Том 12, № 1 (2022)

Последние несколько лет системы CRISPR/Cas активно исследуются и используются для широкого спектра прикладных задач. Многообразие вариантов их применения обусловлено способностью нуклеаз типа Cas направленно расщеплять заданные последовательности нуклеиновых кислот. При этом исследователь может задавать необходимую последовательность направляющих элементов cистемы, в роли которых выступают так называемые единые гидовые РНК, что позволяет системе воздействовать на определенные мишени. Такое свойство и стало одной из причин интереса к системам CRISPR/Cas. Одним из первых направлений применения данных систем было использование их для геномного редактирования. В дальнейшем список потенциальных возможностей расширился: например, CRISPR/Cas можно задействовать в генотерапии и эпигенетических исследованиях. Из единых гидовых РНК могут быть составлены библиотеки, выступающие основой для создания вирусных векторов с последующим трансдуцированием бактериальных клеток и нокаутированием указанных мишеней при помощи cas-белков. Такой подход позволяет осуществлять поиск бактериальных генов, ответственных за устойчивость или чувствительность к различным препаратам. Использование этих систем в молекулярной диагностике инфекционных заболеваний считается одним из наиболее многообещающих направлений. Диагностика при помощи  CRISPR/Cas  позволяет обнаруживать в образцах даже небольшие концентрации патогенных организмов за счет детекции их нуклеотидных последовательностей. При этом такие анализы оказываются точными, быстрыми и несложными в применении, а для функционирования ряда платформ даже не требуется дорогостоящее оборудование, поскольку уже разработаны методы быстрой и простой пробоподготовки, а современные подходы преамплификации позволяют уйти от использования термоциклических аппаратов. Примечательно, что уже открыто огромное число естественных систем CRISPR/Cas различных типов. Такое изобилие способствует разработке разнообразных искусственных систем, каждая из которых обладает своими особенными характеристиками. На их базе создается и множество диагностических платформ, различающихся по свойствам, что позволяет исследователям и медицинским работникам подбирать наилучший метод для решения определенных задач. Для выбора подходящей платформы важно иметь представление об устройстве и функционировании систем CRISPR/Cas, а следовательно, необходима актуальная классификация систем, на базе которой, в свою очередь, уже удобно оценивать само многообразие платформ молекулярной диагностики и представлять типовые характеристики и нюансы устройства для каждого метода. Таким образом, данный обзор, посвященный преимущественно платформам молекулярной диагностики инфекционных заболеваний, также затрагивает вопросы функционирования, устройств и классификации систем CRISPR/Cas.

Стрептококковые заболевания и их осложнения являются одной из глобальных проблем международного здравоохранения. S. pyogenes (стрептококк серологической группы А — СГА) — патоген, вызывающий значительную заболеваемость в разных странах и разных возрастных группах населения, возникающую как спорадически, так и эпидемическими вспышками. Из-за неэффективной антибактериальной терапии или ее отсутствия у 3–5% людей, перенесших стрептококковую инфекцию, могут развиться такие осложнения, как острая ревматическая лихорадка, ревматическое поражение сердца, острый постстрептококковый гломерулонефрит, а также инвазивные осложнения: некротизирующий фасциит и миозит, септицемии и синдром токсического шока, высоколетальные из-за быстрого развития процесса и системного поражения органов. По последним оценкам, ежегодно в мире регистрируется по меньшей мере 517 000 смертей из-за заболеваний, вызываемых S. pyogenes. Разнообразный арсенал факторов патогенности этого возбудителя проявляется сочетанными и последовательными реакциями в процессах колонизации микробом тканей, формирования очага инфекции и преодоления защитных механизмов хозяина. Их совокупность определяет патогенетические механизмы заболеваний стрептококковой этиологии. Факторы патогенности СГА можно разделить на ассоциированные с микробной клеткой, преимущественно с ее клеточной стенкой, и на внеклеточные — экстрацеллюлярные. Спектр активности стрептококковых факторов патогенности может быть достаточно широким (М-белки, пирогенные экзотоксины, суперантигены) или узким (сериновая и цистеиновая протеиназы, стрептокиназа). Исследования специфичности факторов патогенности, их свойств, взаимосвязей, регуляторных механизмов и конкретной функции в патологии являются задачей научного поиска, ведущего к пониманию всей сложности функциональной организации возбудителя в его взаимодействии с макроорганизмом. Необходим также комплексный подход в изучении патогенности стрептококков, поскольку факторы патогенности не проявляют себя изолированно и не всегда регулируются независимо. Во многих случаях регуляторы контролируют экспрессию более чем одного из них. Несмотря на то что S. pyogenes изучаются уже около 150 лет, до настоящего времени остается ряд нерешенных вопросов, связанных с их болезнетворностью. Некоторые факторы патогенности СГА нуждаются в более углубленном изучении, например эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза, аргининдеиминаза. Отдельного внимания требуют иммуноглобулин-деградирующие ферменты в связи с их возможным участием в генезе иммунопатологических процессов стрептококковой этиологии. В данном обзоре суммированы литературные данные о большинстве факторов патогенности S. pyogenes и их роли в инфекционном процессе.

Цитомегаловирусная инфекция (ЦМВИ) остается одной из главных проблем современного здравоохранения. Она относится к категории социально и экономически значимых инфекций, поражает как детей, так и взрослых, характеризуется полиморфизмом клинических проявлений и многообразием путей и факторов передачи. Серьезной проблемой является заражение цитомегаловирусом (ЦМВ) реципиентов крови и органов. Следует отметить, что несмотря на большую медицинскую и социальную значимость инфекции система эпидемиологического надзора и контроля за ЦМВИ в том виде, в котором она существует применительно к другим актуальным инфекциям, в РФ отсутствует. Цель исследования — провести поиск оптимальных вариантов генотипирования цитомегаловирусов и оценку генотипового разнообразия российских изолятов ЦМВ, выделенных у пациентов, перенесших трансплантацию солидных органов. В статье представлены результаты исследования образцов крови, лейкоцитарной массы, слюны, мочи и слезного отделяемого, взятых у 160 пациентов отделения трансплантологии Приволжского окружного медицинского центра ФМБА в возрасте от 22 до 64 лет, перенесших трансплантацию печени и почек. Для тестирования образцов применялись молекулярно-биологические и серологические методы. Генотипирование проводили путем NGS-секвенирования фрагментов ДНК ЦМВ. Установлена высокая частота выявления ДНК ЦМВ у пациентов, перенесших трансплантацию солидных органов. У 41,8±3,8% пациентов была обнаружена ДНК цитомегаловируса в образцах слюны и мочи, а у 18,1±3,04% из них — в образцах крови. У 98,8±3,2% пациентов диагноз «Цитомегаловирусная инфекция» был подтвержден серологически. По результатам анализа литературы проведена оценка различных методических подходов к генотипированию клинических изолятов ЦМВ. В результате был подобран и апробирован на клинических образцах вариант типирования, основанный на определении генотипов по двум вариабельным генам — UL55 (gB), UL73 (gN). Определены спектры и долевое распределение gB- и gN-генотипов ЦМВ, циркулирующих среди взрослых. Установлено, что в группе пациентов, перенесших трансплантацию солидных органов, превалируют генотипы gB2, gN4c, gN4a и gN1. В некоторых случаях обнаружена смешанная инфекция, обусловленная ассоциацией двух и трех генотипов ЦМВ. Проведенный филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей генов UL55 и UL73 свидетельствует о генетической гетерогенности российских изолятов ЦМВ, выделенных у взрослых пациентов группы риска.

Туберкулез (ТБ), хроническое бактериальное заболевание, вызываемое Mycobacterium tuberculosis, обычно поражает легкие, но также может затрагивать и другие анатомические области (внелегочный туберкулез, ВЛТ). Для начала специфического эффективного лечения необходимо проведение быстрой диагностики. Хотя культивирование микобактерий остается золотым стандартом для диагностики ВЛТ, все больший интерес вызывают молекулярные методы. GeneXpert MTB/RIF — быстрый автоматизированный диагностический тест, который позволяет обнаруживать M. tuberculosis, а также мутации в «горячем участке» гена rpoB, связанные с устойчивостью к рифампицину. Настоящее исследование было выполнено для оценки эффективности теста GeneXpert MTB/RIF для диагностики внелегочного туберкулеза в сравнении со стандартным методом. Данное проспективное исследование было проведено на 304 клинических образцах, собранных у 192 пациентов, посещавших лабораторию микобактерий и туберкулеза Института Пастера в Марокко в период с 2016 по 2017 гг. Из 304 образцов 113 составляла плевральная жидкость, очищенная с использованием метода Петрова, а 191 образец биопсии (78 лимфатических узлов и 113 биопсий плевры), деконтаминированные с использованием метода Левейнштейна. Обнаружение и идентификацию Mycobacterium tuberculosis проводили для всех образцов с использованием микроскопии мазка, культивирования на среде Левенштейна–Йенсена и теста GeneXpert MTB/RIF. Наши результаты показали, что 54,5% (103/189) составляли мужчины и 45,5% (86/189) — женщины. Возраст пациентов составлял от 2 до 78 лет, большинство пациентов были в возрастной группе от 25 до 45 лет. Внелегочные образцы были взяты из лимфатических узлов, плевральной жидкости и плевральных тканей с процентным соотношением 25,66, 37,17 и 37,17% соответственно. Интересно, что чувствительность GeneXpert составила 51,4% для всех образцов и 83,3% для лимфатических узлов. Таким образом, настоящее исследование показало, что эффективность теста GeneXpert значительно зависит от типа образца, при этом высокая чувствительность наблюдается для лимфатических узлов. Кроме того, мы показали, что тест GeneXpert MTB/RIF имеет ограничения в диагностике плеврального туберкулеза. Мы рекомендуем совместное использование GeneXpert MTB/RIF и традиционных методов для диагностики внелегочного туберкулеза.

Внебольничные пневмонии относятся к полиэтиологическим инфекционным заболеваниям бактериальной или вирусной природы. В большинстве случаев они обусловлены такими возбудителями, как Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Haemophilus influenzaе, Chlamydophila pneumoniae, Staphylococcus aureus, Legionella spp., грамотрицательными палочками, вирусами гриппа А и В, аденовирусами, PC-вирусом, вирусами парагриппа. Однако, несмотря на внедрение в лабораторную практику широкого спектра современных диагностических методов, этиологию заболевания удается установить только в 40–60% случаев. В настоящей статье приведен анализ данных по обнаружению возбудителей внебольничных пневмоний и их маркеров в пробах клинического материала от больных, проходивших лечение в медицинских организациях  г. Саратова и Саратовской области в период с июля по август 2020 г., сопряженный с увеличением количества случаев заболевания новой коронавирусной инфекцией COVID-19. Клинический материал (мазки из ротоглотки, слюна, мокрота, кровь и сыворотка крови) получен от 129 больных и исследован с помощью микробиологических, иммуносерологических и молекулярно-генетических методов. Для исследований применяли транспортные и питательные среды, диагностические препараты, реагенты, диски с антибактериальными препаратами отечественного и зарубежного производства, зарегистрированные на территории Российской Федерации. В результате проведенных исследований у 82 (63,6%) пациентов выявлены маркеры возбудителя COVID-19 (вирусная РНК или специфические антитела классов IgM и/или IgG), при этом в 42% случаев отмечено совпадение результатов ОТ-ПЦР и ИФА. Отмечено преобладание доли тяжелых клинических форм заболевания в группе больных пневмониями, вызванными вирусом SARS-CoV-2 (17,1%), по сравнению с пневмониями другой этиологии (12,8%). Значительных различий в видовом составе сопутствующей микрофлоры и ее чувствительности к антибактериальным препаратам у лиц с маркерами COVID-19 и без таковых не выявлено. При исследовании бактериологическими методами из проб клинического материала большинства больных были выделены S. aureus, K. pneumoniae, S. pneumoniae, M. pneumoniae, Acinetobacter spp., как в монокультуре, так и в ассоциациях. В 49,6% случаев патогенная микрофлора, в том числе возбудители внебольничных пневмоний, не выявлена, что может быть обусловлено приемом антибактериальных препаратов до начала сбора материала на исследование и лечением сопутствующих хронических заболеваний.

