Грибковые осложнения при новой коронавирусной инфекции COVID-19

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Обоснование. Наблюдаемый в последнее десятилетие рост грибковой патологии, в том числе инвазивных микозов, создающих угрозу жизни, связывают с распространением иммунодефицитных состояний различной этиологии. Пандемия новой коронавирусной инфекции COVID-19 внесла свой отрицательный вклад, вызвав значительное увеличение числа пациентов с грибковыми осложнениями.

Цель исследования — характеристика видов грибковых осложнений в остром периоде новой коронавирусной инфекции COVID-19 на основе анализа клинического течения и терапевтической тактики ведения основного заболевания.

Материалы и методы. Рассмотрены результаты бактериологического исследования 1284 культур из образцов мокроты пациентов с подозрением на вторичную пневмонию при COVID-19. В исследование включено 404 культуры различных видов грибов. Анализ клинической картины проведён у 70 пациентов с грибковыми осложнениями различной локализации, проходивших лечение в условиях краевого ковидного госпиталя. В этой группе учтены результаты микробиологического исследования мокроты, бронхоальвеолярного лаважа, соскобов из очагов поражения в ротоглотке, мочи, крови, биопсийного и аутопсийного материала. Исследование проведено в период с 1 апреля 2020 г. по 31 декабря 2021 г. Пациенты разделены на подгруппы в зависимости от выделенного возбудителя: Candida spp. — 64 пациента и плесневые грибы (Aspergillus spp. и Mucor spp.) — 6 пациентов; от исхода заболевания: благоприятный — 66, летальный — 4.

Результаты. В микробном пейзаже дыхательных путей у больных COVID-19 преобладала грамотрицательная микробная флора, 1/3 культур была представлена грибами. В течение двух лет пандемии доля грибковых культур увеличилась с 26,9% в 2020 г. до 34,2% в 2021 г. при сохранении чувствительности к амфотерицину B и флуконазолу в большинстве случаев. В 2021 г. отметилась негативная тенденция роста в мокроте плесневых грибов вида Aspergillus spp. (5 культур) и Mucor spp. (1 культура).

Типичными грибковыми осложнениями COVID-19 являлись кандидозный стоматит, обусловленный Candida albicans (71%), кандидоз других урогенитальных локализаций в виде кандидурии (20%), поражение лёгких смешанной вирусно-грибковой этиологии, в единичных случаях приводящее к летальному исходу вследствие инвазивного микоза. Только грибковая флора выделялась в 57,1% случаев, различные сочетания грибковой и бактериальной флоры — в 42,9%. Диагностика кандидозного стоматита происходила в среднем на 11,6±1,08 день заболевания COVID-19, что соответствовало 2–3-му дню госпитализации. Предшествовавшее амбулаторное лечение в большинстве случаев включало антибиотики и гормональную терапию глюкокортикоидами. Урогенитальная грибковая инфекция диагностировалась на 17,7±5,17 день болезни на 2-й неделе госпитального лечения (8,0±3,11 день). Грибковая флора в мокроте определялась в среднем на 18,5±4,33 день болезни на 2–3-й неделе госпитализации на фоне интенсивной иммуносупрессивной терапии.

Заключение. Факторами риска развития грибковых осложнений служат возраст пациентов старше 50 лет, избыточная масса тела и гипертоническая болезнь, бесконтрольное применение антибиотиков и глюкокортикоидов на догоспитальном этапе. Микозы регистрируются как при тяжёлом, так и при среднетяжёлом течении COVID-19. Дополнительным фактором их развития является иммуносупрессивная терапия основного заболевания. Наиболее грозными осложнениями течения COVID-19, ухудшающими прогноз выживания, являются присоединение грибов с инвазивным ростом — Aspergillus spp., Mucor, а также развитие грибково-бактериальных ассоциаций с поражением лёгочной ткани.

В условиях продолжающейся пандемии SARS-CoV-2, использования иммуномодулирующих средств, включая комбинированное применение глюкокортикоидов и таргетных иммуносупрессивных препаратов, важно выработать риск-ориентированный подход к диагностике и лечению пациентов с риском генерализованных и инвазивных микозов.

Об авторах

Марина Геннадьевна Авдеева

Кубанский государственный медицинский университет

Email: avdeevam@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-4979-8768
SPIN-код: 2066-2690
Scopus Author ID: 6603810508
ResearcherId: P-2254-2017

д.м.н., профессор

Россия, 350063, Краснодар, ул. Седина, д. 4

Сергей Викторович Зотов

Специализированная клиническая инфекционная больница

Email: bak2554065@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-7661-6982
SPIN-код: 6376-6170

к.м.н., доцент

Россия, 350063, Краснодар, ул. Седина, д. 204

Макка Ибрагимовна Кулбужева

Кубанский государственный медицинский университет; Специализированная клиническая инфекционная больница

Email: kulbuzhevamakka@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1817-6664
SPIN-код: 8090-3715

к.м.н., доцент

Россия, 350063, Краснодар, ул. Седина, д. 4; Краснодар

Дарья Юрьевна Мошкова

Кубанский государственный медицинский университет; Специализированная клиническая инфекционная больница

Email: mrs_darya@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-1401-6970
SPIN-код: 9489-0057

к.м.н., доцент

Россия, 350063, Краснодар, ул. Седина, д. 4; Краснодар

Елена Владимировна Журавлева

Специализированная клиническая инфекционная больница

Автор, ответственный за переписку.
Email: bak2554065@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-0357-6131
Россия, 350063, Краснодар, ул. Седина, д. 4

