Лабораторная диагностика псевдотуберкулёза и кишечного иерсиниоза

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Энтеропатогенные виды Yersinia pseudotuberculosis и Yersinia enterocolitica имеют большое значение во всём мире в связи с их способностью выживать и сохранять патогенные свойства в биотической и абиотической окружающей среде. Они способны вызывать заболевания спорадического и вспышечного характера. Именно поэтому крайне важным является использование современных методов диагностики заболеваний, обусловленных этими возбудителями.

В статье проанализированы методы лабораторной диагностики энтеропатогенных иерсиний (Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica), включающие бактериологический, серологический и молекулярно-генетический. Приведены современные сведения применения метода полимеразной цепной реакции, масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS), дот-иммуноанализа. Приведена схема оптимального протокола обнаружения и идентификации иерсиний.

Сочетание классического микробиологического и молекулярно-генетического методов оперативно определяет наличие или отсутствие патогена в образце, что позволяет целенаправленно использовать бактериологическое исследование для верификации клинического диагноза, подтверждения факторов передачи и планирования противоэпидемических мероприятий.

Об авторах

Маргарита Валентиновна Чеснокова

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Автор, ответственный за переписку.
Email: mar_chumin@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5489-9363
SPIN-код: 2005-4321

д.м.н., профессор

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Валерий Тимофеевич Климов

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Email: 41vklimov@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-0036-0017
SPIN-код: 1382-9190

к.м.н., с.н.с.

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Татьяна Викторовна Каримова

Центр гигиены и эпидемиологии в Новосибирской области

Email: tatianakarimova357@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9099-3621
SPIN-код: 7101-4016

к.м.н.

Россия, Новосибирск

Татьяна Юрьевна Загоскина

Иркутский научно-исследовательский противочумной институт Сибири и Дальнего Востока

Email: t_y_z_@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-9302-7143
SPIN-код: 5891-7130

д.м.н.

Россия, 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, д. 78

Александр Леонидович Панин

Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени Пастера

Email: alp.1952@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-6411-0274
SPIN-код: 4690-3587

м.н.с.

