Детекция и анализ интегративных конъюгативных элементов в штаммах Vibrio spp., выделенных на территории Волгоградской области


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В настоящей работе установлено присутствие интегративных конъюгативных элементов (ICEs) семейства SXT/R391 в штаммах Vibrio spp., выделенных из воды открытых водоемов на территории Волгоградской области в период 2003-2014 г. В составе ICEs штаммов V. cholerae non-O1/non-O139 серогрупп идентифицированы гены резистентности к триметоприму (dfr18), стрептомицину (strB), сульфометаксазолу (sulII). У ICEs штаммов Vibrio spp., не относящихся к виду V. cholerae, обнаружен другой вариант гена дигидрофолатредуктазы - dfrA1, локализованный вне кластера. Полученные результаты показывают, что штаммы водной вибриофлоры могут быть потенциальными резервуарами генов резистентности.

Об авторах

Ирина Борисовна Захарова

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

Email: zib279@gmail.com
канд. биол. наук, зав. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Юлия Александровна Кузютина

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Мария Васильевна Подшивалова

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Антон Александрович Замарин

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

науч. сотр. лаб. геномики и протеомики ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Андрей Владимирович Топорков

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

доктор мед. наук, директор ФКУЗ Волгоградский научноисследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Дмитрий Викторович Викторов

ФКУЗ «Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт» Роспотребнадзора

доктор биол. наук, доцент, зам. директора по научно-экспериментальной работе ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 400131, г. Волгоград, Россия

Список литературы

  1. Thompson F.L., Iida T., Swings J. Biodiversity of vibrios. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2004; 68: 403-31.
  2. MacDonald D., Demarre G., Bouvier M., Mazel D., Gopaul D.N. Structural basis for broad DNA-specificity in integron recombination. Nature. 2006; 440: 1157-62.
  3. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature Rev. Microbiol. 2006; 4: 608-20.
  4. Rodríguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjugative elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob. Agents Chemother. 2012; 56 (5): 2619-26.
  5. Gillings M., Boucher Y., Labbate M., Holmes A., Krishnan S., Holley M., Stokes H.W. The evolution of class 1 integrons and the rise of antibiotic resistance. J. Bacteriol. 2008; 190 (4): 5095-100.
  6. Waldor M., Tschäpe H., Mekalanos J. A new type of conjugative transposon encodes resistance to sulfamethoxazole, trimethoprim, and streptomycin in Vibrio cholerae O139. J. Bacteriol. 1996; 178 (14); 4157-65.
  7. Burrus V., Marrero J., Waldor M. The current ICE age: biology and evolution of SXT-related integrating conjugative elements. Plasmid. 2006; 55 (3): 173-83.
  8. Wozniak R.A., Fouts D.E., Spagnoletti M., Colombo M.M., Ceccarelli D., Garriss G. et al. Comparative ICE genomics: insights into the evolution of the SXT/R391 family of ICEs. PLoS Genet. 2009; 5 (12): e1000786. doi: 10.1371/journal.pgen.1000786.
  9. Захарова И.Б., Викторов Д.В. Интегративные конъюгативные элементы микроорганизмов (ICEs). Молекул. генетика. 2015; 33 (3): 9-16.
  10. Подшивалова М.В., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б. Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT-типа. Эпидемиол. и инфекц. бол. 2014; (3): 34-9.
  11. Тетерятникова Н.Н., Захарова И.Б., Подшивалова М.В., Романова А.В., Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Молекулярная детекция интегронов класса 1 у Burkholderia pseudomallei. Проблемы особо опасных инфекций. 2011; [2 (108)]: 46-9.
  12. Hochhut B., Lotfi Y., Mazel D., Faruque S. M., Woodgate R. Molecular analysis of antibiotic resistance gene clusters in Vibrio cholerae O139 and O1 SXT constins. Antimicrob. Agents Chemother. 2001; 45: 2991-3000.
  13. Ramachandran D., Bhanumathi R., Singh D.V. Multiplex PCR for detection of antibiotic resistance genes and the SXT element: application in the characterization of Vibrio cholerae. J. Med. Microbiol. 2007; 56: 346-51.
  14. Burrus V., Quezada-Calvillo R., Marrero J., Waldor M.K. SXTrelated integrating conjugative element in new world Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2006; 72: 3054-7.
  15. Kitiyodom S., Khemtong S., Wongtavatchai J., Chuanchuen R. Characterization of antibiotic resistance in Vibrio spp. isolated from farmed marine shrimps (Penaeus monodon). FEMS Microbiol. Ecol. 2010; 72: 219-27.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2016


 


Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).