Целью нашей работы стала оценка клинико-анамнестических, серологических, иммунологических и биохимических тестов, используемых для ранней диагностики рака желудка (РЖ), ассоциированного с инфекцией Helicobacter pylori, у взрослого населения Красноярского края. Материалы и методы. Контрольная группа была сформирована из 104 практически здоровых доноров крови, в группу сравнения входили 97 пациентов с хроническим атрофическим гастритом (ХАГ), а в группу больных ранним РЖ — 98 пациентов. Оценка спонтанной и индуцированной хемилюминесценции (ХЛ) моноцитов и нейтрофилов осуществлялась на 36-канальном биохемилюминометре «БЛМ-3607». Оценка фагоцитоза проводилась на проточном цитометре Beckman Coulter FC 500. Для изучения процессов перекисного окисления липидов и факторов системы антиоксидантной защиты использовали спектрофлюориметр Varian Cary Eclipse. Результаты и обсуждение. При изучении фагоцитарного звена иммунитета было обнаружено, что у всех больных ранним РЖ диагностировались показатели максимальной интенсивности спонтанной ХЛ нейтрофилов от 17 831 у.е. и ниже, а при индуцированной ХЛ — от 30 000 у.е. и ниже. Фагоцитарная активность нейтрофильных гранулоцитов у больных ранним РЖ составляла 36% и ниже. При изучении показателей моноцитов было выявлено, что при снижении спонтанной ХЛ от 454 у.е. и снижении индуцированной ХЛ от 1186 у.е. у пациентов в нашем исследовании диагностировался ранний рак желудка. Фагоцитарная активность моноцитов при раннем РЖ составляла 34% и ниже. При исследовании перекисного окисления липидов и факторов системы антиоксидантной защиты у пациентов с ХАГ и РЖ было выявлено повышение уровня малонового диальдегида (MDA). У больных РЖ происходило снижение активности фермента каталазы (CAT). У больных ХАГ происходило снижение уровня глутатионпероксидазы (GPO). У больных ранним РЖ обнаруживалось увеличение активности фермента GPO. Нами были предложены коэффициенты для оценки факторов системы антиоксидантной защиты у пациентов: коэффициент отношения активности фермента супероксиддисмутазы к каталазе (SOD/CAT) и коэффициент отношения активности фермента супероксиддисмутазы к глутатионпероксидазе (SOD/GPO). Заключение. При проведении исследования были получены пороговые значения показателей для формирования групп высокого риска развития раннего РЖ, которые могут использоваться для скрининга взрослого населения.

Для оценки влияния вакцинации на уровень гуморального популяционного противогриппозного иммунитета методом РТГА были проанализированы 2955 сывороток здоровых взрослых доноров, полученных из различных городов Российской Федерации в эпидсезоны 2019–2020 и 2020–2021 гг. Среди доноров 1057 человек были вакцинированы сезонной трехвалентной инактивированной вакциной. Значительно более высокие показатели гуморального противогриппозного иммунитета у привитых лиц по сравнению с невакцинированными (средние геометрические титры антител и доля серопозитивных лиц по отношению к вакцинным вирусам), полученные осенью 2019 и 2020 гг. (через 1–2 месяца после прививочных кампаний), свидетельствовали о положительном вкладе вакцинации в формирование коллективного иммунитета против гриппа В предэпидемические периоды. По прошествии эпидемии 2019–2020 гг., весной 2020 г. (через 6–7 месяцев после вакцинации), в группе привитых доноров уровни антител ко всем компонентам вакцины снизились в 2,6–3,5 раза по сравнению с предэпидемическим периодом осени 2019 г., опустившись значительно ниже защитного уровня (титр в РТГА < 1/40). При этом более не наблюдалось значимых различий между группами вакцинированных и невакцинированных лиц, что указывает на нестабильность поствакцинального противогриппозного гуморального иммунитета. Результатом может быть уменьшение невосприимчивой к гриппу прослойки работоспособного населения в преддверии нового эпидсезона. Помимо