Частота колонизации ротоглотки и резистентность к азолам грибов Candida spp., выделенных у реанимационных пациентов с COVID-19

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Пациенты с COVID-19 восприимчивы к развитию кандидоза ротоглотки и инвазивного кандидоза. Инвазивные грибковые инфекции могут осложнять клиническое течение COVID-19 и связаны со значительным ростом смертности. Важным условием успешного лечения кандидоза является определение чувствительности клинических изолятов грибов к антимикотикам. Проведено микробиологическое исследование мазков из ротоглотки у 54 пациентов в возрасте от 33 до 94 лет (средний возраст — 67,4 лет) с тяжелой и крайне тяжелой формой COVID-19, получавших лечение в отделении реанимации и интенсивной терапии на высоте клинических проявлений. Большинство пациентов (95%) имели коморбидную патологию: гипертоническая болезнь (68,5%), сахарный диабет (24%), ИБС (22,2%), хроническая сердечная недостаточность (38,9%), ожирение (23,8%), нарушение ритма сердца (20,4%), хроническая ишемия головного мозга (56,1%), варикозная болезнь вен нижних конечностей (5,5%), хроническая болезнь почек (20,4%), цирроз печени (5,5%), ВИЧ-инфекция (5,5%). Сравнительный анализ микробного биоценоза слизистой ротоглотки показал отличия в частоте встречаемости условно-патогенных видов микроорганизмов, а также в количестве участников микробных ассоциаций. Поливидовые грибково-бактериальные ассоциации встречались чаще и доминировали над поливидовыми бактериальными ассоциациями. По результатам проведенного исследования установлена высокая частота колонизации ротоглотки пациентов с тяжелой формой COVID-19 штаммами грибов рода Candida. Подавляющее большинство штаммов грибов рода Candida (85,2%) оказались резистентными к антимикотикам группы азолов. Среди кандид доминировали C. albicans — выделена у 37 (68,5%) пациентов, C. рarapsilosis — у 6 (11,1%), C. tropicalis — у 3 (5,5%), С. krusei — у 2 (3,7%), C. kefyr — у 1 (1,9%), C. glabrata — у 1 (1,9%) пациента. У 11 (20,4%) пациентов выделены ассоциации C. albicans и других видов Candida. Концентрация грибов в материале была этиологически значимой (> 104–105 КОЕ/тамп.) у 80% пациентов. Преобладающее большинство штаммов (более 70%) были резистентны к флуконазолу и вориконазолу, что следует учитывать при назначении терапии кандидоза у больных COVID-19. МИК для флуконазола к штаммам C. albicans составила для 4 изолятов > 1024 мкг/мл, для 7 изолятов 512 мкг/мл и для 15 — 128 мкг/мл. Максимальное значение МИК вориконазола в отношении C. albicans составило 256 мкг/мл.

Об авторах

Светлана Анатольевна Лисовская

ФБУН Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО Казанский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ; ФГАОУ ВО Казанский (Приволжский) федеральный университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: S_Lisovskaya@mail.ru

к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории микологии; доцент кафедры микробиологии; ведущий научный сотрудник лаборатории биологически активных терпеноидов

Россия, г. Казань; г. Казань; г. Казань

Гузель Шавхатовна Исаева

ФБУН Казанский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО Казанский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ

Email: S_Lisovskaya@mail.ru

д.м.н., профессор, зам. директора по инновационному развитию; зав. кафедрой микробиологии

Россия, г. Казань; г. Казань

Ирина Венедиктовна Николаева

ФГБОУ ВО Казанский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ

Email: S_Lisovskaya@mail.ru

д.м.н., профессор, зав. кафедрой инфекционных болезней

Россия, г. Казань

Софья Евгеньевна Гусева

ГАУЗ Республиканская клиническая инфекционная больница имени профессора А.Ф. Агафонова МЗ РТ

Email: S_Lisovskaya@mail.ru

врач-инфекционист

Россия, г. Казань

Лилия Рифкатовна Гайнатуллина

ГАУЗ Республиканская клиническая инфекционная больница имени профессора А.Ф. Агафонова МЗ РТ

Email: S_Lisovskaya@mail.ru

врач-инфекционист, зав. отделением

Россия, г. Казань

Никита Сергеевич Чумарев

ФГБОУ ВО Казанский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения РФ

Email: S_Lisovskaya@mail.ru

ассистент кафедры микробиологии

Россия, г. Казань

Список литературы

  1. Аронова Н.В., Павлович Н.В., Цимбалистова М.В., Полеева М.В., Анисимова А.С., Водопьянов С.О., Носков А.К. Видовое разнообразие и маркеры резистентности дрожжей рода Candida у коронапозитивных и коронанегативных больных с внебольничными пневмониями // Антибиотики и химиотерапия. 2021. Т. 66, № 7–8. С. 38–44. [Aronova N.V., Pavlovich N.V., Tsymbalistova M.V., Poleeva M.V., Anisimova A.S., Vodopyanov S.O., Noskov A.K. Species diversity and resistance markers of candida yeasts in COVID positive and COVID negative patients with community-acquired pneumonia. Antibiotiki i khimioterapiya = Antibiotics and Chemotherapy. 2021, vol. 66, no. 7–8, pp. 38–44. (In Russ.)] doi: 10.37489/0235-2990-2021-66-7-8-38-44
  2. Беженар М.Б., Плахова К.И. Механизмы развития резистентности к противогрибковым препаратам грибов рода Candida при рецидивирующем течении урогенитального кандидоза // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2020. Т. 38, № 1. С. 15–23. [Bezhenar M.B., Plakhova K.I. Antifungal drug resistance Candida spp. mechanisms in reccurent genital candidiasis. Molekulyarnaya genetika, mikrobiologiya i virusologiya = Molecular Genetics, Microbiology and Virology, 2020, vol. 38, no. 1, pp. 15–23. (In Russ.)] doi: 10.17116/molgen20203801115
  3. Белоцерковский Б.З., Гельфанд Е.Б., Быков А.О., Мамонтова О.А., Проценко Д.Н. Критерии назначения системной антимикотической терапии в хирургическом отделении реанимации и интенсивной терапии (обзор литературы) // Тазовая хирургия и онкология. 2019. Т. 9, № 4. С. 11–20. [Belotserkovskiy B.Z., Gelfand E.B., Bykov A.O., Mamontova O.A., Protsenko D.N. Criteria for the administration of systemic antimicotic therapy in surgical intensive care units (literature review). Tazovaya khirurgiya i onkologiya = Pelvic Surgery and Oncology, 2019, vol. 9, no. 4, pp. 11–20. (In Russ.)] doi: 10.17650/2686-9594-2019-9-4-11-20
  4. Веселов А.В., Климко Н.Н., Кречикова О.И., Клясова Г.А., Агапова Е.Д., Мултых И.Г., Розанова С.М., Крайнова Л.Е., Дмитриева Н.В., Козлов Р.С. In vitro активность флуконазола и вориконазола в отношении более 10000 штаммов дрожжей: результаты 5-летнего проспективного исследования ARTEMIS Disk в России // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2008. T. 10, № 4. C. 345–354. [Veselov A.V., Klimko N.N., Krechikova O.I., Klyasova G.A., Agapova E.D., Multykh I.G., Rozanova S.M., Krainova L.E., Dmitrieva N.V., Kozlov R.S. In vitro activity of fluconazole and voriconazole against more than 10000 yeast strains: results of a 5-years prospective ARTEMIS disk study in Russia. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2008, vol. 10, no. 4, pp. 345–354. (In Russ.)]
  5. Веселов А.В. Прогностические правила для оценки риска инвазивного кандидоза у пациентов ОРИТ // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017. Т. 19, № 4. С. 296–302. [Veselov A.V. Prognostic rules for invasive candidiasis risk assessment in ICU patients. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya = Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2017, vol. 19, no. 4, pp. 296–302. (In Russ.)]
  6. Назарова Н.М., Гусаков К.И., Павлович С.В., Довлетханова Э.Р. Рецидивирующий вульвовагинальный кандидоз на фоне пандемии COVID-19: алгоритм ведения пациенток // Медицинский Совет. 2021. № 13. С. 177–184. [Nazarova N.M., Gusakov K.I., Pavlovich S.V., Dovletkhanova E.R. Recurrent vulvovaginal candidiasis during COVID-19 pandemic: medical algorithm. Meditsinskiy sovet = Medical Council, 2021, no. 13, pp. 177–184. (In Russ.)] doi: 10.21518/2079-701X-2021-13-177-184
  7. Рауш Е.Р., Выборнова И.В., Шагдилеева Е.В., Васильева Н.В., Богомолова Т.С., Хостелиди С.Н., Климко Н.Н. Определение чувствительности возбудителей инвазивного кандидоза к флуконазолу и вориконазолу по международным стандартам // Проблемы медицинской микологии. 2013. Т. 15, № 1. С. 60–63. [Raush E.R., Vybornova I.V., Shagdileeva E.V., Vasilyeva N.V., Bogomolova T.S., Khostelidi S.N., Klimko N.N. Susceptibility testing of invasive candidosis pathogens to Fluconazole and Voriconazole by international standards. Problemy meditsinskoi mikologii = Problems of Medical Mycology, 2013, vol. 15, no. 1, pp. 60–63. (In Russ.)]
  8. Akpan A., Morgan R. Oral candidiasis. Postgrad. Med. J., 2002, vol. 78, no. 922, pp. 455–459. doi: 10.1136/pmj.78.922.455
  9. Bertolini M., Ranjan A., Thompson A., Diaz P.I., Sobue T., Maas K., Dongari-Bagtzoglou A. Candida albicans induces mucosal bacterial dysbiosis that promotes invasive infection. PLoS Pathog., 2019, vol. 15, no. 4: e1007717. doi: 10.1371/journal.ppat.1007717.10
  10. Casalini G., Giacomelli A., Ridolfo A., Gervasoni C., Antinori S. Invasive fungal infections complicating COVID-19: a narrative review. J. Fungi, 2021, vol. 7, no. 11: 921. doi: 10.3390/jof7110921
  11. Delisle M.S., Williamson D.R., Albert M., Perreault M.M., Jiang X., Day A.G., Heyland D.K. Impact of Candida species on clinical outcomes in patients with suspected ventilator-associated pneumonia. Can. Respir. J., 2011, vol. 18, no. 3, pp. 131–136. doi: 10.1155/2011/827692
  12. Gangneux J.P., Bougnoux M.E., Dannaoui E., Cornet M., Zahar J.R. Invasive fungal diseases during COVID-19: we should be prepared. J. Mycol. Med., 2020, vol. 30, no. 2: e100971. doi: 10.1016/j.mycmed.2020.100971
  13. Jeronimo L.S., Esteves Lima R.P., Suzuki T.Y.U., Discacciati J.A.C., Bhering C.L.B. Oral candidiasis and COVID-19 in users of removable dentures: is special oral care needed? Gerontology, 2022, vol. 68, no. 1, pp. 80–85. doi: 10.1159/000515214
  14. Nucci M., Barreiros G., Guimarães L.F., Deriquehem V.A., Castiñeiras A.C., Nouér S.A. Increased incidence of candidemia in a tertiary care hospital with the Covid-19 pandemic. Mycoses, 2021, vol. 64, no. 2, pp. 152–156. doi: 10.1111/myc.13225
  15. Pendleton K.M., Dickson R.P., Newton D.W., Hoffman T.C., Yanik G.A., Huffnagle G.B. Respiratory tract colonization by Candida species portends worse outcomes in immunocompromised patients. Clin. Pulm. Med., 2018, vol. 25, no. 6, pp. 197–201. doi: 10.1097/CPM.0000000000000279
  16. Pote S.T., Sonawane M.S., Rahi P., Shah S.R., Shouche Y.S., Patole M.S., Thakar M.R., Sharma R. Distribution of pathogenic yeasts in different clinical samples: their identification, antifungal susceptibility pattern, and cell invasion. Infect. Drug. Resist., 2020, no. 13, pp. 1133–1145. doi: 10.2147/IDR.S238002
  17. Ripa M., Galli L., Poli A., Oltolini C., Spagnuolo V., Mastrangelo A., Muccini C., Monti G., De Luca G., Landoni G., Dagna L., Clementi M., Rovere Querini P., Ciceri F., Tresoldi M., Lazzarin A., Zangrillo A., Scarpellini P., Castagna A.; COVID-BioB study group. Secondary infections in patients hospitalized with COVID-19: incidence and predictive factors. Clin. Microbiol. Infect., 2021, vol. 27, no. 3, pp. 451–457. doi: 10.1016/j.cmi.2020.10.021
  18. Romo J.A., Kumamoto C.A. On commensalism of Candida. J. Fungi (Basel), 2020, vol. 6, no. 16. doi: 10.3390/jof6010016
  19. Salehi M., Ahmadikia K., Mahmoudi S., Kalantari S., Jamalimoghadamsiahkali S., Izadi A., Kord M., Dehghan Manshadi S.A., Seifi A., Ghiasvand F., Khajavirad N., Ebrahimi S., Koohfar A., Boekhout T., Khodavaisy S. Oropharyngeal candidiasis in hospitalised COVID-19 patients from Iran: species identification and antifungal susceptibility pattern. Mycoses, 2020, vol. 63, no. 8, pp. 771–778. doi: 10.1111/myc.13137
  20. Wang B., Zhang L., Wang Y., Dai T., Qin Z., Zhou F., Zhang L. Alterations in microbiota of patients with COVID-19: potential mechanisms and therapeutic interventions. Sig. Transduct. Target Ther., 2022, vol. 7, no. 143. doi: 10.1038/s41392-022-00986-0

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рисунок 1. Видовой состав микробного пейзажа ротоглотки у больных COVID-19

Скачать (82KB)
Метаданные
3. Рисунок 2. Частота выделения различных видов грибов рода Candida из ротоглотки у пациентов с тяжелой и крайне тяжелой формой COVID-19

Скачать (82KB)
Метаданные
4. Рисунок 3. Частота встречаемости бактериальных и бактериально-грибковых ассоциаций, выделенных от пациентов с тяжелой и крайне тяжелой формой COVID-19 в разных возрастных группах

Скачать (60KB)
Метаданные

© Лисовская С.А., Исаева Г.Ш., Николаева И.В., Гусева С.Е., Гайнатуллина Л.Р., Чумарев Н.С., 2023

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах