Interdomain Interactions of the PCID2 Protein, One of the Subunits of the TREX-2 mRNA Export Complex in Drosophila melanogaster


Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The TREX-2 complex is responsible for the export of mRNA from the nucleus to the cytoplasm and consists of four proteins. It has recently been shown that the PCID2 subunit of TREX-2 is responsible for the specific recognition of mRNA by the TREX-2 complex. The majority of the protein contains the PCI domain, which has surfaces for RNA binding. The PCI domain includes the central region of the protein, which has a surface for non-specific RNA binding, M-PCID2, and the C-terminal part of the PCI domain and the C-terminal part of the protein, C-PCID2, which has a surface for specific RNA recognition. The N-terminal part of PCID2 contains a region whose function is unknown. Because the TREX-2 complex binds only a specific mRNA and only at a specific stage, we hypothesized that the N-terminal part of PCID2 might modulate the binding of C-PCID2 to RNA by binding to it and covering its RNA binding domain. We showed that the N-terminal region interacts with C-PCID2.The binding of C-PCID2 to RNA is then not impaired. Also, the binding of C-PCID2 to RNA does not disrupt its interaction with the N-terminal part of the protein (N-PCID2). Thus, C-PCID2 can interact with N-PCID2 and RNA by different surfaces. This intrinsic interaction is probably necessary at one of the stages of activity of the TREX-2 complex.

About the authors

Y. A. Vdovina

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russian Federation

Email: d_dmitrieva@mail.ru
Moscow, Russian Federation

S. G. Georgieva

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russian Federation

Email: d_dmitrieva@mail.ru
Moscow, Russian Federation

D. V. Kopytova

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russian Federation

Author for correspondence.
Email: d_dmitrieva@mail.ru
Moscow, Russian Federation

References

  1. Fischer T. et al. The mRNA export machinery requires the novel Sac3p-Thp1p complex to dock at the nucleoplasmic entrance of the nuclear pores // The EMBO journal. England, 2002. Vol. 21, № 21. P. 5843–5852.
  2. Kurshakova M.M. et al. SAGA and a novel Drosophila export complex anchor efficient transcription and mRNA export to NPC // The EMBO journal. England, 2007. Vol. 26, № 24. P. 4956–4965.
  3. Lu Q. et al. Arabidopsis homolog of the yeast TREX-2 mRNA export complex: components and anchoring nucleoporin // The Plant journal: for cell and molecular biology. England, 2010. Vol. 61, № 2. P. 259–270.
  4. Luna R., Gonzalez-Aguilera C., Aguilera A. Transcription at the proximity of the nuclear pore: a role for the THP1-SAC3-SUS1-CDC31 (THSC) complex // RNA biology. United States, 2009. Vol. 6, № 2. P. 145–148.
  5. Wickramasinghe V.O. et al. mRNA export from mammalian cell nuclei is dependent on GANP // Current biology: CB. England, 2010. Vol. 20, № 1. P. 25–31.
  6. Wickramasinghe V.O. et al. Selective nuclear export of specific classes of mRNA from mammalian nuclei is promoted by GANP // Nucleic acids research. England, 2014. Vol. 42, № 8. P. 5059–5071.
  7. Vdovina Y.A. et al. PCID2 Subunit of the Drosophila TREX-2 Complex Has Two RNA-Binding Regions // Current issues in molecular biology. Switzerland, 2023. Vol. 45, № 7. P. 5662–5676.
  8. Glukhova A.A. et al. PCID2, a subunit of the Drosophila TREX-2 nuclear export complex, is essential for both mRNA nuclear export and its subsequent cytoplasmic trafficking // RNA Biology. United States, 2021. Vol. 18, № 11. P. 1969–1980.
  9. Ellisdon A.M. et al. Structural basis for the assembly and nucleic acid binding of the TREX-2 transcription-export complex // Nature structural & molecular biology. United States, 2012. Vol. 19, № 3. P. 328–336.
  10. Viphakone N. et al. TREX exposes the RNA-binding domain of Nxf1 to enable mRNA export // Nature communications. England, 2012. Vol. 3. P. 1006.
  11. Golovanov A.P. et al. The solution structure of REF2-I reveals interdomain interactions and regions involved in binding mRNA export factors and RNA // RNA (New York, NY). 2006. Vol. 12, № 11. P. 1933–1948.
  12. Hautbergue G.M. et al. Mutually exclusive interactions drive handover of mRNA from export adaptors to TAP // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. United States, 2008. Vol. 105, № 13. P. 5154–5159.
  13. Kopytova D. et al. ORC interacts with THSC/TREX-2 and its subunits promote Nxf1 association with mRNP and mRNA export in Drosophila // Nucleic acids research. 2016.
  14. Schneider M. et al. The Nuclear Pore-Associated TREX-2 Complex Employs Mediator to Regulate Gene Expression // Cell. United States, 2015. Vol. 162, № 5. P. 1016–1028.
  15. Aksenova V. et al. Nucleoporin TPR is an integral component of the TREX-2 mRNA export pathway // Nature communications. 2020. Vol. 11, № 1. P. 4577.
  16. Bensidoun P. et al. Nuclear mRNA metabolism drives selective basket assembly on a subset of nuclear pore complexes in budding yeast // Molecular cell. United States, 2022. Vol. 82, № 20. P. 3856–3871.e6.
  17. Jani D. et al. Functional and structural characterization of the mammalian TREX-2 complex that links transcription with nuclear messenger RNA export // Nucleic acids research. England, 2012. Vol. 40, № 10. P. 4562–4573.
  18. Umlauf D. et al. The human TREX-2 complex is stably associated with the nuclear pore basket // Journal of cell science. England, 2013. Vol. 126, № Pt 12. P. 2656–2667.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».