Polymorphism of DNA repair system protein genes and its association with chronic viral hepatitis C

封面

如何引用文章

全文:

详细

Hepatitis C is an infectious disease that causes liver inflammation and often leads to a chronic process. The genes encoding proteins involved in DNA repair systems participate in developing immune responses and inflammation, making them promising candidates for studying genetic predisposition to a wide range of common diseases, including infections. However, this group of genes is rarely studied to assess their role in genetic susceptibility to infectious diseases. In the present study, we investigated a role for polymorphisms in DNA repair system protein genes (ATM (rs189037 and rs1801516), NBN (rs709816 and rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2 (rs1805321)) in the pathogenesis of chronic hepatitis C. As a result, associations were found both between some studied markers (rs1805321 in the PMS2 gene and rs1801516 in the ATM gene) and chronic hepatitis C as well as relations of various quantitative traits and the polymorphisms of these genes. For example, variability in blood biochemical parameters (levels of cholesterol, glucose, iron, prothrombin index values, and thymol test results) was shown to depend on genotypes of two markers in the NBN gene (rs709816 and rs1805800). Clinical and morphological indicators are associated with variants in the NBN (rs1805800), MRE11 (rs473297), and PMS2 (rs1805321) genes. The absolute and relative levels of neutrophils are influenced by rs1805800 (NBN), rs473297 (MRE11), and rs1799977 (MLH1), whereas lymphocyte counts are affected by both markers in the NBN gene, rs473297 (MRE11), rs1799977 (MLH1), and rs1805321 (PMS2). The lowest post-treatment IgG levels are observed in carriers of rarer genotypes in rs1805800 and rs709816 in NBN gene. Thus, our study demonstrates an impact of the studied genes on the pathogenesis of chronic hepatitis C, although the mechanism underlying such associations is not always clear. Nevertheless, our findings suggest about pleiotropic effects of DNA repair protein genes and their involvement in developing chronic hepatitis C.

作者简介

Nadezhda Babushkina

Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences

编辑信件的主要联系方式.
Email: nad.babushkina@medgenetics.ru

PhD (Biology), Senior Researcher, Laboratory of Population Genetics, Research Institute of Medical Genetics

俄罗斯联邦, Tomsk

V. Shavrak

Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences

Email: nad.babushkina@medgenetics.ru

Junior Researcher, Laboratory of Genomics of Orphan Diseases, Research Institute of Medical Genetics

俄罗斯联邦, Tomsk

I. Goncharova

Tomsk National Research Medical Center of the Russian Academy of Sciences

Email: nad.babushkina@medgenetics.ru

PhD (Biology), Researcher, Population Genetics Laboratory, Research Institute of Medical Genetics

俄罗斯联邦, Tomsk

E. Beloborodova

Siberian State Medical University

Email: nad.babushkina@medgenetics.ru

DSc (Medicine), Professor of the Department of Hospital Therapy with a Course of Rehabilitation, Physiotherapy and Sports Medicine

俄罗斯联邦, Tomsk

参考

  1. Бабушкина Н.П., Гончарова И.А., Постригань А.Е., Кучер А.Н. Ген PMS2 ассоциирован с хроническим вирусным гепатитом С // Медицинская генетика. 2022. Т. 21, № 7. С. 19–23. [Babushkina N.P., Goncharova I.A., Postrigan’ A.E., Kucher A.N. The PMS2 gene is associated with HCVC. Meditsinskaya genetika = Medical Genetics, 2022, vol. 21, no. 7, pp. 19–23. (In Russ.)] doi: 10.25557/2073-7998.2022.07.19-23
  2. Белобородова Е.В., Гончарова И.А., Белобородова Э.И., Пурлик И.Л., Калачева Т.П., Акбашева О.Е., Рачковский М.И., Бурковская В.А. Иммуногенетика и прогрессирование хронических вирусных гепатитов // Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2015. Т. 3, № 115. С. 45–49. [Beloborodova E.V., Goncharova I.A., Beloborodova E.I., Purlik I.L., Kalacheva T.P., Akbasheva O.E., Rachkovskij M.I., Burkovskaja V.A. Immunogenetics and progression of chronic viral hepatitis. Eksperimental’naya i klinicheskaya gastroenterologiya = Experimental and Clinical Gastroenterology, 2015, vol. 3, no. 115, pp. 45–49. (In Russ.)]
  3. Белобородова Е.В., Гончарова И.А., Рязанцева Н.В., Белобородова Э.И., Пурлик И.Л., Калачева Т.П. Роль иммуногенетики в прогрессировании хронических вирусных гепатитов // Клинические перспективы гастроэнтерологии, гепатологии. 2014. № 2. С. 11–14. [Beloborodova E.V., Goncharova I.A., Rjazanceva N.V., Beloborodova E.I., Purlik I.L., Kalacheva T.P. Role of immunogenetics in progression of chronic viral hepatitis. Klinicheskie perspektivy gastroenterologii, gepatologii = Clinical Perspectives of Gastroenterology, Hepatology, 2014, no. 2, pp. 11–14. (In Russ.)]
  4. Гепатит С // Всемирная организация здравоохранения, 2024. [Hepatitis C. World Health Organization, 2024. (In Russ.)] URL: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hepatitis-c (17.07.2025)
  5. Гончарова И.А., Белобородова Е.В., Фрейдин М.Б., Белобородова Э.И., Черногорюк Г.Э., Пузырев В.П. Генетические факторы подверженности к хронизации вирусного гепатита и фиброзу в печени // Молекулярная биология. 2008. Т. 42, № 2. С. 238–241. [Goncharova I.A., Beloborodova E.V., Frejdin M.B., Beloborodova E.I., Chernogorjuk G.E., Puzyrev V.P. Genetic factors of susceptibility to chronic viral hepatitis and liver fibrosis. Molekulyarnaya biologiya = Molecular Biology, 2008, vol. 42, no. 2, pp. 238–241. (In Russ.)]
  6. Гончарова И.А., Назаренко М.С., Тарасенко Н.В., Марков А.В., Белобородова Е.В., Пузырев В.П. Генетические маркеры фиброгенеза при хроническом вирусном гепатите С // Медицинская генетика. 2016. Т. 15, № 12. С. 29–36. [Goncharova I.A., Nazarenko M.S., Tarasenko N.V., Markov A.V., Beloborodova E.V., Puzyrev V.P. Genetic markers of fibrogenesis in determining susceptibility to chronic hepatitis C virus infection. Meditsinskaya genetika = Medical Genetics, 2016, vol. 15, no. 12, pp. 29–36. (In Russ.)]
  7. Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Дунаева Л.Е., Белобородова Е.В., Белобородова Э.И., Пузырев В.П. Анализ связи полиморфизма Ile50Val гена рецептора интерлейкина-4 (IL4RA) с хроническим вирусным гепатитом // Молекулярная биология. 2005. Т. 39, № 3. С. 379–384. [Goncharova I.A., Frejdin M.B., Dunaeva L.E., Beloborodova E.V., Beloborodova E.I., Puzyrev V.P. Association of the ile50Val polymorphism of the interleukin-4 receptor gene IL4RA with chronic viral hepatitis. Molekulyarnaya biologiya = Molecular Biology, 2005, vol. 39, no. 3, pp. 379–384. (In Russ.)]