влияния вакцинации на состояние популяционного иммунитета взрослого населения России, в РТГА была оценена иммуногенность инактивированной трехвалентной сезонной вакцины по результатам анализа парных сывороток, полученных от 295 и 112 здоровых лиц различного возраста, привитых осенью 2019 г. и 2020 г. соответственно. Характер реакции на вакцину зависел от возраста. У детей 3–14 лет наблюдался более активный ответ по сравнению с лицами старшего возраста. Показана недостаточная иммуногенность вакцинных компонентов вирусов гриппа В. Через 1–1,5 месяца после вакцинации во всех возрастных группах средние геометрические титры антител к вирусам гриппа В были ниже (в 2–8 раз), чем к актуальным А(H1N1)pdm09-подобным штаммам и вирусам гриппа А(H3N2). Анализ иммуногенности вакцины показал статистически значимую обратную связь между уровнем предсуществующих штамм-специфичных антител, выявленных в крови на момент прививки, и образованием антител к соответствующему вакцинному вирусу через 1–1,5 месяца после вакцинации. Сероконверсии к каждому вакцинному компоненту значительно чаще наблюдали у лиц с низким исходным уровнем в крови антител к соответствующему вирусу.

Изучение роли грибковой аллергии в развитии атопического дерматита (АтД) и псориаза (ПС) представляет особый интерес и определяет актуальность проведенного исследования. Цель работы — изучить и провести сравнительный анализ спектра сенсибилизации к грибковым аллергенам больных атопическим дерматитом и псориазом. Материалы и методы. В исследовании приняли участие больные АтД (I группа, n = 53, средний возраст 33,0±1,3 лет) и ПС (II группа, n = 53, средний возраст 40,0±1,8 лет) в возрасте от 18 до 66 лет. Определение сенсибилизации к грибковым аллергенам проводилось методом кожного prick-тестирования с использованием стандартизованных грибковых аллергенов: Candida albicans, Alternaria alternata, Aspergillus fumigatus, Cladosporium herbarum, Penicillium notatum (Allergopharma, Германия) и пищевых дрожжей (Микроген, Россия). Методом непрямого иммунофлуоресцентного анализа на полуавтоматическом анализаторе Multiskan FC (ThermoFisher Scientific, Финляндия) была определена концентрация аллерген-специфических IgE к смеси грибковых аллергенов: Penicillium notatum, Cladosporium herbarum, Aspergillus fumigatus, Mucor racemosus, Alternaria alternata (Алкор Био, Россия). Тест считался положительным при уровне IgE ≥ 0,35 кЕ/л. Для статистического анализа применяли пакет прикладных программ Statistica 8.0. Результаты и обсуждение. При изучении особенностей сенсибилизации к грибковым аллергенам определено, что в группе больных АтД отмечается наиболее высокая частота сенсибилизации к пищевым дрожжам, а также к грибкам рода Alternaria alternata и Cladosporium herbarum. В группе больных ПС установлена наиболее высокая частота сенсибилизации к грибкам рода Cladosporium herbarum, Aspergillus fumigatus и Alternaria alternata. При изучении межгрупповых различий определено, что частота сенсибилизации к грибкам была выше в группе больных ПС, чем в группе больных АтД, однако статистической значимости показатели не достигли. Сенсибилизация к смеси плесневых аллергенов, согласно концентрации аллерген-специфических IgE, была чаще отмечена в группе больных АтД в сравнении с группой больных ПС: 15% против 5,3%. Вероятнее всего, развитие АтД и ПС связано с участием другого класса реагинов (IgG4) или с вовлечением иных иммунопатологических механизмов запуска аллергии (по классификации Джелла и Кумбса). Таким образом, грибковая аллергия может играть важную роль в этиопатогенезе атопического дерматита и псориаза. Проведенное нами исследование может ориентировать клиницистов в плане персонализированных подходов к диагностике и лечению данных патологий с включением специфического аллергологического обследования больных АтД и ПС.

