VISUALIZATION OF BIOMEDICAL DATA USING R


Cite item

Full Text

Abstract

The paper presents basic principles of using R software for visualization of biomedical research data. Basic types of graphs and algorithms for graph creation are presented. Specification of using different graph types in implementation of different data types is described.

About the authors

V L Egoshin

Semey State Medical University

г. Семей, г. Павлодар, Казахстан

S V Ivanov

I. P. Pavlov First St. Petersburg State Medical University

г. Санкт-Петербург

N V Savvina

North-Eastern Federal University

г. Якутск

S B Kalmakhanov

Al-Farabi Kazakh National University

г. Алматы, Казахстан

A M Grjibovski

North-Eastern Federal University; Northern State Medical University

Email: Andrej.Grjibovski@gmail.com
доктор медицины, заведующий ЦНИЛ Северного государственного медицинского университета; профессор Северо-Восточного федерального университета; почетный доктор Международного казахско-турецкого университета, г, Туркестан, Казахстан; почетный профессор Государственного медицинского университета г 163000 г. Архангельск, Троицкий проспект, д. 51, офис 1252

References

  1. Гржибовский А. М., Унгуряну Т. Н., Горбатова М. А. Описательная статистика с использованием пакетов статистических программ SPSS и STATA // Наркология. 2017. № 4. С. 36-51.
  2. Кабаков Р. И. R в действии. Анализ и визуализация данных в программе R: пер. с англ. П. А. Волковой. М.: ДМК Пресс, 2014. 588 с.
  3. Мастицкий С. Э., Шитиков В. К. Статистический анализ и визуализация данных с помощью R. М.: ДМК Пресс, 2015. 496 с.
  4. Нейтан Яу. Искусство визуализации в бизнесе. Как представить сложную информацию простыми образами / пер. с англ. Кировой C. М.: Манн, Иванов и Фербер, 2013, 352 с.
  5. Усынина А. А., Одланд И. О., Пылаева Ж. А., Пастбина И. М., Гржибовский А. М. Регистр родов Архангельской области как важный информационный ресурс для науки и практического здравоохранения // Экология человека. 2017. № 2. С. 58-64.
  6. Холматова К. К., Харькова О. А., Гржибовский А. М. Классификация научных исследований в здравоохранении // Экология человека. 2016. № 1. С. 57-64.
  7. Chambers J., Cleveland W., Beat Kleiner B., Tukey P. Graphical methods for Data Analysis. Wadsworth, 1983.
  8. Data Visualization Cheat Sheet. URL: https://www. rstudio.com/resources/cheatsheets/ (дата обращения: 18.05.2018).
  9. ggplot2 Reference. URL: http://ggplot2.tidyverse.org/ reference/ (дата обращения: 18.05.2018).
  10. Graphs with ggplot2. URL: http://www.cookbook-r. com/Graphs/ (дата обращения: 18.05.2018).
  11. Grolemund G., Wickham H. R for data science. URL: http://r4ds.had.co.nz (дата обращения: 18.05.2018).
  12. How to make any plot in ggplot2. URL: http://r-statistics.co/ggplot2-Tutorial-With-R.html (дата обращения: 18.05.2018).
  13. R: анализ и визуализация данных. URL: http://r-analytics.blogspot.ru (дата обращения: 18.05.2018).
  14. Tukey J. W. Exploratory data analysis. Reading, PA: Addison-Wesley, 1977.
  15. Tutorials. URL: http://flowingdata.com/category/ tutorials/ (дата обращения: 18.05.2018).
  16. Wickham H. ggplot2: Elegant Graphics for Data Analysis. New York, Springer, 2009.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2018 Human Ecology


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».