DIFFERENT PROTEIN GROUPS INVOLVED IN TRANSCRIPTION REGULATION IN GENES OF DEVELOPMENT AND HOUSEKEEPING IN DROSOPHILA

Мұқаба

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Ашық рұқсат Ашық рұқсат
Рұқсат жабық Рұқсат берілді
Рұқсат жабық Тек жазылушылар үшін

Аннотация

Antibodies to histone modifications and an insulator protein involved in the processes of transcription initiation and elongation are mapped in Drosophila polytene chromosomes. The CHRIZ protein (chromatin insulator) and H3K36me3 histone modification (RNA elongation) are detected only in the localization of housekeeping genes (interbands and gray bands of polytene chromosomes) and never in the regions of development genes (black bands and large puffs arising from them). Antibodies to H3S10P histone modification, which is associated with the initial elongation of the RNA strand during transcription, are found exclusively in small puffs, but not in housekeeping gene localization sites or large ecdysone-induced puffs, where housekeeping genes are localized. Antibodies to H4R3me2 histone modification (a co-repressor of the ecdysone receptor) are detected only in large α-induced puffs.

Авторлар туралы

I. Zhimulev

Institute of Molecular and Cellular Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Хат алмасуға жауапты Автор.
Email: zhimulev@mcb.nsc.ru
Russian Federation, Novosibirsk

T. Vatolina

Institute of Molecular and Cellular Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: zhimulev@mcb.nsc.ru
Russian Federation, Novosibirsk

G. Pokholkova

Institute of Molecular and Cellular Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: zhimulev@mcb.nsc.ru
Russian Federation, Novosibirsk

O. Antonenko

Institute of Molecular and Cellular Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: zhimulev@mcb.nsc.ru
Russian Federation, Novosibirsk

M. Maltseva

Institute of Molecular and Cellular Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: zhimulev@mcb.nsc.ru
Russian Federation, Novosibirsk

Әдебиет тізімі

  1. Lenhard B., Sandelin A., Carninci P. Metazoan promoters: emerging characteristics and insights into transcriptional regulation // Nat. Rev. Genet. 2012. V. 13. № 4. P. 233–245.
  2. Andersson R., Sandelin A. Determinants of enhancer and promoter activities of regulatory elements // Nat. Rev. Genet. 2020. V. 21. P. 71–87.
  3. Boros I.M. Histone modification in Drosophila // Briefings in Functional Genomics. 2012. V. 11. № 4. P. 319–331.
  4. Lindehell H., Glotov A., Dorafshan E., et al. The role of H3K36 methylation and associated methyltransferases in chromosome-specific gene regulation // Sci. Adv. 2021. V. 7. № 40. eabh4390.
  5. Zhimulev I.F., Zykova T.Yu., Goncharov F.P., et al. Genetic organization of polytene chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster // PLoS One. 2014. V. 9. № 7. P. e101631.
  6. Bridges C.B. A revised map of the salivary gland X-chromosome of Drosophila melanogaster // J. Hered. 1938. V. 29. № 1. P. 11–13.
  7. Kozlova T.Yu., Semeshin V.F., Tretyakova I.V., et al. Molecular and cytogenetical characterization of the 10A1-2 band and adjoining region in the Drosophila melanogaster polytene X chromosome // Genetics. 1994. V. 136. № 3. P. 1063–1073.
  8. Zykova T.Yu., Levitsky V.G., Belyaeva E.S., et al. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome // Curr. Genomics. 2018. V.19. № 3. P. 179–191.
  9. Ashburner M., Chihara C., Meltzer P., et al. Temporal control of puffing activity in polytene chromosomes // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1974. V. 38. P. 655–662.
  10. Zhimulev I.F. Genetic organization of polytene chromosomes // Advances in Genetics. 1999. V. 39. P. 1–589.
  11. Thummel C.S. Ecdysone-regulated puff genes 2000 // Insect Biochem. Mol. Biol. 2002 V. 32. № 2. P. 113–20.
  12. King-Jones K., Thummel C. Nuclear receptors – a perspective from Drosophila // Nat. Rev. Genet. 2005. V. 6. № 4. P. 311–323.
  13. FlyBase version FB2022_06, released Desember 13, 2022.
  14. Pokholkova G.V., Demakov S.A., Andreenkov O.V., et al. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing // Plos One. 2018. V. 13. № 4. P. e0192634.
  15. Boldyreva L.V., Goncharov F.P., Demakova O.V., et al. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster Cell Lines // Curr. Genomics. 2017. V. 18. № 2. P. 214–226.
  16. Sharda A., Humphrey T.C. The role of histone H3K36me3 writers, readers and erasers in maintaining genome stability // DNA Repair. 2022. № 119: 103407.
  17. Kimura S., Sawatsubashi S., Ito S., et al. Drosophila arginine methyltransferase 1 (DART1) is an ecdysone receptor co-repressor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008. V. 371. № 4. P. 889–893.
  18. Karam C.S., Kellner W.A., Takenaka N., et al. 14-3-3 mediates histone cross-talk during transcription elongation in Drosophila // PLoS Genetics. 2010. V. 6. № 6. P. e1000975.
  19. Cai W., Bao X., Deng H., et al. RNA polymerase II-mediated transcription at active loci does not require histone H3S10 phosphorylation in Drosophila. Development. 2008. V. 135. № 17. P. 2917–2925.

Қосымша файлдар

Қосымша файлдар
Әрекет
1. JATS XML
2.

Жүктеу (1MB)
3.

Жүктеу (2MB)
4.

Жүктеу (2MB)
5.

Жүктеу (1MB)

© И.Ф. Жимулев, Т.Ю. Ватолина, Г.В. Похолкова, О.В. Антоненко, М.В. Мальцева, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».