  8. Лифшиц В.М., Сидельникова В.И. Биохимические анализы в клинике. 2-е изд. М.: Медицинское информационное агентство, 2001. 303 с. [Lifshic V.M., Sidel’nikova V.I. Biochemical analyses in clinic. 2nd ed. Moscow: Medicinskoe informacionnoe agentstvo, 2001. 303 p. (In Russ.)]
  9. Нурмагомаев М.С., Магомедова З.С., Каграманова З.С. Хронические гепатиты в клинике внутренних болезней // Научное обозрение. Медицинские науки. 2016. № 5. С. 77–91. [Nurmagomaev M.S., Magomedova Z.S., Kagramanova Z.S. Chronic hepatitis in the clinic of internal diseases. Nauchnoe obozrenie. Meditsinskie nauki = Scientific Review. Medical Sciences, 2016, no. 5, pp. 77–91. (In Russ.)]
  10. Офицеров В.И. Подклассы иммуноглобулина G: возможности использования в диагностической практике. Методическое пособие. Кольцово: ЗАО «Вектор-Бест», 2005. [Oficerov V.I. Immunoglobulin G subclasses: possibilities of use in diagnostic practice. Methodological manual. Koltsovo: ZAO “Vektor-Best”, 2005. (In Russ.)]
  11. Стяжкина С.Н., Глушкова Т.Г., Кирьянов Н.А., Зайцев Д.В., Ленцова С.И., Горбунова М.А. Морфофункциональная характеристика печени и поджелудочной железы при воздействии гепатопротектора Ремаксол на фоне острого алкогольного воздействия у крыс // Эффективная фармакотерапия. 2024. Т. 20, № 2. С. 26–29. [Stjazhkina S.N., Glushkova T.G., Kir’janov N.A., Zajcev D.V., Lencova S.I., Gorbunova M.A. Morphofunctional Characteristic of the Hepar and Pancreas When Exposed to the Hepatoprotector Remaxol in Cases of Acute Alcohol Damage in Rats. Effektivnaya farmakoterapiya = Effective Pharmacotherapy, 2024, vol. 20, no. 2, pp. 26–29. (In Russ.)] doi: 10.33978/2307-3586-2024-20-2-26-29
  12. Трошина Е.А., Сенюшкина Е.С. Вклад центральных регуляторов иммунного ответа в развитие заболеваний щитовидной железы // Проблемы эндокринологии. 2019. Т. 65, № 6. С. 458–465. [Troshina E.A., Senjushkina E.S. The value of central regulators of the immune response in the development of autoimmune thyroid diseases. Problemy endokrinologii = Problems of Endocrinology, 2019, vol. 65, no. 6, pp. 458–465. (In Russ.)] doi: 10.14341/probl10304
  13. Яковенко Э.П., Григорьев П.Я. Хронические заболевания печени: диагностика и лечение // Русский медицинский журнал. 2003. Т. 5. С. 291. [Yakovenko E.P., Grigoriev P.Ya. Chronic liver diseases: diagnosis and treatment. Russkij medicinskij zhurnal = Russian Medical Journal, 2003, vol. 5, p. 291. (In Russ.)]
  14. Almeida Pereira Leite S.T., Marques-Guimarães N., Silva-Oliveira J.C., Dutra-Souto F.J., Alves-dos-Santos R., Bassi-Branco C.L. The X-ray repair cross complementing protein 1 (XRCC1) rs25487 polymorphism and susceptibility to cirrhosis in Brazilian patients with chronic viral hepatitis. Ann. Hepatol., 2013, vol. 12, no. 5, pp. 733–739.
  15. Ariumi Y., Kuroki M., Dansako H., Abe K., Ikeda M., Wakita T., Kato N. The DNA-damage sensors ataxia-telangiectasia mutated kinase and checkpoint kinase 2 are required for hepatitis C virus RNA replication. J. Virol., 2008, vol. 82, no. 19, pp. 9639–9646. doi: 10.1128/JVI.00351-08
  16. Basyte-Bacevice V., Skieceviciene J., Valantiene I., Sumskiene J., Petrenkiene V., Kondrackiene J., Petrauskas D., Lammert F., Kupcinskas J. SERPINA1 and HSD17B13 gene variants in patients with liver fibrosis and cirrhosis. J. Gastrointestin. Liver Dis., 2019, vol. 28, no. 3, pp. 297–302. doi: 10.15403/jgld-168
