Circadian Regulation of Expression of Carotenoid Metabolism Genes (PSY2, LCYE, CRTRB1, NCED1) in Leaves of Tomato Solanum lycopersicum L.

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The circadian dynamics of the expression of key genes of carotenoid metabolism (PSY2, LCYE, CrtRB1, and NCED1) in the photosynthetic tissue of tomato Solanum lycopersicum L. (cultivar Korneevsky) plants was characterized. An in silico analysis of the gene expression pattern was carried out and a high level of their transcripts was detected in the leaf tissue. qRT-PCR analysis of gene expression was performed at six time points during the day and found the highest levels of PSY2, LCYE and NCED1 transcripts in the second half of the light phase, and CrtRB1 – at the end of the dark phase. The content and composition of carotenoids in leaf tissue in the middle of the day was determined and it was shown that the leaf accumulates 1.5 times more compounds of the ɛ/β-branch of carotenoid biosynthesis pathway than compounds of the β/β-branch.

About the authors

M. A. Filyushin

Institute of Bioengineering, Federal Research Center “Fundamentals of Biotechnology” of the Russian Academy of Sciences

Author for correspondence.
Email: michel7753@mail.ru
Russian Federation, Moscow

A. V. Shchennikova

Institute of Bioengineering, Federal Research Center “Fundamentals of Biotechnology” of the Russian Academy of Sciences

Email: michel7753@mail.ru
Russian Federation, Moscow

E. Z. Kochieva

Institute of Bioengineering, Federal Research Center “Fundamentals of Biotechnology” of the Russian Academy of Sciences

Email: michel7753@mail.ru
Russian Federation, Moscow

References

  1. Stra A., Almarwaey L.O., Alagoz Y., et al. // Front. Plant Sci. 2023. V. 13. 1072061.
  2. Stauder R., Welsch R., Camagna M., et al. // Front. Plant Sci. 2018. V. 9. 255.
  3. Li F., Vallabhaneni R., Yu J., Rocheford T., et al. // Plant Physiol. 2008. V. 147(3). P. 1334–1346.
  4. Ezquerro M., Burbano-Erazo E., Rodriguez-Concepcion M. // Plant Physiol. 2023. V. 193(3). P. 2021–2036.
  5. LaPorte M.F., Vachev M., Fenn M., et al. // G3 (Bethesda). 2022. V. 12(3). jkac006.
  6. Hu L., Feng S., Liang G., et al. // AMB Express. 2021. V. 11(1). 83.
  7. López-Ráez J.A., Kohlen W., Charnikhova T., et al. // New Phytol. 2010. V. 187. P. 343–354.
  8. Zhang M., Yuan B., Leng P. // J. Exp. Bot. 2009. V.60. P. 1579–1588.
  9. Kai W., Fu Y., Wang J., Liang B., et al. // Sci Rep. 2019. V. 9. 16943.
  10. Yang R., Yang T., Zhang H., et al. // Plant Physiol. Biochem. 2014. V. 77. P. 23–34.
  11. Yari Kamrani Y., Shomali A., Aliniaeifard S., et al. // Cells. 2022. V. 11(7). 1154.
  12. Li F., Vallabhaneni R., Yu J., Rocheford T., et al. // Plant Physiol. 2008. V. 147. P. 1334–1346.
  13. Sun T.H., Liu C.Q., Hui Y.Y., et al. // J. Integr. Plant Biol. 2010. V. 52. P. 868–878.
  14. Baek D., Kim W.Y., Cha J.Y., et al. // Plant Physiol. 2020. V. 184(1). P. 443–458.
  15. Efremov G.I., Ashikhmin A.A., Shchennikova A.V., et al. // Russian Journal of Plant Physiology. 2023. V. 70(2). P. 17

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».