The relationship of microbial biodiversity and clinical forms of oral lichen planus: analysis based on 16S rRNA sequencing

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

BACKGROUND: The composition and changes of microbiota have a significant impact on overall health and the development of various diseases. Of particular relevance is the problem of changes in the oral microbiota in patients with lichen planus of the oral mucosa. Studying the relationship between the composition of the oral microbiota and the pathogenesis of oral lichen planus will improve the understanding of the mechanisms of this disease. Thus, this topic is of considerable interest to a wide range of specialists in the field of medicine and biology.

AIM: Detailed analysis of oral cavity microbiota and establishment of potential pathogenetic microbial associations with oral lichen planus.

MATERIALS AND METHODS: The study included samples from patients diagnosed with various forms of oral red squamous lichen planus (lichen planus erosive-ulcerative) and a control group. The investigation was based on analyzing microbial diversity metrics (alpha and beta diversity), relative abundance of bacterial taxa, and identification of unique bacterial taxa in the oral red squamous lichen planus patients. This analysis utilized the 16S rRNA sequencing method.

RESULTS: The analysis revealed a rich bacterial composition in patients with oral lichen planus, which was significantly different from that in the control group. Differences were also observed between the subgroups, especially between the typical and erosive-ulcerative forms of the disease. Notably, beta diversity did not show significant differences between the groups, indicating a similar overall microbiota composition despite fluctuations in the relative abundance of species. Nevertheless, the typical clinical form of the disease demonstrated more significant differences in the microbiota structure compared to the hyperkeratotic and erosive-ulcerative forms. Furthermore, analysis of the study groups revealed the presence of 50% shared microbial species, while the other half was represented by unique species associated with oral lichen planus. Regarding the subgroups, it was found that unique microorganisms correlated with the typical and erosive-ulcerative forms, respectively, providing a deeper understanding of the specific microbiological profile in the context of this disease.

CONCLUSION: The study confirmed the hypothesis of an association between the microbiota composition and oral lichen planus, which may be of importance for the development of novel therapeutic approaches.

作者简介

Natalya Teplyuk

Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)

Email: teplyukn@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5800-4800
SPIN 代码: 8013-3256

MD, Dr. Sci. (Med.), Professor

俄罗斯联邦, Moscow

Mikhail Stepanov

Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)

Email: Doctor.stepanov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-1872-9487
SPIN 代码: 6524-5665

MD, Cand. Sci. (Med.), Associate Professor

俄罗斯联邦, Moscow

Baira Damdinova

Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University)

编辑信件的主要联系方式.
Email: baira_d@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4162-2928
俄罗斯联邦, Moscow

Stepan Toshchakov

National Research Centre "Kurchatov Institute"

Email: stepan.toshchakov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-7549-3450
SPIN 代码: 8994-5224

Cand. Sci. (Biol.)

俄罗斯联邦, Moscow

Sergey Noskov

National Research Centre "Kurchatov Institute"

Email: sergey.noskov.2001@icloud.com
ORCID iD: 0009-0006-1578-1382
俄罗斯联邦, Moscow

Nina Tutubalina

National Research Centre "Kurchatov Institute"

