Influence of Xanthomonas euvesicatoria pv. allii on germination of 12 onion varieties


Cite item

Full Text

Abstract

Onion bacterial blight is a problematic disease affecting onion production in many countries. The disease is seed-transmitted, hence difficult to control. The study was based on the effects of bacteria on germination percentage and germination energy of various commercial onion varieties. Twelve commercial varieties were obtained from the market and inoculated with bacteria and then tested for germination percentage and germination energy. For most onion varieties, the level of germination inhibition increased with increasing bacterial concentration. On the 5th day of recording, the germination of onion seeds of the variety Karantansky which were inoculated with bacteria at a concentration of 108 CFU/ml differed significantly from the germination of seeds in the control variant. At the same time, seed germination was similar to the control when using bacteria at a concentration of 106 cfu/ml. On the 14th day of record, it was found that the highest concentration (108 CFU/ ml) caused the highest level of inhibition in most onion seeds, while moderate levels were observed at 106 CFU/ ml and the lowest concentration (104 CFU/ml) caused the least inhibition. In the cultivar Khaltsedon, seeds did not germinate at any of the bacterial concentrations compared to 8 % germination in the control. Regarding germination energy, the highest concentration of inoculum on the 5th day of record had the greatest effect in 3 varieties: Myachkovsky 300, Carmen MS and Khaltsedon with germination energy of 3, 2 and 0 %, respectively. In most varieties, the highest bacterial concentration of 108 CFU/ml had the least effect on germination energy, followed by 106 CFU/ml and the highest of 104 CFU/ml on the 14th day of record. However, there were no differences in the effect of concentrations for the varieties Karantansky and Khaltsedon, although all treatments differed significantly from controls (p < 0.05).

About the authors

Nyasha J. Kavhiza

RUDN University

Author for correspondence.
Email: njkavhiza@rocketmail.com
ORCID iD: 0000-0002-8505-3253

PhD scholar, Department of Agrobiotechnology, Agrarian and Technological Institute

6 Miklukho-Maklaya st., Moscow, 117198, Russian Federation

Meisam Zargar

RUDN University

Email: zargar_m@rudn.ru
ORCID iD: 0000-0002-5208-0861
Scopus Author ID: 57203177348

Doctor of Agricultural Sciences, Associate Professor, Department of Agrobiotechnology, Agrarian and Technological Institute

6 Miklukho-Maklaya st., Moscow, 117198, Russian Federation

Svetlana I. Prikhodko

All-Russian Plant Quarantine Center

Email: svetlana.prik@yandex.ru
Head of the Laboratory of Bacteriology 32 Pogranichnaya st., Bykovo, Moscow Region, 140150, Russian Federation

Elena N. Pakina

RUDN University

Email: e-pakina@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6493-6121
Scopus Author ID: 56805238100

Doctor of Biological Sciences, Professor, Department of Agrobiotechnology, Agrarian and Technological Institute

6 Miklukho-Maklaya st., Moscow, 117198, Russian Federation

Simbo Diakite

RUDN University

Email: 1042215234@pfur.ru
ORCID iD: 0000-0003-1462-1329
Scopus Author ID: 57605101300

Doctoral Student of plant protection, Department of Agrobiotechnology, Agrarian and Technological Institute

6 Miklukho-Maklaya st., Moscow, 117198, Russian Federation

References

  1. Nikus O, Mulugeta F. Onion seed production techniques. A Manual for Extension Agents and Seed Producers. Asella, Ethiopia; 2010.
  2. Kadota I, Uehara K, Shinohara H, Nishiyama K. Bacterial Blight of Welsh Onion: A New Disease Caused by Xanthomonas campestris pv. allii pv. nov. J Gen Plant Pathol. 2000;66:310-315. doi: 10.1007/PL00012970
  3. Pruvost O, Robène I, Escalon A, Leduc A, Gagnevin L, Vernière C, et al. The Dynamic World of the Genus Xanthomonas. In: Schwartz HF, Gent DH, Alvarez AM, Leduc A, Royer M, Vowell TS, et al. (eds.) Virulence Mechanisms of PlantPathogenic Bacteria. The American Phytopathological Society; 2016. p.381-418. doi: 10.1094/9780890544495.021
  4. Robène-S oustrade I, Legrand D, Gagnevin L, Chiroleu F, Laurent A, Pruvost O. Multiplex Nested PCR for Detection of Xanthomonas axonopodis pv. allii from Onion Seeds. Appl Environ Microbiol. 2010;76(9):2697-2703. doi: 10.1128/AEM.02697-09
  5. Gent DH, Schwartz HF, Ishimaru CA, Louws FJ, Cramer RA, Lawrence CB. Polyphasic Characterization of Xanthomonas Strains from Onion. Phytopathology. 2004;94(2):184-195. doi: 10.1094/PHYTO.2004.94.2.184
  6. Humeau L, Roumagnac P, Picard Y, RobèneSoustrade I, Chiroleu F, Gagnevin L, et al. Quantitative and molecular epidemiology of bacterial blight of onion in seed production fields. Phytopathology. 2006;96(12):1345 doi: 10.1094/PHYTO-96-1345
  7. Ahonsi MO, Berner DK, Emechebe AM, Lagoke ST. Selection of rhizobacterial strains for suppression of germination of Striga hermonthica (Del.) Benth. seeds. Biological Control. 2002;24(2):143-152. doi: 10.1016/ S1049-9644(02)00019-1
  8. Miché L, Bouillant ML, Rohr R, Salle G, Bally R. Physiological and Cytological Studies on the Inhibition of Striga Seed Germination by the Plant Growth-promoting Bacterium Azospirillum brasilense. European Journal of Plant Pathology. 2000;106:347-351. doi: 10.1023/A:1008734609069
  9. Dadon T, Nun NB, Mayer AM. A factor from Azospirillum brasilense inhibits germination and radicle growth of Orobanche aegyptiaca. Israel Journal of Plant Sciences. 2004;52(2):83-86. doi: 10.1560/Q3BA-8BJW- W7GH-XHPX
  10. Mabrouk Y, Zourgui L, Sifi B, Delavault P, Simier P, Belhadj O. Some compatible Rhizobium leguminosarum strains in peas decrease infections when parasitised by Orobanche crenata. Weed Research. 2007;47(1):44-53. doi: 10.1111/j.1365-3180.2007.00548.x
  11. Patil VS. Isolation, characterization and identification of rhizospheric bacteria with the potential for biological control of Sida acuta. J Environ Res Develop. 2014;8(3):411-417.
  12. Roumagnac P, Gagnevin L, Pruvost O. Detection of Xanthomonas sp., the Causal Agent of Onion Bacterial Blight, in Onion Seeds Using a Newly Developed Semi-selective Isolation Medium. European Journal of Plant Pathology. 2000;106:867-877. doi: 10.1023/A:1008743120242
  13. Bashan Y. Inhibition of seed germination and root development caused by Xanthomonas campestris pv. vesicatoria in pepper and tomato. Journal of phytopathology. 1986;116(3):228-237. doi: 10.1111/j.1439-0434.1986.tb00915.x
  14. Bashan Y, Okon Y. Inhibition of seed germination and development of tomato plants in soil infested with Pseudomonas tomato. Ann Applied Biology. 1981;98(3):413-417. doi: 10.1111/j.1744-7348.1981.tb00773.x

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».