  17. Bochud P.Y., Bibert S., Kutalik Z., Patin E., Guergnon J., Nalpas B., Goossens N., Kuske L., Müllhaupt B., Gerlach T., Heim M.H., Moradpour D., Cerny A., Malinverni R., Regenass S., Dollenmaier G., Hirsch H., Martinetti G., Gorgiewski M., Bourlière M., Poynard T., Theodorou I., Abel L., Pol S., Dufour J.F., Negro F. IL28B alleles associated with poor hepatitis C virus clearance protect against inflammation and fibrosis in patients infected with non-1 HCV genotypes. Hepatology, 2012, vol. 55, no. 2, pp. 384–394. doi: 10.1002/hep.24678
  18. Bredemeyer A.L., Sharma G.G., Huang C.Y., Helmink B.A., Walker L.M., Khor K.C., Nuskey B., Sullivan K.E., Pandita T.K., Bassing C.H., Sleckman B.P. ATM stabilizes DNA double-strand-break complexes during V(D)J recombination. Nature, 2006, vol. 442, no. 7101, pp. 466–470. doi: 10.1038/nature04866
  19. Chahwan R., Edelmann W., Scharff M.D., Roa S. Mismatch-mediated error-prone repair at the immunoglobulin genes. Biomed. Pharmacother., 2011, vol. 65, no. 8, pp. 529–536. doi: 10.1016/j.biopha.2011.09.001
  20. Chahwan R., van Oers J.M., Avdievich E., Zhao C., Edelmann W., Scharff M.D., Roa S. The ATPase activity of MLH1 is required to orchestrate DNA double-strand breaks and end processing during class-switch recombination. J. Exp. Med., 2012, vol. 209, no. 4, pp. 671–678. doi: 10.1084/jem.20111531
  21. Chen H.T., Bhandoola A., Difilippantonio M.J., Zhu J., Brown M.J., Tai X., Rogakou E.P., Brotz T.M., Bonner W.M., Ried T., Nussenzweig A. Response to RAG-mediated VDJ cleavage by NBS1 and γ-H2AX. Science, 2000, vol. 290, no. 5498, pp. 1962–1965. doi: 10.1126/science.290.5498.1962
  22. Cui A., Li B., Wallace M.S., Gonye A.L.K., Oetheimer C., Patel H., Tonnerre P., Holmes J.A., Lieb D., Yao B.S., Ma A., Roberts K., Damasio M., Chen J.H., Piou D., Carlton-Smith C., Brown J., Mylvaganam R., Hon Fung J.M., Sade-Feldman M., Aneja J., Gustafson J., Epstein E.T., Salloum S., Brisac C., Thabet A., Kim A.Y., Lauer G.M., Hacohen N., Chung R.T., Alatrakchi N. Single-cell atlas of the liver myeloid compartment before and after cure of chronic viral hepatitis. J. Hepatol., 2024, vol. 80, no. 2, pp. 251–267. doi: 10.1016/j.jhep.2023.02.040
  23. Desbois A.C., Cacoub P. Diabetes mellitus, insulin resistance and hepatitis C virus infection: a contemporary review. World J. Gastroenterol., 2017, vol. 23, no. 9, pp. 1697–1711. doi: 10.3748/wjg.v23.i9.1697
  24. Dinkelmann M., Spehalski E., Stoneham T., Buis J., Wu Y., Sekiguchi J.M., Ferguson D.O. Multiple functions of MRN in end-joining pathways during isotype class switching. Nat. Struct. Mol. Biol., 2009, vol. 16, no. 8, pp. 808–813. doi: 10.1038/nsmb.1639
  25. Douam F., Bobay L.M., Maurin G., Fresquet J., Calland N., Maisse C., Durand T., Cosset F.L., Féray C., Lavillette D. Specialization of hepatitis C virus envelope glycoproteins for B lymphocytes in chronically infected patients. J. Virol., 2015, vol. 90, no. 2, pp. 992–1008. doi: 10.1128/JVI.02516-15
  26. Du F., Zhang M., Li X., Yang C., Meng H., Wang D., Chang S., Xu Y., Price B., Sun Y. Dimer–monomer transition and dimer re-formation play important roles for ATM cellular function during DNA repair. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2014, vol. 452, no. 4, pp. 1034–1039. doi: 10.1016/j.bbrc.2014.09.038
  27. Durand T., Di Liberto G., Colman H., Cammas A., Boni S., Marcellin P., Cahour A., Vagner S., Féray C. Occult infection of peripheral B cells by hepatitis C variants which have low translational efficiency in cultured hepatocytes. Gut, 2010, vol. 59, no. 7, pp. 934–942. doi: 10.1136/gut.2009.192088
  28. Elgretli W., Chen T., Kronfli N., Sebastiani G. Hepatitis C virus — lipid interplay: pathogenesis and clinical impact. Biomedicines, 2023, vol. 11, no. 2: 271. doi: 10.3390/biomedicines11020271
  29. Fabris C., Falleti E., Cussigh A., Bitetto D., Fontanini E., Colletta C., Vandelli C., Cmet S., Ceriani E., Smirne C., Toniutto P., Pirisi M. The interleukin 28B rs12979860 C/T polymorphism and serum cholesterol as predictors of fibrosis progression in patients with chronic hepatitis C and persistently normal transaminases. J. Med. Virol., 2012, vol. 84, no. 5, pp. 747–755. doi: 10.1002/jmv.23259
  30. Ferreira J., Bicho M., Serejo F. ABCA1 polymorphism R1587K in chronic hepatitis C is gender-specific and modulates liver disease severity through its influence on cholesterol metabolism and liver function: a preliminary study. Genes (Basel), 2022, vol. 13, no. 11: 2095. doi: 10.3390/genes13112095
  31. Frey S., Bertocci B., Delbos F., Quint L., Weill J.C., Reynaud C.A. Mismatch-repair deficiency interferes with the accumulation of mutations in chronically stimulated B cells and not with the hypermutation process. Immunity, 1998, vol. 9, no. 1, pp. 127–134. doi: 10.1016/S1074-7613(00)80594-4
  32. Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V., Urban T.J., Heinzen E.L., Qiu P., Bertelsen A.H., Muir A.J., Sulkowski M., McHutchison J.G., Goldstein D.B. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance. Nature, 2009, vol. 461, no. 7262, pp. 399–401. doi: 10.1038/nature08309
  33. GTEx Consortium. GTExPortal – the genotype-tissue expression project data portal. GTExPortal, 2025. URL: https://www.gtexportal.org/home
  34. GWAS Catalog — The NHGRI-EBI Catalog of human genome-wide association studies. URL: https://www.ebi.ac.uk/gwas/efotraits/EFO_0003047 GWAS Catalog
  35. Hardy L.C., Smeekens J.M., Raghuwanshi D., Sarkar S., Daskhan G.C., Rogers S., Nycholat C., Maleki S., Burks A.W., Paulson J.C., Macauley M.S., Kulis M.D. Targeting CD22 on memory B cells to induce tolerance to peanut allergens. J. Allergy. Clin. Immunol., 2022, vol. 150, no. 6, pp. 1476–1485. doi: 10.1016/j.jaci.2022.06.022
  36. Helmink B.A., Bredemeyer A.L., Lee B.S., Huang C.Y., Sharma G.G., Walker L.M., Bednarski J.J., Lee W.L., Pandita T.K., Bassing C.H., Sleckman B.P. MRN complex function in the repair of chromosomal RAG-mediated DNA double-strand breaks. J. Exp. Med., 2009, vol. 206, no. 3, pp. 669–679. doi: 10.1084/jem.20081326
  37. Hesselink L., Spijkerman R., van Wessem K.J.P., Koenderman L., Leenen L.P.H., Huber-Lang M., Hietbrink F. Neutrophil heterogeneity and its role in infectious complications after severe trauma. World J. Emerg. Surg., 2019, vol. 14: 24. doi: 10.1186/s13017-019-0244-3
  38. Hinrichsen I., Kemp M., Peveling-Oberhag J., Passmann S., Plotz G., Zeuzem S., Brieger A. Promoter methylation of MLH1, PMS2, MSH2 and p16 is a phenomenon of advanced-stage HCCs. PLoS One, 2014, vol. 9, no. 1: e84453. doi: 10.1371/journal.pone.0084453
  39. Lahdesmaki A., Taylor A.M., Chrzanowska K.H., Pan-Hammarström Q. Delineation of the role of the MRE11 complex in class-switch recombination. J. Biol. Chem., 2004, vol. 279, no. 17, pp. 16479–16487. doi: 10.1074/jbc.M312796200
  40. Li F., Qu H., Li Y., Liu J., Fu H. Establishment and assessment of a mortality-risk prediction model in patients with sepsis based on early-stage peripheral lymphocyte subsets. Aging (Albany N. Y.), 2024, vol. 16, no. 8, pp. 7460–7473. doi: 10.18632/aging.205772
  41. Liu B., Wang K., Wu J., Hu Y., Yang X., Xu L., Sun W., Jia X., Wu J., Fu S., Qiao Y., Zhang X. Association of APEX1 and XRCC1 gene polymorphisms with HIV-1 infection susceptibility and AIDS progression in a northern Chinese MSM population. Front. Genet., 2022, vol. 13: 861355. doi: 10.3389/fgene.2022.861355
  42. Liu C., Qiao Y., Xu L., Wu J., Mei Q., Zhang X., Wang K., Li Q., Jia X., Sun H., Wu J., Sun W., Fu S. Association between polymorphisms in MRE11 and HIV-1 susceptibility and AIDS progression in a northern Chinese MSM population. J. Antimicrob. Chemother., 2019, vol. 74, no. 7, pp. 2009–2018. doi: 10.1093/jac/dkz132
  43. Liu Y., Dong J., Zhang Z., Liu Y., Wang Y. Regulatory T cells: a suppressor arm in post-stroke immune homeostasis. Neurobiol. Dis., 2023, vol. 189: 106350. doi: 10.1016/j.nbd.2023.106350
  44. Mirman Z., de Lange T. 53BP1: a DSB escort. Genes Dev., 2020, vol. 34, no. 1–2, pp. 7–23. doi: 10.1101/gad.333237.119
  45. Mizutani T., Kato N., Ikeda M., Sugiyama K., Shimotohno K. Long-term human T-cell culture system supporting hepatitis C virus replication. Biochem. Biophys. Res. Commun., 1996, vol. 227, no. 3, pp. 822–826. doi: 10.1006/bbrc.1996.1591
  46. Ohta K., Ito M., Chida T., Nakashima K., Sakai S., Kanegae Y., Kawasaki H., Aoshima T., Takabayashi S., Takahashi H., Kawata K., Shoji I., Sawasaki T., Suda T., Suzuki T. Role of hepcidin upregulation and proteolytic cleavage of ferroportin 1 in hepatitis C virus-induced iron accumulation. PLoS Pathog., 2023, vol. 19, no. 8: e1011591. doi: 10.1371/journal.ppat.1011591
  47. Pan-Hammarström Q., Dai S., Zhao Y., van Dijk-Härd I.F., Gatti R.A., Børresen-Dale A.L., Hammarström L. ATM is not required in somatic hypermutation of VH, but is involved in the introduction of mutations in the switch μ region. J. Immunol., 2003, vol. 170, no. 7, pp. 3707–3716. doi: 10.4049/jimmunol.170.7.3707
  48. Peron S., Metin A., Gardes P., Alyanakian M.A., Sheridan E., Kratz C.P., Fischer A., Durandy A. Human PMS2 deficiency is associated with impaired immunoglobulin class-switch recombination. J. Exp. Med., 2008, vol. 205, no. 11, pp. 2465–2472. doi: 10.1084/jem.20080789
  49. Reina-San-Martin B., Chen J., Nussenzweig A., Nussenzweig M.C. Enhanced intra-switch region recombination during immunoglobulin class-switch recombination in 53BP1–/– B cells. Eur. J. Immunol., 2007, vol. 37, no. 1, pp. 235–239. doi: 10.1002/eji.200636789
  50. Rybicka M., Woziwodzka A., Sznarkowska A., Romanowski T., Stalke P., Dręczewski M., Verrier E.R., Baumert T.F., Bielawski K.P. Liver cirrhosis in chronic hepatitis B patients is associated with genetic variations in DNA-repair pathway genes. Cancers (Basel), 2020, vol. 12, no. 11: 3295. doi: 10.3390/cancers12113295
  51. Saidi A., Li T., Weih F., Concannon P., Wang Z.Q. Dual functions of Nbs1 in the repair of DNA breaks and proliferation ensure proper V(D)J recombination and T-cell development. Mol. Cell. Biol., 2010, vol. 30, no. 22, pp. 5572–5581. doi: 10.1128/MCB.00917-10
  52. Sarhan M.A., Pham T.N., Chen A.Y., Michalak T.I. Hepatitis C virus infection of human T lymphocytes is mediated by CD5. J. Virol., 2012, vol. 86, no. 7, pp. 3723–3735. doi: 10.1128/JVI.06956-11
  53. Schrader C.E., Edelmann W., Kucherlapati R., Stavnezer J. Reduced isotype switching in splenic B cells from mice deficient in mismatch-repair enzymes. J. Exp. Med., 1999, vol. 190, no. 3, pp. 323–330. doi: 10.1084/jem.190.3.323
  54. Sharkawy R.E., Bayoumi A., Metwally M., Mangia A., Berg T., Romero-Gomez M., Abate M.L., Irving W.L., Sheridan D., Dore G.J., Spengler U., Lampertico P., Bugianesi E., Weltman M., Mollison L., Cheng W., Riordan S., Santoro R., Gallego-Durán R., Fischer J., Nattermann J., D’Ambrosio R., McLeod D., Powell E., Latchoumanin O., Thabet K., Najim M.A.M., Douglas M.W., Liddle C., Qiao L., George J., Eslam M. A variant in the MICA gene is associated with liver fibrosis progression in chronic hepatitis C through TGF-β1-dependent mechanisms. Sci. Rep., 2019, vol. 9, no. 1: 1439. doi: 10.1038/s41598-018-35736-2
  55. Sun Y., Lu Y., Li T., Xie L., Deng Y., Li S., Qin X. Interferon γ +874T/A polymorphism increases the risk of hepatitis virus-related diseases: evidence from a meta-analysis. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 5: e0121168. doi: 10.1371/journal.pone.0121168
  56. Świątek-Kościelna B., Kałużna E., Strauss E., Nowak J., Bereszyńska I., Gowin E., Wysocki J., Rembowska J., Barcińska D., Mozer-Lisewska I., Januszkiewicz-Lewandowska D. Prevalence of IFNL3 rs4803217 single-nucleotide polymorphism and clinical course of chronic hepatitis C. World J. Gastroenterol., 2017, vol. 23, no. 21, pp. 3815–3824. doi: 10.3748/wjg.v23.i21.3815
  57. Thanapirom K., Suksawatamnuay S., Sukeepaisarnjaroen W., Tangkijvanich P., Treeprasertsuk S., Thaimai P., Wasitthankasem R., Poovorawan Y., Komolmit P. Association between CXCL10 and DPP4 gene polymorphisms and a complementary role for unfavorable IL28B genotype in prediction of treatment response in Thai patients with chronic hepatitis C virus infection. PLoS One, 2015, vol. 10, no. 9: e0137365. doi: 10.1371/journal.pone.0137365
  58. Thanapirom K., Suksawatamnuay S., Sukeepaisarnjaroen W., Tangkijvanich P., Treeprasertsuk S., Thaimai P., Wasitthankasem R., Poovorawan Y., Komolmit P. Vitamin D-related gene polymorphism predicts treatment response to pegylated interferon-based therapy in Thai chronic hepatitis C patients. BMC Gastroenterol., 2017, vol. 17: 54. doi: 10.1186/s12876-017-0613-x
  59. Ton Tran H.T., Li C., Chakraberty R., Cairo C.W. NEU1 and NEU3 enzymes alter CD22 organization on B cells. Biophys. Rep. (N. Y.), 2022, vol. 2, no. 3: 100064. doi: 10.1016/j.bpr.2022.100064
  60. Wang J., Sadeghi C.A., Le L.V., Le Bouteiller M., Frock R.L. ATM and 53BP1 regulate alternative end joining-mediated V(D)J recombination. Sci. Adv., 2024, vol. 10, no. 31: e4682. doi: 10.1126/sciadv.adn4682
  61. WEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit. URL: https://www.webgestalt.org
  62. Yang Y., Tu Z.K., Liu X.K., Zhang P. Mononuclear phagocyte system in hepatitis C virus infection. World J. Gastroenterol., 2018, vol. 24, no. 44, pp. 4962–4973. doi: 10.3748/wjg.v24.i44.4962
  63. Yee L.J., Im K., Borg B., Yang H., Liang T.J. Interleukin-6 haplotypes and the response to therapy of chronic hepatitis C virus infection. Genes Immun., 2009, vol. 10, no. 4, pp. 365–372. doi: 10.1038/gene.2009.26
  64. Yun M.H., Hiom K. Understanding the functions of BRCA1 in the DNA-damage response. Biochem. Soc. Trans., 2009, vol. 37, no. 4, pp. 597–604. doi: 10.1042/BST0370597
  65. Zhao J., Dang X., Zhang P., Nguyen L.N., Cao D., Wang L., Wu X., Morrison Z.D., Zhang Y., Jia Z., Xie Q., Wang L., Ning S., El Gazzar M., Moorman J.P., Yao Z.Q. Insufficiency of DNA-repair enzyme ATM promotes naive CD4 T-cell loss in chronic hepatitis C virus infection. Cell Discov., 2018, vol. 4: 16. doi: 10.1038/s41421-018-0015-4

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2. Figure. Frequencies (in %) of genotypes and alleles of variants associated with CHC

下载 (204KB)
索引源数据

版权所有 © Babushkina N.P., Shavrak V.E., Goncharova I.A., Beloborodova E.V., 2025

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名 4.0国际许可协议的许可

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».