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Adeolu M., Alnajar S., Naushad S., Gupta RS. Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov // Int J Syst Evol Microbiol. 2016. Vol. 66, N 12. Р. 5575−5599. doi: 10.1099/ijsem.0.001485
  2. Сомова Л.М., Андрюков Б.Г., Тимченко Н.Ф., Псарева Е.К. Псевдотуберкулез как персистентная инфекция: этиопатогенетические предпосылки // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019. № 2. С. 110−119. doi: 10.36233/0372-9311-2019-2-110-119
  3. Savin C., Frangeul L., Ma L., et al. Draft genome sequence of a clinical strain of yersinia enterocolitica (ip10393) of bioserotype 4/O:3 from France // Genome Announc. 2013. Vol. 1, N 1. Р. e00150-12. doi: 10.1128/genomeA.00150-12
  4. Шурыгина И.А., Чеснокова М.В., Климов В.Т. и др. Псевдотуберкулез. Новосибирск: Наука, 2003. 320 с.
  5. Fredriksson-Ahomaa M., Korkeala H. Low occurrence of pathogenic Yersinia enterocolitica in clinical, food, and environmental samples: a methodological problem // Clin Microbiol Rev. 2003. Vol. 16, N 2. Р. 220−229. doi: 10.1128/CMR.16.2.220-229.2003
  6. Black R.E., Jackson R.J., Tsai T., et al. Epidemic Yersinia enterocolitica infection due to contaminated chocolate milk // N Engl J Med. 1978. Vol. 298, N 2. Р. 76−79. doi: 10.1056/NEJM197801122980204
  7. Tacket C.O., Ballard J., Harris N., et al. An outbreak of Yersinia enterocolitica infections caused by contaminated tofu (soybean curd) // Am J Epidemiol. 1985. Vol. 121, N 5. Р. 705−711. doi: 10.1093/aje/121.5.705
  8. Abraham M., Pai M., Kang G., et al. An outbreak of food poisoning in Tamil Nadu associated with Yersinia enterocolitica // Indian J Med Res. 1997. Vol. 106. Р. 465−468.
  9. Swaminathan B., Harmon M.C., Mehlman I.J. Yersinia enterocolitica // J Appl Bacteriol. 1982. Vol. 52, N 2. Р. 151−183. doi: 10.1111/j.1365-2672.1982.tb04838.x
  10. Чеснокова М.В. Псевдотуберкулез в Сибири: теоретические и прикладные аспекты эпидемиологии, лабораторной диагностики и профилактики: Автореф. дис. … докт. мед. наук. Иркутск, 2004. 42 с.
  11. Martínez P.O., Fredriksson-Ahomaa M., Sokolova Y., et al. Prevalence of enteropathogenic Yersinia in Estonian, Latvian, and Russian (Leningrad region) pigs // Foodborne Pathog Dis. 2009. Vol. 6, N 6. Р. 719−724. doi: 10.1089/fpd.2008.0251
  12. Fukushima H., Matsuda Y., Seki R., et al. Geographical heterogeneity between Far Eastern and Western countries in prevalence of the virulence plasmid, the superantigen Yersinia pseudotuberculosis-derived mitogen, and the high-pathogenicity island among Yersinia pseudotuberculosis strains // J Clin Microbiol. 2001. Vol. 39, N 10. Р. 3541−3547. doi: 10.1128/JCM.39.10.3541-3547.2001
  13. Niléhn B. Studies on Yersinia enterocolitica with special reference to bacterial diagnosis and occurrence in human acute enteric disease, 1969 // APMIS. 2007. Vol. 115, N 5. Р. 578−588; discussion 589-591. doi: 10.1111/j.1600-0463.2007.apm_725.x
  14. Landgraf M., Iaria S.T., Falcão D.P. An improved enrichment procedure for the Isolation of Yersinia enterocolitica and related species from milk // J Food Prot. 1993. Vol. 56, N 5. Р. 447−450. doi: 10.4315/0362-028X-56.5.447
  15. Fondrevez M., Labbé A., Houard E., et al. A simplified method for detecting pathogenic Yersinia enterocolitica in slaughtered pig tonsils // J Microbiol Methods. 2010. Vol. 83, N 2. Р. 244−249. doi: 10.1016/j.mimet.2010.09.012
  16. Fredriksson-Ahomaa M. Isolation of enteropathogenic Yersinia from non-human sources // Adv Exp Med Biol. 2012. N 954. Р. 97−105. doi: 10.1007/978-1-4614-3561-7_12
  17. Carniel E. The Yersinia high-pathogenicity island // Int Microbiol. 1999. Vol. 2, N 3. Р. 161−167.
  18. Fukushima H., Gomyoda M., Tsubokura M., Aleksić S. Isolation of Yersinia pseudotuberculosis from river waters in Japan and Germany using direct KOH and HeLa cell treatments // Zentralbl Bakteriol. 1995. Vol. 282, N 1. Р. 40−49. doi: 10.1016/s0934-8840(11)80795-4
  19. Koujitani E., Horisaka T., Nomura Y., et al. Immuno-magnetic separation and agar layer methods for the isolation of freeze-injured Yersinia enterocolitica O:8 from water // J Vet Med Sci. 2006. Vol. 68, N 3. Р. 195−199. doi: 10.1292/jvms.68.195
  20. Fukushima H., Shimizu S., Inatsu Y. Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis detection in foods // J Pathog. 2011. Vol. 2011. Р. 735308. doi: 10.4061/2011/735308
  21. Aulisio C.C., Mehlman I.J., Sanders A.C. Alkali method for rapid recovery of Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis from foods // Appl Environ Microbiol. 1980. Vol. 39, N 1. Р. 135−140. doi: 10.1128/aem.39.1.135-140.1980
  22. Fukushima H., Tsubokura M., Otsuki K., et al. Epidemiological study of Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis infections in Shimane Prefecture, Japan // Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg B. 1985. Vol. 180, N 5-6. Р. 515−527.
  23. Weagant S.D. A new chromogenic agar medium for detection of potentially virulent Yersinia enterocolitica // J Microbiol Methods. 2008. Vol. 72, N 2. Р. 185−190. doi: 10.1016/j.mimet.2007.11.019
  24. Ценева Г.Я., Мессорош В.Г., Куляшова Л.Б., и др. Эффективность применения питательных сред для выделения иерсиний // Клиническая лабораторная диагностика. 1993. № 3. С. 73−74.
  25. Ito T., Suzuki T., Kawase J., et al. Yersinia enterocolitica bacteremia and enterocolitis in a previously healthy 20-month-old girl // J Infect Chemother. 2012. Vol. 18, N 5. Р. 756−759. doi: 10.1007/s10156-011-0353-8
  26. Van Damme I., Berkvens D., de Zutter L. Effect of sampling and short isolation methodologies on the recovery of human pathogenic Yersinia enterocolitica from pig tonsils // Foodborne Pathog Dis. 2012. Vol. 9, N 7. Р. 600−606. doi: 10.1089/fpd.2012.1128
  27. Niskanen T., Laukkanen R., Murros A., et al. Characterisation of non-pathogenic Yersinia pseudotuberculosis-like strains isolated from food and environmental samples // Int J Food Microbiol. 2009. Vol. 129, N 2. Р. 150−156. doi: 10.1016/j.ijfoodmicro.2008.11.015
  28. Sharma N.K., Doyle P.W., Gerbasi S.A., Jessop J.H. Identification of Yersinia species by the API 20E // J Clin Microbiol. 1990. Vol. 28, N 6. Р. 1443−1444. doi: 10.1128/jcm.28.6.1443-1444.1990
  29. Linde H.J., Neubauer H., Meyer H., et al. Identification of Yersinia species by the Vitek GNI card // J Clin Microbiol. 1999. Vol. 37, N 1. Р. 211−214. doi: 10.1128/JCM.37.1.211-214.1999
  30. Bogdanovich T., Carniel E., Fukushima H., Skurnik M. Use of O-antigen gene cluster-specific PCRs for the identification and O-genotyping of Yersinia pseudotuberculosis and Yersinia pestis // J Clin Microbiol. 2003. Vol. 41, N 11. Р. 5103−5112. doi: 10.1128/JCM.41.11.5103-5112.2003
  31. Laird W.J., Cavanaugh D.C. Correlation of autoagglutination and virulence of yersiniae // J Clin Microbiol. 1980. Vol. 11, N 4. Р. 430−432. doi: 10.1128/jcm.11.4.430-432.1980
  32. Bhaduri S., Turner-Jones C., Lachica R.V. Convenient agarose medium for simultaneous determination of the low-calcium response and Congo red binding by virulent strains of Yersinia enterocolitica // J Clin Microbiol. 1991. Vol. 29, N 10. Р. 2341−2344. doi: 10.1128/jcm.29.10.2341-2344.1991
  33. Zink D.L., Feeley J.C., Wells J.G., et al. Plasmid-mediated tissue invasiveness in Yersinia enterocolitica // Nature. 1980. Vol. 283, N 5743. Р. 224−226. doi: 10.1038/283224a0
  34. Kapperud G. Yersinia enterocolitica in food hygiene // Int J Food Microbiol. 1991. Vol. 12, N 1. Р. 53−65. doi: 10.1016/0168-1605(91)90047-s
  35. Kapperud G., Vardund T. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica in food, water, and feces by nested polymerase chain reactions and immunomagnetic separation // Contrib Microbiol Immunol. 1995. Vol. 13. Р. 130−133.
  36. Skurnik M., Wolf-Watz H. Analysis of the YopA gene encoding the Yop1 virulence determinants of Yersinia spp // Mol Microbiol. 1989. Vol. 3, N 4. Р. 517−529. doi: 10.1111/j.1365-2958.1989.tb00198.x
  37. Wang R.F., Cao W.W., Cerniglia C.E. A universal protocol for PCR detection of 13 species of foodborne pathogens in foods // J Appl Microbiol. 1997. Vol. 83, N 6. Р. 727−736. doi: 10.1046/j.1365-2672.1997.00300.x
  38. Lambertz S.T., Nilsson C., Hallanvuo S. TaqMan-based real-time PCR method for detection of Yersinia pseudotuberculosis in food // Appl Environ Microbiol. 2008. Vol. 74, N 20. Р. 6465−6469. doi: 10.1128/AEM.01459-08
  39. Wren B.W., Tabaqchali S. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica by the polymerase chain reaction // Lancet. 1990. Vol. 336, N 8716. Р. 693. doi: 10.1016/0140-6736(90)92191-j
  40. Vishnubhatla A., Fung D.Y., Oberst R.D., et al. Rapid 5’ nuclease (TaqMan) assay for detection of virulent strains of Yersinia enterocolitica // Appl Environ Microbiol. 2000. Vol. 66, N 9. Р. 4131−4135. doi: 10.1128/AEM.66.9.4131-4135.2000
  41. Wannet W.J., Reessink M., Brunings H.A., Maas H.M. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica by a rapid and sensitive duplex PCR assay // J Clin Microbiol. 2001. Vol. 39, N 12. Р. 4483−4486. doi: 10.1128/JCM.39.12.4483-4486.2001
  42. Sandery M., Stinear T., Kaucner C. Detection of pathogenic Yersinia enterocolitica in environmental waters by PCR // J Appl Bacteriol. 1996. Vol. 80, N 3. Р. 327−332. doi: 10.1111/j.1365-2672.1996.tb03227.x
  43. Fukushima H., Tsunomori Y., Seki R. Duplex real-time SYBR green PCR assays for detection of 17 species of food- or waterborne pathogens in stools // J Clin Microbiol. 2003. Vol. 41, N 11. Р. 5134−5146. doi: 10.1128/JCM.41.11.5134-5146.2003
  44. Thisted Lambertz S., Danielsson-Tham M.L. Identification and characterization of pathogenic Yersinia enterocolitica isolates by PCR and pulsed-field gel electrophoresis // Appl Environ Microbiol. 2005. Vol. 71, N 7. Р. 3674−3681. doi: 10.1128/AEM.71.7.3674-3681.2005
  45. Rossen L., Nørskov P., Holmstrøm K., Rasmussen O.F. Inhibition of PCR by components of food samples, microbial diagnostic assays and DNA-extraction solutions // Int J Food Microbiol. 1992. Vol. 17, N 1. Р. 37−45. doi: 10.1016/0168-1605(92)90017-w
  46. Stephan R., Cernela N., Ziegler D., et al. Rapid species identification and subtyping of Yersinia enterocolitica by MALDI-TOF mass spectrometry // J Microbiol Methods. 2011. Vol. 87, N 2. Р. 150−153. doi: 10.1016/j.mimet.2011.08.016

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. Схема выявления и идентификации энтеропатогенных иерсиний. Примечание. ПЦР — полимеразная цепная реакция, DIA — дот-иммуноанализ, Y.ptbc — Yersinia pseudotuderculosis, Y.ent — Yersinia enterocolitica, МФА — метод флюоресцирующих антител, inv — ген инвазивности, HPI — остров высокой патогенности иерсиний, YAPI — адгезивный остров патогенности иерсиний, pYV — плазмида вирулентности Y. pseudotuderculosis, ymp — ген токсина суперантигена А/С Y. pseudotuderculosis, ail — ген адгезии-инвазии Y. enterocolitica, yst A — ген энтеротоксина А, yst В — ген энтеротоксина B, VNTR — вариабельное число тандемных повторов, PFGA — электрофорез в пульсирующем поле.

Скачать (592KB)
Метаданные

© ООО "Эко-вектор", 2022


 


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах