NON-CATALYTIC DOMAINS OF DNA POLYMERASE λ: INFLUENCE ON ENZYME ACTIVITY AND ITS REGULATION

封面

如何引用文章

全文:

详细

DNA polymerase λ (Polλ) belongs to the same structural X-family as DNA polymerase β, the main polymerase of base excision repair. The role of Polλ in this process remains not fully understood. A significant difference between the two DNA polymerases is the presence of an extended non-catalytic N-terminal region in the Polλ structure. The influence of this region on the interaction of Polλ with DNA and multifunctional proteins, poly(ADP-ribose)polymerase 1 (PARP1) and replication protein A (RPA), was studied in detail for the first time. The data obtained suggest that non-catalytic Polλ domains play a suppressor role both in relation to the polymerase activity of the enzyme and in interaction with DNA and PARP1.

作者简介

Ekaterina Maltseva

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine Siberian Branch of Russian Academy of Sciences

Email: lavrik@niboch.nsc.ru
Russian Federation, Moscow

Nadejda Rechkunova

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine Siberian Branch of Russian Academy of Sciences

Email: lavrik@niboch.nsc.ru
Russian Federation, Moscow

Olga. Lavrik

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine Siberian Branch of Russian Academy of Sciences

编辑信件的主要联系方式.
Email: lavrik@niboch.nsc.ru
Russian Federation, Moscow

参考

  1. Belousova E.A., Lavrik OI. DNA polymerases β and λ and their roles in cell. // DNA Repair (Amst). 2015. V. 29. P. 112–126.
  2. Beard W.A., Wilson S.H. DNA polymerase beta and other gap-filling enzymes in mammalian base excision repair. // Enzymes. 2019. V. 45. P. 1–26.
  3. Carter R.J., Parsons J.L. Base Excision Repair, a Pathway Regulated by Posttranslational Modifications. // Mol Cell Biol. 2016. V. 36. № 10. P. 1426–37.
  4. Sukhanova M., Khodyreva S., Lavrik O. Poly(ADP-ribose) polymerase 1 regulates activity of DNA polymerase beta in long patch base excision repair. // Mutat Res. 2010. V. 685. № 1–2. P. 80–9.
  5. Maltseva E.A., Krasikova Y.S., Sukhanova M.V., et al. Replication protein A as a modulator of the poly(ADP-ribose)polymerase 1 activity. // DNA Repair (Amst). 2018. V. 72. P. 28–38.
  6. Maga G., Crespan E., Wimmer U., et al. Replication protein A and proliferating cell nuclear antigen coordinate DNA polymerase selection in 8-oxo-guanine repair. // Proc Natl Acad Sci U S A. 2008. V. 105. № 52. P. 20689–94.
  7. Lebedeva N.A., Rechkunova N.I., Dezhurov S.V., et al. Comparison of functional properties of mammalian DNA polymerase lambda and DNA polymerase beta in reactions of DNA synthesis related to DNA repair. // Biochim Biophys Acta. 2005. V. 1751. № 2. P. 150–8.
  8. Thapar U., Demple B. Deployment of DNA polymerases beta and lambda in single-nucleotide and multinucleotide pathways of mammalian base excision DNA repair. // DNA Repair (Amst). 2019. V. 76. P. 11–19.
  9. Fiala K.A., Duym W.W., Zhang J., et al. Up-regulation of the fidelity of human DNA polymerase lambda by its non-enzymatic proline-rich domain. // J Biol Chem. 2006. V. 281. № 28. P. 19038–44.
  10. Taggart D.J., Dayeh D.M., Fredrickson S.W., et al. N-terminal domains of human DNA polymerase lambda promote primer realignment during translesion DNA synthesis. // DNA Repair (Amst). 2014. V. 22. P. 41–52.
  11. Braithwaite E.K., Kedar P.S., Lan L., et al. DNA polymerase lambda protects mouse fibroblasts against oxidative DNA damage and is recruited to sites of DNA damage/repair. // J Biol Chem. 2005. V. 280. № 36. P. 31641–7.
  12. Shimazaki N., Yoshida K., Kobayashi T., et al. Over-expression of human DNA polymerase lambda in E. coli and characterization of the recombinant enzyme. // Genes Cells. 2002. V. 7. № 7. P. 639–51.
  13. Blanca G., Shelev I., Ramadan K., et al. Human DNA polymerase λ diverged in evolution from DNA polymerase β toward specific Mn++ dependence: a kinetic and thermodynamic study. // Biochemistry 42 (2003) 7467–7476.
  14. Prasad R., Williams J.G., Hou E.W., et al. Pol β associated complex and base excision repair factors in mouse fibroblasts. // Nucleic Acids Res. 2012. V. 40. № 22. P. 11571–82.
  15. Moor N.A., Vasil’eva I.A., Anarbaev R.O., et al. Quantitative characterization of protein-protein complexes involved in base excision DNA repair. // Nucleic Acids Res. 2015. V. 43. № 12. P. 6009–22.
  16. Howard M.J., Horton J.K., Zhao M.L., et al. Lysines in the lyase active site of DNA polymerase β destabilize nonspecific DNA binding, facilitating searching and DNA gap recognition. // J Biol Chem. 2020. V. 295. № 34. P. 12181–12187.
  17. Jelezcova E., Trivedi R.N., Wang X.H., Tang J.B., et al. Parp1 activation in mouse embryonic fibroblasts promotes Pol beta-dependent cellular hypersensitivity to alkylation damage. // Mutat Res. 2010. V. 686. № 1–2. P. 57–67.

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
2.

下载 (1MB)
3.

下载 (513KB)
4.

下载 (649KB)
5.

下载 (109KB)

版权所有 © Е.А. Мальцева, Н.И. Речкунова, О.И. Лаврик, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».