Микробные ассоциации биотопов человека как фактор, определяющий возникновение полимикробных инфекций

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

С каждым годом накапливаются сведения об участии условно патогенных микроорганизмов в инициации воспалительных заболеваний человека, поддержании хронического воспалительного ответа и адаптации их таким образом к условиям существования в биотопах организма человека. В настоящем обзоре приводятся сведения о взаимодействиях микроорганизмов, имеющих значение в клинической практике, которые отражаются на вирулентности как условно патогенных видов, так и безусловных патогенов, что, вероятно, лежит в основе хронизации инфекционно-воспалительных процессов. Зачастую по отдельности условно патогенные виды не могут в полном объёме реализовать свой патогенный потенциал, что в условиях микробного симбиоза наблюдается в большинстве случаев. Требуется пересмотр подходов к интерпретации результатов микробиологических исследований, что предполагает учёт функциональной активности совокупной микрофлоры, а также поиск отдельных внехромосомных генетических элементов как маркер патогенности совокупности микроорганизмов.

Об авторах

Анатолий Петрович Годовалов

Пермский государственный медицинский университет имени академика Е.А. Вагнера

Автор, ответственный за переписку.
Email: AGodovalov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5112-2003
SPIN-код: 4482-4378

к.м.н

Россия, Пермь

Список литературы

  1. Шкарин В.В., Благонравова А.С., Чубукова О.А. Эпидемиологический подход к изучению сочетанной инфекционной патологии // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2016. № 6. С. 67–75.
  2. Гинцбург А.Л., Ильина Т.С., Романова Ю.М. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2003. № 5. С. 86–93.
  3. Бухарин О.В. Симбиотические взаимоотношения микроорганизмов при инфекции // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013. № 1. С. 93–97.
  4. Бельский В.В., Шаталова Е.В. Взаимное влияние возбудителей при смешанной инфекции ожоговой травмы // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1999. № 4. С. 3–7.
  5. Roberts F.A., Darveau R.P. Microbial protection and virulence in periodontal tissue as a function of polymicrobial communities: symbiosis and dysbiosis // Periodontol 2000. 2015. Vol. 69, N 1. P. 18–27. doi: 10.1111/prd.12087
  6. Janda J.M., Abbott S.L. The Changing Face of the Family Enterobacteriaceae (Order: “Enterobacterales”): New Members, Taxonomic Issues, Geographic Expansion, and New Diseases and Disease Syndromes // Clin Microbiol Rev. 2021. Vol. 34, N 2. P. e00174-20. doi: 10.1128/CMR.00174-20
  7. Rodriguez-Medina N., Barrios-Camacho H., Duran-Bedolla J., Garza-Ramos U. Klebsiella variicola: an emerging pathogen in humans // Emerg Microbes Infect. 2019. Vol. 8, N 1. P. 973–988. doi: 10.1080/22221751.2019.1634981
  8. Hajjar R., Ambaraghassi G., Sebajang H., et al. Raoultella ornithinolytica: emergence and resistance. Infect Drug Resist // 2020. Vol. 13. P. 1091–1104. doi: 10.2147/IDR.S191387
  9. Keyes J., Johnson E.P., Epelman M., et al. Leclercia adecarboxylata: an emerging pathogen among pediatric infections // Cureus. 2020. Vol. 12. P. e8049. doi: 10.7759/cureus.8049
  10. Jun J.-B. Klebsiella pneumoniae liver abscess // Infect Chemother. 2018. Vol. 50, N 3. P. 210–218. doi: 10.3947/ic.2018.50.3.210
  11. Rashid T., Ebringer A. Rheumatoid arthritis is linked to Proteus — the evidence // Clin Rheumatol. 2007. Vol 26, N 7. P. 1036–1043. doi: 10.1007/s10067-006-0491-z
