf10P = Phf10A + Phf10B) и содержащих PDSM-мотив (Phf10-S = Phf10C + Phf10D) на С-конце. По оси Y показано изменение уровня РНК относительно контроля при нормировании на уровень экспрессии гена RPLP0. Во всех экспериментах измерения проведены в 3 повторностях и представлены в виде среднее ± стандартное откло- нение. * – p < 0.005 сравнение с контролем (однофакторный дисперсионный анализ с критерием множественных сравнений Даннета).
Скачать (539KB)
4.
Рис. 3. Вестерн-блоттинг изоформ PHF10 (указаны справа на верхней панели) в лизатах клеток RKO, отобранных в различной плотности. Окрашивание антителами к b-тубулину использовали в качестве контроля нанесения. Изменение экспрессии MYC и P27 характеризуют свойство клеток пролиферировать.
Скачать (206KB)
