Роль интегративно-конъюгативных элементов в реализации устойчивости Vibrio сholerae к тяжёлым металлам
- Авторы: Водопьянов С.О.1, Евтеев А.В.1, Водопьянов А.С.1, Писанов Р.В.1, Селянская Н.А.1, Кругликов В.Д.1
-
Учреждения:
- Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
- Выпуск: Том 30, № 2 (2025)
- Страницы: 98-105
- Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
- URL: https://journals.rcsi.science/1560-9529/article/view/334361
- DOI: https://doi.org/10.17816/EID677097
- EDN: https://elibrary.ru/RDDPWH
- ID: 334361
Цитировать
Аннотация
Обоснование. В процессе мониторинга объектов окружающей среды в субъектах Российской Федерации регистрируют постоянное выделение как нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, так и эпизодическое обнаружение единичных токсигенных штаммов Vibrio cholerae О1 El Tor. Существует предположение о том, что тяжёлые металлы во внешней среде могут выступать одним из факторов, способствующих эволюции холерного вибриона. Изучение толерантности нетоксигенных V. сholerae О1 из водных объектов подтвердило существование изолятов, устойчивых к широкому спектру тяжёлых металлов в разных комбинациях. Работ, посвящённых анализу генетической природы толерантности вибрионов к тяжёлым металлам, в настоящее время крайне мало, а сведения о наличии генов резистентности к тяжёлым металлам у токсигенных вибрионов отсутствуют.
Цель исследования. Идентифицировать возможные гены, обуславливающие резистентность к тяжёлым металлам у токсигенных холерных вибрионов.
Методы. В работе использовали два штамма V. cholerae серогруппы О1 — 83 и 5879 и штамм Escherichia coli QD5003 Rif r. Для анализа in silico отобрали 1880 полных геномов токсигенных холерных вибрионов, принадлежащих разным серогруппам и выделенных в разные периоды времени.
Результаты. Сравнительный биоинформационный анализ методом вычитания геномов выявил ген czcA (номер доступа в базе данных NCBI GenBank: MVB73536.1) у штамма V. сholerae 83. При анализе секвенированных геномов 1880 штаммов V. сholerae различных серогрупп и сроков выделения ген czcA обнаружили у 159 токсигенных штаммов из 1125 исследованных (14,1%), но ни в одном из 775 геномов нетоксигенных вибрионов. Методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с виртуальными праймерами in silico подтвердили наличие гена czcA у штамма V. сholerae 83 в составе интегративно-конъюгативного элемента типа ICEVchBan11. Среди 159 czcA+ геномов V. сholerae достоверно идентифицировали два типа интегративно-конъюгативных элементов: 113 ICEVchBan9 и 27 ICEVchBan11. Для исследования возможной биологической роли czcA провели конъюгативный перенос ICEVchBan11 в клетки V. сholerae 5879. При этом клетки czcA+ штамма 5879 достоверно повысили устойчивость к ионам кадмия.
Заключение. Полученные данные позволяют предположить, что наличие гена czcA у токсигенных холерных вибрионов может повышать устойчивость к токсическому действию тяжёлых металлов. В частности, это может давать бактерии преимущество при попадании в водоёмы с повышенным содержанием ионов кадмия.
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Сергей Олегович Водопьянов
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Автор, ответственный за переписку.
Email: serge100v@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4336-0439
SPIN-код: 4672-9310
д-р мед. наук
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Артём Владимирович Евтеев
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Email: evteev_av@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-0087-9153
SPIN-код: 6050-0361
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40
Алексей Сергеевич Водопьянов
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Email: vodopyanov_as@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-9056-3231
SPIN-код: 7319-3037
канд. мед. наук
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Руслан Вячеславович Писанов
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Email: pisanov_rv@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-7178-8021
SPIN-код: 4270-3091
канд. биол. наук
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Надежда Александровна Селянская
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Email: selyanskaya_na@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-0008-4705
SPIN-код: 7920-3340
канд. мед. наук
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Владимир Дмитриевич Кругликов
Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт
Email: kruglikov_vd@antiplague.ru
ORCID iD: 0000-0002-6540-2778
SPIN-код: 9767-2936
д-р мед. наук
Россия, 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, д. 117/40Список литературы
- Noskov AK, Kruglikov VD, Moskvitina EA, et al. Characteristics of the epidemiological situation of Cholera in the World and in the Russian Federation in 2020 and forecast for 2021. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2021;(1):43-51. doi: 10.21055/0370-1069-2021-1-43-51 EDN: FDEEHM
- Noskov AK, Kruglikov VD, Moskvitina EA. Cholera: trends in the development of the epidemic process in 2021 and forecast for 2022. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2022;(1):24-34. doi: 10.21055/0370-1069-2022-1-24-34 EDN: DEWWJY
- Chen R, Tu H, Chen T. Potential application of living microorganisms in the detoxification of heavy metals. Foods. 2022;11(13):1905. doi: 10.3390/foods11131905 EDN: SNLBSZ
- Sandhi A, Yu C, Rahman MM, et al. Arsenic in the water and agricultural crop production system: Bangladesh perspectives. Environ. Sci. Pollut. Res. 2022;29(34):51354–51366. doi: 10.1007/s11356-022-20880-0 EDN: JPPOMH
- Bueno E, Pinedo V, Shinde DD, et al. Transient glycolytic complexation of arsenate enhances resistance in the enteropathogen Vibrio cholerae. mBio. 2022;13(5). doi: 10.1128/mbio.01654-22 EDN: XMMIBJ
- Klenova IA, Shulga TG. Technology of cleaning of the river Temernik. Engineering Journal of Don. 2018;1(48):118. EDN: XSMPZJ
- Fang J, Cheng H, Yu T, et al. Occurrence of virulence factors and antibiotic and heavy metal resistance in Vibrio parahaemolyticus isolated from Pacific mackerel at markets in Zhejiang, China. J. Food Prot. 2020;83(8):1411-9. doi: 10.4315/jfp-20-091 EDN: ADHOFV
- Yu P, Yang L, Wang J, et al. Genomic and transcriptomic analysis reveal multiple strategies for cadmium tolerance in Vibrio parahaemolyticus N10-18 isolated from aquatic animal Ostrea gigas Thunberg. Foods. 2022;11(23). doi: 10.3390/food11233777 EDN: JCEVAY
- Kang CH, Shin Y, Yu H, et al. Antibiotic and heavy metal resistance of Vibrio parahaemolyticus isolated from oysters in Korea. Mar. Pollut. Bull. 2018;135:69-74. doi: 10.1016/j.marpolbul.2018.07.007
- Song Y, Yu P, Li B, et al. The mosaic accessory gene structures of the SXT/R391-like integrative and conjugative elements derived from Vibrio spp. isolated from aquatic products and the environment in the Yangtze River estuary, China. BMC Microbiol. 2013;13(1):1-13. doi: 10.1186/1471-2180-13-214 EDN: AXKKAQ
- Fu H, Yu P, Liang W, et al. Virulence, resistance, and genomic fingerprint traits of Vibrio cholerae isolated from 12 species of aquatic products in Shanghai, China. Microb. Drug Resist. 2020;26(12):1526–1539. doi: 10.1089/mdr.2020.0269 EDN: IKNVWS
- Xu M, Wu J, Chen L. Virulence, antimicrobial and heavy metal tolerance, and genetic diversity of Vibrio cholerae recovered from commonly consumed freshwater fish. Environ. Sci. Pollut. Res. 2019;26(26):27338-27352. doi: 10.1007/s11356-019-05287-8 EDN: TKRLQE
- Vodopyanov SO, Gerasimenko AA, Yezhova MI, et al. Combined occurrence of the cold shock gene csh1 and the arsenic resistance gene arsB in Vibrio cholerae O1, O139, NonO1/NonO139 serogroups. Bulletin of Biotechnology and Physico-Chemical Biology named after Yu.A. OVchinnikov. 2023;19(3):14-21. EDN: REQXAU
- Wick RR, Judd LM, Cerdeira LT et al. Trycycler: consensus long-read assemblies for bacterial genomes. Genome Biol. 2021;22(1):266. doi: 10.1186/s13059-021-02483-z EDN: UNZRDJ
- Wick RR, Judd LM, Holt KE. Assembling the perfect bacterial genome using Oxford Nanopore and Illumina sequencing. PLoS Comput. Biol. 2023;19(3):e1010905. doi: 10.1371/journal.pcbi.1010905 EDN: MCAGXD
- Oxford Nanopore Technologies. Sequence correction provided by Oxford Nanopore Technologies research [Internet]. GitHub repository. 2018. [cited 2023 Oct 23]. Available from: https://github.com/nanoporetech/medaka
- Walker BJ, Abeel T, Shea T, et al. Pilon: an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement. PLoS ONE. 2014;9(11):e112963. doi: 10.1371/journal.pone.0112963
- Vodopyanov AS, Vodopyanov SO, Pisanov RV. V. сholerae ICE Genotyper [Computer program]. Certificate of state registration of the computer program No. 2023663855, application No. 2023663090; 2023. Available from: https://shorturl.at/AMN63
- Selyanskaya NA, Titova SV, Menshikova EA, et al. The influence of cultivation conditions on the transfer of antibiotic resistance genes in Vibrio cholera. Antibiot Khimioter = Antibiotics and Chemotherapy. 2024;69(9-10):4-10. doi: 10.37489/0235-2990-2024-69-9-10-4-10 EDN: QYNJYC
- Pal C, Bengtsson-Palme J, Rensing C, et al. BacMet: antibacterial biocide and metal resistance genes database. Nucleic Acids Res. 2013;42(D1):D737–43. doi: 10.1093/nar/gkt1252
- Nies DH, Nies A, Chu L, Silver S. Expression and nucleotide sequence of a divalent cation efflux system from Alcaligenes eutrophus determined by a plasmid. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989;86(19):7351-7355. doi: 10.1073/pnas.86.19.7351
- McGinnis S, Madden TL. BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools. Nucleic Acids Res. 2004;32:W20–25. doi: 10.1093/nar/gkh435 EDN: IUCVKN
- Vodopyanov SO, Vodopyanov AS, Oleynikov IP, Titova SV. Prevalence of ICE elements of different types in Vibrio cholerae. Public Health and Life Environment – PH&LE. 2018;(1(298)):33-35. doi: 10.35627/2219-5238/2018-298-1-33-35 EDN: YTZSTV
- Nies DH. Cobalt, zinc, cadmium efflux system (CzcABC) from Alcaligenes eutrophus in Escherichia coli functions as a proton-cation antiporter. J. Bacteriol. 1995;177(10):2707-2712. doi: 10.1128/jb.177.10.2707-2712.1995
- Kaci A, Petit F, Lesueur P, et al. Distinct diversity of the czcA gene in two sedimentary horizons from a contaminated estuarine core. Environ. Sci. Pollut. Res. 2014;21:10787–10802. doi: 10.1007/s11356-014-3029-y EDN: TQTMGZ
- Dahanayake PS, Hossain S, Wickramanayake MVKS, Heo GJ. Antibiotic and heavy metal resistance genes in Aeromonas spp. isolated from marketed Manila Clam (Ruditapes philippinarum) in Korea. J. Appl. Microbiol. 2019;127(3):941–952. doi: 10.1111/jam.14355 EDN: SYKMKP
- Kumarage PM, Majeed S, De Silva LADS, Heo GJ. Detection of virulence, antimicrobial resistance, and heavy metal resistance properties in Vibrio anguillarum isolated from mullet (Mugil cephalus) cultured in Korea. Braz. J. Microbiol. 2023;54:415–425. doi: 10.1007/s42770-023-00911-9 EDN: GMRRHS
Дополнительные файлы