  12. Cheung G.Y.C., Bae J.S., Otto M. Pathogenicity and virulence of Staphylococcus aureus. Virulence // 2021. Vol. 12, N 1. P. 547–569. doi: 10.1080/21505594.2021.1878688
  13. Laux C., Peschel A., Krismer B. Staphylococcus aureus Colonization of the Human Nose and Interaction with Other Microbiome Members // Microbiol Spectr. 2019. Vol. 7, N 2. doi: 10.1128/microbiolspec.GPP3-0029-2018
  14. Rasigade J.-P., Dumitrescu O., Lina G. New epidemiology of Staphylococcus aureus infections // Clin Microbiol Infect. 2014. Vol. 20, N 7. P. 587–588. doi: 10.1111/1469-0691.12718
  15. Tong S.Y., Davis J.S., Eichenberger E., et al. Staphylococcus aureus infections: epidemiology, pathophysiology, clinical manifestations, and management // Clin Microbiol Rev. 2015. Vol. 28, N 3. P. 603–661. doi: 10.1128/CMR.00134-14
  16. Achermann Y., Goldstein E.J., Coenye T., Shirtliff M.E. Propionibacterium acnes: from commensal to opportunistic biofilm-associated implant pathogen // Clin Microbiol Rev. 2014. Vol. 27, N 3. P. 419–440. doi: 10.1128/CMR.00092-13
  17. Baker J.M., Chase D.M., Herbst-Kralovetz M.M. Uterine Microbiota: Residents, Tourists, or Invaders? // Front Immunol. 2018. Vol. 9. P. 208. doi: 10.3389/fimmu.2018.00208
  18. Годовалов А.П., Карпунина Н.С., Карпунина Т.И. Moraxella osloensis в микробиоте репродуктивного тракта при бесплодии: случайные находки или маркеры патологии? // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021. Т. 98, № 1. С. 28–35. doi: 10.36233/0372-9311-53
  19. Sheppard S.K. Strain wars and the evolution of opportunistic pathogens // Curr Opin Microbiol. 2022. Vol. 67. P. 102138. doi: 10.1016/j.mib.2022.01.009
  20. Valm A.M. The Structure of Dental Plaque Microbial Communities in the Transition from Health to Dental Caries and Periodontal Disease // J Mol Biol. 2019. Vol. 431, N 16. P. 2957–2969. doi: 10.1016/j.jmb.2019.05.016
  21. Iwase T., Uehara Y., Shinji H., et al. Staphylococcus epidermidis Esp inhibits Staphylococcus aureus biofilm formation and nasal colonization // Nature. 2010. Vol. 465, N 7296. P. 346–349. doi: 10.1038/nature09074
  22. Zipperer A., Konnerth M.C., Laux C., et al. Human commensals producing a novel antibiotic impair pathogen colonization // Nature. 2015. Vol. 535, N 7613. P. 511–516. doi: 10.1038/nature18634
  23. Uehara Y., Kikuchi K., Nakamura T., et al. H(2)O(2) produced by viridans group streptococci may contribute to inhibition of methicillinresistant Staphylococcus aureus colonization of oral cavities in newborns // Clin Infect Dis. 2001. Vol. 32, N 10. P. 1408–1413. doi: 10.1086/320179
  24. Uehara Y., Nakama H., Agematsu K., et al. Bacterial interference among nasal inhabitants: eradication of Staphylococcus aureus from nasal cavities by artificial implantation of Corynebacterium sp // J Hosp Infect. 2000. Vol. 44, N 2. P. 127–133. doi: 10.1053/jhin.1999.0680
  25. Wollenberg M.S., Claesen J., Escapa I.F., et al. Propionibacterium-produced coproporphyrin III induces Staphylococcus aureus aggregation and biofilm formation // mBio. 2014. Vol. 5, N 4. P. e01286-14. doi: 10.1128/mBio.01286-14
  26. Salvadori G., Junges R., Morrison D.A., Petersen F.C. Competence in Streptococcus pneumoniae and Close Commensal Relatives: Mechanisms and Implications // Front Cell Infect Microbiol. 2019. Vol. 9. P. 94. doi: 10.3389/fcimb.2019.00094
  27. Kilian M., Poulsen K., Blomqvist T., et al. Evolution of Streptococcus pneumoniae and its close commensal relatives // PLoS One. 2008. Vol. 3, N 7. P. e2683. doi: 10.1371/journal.pone.0002683
  28. Martens E.C., Neumann M., Desai M.S. Interactions of commensal and pathogenic microorganisms with the intestinal mucosal barrier // Nat Rev Microbiol. 2018. Vol. 16, N 8. P. 457–470. doi: 10.1038/s41579-018-0036-x
  29. Deriu E., Liu J.Z., Pezeshki M., et al. Probiotic bacteria reduce salmonella typhimurium intestinal colonization by competing for iron // Cell Host Microbe. 2013. Vol. 14, N 1. P. 26–37. doi: 10.1016/j.chom.2013.06.007
  30. Maltby R., Leatham-Jensen M.P., Gibson T., et al. Nutritional basis for colonization resistance by human commensal Escherichia coli strains HS and Nissle 1917 against E. coli O157:H7 in the mouse intestine // PloS One. 2013. Vol. 8, N 1. P. e53957. doi: 10.1371/journal.pone.0053957
  31. Deasy A.M., Guccione E., Dale A.P., et al. Nasal Inoculation of the Commensal Neisseria lactamica Inhibits Carriage of Neisseria meningitidis by Young Adults: A Controlled Human Infection Study // Clin Infect Dis. 2015. Vol. 60, N 10. P. 1512–1520. doi: 10.1093/cid/civ098
  32. Kim W.J., Higashi D., Goytia M., et al. Commensal Neisseria Kill Neisseria gonorrhoeae through a DNA-Dependent Mechanism // Cell Host Microbe. 2019. Vol. 26, N 2. P. 228–239.e8. doi: 10.1016/j.chom.2019.07.003
  33. Breshears L.M., Edwards V.L., Ravel J., Peterson M.L. Lactobacillus crispatus inhibits growth of Gardnerella vaginalis and Neisseria gonorrhoeae on a porcine vaginal mucosa model // BMC Microbiol. 2015. Vol. 15. P. 276. doi: 10.1186/s12866-015-0608-0
  34. Wyatt T.D., Greer A. The influence of growth medium on the interactions between Bordetella pertussis and Staphylococcus aureus // J Med Microbiol. 1976. Vol. 9, N 2. P. 243–246. doi: 10.1099/00222615-9-2-243
  35. Antipov D., Raiko M., Lapidus A., Pevzner P.A. Plasmid detection and assembly in genomic and metagenomic data sets // Genome Res. 2019. Vol. 29, N 6. P. 961–968. doi: 10.1101/gr.241299.118
  36. Pellow D., Zorea A., Probst M., et al. SCAPP: an algorithm for improved plasmid assembly in metagenomes // Microbiome. 2021. Vol. 9, N 1. P. 144. doi: 10.1186/s40168-021-01068-z
  37. Ottman N., Smidt H., de Vos W.M., Belzer C. The function of our microbiota: who is out there and what do they do? // Front Cell Infect Microbiol. 2012. Vol. 2. P. 104. doi: 10.3389/fcimb.2012.00104
  38. Ng H.M., Kin L.X., Dashper S.G., et al. Bacterial interactions in pathogenic subgingival plaque // Microb Pathog. 2016. Vol. 94. P. 60–69. doi: 10.1016/j.micpath.2015.10.022
  39. Kin L.X., Butler C.A., Slakeski N., et al. Metabolic cooperativity between Porphyromonas gingivalis and Treponema denticola // J Oral Microbiol. 2020. Vol. 12, N 1. P. 1808750. doi: 10.1080/20002297.2020.1808750
  40. Cuthbert B.J., Hayes C.S., Goulding C.W. Functional and Structural Diversity of Bacterial Contact-Dependent Growth Inhibition Effectors // Front Mol Biosci. 2022. Vol. 9. P. 866854. doi: 10.3389/fmolb.2022.866854
  41. Morou-Bermudez E., Elias-Boneta A., Billings R.J., et al. Urease activity in dental plaque and saliva of children during a three-year study period and its relationship with other caries risk factors // Arch Oral Biol. 2011. Vol. 56, N 11. P. 1282–1289. doi: 10.1016/j.archoralbio.2011.04.015

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО "Эко-вектор", 2023


 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах