Нейрональная и мышечная дифференцировки клеток млекопитающих сопровождаются сменой экспрессирующихся изоформ PHF10

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Комплекс ремоделирования хроматина PBAF играет важнейшую роль в регуляции экспрессии генов в процессе дифференцировки тканей и при развитии организма. Специфичность взаимодействие комплекса с хроматином определяется наличием в ряде его субъединиц доменов, узнающих определенные модификации N-концевых последовательностей гистонов. PHF10, субъединица комплекса PBAF, содержит DPF-домен, являющийся уникальным доменом взаимодействия с хроматином. В клетках позвоночных также присутствует изоформа PHF10, не имеющая домена DPF. В данной работе показано, что при нейрональной и мышечной дифференцировке клеток человека и мыши меняется экспрессия изоформ PHF10: формы, не имеющие DPF, замещают формы, в которых он присутствует. Замена изоформ PHF10 в комплексе PBAF может влиять на его избирательность в регуляции генов дифференцирующихся клеток.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Д. О. Байрамова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

А. М. Азиева

Научно-исследовательский центр «Курчатовский институт»

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва

А. В. Феоктистов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

С. Г. Георгиева

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук

Email: so2615@gmail.com

академик РАН

Россия, Москва

Н. В. Сошникова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук; Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта

Автор, ответственный за переписку.
Email: so2615@gmail.com
Россия, Москва; Москва

Список литературы

  1. Moshkin Y. M., et al. // Mol Cell Biol. 2012. V. 32. № 3. P. 675–688.
  2. Sokpor G., et al. // Front Mol Neurosci. 2017. V. 10. P. 243.
  3. Centore R. S., et al // Trends Genet. 2020. V. 36. № 12. P. 936–950.
  4. Singh A., et al. // Cell Biochem Biophys. 2023. V. 81. № 2. P. 167–187.
  5. Krasteva V., et al. // Exp Hematol. 2017. V. 48. P. 58–71.
  6. Brechalov A. V., et al. // Cell Cycle. 2014. V. 13 № 12. P. 1970–1979.
  7. Soshnikova N. V., et al. // Acta Naturae. 2020. V. 12. № 4. P. 57–65.
  8. Chugunov A. O., et al. // Int J Mol Sci. 2021. V. 22. № 20.
  9. Regadas I., et al. // Mol Cell. 2021. Vol. 81. № 8. P. 1766–1780.
  10. Viryasova G. M., et al .// Biochim Biophys Acta Mol Cell Res. 2019. V. 1866. № 12. P. 118525.
  11. Lessard J., et al // Neuron. 2007. V. 55. № 2. P. 201–215.
  12. Banga S. S., et al. // Cytogenet Genome Res. 2009. V. 126. № 3. P. 227–242.
  13. Tatarskiy V. V.et al. // Sci Rep. 2017. V. 7. № 1. P. 5645.
  14. GTEx Consortium // Nat Genet. 2013. V. 45. № 6. P. 580–585.
  15. Jing L., et al. // Bio Protoc. 2012. V. 2. № 10.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. (а) Схема изоформ PHF10. Обозначены характерные домены и мотивы изоформ PHF10. (б) Предсказан- ная структура PHF10-Pl (Q8WUB8) согласно Alpha Fold database (https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q8WUB8). (в) Экс- прессия изоформ PHF10-P, PHF10-S и их соотношение в различных тканях человека согласно базе данных GTEx (The Genotype-Tissue Expression (GTEx) Project data). По оси ординат TPM (количество транскриптов на миллион прочтений в образце).

3. Рис. 2. (а) и (б) Нейрональная дифференцировка клеток человека линии SH-SY5Y (А) и клеток мыши линии Neuro 2a (б): левая панель – визуализация с помощью негативного контрастирования фенотипа клеток в течение десяти дней дифференцировки; правая панель – Вестерн-блоттинг изоформ PHF10 без дифференцировки, в середине и по окончании дифференцировки. Изоформы обозначены справа. Слева показан маркер молекулярных масс – 55 и 70кДа. Окраска антителами к тубулину использовалась как контроль нанесения в обоих случаях.

Скачать (819KB)
4. Рис. 3. Вестерн-блоттинг изоформ Phf10 в процессе миогенной дифференцировки клеток мыши линии С2С12. Изоформы обозначены справа. Слева пока- зан маркер молекулярных масс – 55 и 70кДа. Окра- ска антителами к белку Gapgh использовалась как контроль нанесения.

Скачать (199KB)

© Российская академия наук, 2024

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах