Идентификация потенциальных пробиотических культур из почвенного покрова Самарской области

Обоснование. Положительное влияние пробиотиков на организм человека разнообразно, пробиотические препараты восстанавливают нормобиоту слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта, обладают иммуномодулирующими свойствами. Наиболее изученными источниками пробиотических культур являются молочные продукты. Также в последнее время активно ведётся поиск пробиотических штаммов. Одним из перспективных источников является почва — экосистема с наибольшим биоразнообразием микроорганизмов.

Цель. Анализ видового разнообразия микроорганизмов почвы Самарской области с описанием основных групп потенциально пробиотических микроорганизмов.

Методы. Проведена микробиологическая оценка сельскохозяйственных почв. Было собрано 75 образцов почвы. Для бактериологического исследования использовали питательные среды: универсальный хромогенный агар, агар Мюллера–Хинтон с добавлением 5% бараньей крови, агар Миддлбрука, агар Рогоза, маннит-солевой агар, агар для выделения Brucella spp., агар для выделения Burkholderia cepacia complex, ксилозо-лизиновый дезоксихолатный агар, цетримидный агар, глюкозный агар Эшби, агар для выделения Clostridium spp., анаэробный агар, дифференциальный агар Редди, агар Сабуро и гранулированный агар Чапека–Докса. Посев образцов осуществляли по методу Дригальского. Идентификацию колоний микроорганизмов проводили с помощью методики MALDI-ToF масс-спектрометрии на приборе Microflex LT.

Результаты. Во всех образцах почвы были обнаружены основные представители типичных обитателей желудочно-кишечного тракта, используемых в качестве пробиотиков: Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligalactobacillus, Streptococcus. Было идентифицировано 45 видов возбудителей рода Bacillus. Среди представителей рода Lactobacillus наиболее часто встречаемыми были L. jensenii и L. sakei (в 50,7% образцов), L. plantarum (в 46,7%). Наиболее часто встречался Ligilactobacillus agilis — в 32% проб, также один из важных микроорганизмов, используемых в пробиотических препаратах Lig. salivarius был изолирован в 24% образцов. Enterococcus faecium был обнаружен в 68% образцов. Бактерии рода Streptococcus не являются типичными представителями микроорганизмов желудочно-кишечного тракта человека, обнаруженный в 4% образцов Str. salivarius является доминирующим представителем нормальной микрофлоры ротовой полости на протяжении всей жизни человека.

Заключение. Из полученных данных видно, что выявленные микроорганизмы, обитающие в почвенных покровах, могут быть использованы для разработки новых препаратов-пробиотиков. Большинство из них применяется в клинической практике для использования в лечении заболеваний желудочно-кишечного тракта (Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligilactobacillus).