Синтез бинарных исходов рандомизированных клинических исследований в байесовском сетевом метаанализе

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Представлены основные аспекты проведения байесовского сетевого мета-анализа как метода непрямых сравнений с использованием математических моделей. Для описания работы байесовского сетевого мета-анализа были включены программные коды двух основных моделей со случайными и фиксированными эффектами. Модели написаны на языке Компонентного Паскаля и работают в программе JAGS. В качестве данных, использовавшихся в целях проведения моделирования, использованы сгенерированные данные из статьи Д. Ху, А.М. О Коннор, С. Ван и др. [6] для возможности сверки результатов. Для загрузки данных в модель и запуска программы использовался язык R и пакет rjags. При определении лучшей модели были использованы показатели адекватности модели, такие как суммарное остаточное отклонение, леверидж и информационный критерий отклонения, рассчитанные при помощи оригинального кода на языке R. Также использовался графический метод определения адекватности моделей с помощью пакета ggplot2. Рассмотрен пример построения сети доказательств по доступным результатам об эффективности лекарственных препаратов из клинических исследований с учетом допущений транзитивности и гетерогенности. Указана возможность проведения непрямых сравнений вместе с прямыми для определения истинных оценок лекарственных препаратов. Объяснены элементы байесовской статистики, такие как априорная и апостериорная вероятности и правдоподобие, преимущества использования в проведении метаанализа. Представлен математический аппарат обобщенной линейной модели как в общем виде, так и в частном для использования биномиальных выходных данных в целях получения относительных оценок эффектов терапий. Представлено объяснение работы моделей. Модель со случайными эффектами показала преимущество использования над моделью с фиксированными эффектами после сравнения метрик адекватности. Для достижения лучшей адекватности нужно уделить время тщательной выгрузке данных из публикаций и выбору информативных прайоров. В целом байесовский синтез представляет собой отдельный и важный вид сетевого метаанализа. Он является особенным в своем роде благодаря использованию вероятностного подхода к анализу данных. понимание основных принципов байесовской статистики также является важным аспектом для успешного использования этого метода в различных областях исследований. Однако для эффективного применения этого метода необходимо уделять внимание тщательной подготовке данных и выбору априорных представлений. При наличии информативных априорных распределений и правильной реализации байесовский синтез может дать более точные и надежные результаты, чем другие методы метаанализа. Байесовский синтез является признанным в мире и в Российской Федерации методом статистического анализа данных.

Об авторах

Кирилл Викторович Сапожников

Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова

Автор, ответственный за переписку.
Email: vmeda-nio@mil.ru
ORCID iD: 0000-0002-2476-7666
SPIN-код: 2707-0339
Scopus Author ID: 57200810332
ResearcherId: ААЕ-3453-2022

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Сергей Александрович Парфенов

Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова

Email: sa.parfenov1988@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1649-9796
SPIN-код: 6939-6910

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Андрей Анатольевич Лазарев

Санкт-Петербургский государственный университет телекоммуникаций

Email: Andrey.05.03.ru@mail.ru
ORCID iD: 0009-0006-6204-8423
SPIN-код: 9715-2124

аспирант

Россия, Санкт-Петербург

Руслан Валентинович Киричек

Санкт-Петербургский государственный университет телекоммуникаций

Email: kirichek@sut.ru
ORCID iD: 0000-0002-8781-6840
SPIN-код: 3253-4972

д-р тех. наук, доцент

Россия, Санкт-Петербург

Дарья Георгиевна Толкачева

Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации

Email: tolkacheva.d@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-6314-4218
SPIN-код: 4186-5243
Scopus Author ID: 57221817074

независимый эксперт исследовательских проектов

Россия, Москва

Ольга Николаевна Мироненко

Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации

Email: freelomir@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8952-8386
SPIN-код: 3265-8708

канд. экон. наук

Россия, Москва

Наталия Владимировна Клишкова

Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова

Email: N-Klishkova@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0273-0931
SPIN-код: 7031-7397

канд. пед. наук, доцент

Россия, Санкт-Петербург

Валерий Викторович Кулишенко

Военно-медицинская академия имени С.М. Кирова

Email: v_kulishenko@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-3872-3357
SPIN-код: 1899-7341

канд. мед. наук

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Богданов А.А., Богданов А.А. Сетевой метаанализ для клиницистов // Современная Онкология. 2021. Т. 23, № 3. С. 418–424. EDN: IVQHBW doi: 10.26442/18151434.2021.3.201202
  2. Омельяновский В.В., Авксентьева М.В., Сура М.В., и др. Москва: ЦЭККМП, 2017. 28 с.
  3. Sadeghirad B., Foroutan F., Zoratti M.J., et al. Theory and practice of Bayesian and frequentist frameworks for network meta-analysis // BMJ Evid Based Med. 2023. Vol. 28, N 3. P. 204–209. doi: 10.1136/bmjebm-2022-111928
  4. Li T., Puhan M.A., Vedula S.S., et al. Network meta-analysis-highly attractive but more methodological research is needed // BMC Med. 2011. Vol. 9. P. 79. doi: 10.1186/1741-7015-9-79
  5. Chaimani A., Caldwell D.M., Li T., et al. Undertaking network meta-analyses // Cochrane handbook for systematic reviews of interventions. 2019. P. 285–320. doi: 10.1002/9781119536604.ch11
  6. Hu D., O’Connor A.M., Wang C., et al. How to conduct a Bayesian network meta-analysis // Front Vet Sci. 2020. Vol. 7. P. 271. doi: 10.3389/fvets.2020.00271
  7. Rouse B., Chaimani A., Li T. Network meta-analysis: an introduction for clinicians // Intern Emerg Med. 2017. Vol. 12. P. 103–111. doi: 10.1007/s11739-016-1583-7
  8. Bland J.M., Altman D.G. Bayesians and frequentists // BMJ. 1998. Vol. 317, N 7166. P. 1151–1160. doi: 10.1136/bmj.317.7166.1151
  9. Kruschke J.K., Liddell T.M. The Bayesian New Statistics: Hypothesis testing, estimation, meta-analysis, and power analysis from a Bayesian perspective // Psychon Bull Rev. 2018. Vol. 25. P. 178–206. doi: 10.3758/s13423-016-1221-4
  10. Hespanhol L., Vallio C.S., Costa L.M., Saragiotto B.T. Understanding and interpreting confidence and credible intervals around effect estimates // Braz J Phys Ther. 2019. Vol. 23, N 4. P. 290–301. doi: 10.1016/j.bjpt.2018.12.006
  11. Dias S., Ades A.E., Welton N.J., Jansen J.P. Network meta-analysis for decision-making. Bristol: John Wiley & Sons, 2018. 473 р.
  12. Rosenberger K.J., Xing A., Murad M.H., et al. Prior choices of between-study heterogeneity in contemporary Bayesian network meta-analyses: an empirical study // J Gen Intern Med. 2021. Vol. 36, N 4. P. 1049–1057. doi: 10.1007/s11606-020-06357-1
  13. White I.R., Turner R.M., Karahalios A., Salanti G. A comparison of arm-based and contrast-based models for network meta-analysis // Stat Med. 2019. Vol. 38, N 27. P. 5197–5213. doi: 10.1002/sim.8360
  14. Lin L., Chu H., Hodges J.S. On evidence cycles in network meta-analysis // Stat Interface. 2020. Vol. 13, N 4. P. 425. doi: 10.4310/sii.2020.v13.n4.a1
  15. Dias S., Welton N.J., Sutton A.J., Ades A.E. NICE DSU technical support document 2: a generalised linear modelling framework for pairwise and network meta-analysis of randomised controlled trials. Bristol: National Institute for Health and Clinical Excellence, 2011. 98 р.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Сеть из трех доказательств

Скачать (32KB)
3. Рис. 2. Вклад данных при использовании модели со случайными эффектами

Скачать (203KB)
4. Рис. 3. Вклад данных в модель с фиксированными эффектами

Скачать (215KB)

© Эко-Вектор, 2024



Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».