В настоящее время оценка иммуногенных свойств вирусов гриппа, входящих в состав гриппозных вакцин, проводится с использованием показателей серопротекции, сероконверсии и кратности приростов антител после вакцинации. При этом существенные различия в иммуногенности вакцин, связанные с динамикой формирования высоких титров антител, ответственных за длительную защиту привитых, остаются за рамками внимания исследователей. Вирусы гриппа, подобные A(H1N1)pdm09, вызвавшему пандемию 2009–2010 гг., продолжают циркуляцию в человеческой популяции, поэтому оценка иммуногенной активности вакцинных вирусов, подготовленных в пандемический период, представляет интерес с точки зрения методологии подготовки пандемических вакцин для их применения в различных в различных группах населения (взрослые, дети, пожилые люди). Анализ иммуногенности гриппозных вакцин, применяемых в период пандемии свиного гриппа 2009–2010 гг. и постпандемический период до 2014 г., был выполнен графическим методом (иммунографики). Для каждой группы привитых (в зависимости от использованной вакцины) вычисляли кратность нарастания антител (КрН) и строили графики иммуногенности. По оси абсцисс (х) откладывали значения КрН антител, имеющихся в данной группе вакцинированных, по оси ординат (y)  — количество сывороток (в  %)    с данной кратностью нарастания антител от 1 до максимально достигнутых в группе привитых. Предлагаемая методика оценки иммуногенности позволяет строить графики независимо от уровня антител в сыворотках волонтеров. Использование метода иммунографиков позволило выявить ряд особенностей формирования иммунного ответа к пандемическому вирусу A(H1N1)pdm09, таких как отсутствие иммунного ответа у значительного количества взрослых волонтеров (25–27%) и детей младшего возраста (60–70%) на введение моновакцины. Причинами такой иммунной реакции могут быть как недостаточная доза вирусного антигена в вакцине, так и супрессия иммунного ответа, которую оказывал вирус гриппа A(H1N1)pdm09. Изучение иммуногенных свойств сезонных гриппозных вакцин в период с 2010 по 2014 г., содержащих антиген вируса гриппа A(H1N1) pdm09, выявило разнообразие в формировании гуморального иммунитета у вакцинированных от кратковременного с невысокой кратностью нарастания антител у детей до формирования высоких титров антител у пожилых людей. Практическим результатом иммунографического анализа гриппозных моновакцин, в частности полученных на основе вируса гриппа A(H1N1)pdm09, могут быть рекомендации по увеличению антигенной нагрузки в начале пандемического цикла и/или купирование супрессивных свойств вакцинных вирусов в составе детских вакцин, так как увеличение дозы вируса в вакцине для детей не всегда выполнимо.

В статье рассмотрена взаимосвязь снижения противоинфекционной защиты организма на фоне длительной инвазии Opisthorchis felineus в гепатобилиарной системе, обсеменения протоковой желчи микрофлорой и выявления в желчи эндогенного фактора мутагенеза (канцерогенеза) — вторичных желчных кислот. Показана роль генотипа организма в иммунном ответе на патоген — трематоду Opisthorchis felineus — и в развитии гельминта в гепатобилиарной системе. Рассмотрено значение нарушения механизмов регуляции тканевого гомеостаза в индукции компенсаторной хронической гомеостатической пролиферации и онкогенезе соматических клеток. Результаты исследования свидетельствуют о том, что в обусловленном хронической описторхозной инвазией дисбалансе иммунобиологической реактивности организма особое значение имеет нарушение функционирования регуляторных Т-клеток, угнетение эффекторной функции NK и весьма высокая функциональная активность В-клеток памяти. Снижение противоинфекционной защиты организма обусловливает обсемененность внутрипеченочных желчных протоков различными видами бактерий. Наличие вторичных желчных кислот в гепатобилиарной системе ассоциировалось с билиарными штаммами бактерий, населяющих кишечный тракт: Proteus vulgaris, Proteus mirabilis, Citrobacter freundii, Bacteroides аlcaligues faecalis, Clostridium, Streptococcus faecalis, Eschеrichia coli — представители кишечной микрофлоры и др. Участие микробиоты в биотрансформации желчных кислот непосредственно в протоковой желчи подтверждено в экспериментах in vitro. Экспресс-методами на Drosophila melanogaster и штаммах Salmonella typhimurium ТА100, ТА98 установлено, что желчь у больных хроническим описторхозом обладает более высокой мутагенной активностью, чем в группах контроля. Мутационные события в соматических и бактериальных клетках зависят от присутствия в протоковой желчи вторичных желчных кислот (дезоксихолевой, литохолевой), а также уровня общей концентрации желчных кислот. Результаты исследования подтверждают концепцию профессора А.А. Шайна о наличии в желчи больных хроническим описторхозом эндогенного фактора риска первичного холангиоцеллюлярного рака печени — вторичных желчных кислот. Концепция холангиоканцерогенеза, основанная на мутационных событиях, дополняется нарушением генеративного цикла клеток тканей и их дифференцировки в результате снижения активности кейлонного фактора, а также порога чувствительности к нему. Уровень изученности и понимание механизмов холангиоканцерогенеза на фоне хронической описторхозной инвазии позволят разработать патогенетические подходы к коррекции систем регуляции гомеостаза организма и профилактики холангиокарцином.

Микробиологический мониторинг является важнейшим компонентом эпидемиологической безопасности организации лечебно-диагностического процесса, неотъемлемой частью процесса обеспечения эпидемиологического наблюдения за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи (ИСМП), путем этиологической расшифровки, выявления госпитальных штаммов микроорганизмов и разработки стратегии и тактики борьбы с ними. В современных условиях развития здравоохранения и человечества в целом важнейшей проблемой является неуклонный рост числа инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП), обусловленных нечувствительными к антимикробным препаратам (АМП) возбудителями, и снижение эффективности препаратов, используемых для их лечения. В условиях стационара структура инфекционных патологий, сопровождающих лечебно-диагностический процесс, специфична  и  определяется профилем и характером проводимого лечения, а также нозологией и возрастом пациентов. Микробиологический мониторинг играет важную роль для оценки и корректировки проводимой антимикробной терапии на основе организации своевременного и рационального взаимодействия лечащего врача и сотрудников бактериологической лаборатории. В этиологической структуре ИСМП к ведущим возбудителям относятся Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanii, а также Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium. В настоящем исследовании оценены показатели распространенности в медицинских организациях Санкт-Петербурга потенциальных возбудителей инфекций кровотока, резистентных к АМП. Ретроспективно проанализированы данные о чувствительности к антимикробным препаратам штаммов шести клинически значимых возбудителей ИСМП, выявленных при исследовании крови пациентов 50 стационаров Санкт-Петербурга в 2016–2019 гг. Установлено, что применение β-лактамных антимикробных препаратов в настоящее время не эффективно при лечении больных с инфекциями кровотока, вызванными штаммами S. aureus (в 21,9% случаев), E. coli (в 2,1% случаев), Klebsiella spp. (в 39,6% случаев), P. aeruginosa (в 40,5% случаев), Acinetobacter spp. (в 66,7% случаев), Enterococcus spp. (в 4,4% случаев). Показано, что целенаправленный мониторинг инфекционных процессов, протекающих на фоне полирезистентности их возбудителей, следует рассматривать как эффективный организационный механизм своевременного выявления и профилактики осложнений, наблюдаемых в клинической практике, при оказании медицинской помощи пациентам, подверженным высокому риску развития инфекций кровотока. Выявление особенностей эпидемического процесса гнойно-септических инфекций с учетом фенотипа резистентности возбудителя в медицинских организациях позволяет определять пути совершенствования мер их профилактики для повышения качества оказываемой медицинской помощи. Очевидно, что данные микробиологического мониторинга также необходимы для разработки и проведения мероприятий по сдерживанию дальнейшего роста антимикробной резистентности возбудителей инфекционных заболеваний.