Создание клона эмбриональных стволовых клеток мышей с кондиционным нокаутом гуманизированного гена Snca

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Одним из ключевых молекулярных звеньев в патогенезе болезни Паркинсона является белок α-синуклеин. Накопленные данные свидетельствуют о том, что патогенные мутации в гене Snca ассоциированы с развитием нейродегенеративного повреждения головного мозга, тем самым указывая на актуальность изучения нейробиологической роли α-синуклеина.

Цель. Создание генетически-модифицированного клона стволовых клеток мышей с кондиционным нокаутом гуманизированного α-синуклеина, который может быть использован для реинъекции в мышиные бластоцисты, а также для фундаментальных и прикладных in vitro исследований в области патофизиологии и нейрофармакологии.

Материалы и методы. Для создания мышиных стволовых клеток с кондиционным нокаутом гуманизированного гена Snca был использован прежде полученный клон с фланкированным LoxP-сайтами первым экзоном Snca. Для гуманизации IV и V экзона была использована система CRISPR/Cas9-опосредованной гомологичной рекомбинации с донорными ДНК олигонуклеотидами человеческих сайтов соответствующих генов. Нуклеаза Cas9, гидовые РНК и донорная ДНК были трансфецированы в клетки мыши.

Результаты. Нами был предложен и реализован подход к получению клонов мышиных генетически-модифицированных стволовых клеток, экспрессирующих патологический гуманизированный α-синуклеин. Полученные клоны были высеяны на чашки Петри для размножения и дальнейшего генетического анализа. Был обнаружен клон 126-2F4, несущий необходимые генетические модификации. Результаты проведенного исследования принципиально важны не только для понимания развития патологического процесса при α-синуклеинопатиях, но и, что ещё важнее, для разработки новых терапевтических подходов, которые позволят остановить распространение агрегационной патологии человеческого α-синуклеина по нервной системе и валидации этих подходов в доклинических испытаниях.

Заключение. В результате проведенного исследования разработана стратегия CRISPR/Cas9-ассистированной гомологической рекомбинации в геноме эмбриональных стволовых клеток мыши для создания полностью гуманизированного гена Snca, кодирующего α-синуклеин. Выполнено редактирование генома клона эмбриональных стволовых клеток мыши с использованием CRISPR технологии. Синтезированы РНК и ДНК олигонуклеотиды, необходимые для создания рибонуклеопротеиновых комплексов, осуществляющих направленную гомологическую рекомбинацию в Snca локусе генома мыши. Разработанный клон клеток может служить для создания линии генетически-модифицированных мышей, служащих тест-системой для патофизиологических и нейрофармакологических исследований, связанных с синуклеинопатиями. При этом до индукции Cre-зависимой рекомбинации данная линия является репрезентативной моделью для исследования биологической роли мутантного Snca. В то же время, после Cre-зависимая активация нокаута позволяет имитировать фармакологическое ингибирование α-синуклеина, что представляет особый интерес для прикладных исследований в нейрофармакологии.

Об авторах

Евгений Александрович Патраханов

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: pateval7@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8415-4562

ассистент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Владимир Михайлович Покровский

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: vmpokrovsky08@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-3138-2075

ассистент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Анастасия Юрьевна Карагодина

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: karagodina75@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9440-5866

ассистент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Анастасия Михайловна Краюшкина

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: annkrayushkina98@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6830-3820

ассистент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Никита Сергеевич Жунусов

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: nzhunu@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1969-3615

ассистент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Алексей Васильевич Дейкин

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: deykin@bsu.edu.ru
ORCID iD: 0000-0001-9960-0863

кандидат биологических наук, доцент кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Михаил Викторович Корокин

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Автор, ответственный за переписку.
Email: mkorokin@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5402-0697

доктор медицинских наук, доцент, профессор кафедры фармакологии и клинической фармакологии

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Михаил Владимирович Покровский

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: mpokrovsky@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-4478-1091

доктор медицинских наук, профессор кафедры фармакологии и клинической фармакологии, руководитель НИИ Фармакологии живых систем

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Оксана Борисовна Алтухова

Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Белгородский государственный национальный исследовательский университет»

Email: altuhova_o@bsu.edu.ru
ORCID iD: 0000-0003-4674-8797

доктор медицинских наук, доцент, заведующий кафедрой акушерства и гинекологии медицинского института

Россия, 308015, г. Белгород, ул. Победы, д. 85

Список литературы

  1. Checkoway H., Lundin J.I., Kelada S.N. Neurodegenerative diseases // IARC Sci. Publ. – 2011. – P. 407–419.
  2. Bougea A. Synuclein in neurodegeneration // Adv. Clin. Chem. – 2021. – Vol. 103. – P. 97–134. doi: 10.1016/bs.acc.2020.08.007
  3. Ozansoy M., Başak A.N. The central theme of Parkinson’s disease: α-synuclein // Mol Neurobiol. – 2013. – Vol. 47, No. 2. – P. 460–465. doi: 10.1007/s12035-012-8369-3
  4. George J.M. The synucleins // Genome Biol. – 2002. – Vol. 3, No. 1. – Art. ID: 3002. doi: 10.1186/gb-2001-3-1-reviews3002
  5. Breydo L., Wu J.W., Uversky V.N. Α-synuclein misfolding and Parkinson’s disease // Biochim. Biophys. Acta. – 2012. – Vol. 1822, No. 2. – P. 261–285. doi: 10.1016/j.bbadis.2011.10.002
  6. Iwai A., Masliah E., Yoshimoto M., Ge N., Flanagan L., de Silva H.A., Kittel A., Saitoh T. The precursor protein of non-A beta component of Alzheimer’s disease amyloid is a presynaptic protein of the central nervous system // Neuron. – 1995. – Vol. 14, No. 2. – P. 467–475. doi: 10.1016/0896-6273(95)90302-x
  7. Lee S.J., Jeon H., Kandror K.V. Alpha-synuclein is localized in a subpopulation of rat brain synaptic vesicles // Acta Neurobiol. Exp. (Wars). – 2008. – Vol. 68, No. 4. – P. 509–515.
  8. Lashuel H.A., Overk C.R., Oueslati A., Masliah E. The many faces of α-synuclein: from structure and toxicity to therapeutic target // Nat. Rev. Neurosci. – 2013. – Vol. 14, No. 1. – P. 38–48. doi: 10.1038/nrn3406
  9. Dalfó E., Ferrer I. Alpha-synuclein binding to rab3a in multiple system atrophy // Neurosci. Lett. – 2005. – Vol. 380, No. 1–2. – P. 170–175. doi: 10.1016/j.neulet.2005.01.034
  10. Burré J., Sharma M., Tsetsenis T., Buchman V., Etherton M.R., Südhof T.C. Alpha-synuclein promotes SNARE-complex assembly in vivo and in vitro // Science. – 2010. – Vol. 329, No. 5999. – P. 1663–1667. doi: 10.1126/science.1195227
  11. Ninkina N., Connor-Robson N., Ustyugov A.A., Tarasova T.V., Shelkovnikova T.A., Buchman V.L. A novel resource for studying function and dysfunction of α-synuclein: mouse lines for modulation of endogenous Snca gene expression // Sci. Rep. – 2015. – Vol. 5. – Art. ID: 16615. doi: 10.1038/srep16615
  12. Roman A.Y., Limorenko G., Ustyugov A.A., Tarasova T.V., Lysikova E.A., Buchman V.L., Ninkina N. Generation of mouse lines with conditionally or constitutively inactivated Snca gene and Rosa26-stop-lacZ reporter located in cis on the mouse chromosome 6 // Transgenic Res. – 2017. – Vol. 26, No. 2. – P. 301–307. doi: 10.1007/s11248-016-9995-8
  13. Chaprov K.D., Lysikova E.A., Teterina E.V., Buchman V.L. Kinetics of alpha-synuclein depletion in three brain regions following conditional pan-neuronal inactivation of the encoding gene (Snca) by tamoxifen-induced Cre-recombination in adult mice // Transgenic Res. – 2021. – Vol. 30, No. 6. – P. 867–873. doi: 10.1007/s11248-021-00286-3
  14. Krüger R., Kuhn W., Müller T., Woitalla D., Graeber M., Kösel S., Przuntek H., Epplen J.T., Schöls L., Riess O. Ala30Pro mutation in the gene encoding alpha-synuclein in Parkinson’s disease // Nat. Genet. – 1998. – Vol. 18, No. 2. – P. 106–108. doi: 10.1038/ng0298-106
  15. Polymeropoulos M.H., Lavedan C., Leroy E., Ide S.E., Dehejia A., Dutra A., Pike B., Root H., Rubenstein J., Boyer R., Stenroos E.S., Chandrasekharappa S., Athanassiadou A., Papapetropoulos T., Johnson W.G., Lazzarini A.M., Duvoisin R.C., Di Iorio G., Golbe L.I., Nussbaum R.L. Mutation in the alpha-synuclein gene identified in families with Parkinson’s disease // Science. – 1997. – Vol. 276, No. 5321. – P. 2045–2047. doi: 10.1126/science.276.5321.2045
  16. Angelova P.R., Choi M.L., Berezhnov A.V., Horrocks M.H., Hughes C.D., De S., Rodrigues M., Yapom R., Little D., Dolt K.S., Kunath T., Devine M.J., Gissen P., Shchepinov M.S., Sylantyev S., Pavlov E.V., Klenerman D., Abramov A.Y., Gandhi S. Alpha synuclein aggregation drives ferroptosis: an interplay of iron, calcium and lipid peroxidation // Cell Death Differ. – 2020. – Vol. 27, No. 10. – P. 2781–2796. doi: 10.1038/s41418-020-0542-z
  17. Angelova P.R., Horrocks M.H., Klenerman D., Gandhi S., Abramov A.Y., Shchepinov M.S. Lipid peroxidation is essential for α-synuclein-induced cell death // J. Neurochem. – 2015. – Vol. 133, No. 4. – P. 582–589. doi: 10.1111/jnc.13024
  18. Choi M.L., Chappard A., Singh B.P., Maclachlan C., Rodrigues M., Fedotova E.I., Berezhnov A.V., De S., Peddie C.J., Athauda D., Virdi G.S., Zhang W., Evans J.R., Wernick A.I., Zanjani Z.S., Angelova P.R., Esteras N., Vinokurov A.Y., Morris K., Jeacock K., Tosatto L., Little D., Gissen P., Clarke D.J., Kunath T., Collinson L., Klenerman D., Abramov A.Y., Horrocks M.H., Gandhi S. Pathological structural conversion of α-synuclein at the mitochondria induces neuronal toxicity // Nat. Neurosci. – 2022. – Vol. 25, No. 9. – P. 1134–1148. doi: 10.1038/s41593-022-01140-3. Erratum in: Nat. Neurosci. – 2022. – Vol. 25, No. 11. – Art. ID: 1582.
  19. Choi M.L., Gandhi S. Crucial role of protein oligomerization in the pathogenesis of Alzheimer’s and Parkinson’s diseases // FEBS J. – 2018. – Vol. 285, No. 19. – P. 3631–3644. doi: 10.1111/febs.14587
  20. Srinivasan E., Chandrasekhar G., Chandrasekar P., Anbarasu K., Vickram A.S., Karunakaran R., Rajasekaran R., Srikumar P.S. Alpha-Synuclein Aggregation in Parkinson’s Disease // Front. Med. (Lausanne). – 2021. – Vol. 8. – Art. ID: 736978. doi: 10.3389/fmed.2021.736978
  21. Chaprov K.D., Goloborshcheva V.V., Tarasova T.V., Teterina E.V., Korokin M.V., Soldatov V.O., Pokrovskiy M.V., Kucheryanu V.G., Morozov S.G., Ovchinnikov R.K. Increased Expression of the Multimerin-1 Gene in α-Synuclein Knokout Mice // Dokl. Biol. Sci. – 2020. – Vol. 494, No. 1. – P. 260–263. doi: 10.1134/S0012496620050014
  22. Soldatov V.O., Kubekina M.V., Silaeva Yu.Yu., Bruter A.V., Deykin A.V. On the way from SARS-CoV-sensitive mice to murine COVID-19 model // Research Results in Pharmacology. – 2022. – Vol. 6, No. 2. – P. 1–7. doi: 10.3897/rrpharmacology.6.53633
  23. Bruter A.V., Korshunova D.S., Kubekina M.V., Sergiev P.V., Kalinina A.A., Ilchuk L.A., Silaeva Y.Y., Korshunov E.N., Soldatov V.O., Deykin A.V. Novel transgenic mice with Cre-dependent co-expression of GFP and human ACE2: a safe tool for study of COVID-19 pathogenesis. Transgenic Res. 2021 Apr 14;30(3):289–301. doi: 10.1007/s11248-021-00249-8. Epub ahead of print.
  24. Кузубова Е.В., Радченко А.И., Покровский В.М., Патраханов Е.А., Новикова А.А., Степенко Ю.В., Дейкин А.В. Патологические состояния, ассоциированные с белком тау: механизмы развития и возможные биологические мишени для фармакологической коррекции тау-протеинопатии (обзор) // Научные результаты биомедицинских исследований. – 2022. – Т. 8, № 4. – С. 474–797. doi: 10.18413/2658-6533-2022-8-4-0-6
  25. Dolskiy A.A., Gudymo A.S., Taranov O.S., Grishchenko I.V., Shitik E.M., Prokopov D.Y., Soldatov V.O., Sobolevskaya E.V., Bodnev S.A., Danilchenko N.V., Moiseeva A.A., Torzhkova P.Y., Bulanovich Y.A., Onhonova G.S., Ivleva E.K., Kubekina M.V., Belykh A.E., Tregubchak T.V., Ryzhikov A.B., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Deykin A.V., Yudkin D.V. The Tissue Distribution of SARS-CoV-2 in Transgenic Mice With Inducible Ubiquitous Expression of hACE2 // Front. Mol. Biosci. – 2022. – Vol. 8. – Art. ID: 821506. doi: 10.3389/fmolb.2021.821506

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рисунок 1 – Стратегия CRISPR/Cas9-ассистированной гомологической рекомбинации в геноме эмбриональных стволовых клеток мыши для создания полностью гуманизированного гена Snca

Скачать (949KB)
3. Рисунок 2 – Анализ продуктов ПЦР амплификации ДНК проанализированных клонов после нуклеофекции клеток клона 126 эмбриональных стволовых клеток мыши РНП комплексами

Скачать (54KB)
4. Рисунок 3 – Анализ двух клонов, в которых при первичном скрининге была выявлена гомологическая рекомбинация в экзоне V гена Snca, с помощью обработки 269-нуклеотидного продукта ПЦР амплификации рестрикционной эндонуклеазой ApaI

Скачать (49KB)
5. Рисунок 4 – Анализ гуманизaции экзона IV в геноме клеток клона 126-2-F4. ДНК материнского клона 126, клона 126-2-F4

Скачать (49KB)
6. Рисунок 5 – Стратегия создания клона эмбриональных стволовых клеток мыши с кондиционным нокаутом гуманизированного гена Snca

Скачать (189KB)

© Патраханов Е.А., Покровский В.М., Карагодина А.Ю., Краюшкина А.М., Жунусов Н.С., Дейкин А.В., Корокин М.В., Покровский М.В., Алтухова О.Б., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».