Email: nina.tutubalina@gmail.com
ORCID iD: 0009-0004-7016-3670
俄罗斯联邦, Moscow

参考

  1. Roopashree MR, Gondhalekar RV, Shashikanth MC, et al. Pathogenesis of oral lichen planus: A review. J Oral Pathol Med. 2010;39(10):729–734. doi: 10.1111/j.1600-0714.2010.00946.x
  2. Federal clinical recommendations for the management of patients with red squamous lichen planus. Moscow: Russian Society of Dermatovenerologists and Cosmetologists, 2015. 19 р. (In Russ).
  3. Chuykin SV, Akmalova GM, Chernysheva ND. Clinical features of lichen ruber planus of the oral mucosa. Russ J Clin Dermatol Venereol. 2015;14(3):72–75. doi: 10.17116/klinderma201514372-75
  4. Teplyuk NP, Stepanov MA, Damdinova BSh, Lazareva PI. Etiology, clinical manifestations, and oral microbiota in oral lichen planus: A review of the scientific literature. Russ J Skin Venereal Dis. 2023;26(6):553–562. EDN: IMYRHA doi: 10.17816/dv569013
  5. Jung W, Jang S. Oral Microbiome research on oral lichen planus: Current findings and perspectives. Biology. 2022;11(5):723. doi: 10.3390/biology11050723
  6. Yu FY, Wang QQ, Li M, et al. Dysbiosis of saliva microbiome in patients with oral lichen planus. BMC Microbiol. 2020;20(1):75. doi: 10.1186/s12866-020-01733-7
  7. Bornstein MM, Hakimi B, Persson GR. Microbiological findings in subjects with asymptomatic oral lichen planus: A cross-sectional comparative study. J Periodontol. 2008;79(12):2347–2355. doi: 10.1902/jop.2008.080303
  8. Svitich OA, Teplyuk NP, Stepanov MA, et al. Studying the relationship between oral lichen planus and periodontal disease: Value on periodontal pathogens and oral hygiene. Russ J Clin Dermatol Venereol. EDN: CKPMVN 2024;27(1):45–54. doi: 10.17816/dv624269
  9. Zaatout N. Presence of non-oral bacteria in the oral cavity. Arch Microbiol. 2021;203(6):2747–2760. doi: 10.1007/s00203-021-02300-y
  10. Brooke JS. Stenotrophomonas maltophilia: An emerging global opportunistic pathogen. Clin Microbiol Rev. 2012;25(1):2–41. doi: 10.1128/CMR.00019-11

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
2. Fig. 1. Analysis of alpha diversity of the bacterial composition of the oral mucosa depending on the presence of the disease using the Chao1 and Shannon indices.

下载 (140KB)
3. Fig. 2. Alpha diversity measurement of bacterial composition of oral cavity according to the form of the oral lichen planus disease using Chao1 and Shannon Index.

下载 (166KB)
4. Fig. 3. Rarefaction curve plot.

下载 (281KB)
5. Fig. 4. Representation of the relative abundance of oral microbiota at the phylum level with comparisons between the main group (О-Г) and control group (К-Г) (a), as well as among the typical, erosive-ulcerative, and hyperkeratotic forms (b) (The 10 more frequent taxa).

下载 (180KB)
6. Fig. 5. Representation of the relative abundance of oral microbiota at a family level with comparisons between the main group (О-Г) and control group (К-Г) (a), as well as among the typical, erosive-ulcerative, and hyperkeratotic forms (b) (The 10 more frequent taxa).

下载 (221KB)
7. Fig. 6. Representation of the relative abundance of oral microbiota at a genus level with comparisons between the main group (О-Г) and control group (К-Г) (a), as well as among the typical, erosive-ulcerative, and hyperkeratotic forms (b) (The 10 more frequent taxa).

下载 (216KB)
8. Fig. 7. Beta-diversity analysis of microbial community compositional differences between the main group (О-Г) and the control group (К-Г) using PCoA (Principal coordinate Analysis).

下载 (264KB)
9. Fig. 8. Beta-Diversity Analysis of microbial community compositional differences according to the form of the disease using PCoA (Principal coordinate Analysis).

下载 (243KB)
10. Fig. 9. Venn diagram representation of the main (О-Г, oral lichen planus patients) and control (К-Г) group (a) and according to clinical form (b).

下载 (113KB)
11. Fig. 10. Differential abundance of amplicon sequence variants (ASV) between the main group (О-Г) and the control group (К-Г) as determined by linear discriminant analysis (LDA).

下载 (138KB)
12. Fig. 11. Differential abundance of amplicon sequence variants ( ASVs) between the typical and hyperkeratotic forms of oral lichen planus using linear discriminant analysis (LDA).

下载 (251KB)

版权所有 © Eco-Vector, 2024

Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名-非商业性使用-禁止演绎 4.0国际许可协议的许可。
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».