Список литературы

  1. Kuchi Bhotla H., Balasubramanian B., Meyyazhagan A., et al. Opportunistic mycoses in COVID-19 patients/survivors: Epidemic inside a pandemic // J Infect Public Health. 2021. Vol. 14, N 11. P. 1720–1726. doi: 10.1016/j.jiph.2021.10.010
  2. Акимкин В.Г., Тутельян А.В., Шулакова Н.И. Микологический айсберг: современные сдвиги в эпидемиологии микозов // Инфекционные болезни. 2022. Т. 20, № 1. С. 120–126. doi: 10.20953/1729-9225-2022-1-120-126
  3. Suleyman G., Alangaden G.J. Nosocomial Fungal Infections: Epidemiology, Infection Control, and Prevention // Infect Dis Clin North Am. 2021. Vol. 35, N 4. P. 1027–1053. doi: 10.1016/j.idc.2021.08.002
  4. Arastehfar A., Carvalho A., Nguyen M.H., et al. COVID-19-Associated Candidiasis (CAC): An Underestimated Complication in the Absence of Immunological Predispositions? // J Fungi (Basel). 2020. Vol. 6, N 4. P. 211. doi: 0.3390/jof6040211
  5. Posteraro B., Torelli R., Vella A., et al. Pan-Echinocandin-Resistant Candida glabrata Bloodstream Infection Complicating COVID-19: A Fatal Case Report // J Fungi (Basel). 2020. Vol. 6, N 3. P. 163. doi: 10.3390/jof6030163
  6. Chong W.H., Saha B.K., Ananthakrishnan R., Chopra A. State-of-the-art review of secondary pulmonary infections in patients with COVID-19 pneumonia // Infection. 2021. Vol. 49, N 4. P. 591–605. doi: 10.1007/s15010-021-01602-z
  7. Lansbury L., Lim B., Baskaran V., Lim W.S. Co-infections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis // J Infect. 2020. Vol. 81, N 2. P. 266–275. doi: 10.1016/j.jinf.2020.05.046
  8. Langford B.J., So M., Raybardhan S., et al. Bacterial co-infection and secondary infection in patients with COVID-19: a living rapid review and meta-analysis // Clin Microbiol Infect. 2020. Vol. 26, N 12. P. 1622–1629. doi: 10.1016/j.cmi.2020.07.016
  9. Chen X., Liao B., Cheng L., et al. The microbial coinfection in COVID-19 // Appl Microbiol Biotechnol. 2020. Vol. 104, N 18. P. 7777–7785. doi: 10.1007/s00253-020-10814-6
  10. Peng J., Wang Q., Mei H., et al. Fungal co-infection in COVID-19 patients: evidence from a systematic review and meta-analysis // Aging (Albany NY). 2021. Vol. 13, N 6. P. 7745–7757. doi: 10.18632/aging.202742
  11. Lai C.C., Yu W.L. COVID-19 associated with pulmonary aspergillosis: A literature review // J Microbiol Immunol Infect. 2020. Vol. 54, N 1. P. 46–53. doi: 10.1016/j.jmii.2020.09.004
  12. Al-Hatmi A.M.S., Mohsin J., Al-Huraizi A., Khamis F. COVID-19 associated invasive candidiasis // J Infect. 2021. Vol. 82, N 2. P. e45–e46. doi: 10.1016/j.jinf.2020.08.005
  13. Chowdhary A., Tarai B., Singh A., et al. Multidrug-Resistant Candida auris Infections in Critically Ill Coronavirus Disease Patients, India, April-July 2020 // Emerg Infect Dis. 2020. Vol. 26, N 11. P. 2694–2696. doi: 10.3201/eid2611.203504
  14. Mohamed A., Rogers T.R., Talento A.F. COVID-19 Associated Invasive Pulmonary Aspergillosis: Diagnostic and Therapeutic Challenges // J Fungi (Basel). 2020. Vol. 6, N 3. P. 115. doi: 10.3390/jof6030115
  15. Machado M., Valerio M., Álvarez-Uría A., et al.; COVID-19 Study Group. Invasive pulmonary aspergillosis in the COVID-19 era: An expected new entity // Mycoses. 2021. Vol. 64, N 2. P. 132–143. doi: 10.1111/myc.13213
  16. Song G., Liang G., Liu W. Fungal Co-infections Associated with Global COVID-19 Pandemic: A Clinical and Diagnostic Perspective from China // Mycopathologia. 2020. Vol. 185, N 4. P. 599–606. doi: 10.1007/s11046-020-00462-9
  17. Heaney A.K., Head J.R., Broen K., et al. Coccidioidomycosis and COVID-19 Co-Infection, United States, 2020 // Emerg Infect Dis. 2021. Vol. 27, N 5. P. 1266–1273. doi: 10.3201/eid2705.204661
  18. Muthu V., Rudramurthy S.M., Chakrabarti A., Agarwal R. Epidemiology and Pathophysiology of COVID-19-Associated Mucormycosis: India Versus the Rest of the World // Mycopathologia. 2021. Vol. 186, N 6. P. 739–754. doi: 10.1007/s11046-021-00584-8
  19. Tabassum T., Araf Y., Moin A.T., et al. COVID-19-associated-mucormycosis: possible role of free iron uptake and immunosuppression // Mol Biol Rep. 2022. Vol. 49, N 1. P. 747–754. doi: 10.1007/s11033-021-06862-4
  20. Chao C.M., Lai C.C., Yu W.L. COVID-19 associated mucormycosis — An emerging threat // J Microbiol Immunol Infect. 2022. Vol. 55, N 2. P. 183–190. doi: 10.1016/j.jmii.2021.12.007
  21. Mahalaxmi I., Jayaramayya K., Venkatesan D., et al. Mucormycosis: An opportunistic pathogen during COVID-19 // Environ Res. 2021. Vol. 201. P. 111643. doi: 10.1016/j.envres.2021.111643
  22. Singh K., Kumar S., Shastri S., et al. Black fungus immunosuppressive epidemic with Covid-19 associated mucormycosis (zygomycosis): a clinical and diagnostic perspective from India // Immunogenetics. 2022. Vol. 74, N 2. P. 197–206. doi: 10.1007/s00251-021-01226-5
  23. Didehdar M., Chegini Z., Moradabadi A., et al. Gastrointestinal mucormycosis: A periodic systematic review of case reports from 2015 to 2021 // Microb Pathog. 2022. Vol. 163. P. 105388. doi: 10.1016/j.micpath.2022.105388
  24. Bhattacharyya A., Sarma P., Kaur H., et al. COVID-19-associated rhino-orbital-cerebral mucormycosis: A systematic review, meta-analysis, and meta-regression analysis // Indian J Pharmacol. 2021. Vol. 53, N 6. P. 499–510. doi: 10.4103/ijp.ijp_839_21
  25. Sanghvi D., Kale H. Imaging of COVID-19-associated craniofacial mucormycosis: a black and white review of the “black fungus” // Clin Radiol. 2021. Vol. 76, N 11. P. 812–819. doi: 10.1016/j.crad.2021.07.004
  26. Al-Tawfiq J.A., Alhumaid S., Alshukairi A.N., et al. COVID-19 and mucormycosis superinfection. The perfect storm // Infection. 2021. Vol. 49, N 5. P. 833–853. doi: 10.1007/s15010-021-01670-1
  27. Manchanda S., Semalti K., Bhalla A.S., et al. Revisiting rhino-orbito-cerebral acute invasive fungal sinusitis in the era of COVID-19: pictorial review // Emerg Radiol. 2021. Vol. 28, N 6. P. 1063–1072. doi: 10.1007/s10140-021-01980-9
  28. Rudrabhatla P.K., Reghukumar A., Thomas S.V. Mucormycosis in COVID-19 patients: predisposing factors, prevention and management // Acta Neurol Belg. 2022. Vol. 122, N 2. P. 273–280. doi: 10.1007/s13760-021-01840-w
  29. Gumashta J., Gumashta R. COVID19 associated mucormycosis: Is GRP78 a possible link? // J Infect Public Health. 2021. Vol. 14, N 10. P. 1351–1357. doi: 10.1016/j.jiph.2021.09.004
  30. Авдеев С.Н., Адамян Л.В., Алексеева Е.И., и др. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (COVID-19): временные методические рекомендации. Версия 15 (22.02.2022). Москва: Минздрав РФ, 2022. 245 с.
  31. Диагностика и лечение микозов в отделениях реанимации и интенсивной терапии: российские рекомендации / отв. ред. Н.Н. Климко. 2-е изд. Москва: Фармтек, 2015. 96 с.
  32. Багирова Н.С. Инвазивные грибковые инфекции: пересмотр определений, новое в диагностике по данным EORTC / MSGERC // Злокачественные опухоли. 2020. Т. 10, № 3 (приложение 1). С. 39–48. doi: 10.18027/2224-5057-2019-10-3s1-39-48
  33. Pappas P.G., Kauffman C.A., Andes D.R., et al. Clinical Practice Guideline for the Management of Candidiasis: 2016 Update by the. Infectious Diseases Society of America // Clin Infect Dis. 2016. Vol. 62, N 4. P. e1–50. doi: 10.1093/cid/civ9335
  34. Koehler P., Bassetti M., Chakrabarti A., et al. Defining and managing COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: the 2020 ECMM/ISHAM consensus criteria for research and clinical guidance // Lancet Infect Dis. 2021. Vol. 21, N 6. P. e149–e162. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30847-1
  35. Солопова Г.Г., Масчан А.А., Новичкова Г.А. Рекомендации 2020 года по диагностике и терапии инвазивного аспергиллёза у детей с онкогематологическими заболеваниями // Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2020. Т. 19, № 1. С. 158–166. doi: 10.24287/1726-1708-2020-19-1-158-166
  36. Авдеева М.Г., Шубина Г.В., Ганжа А.А., Журавлёва Е.В. Внебольничная пневмония у пациентов инфекционного стационара: проблемы развития резистентности к антимикробным препаратам // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2018. Т. 23, № 3. С. 108–113. doi: 10.18821/1560-9529-2018-23-3-108-113
  37. Авдеева М.Г., Кулбужева М.И., Зотов С.В., и др. Микробный пейзаж у госпитальных больных с новой коронавирусной инфекцией COVID-19, сравнительная антибиотикорезистентность с «доковидным» периодом: проспективное исследование // Кубанский научный медицинский вестник. 2021. Т. 28, № 5. С. 14–28. doi: 10.25207/1608-6228-2021-28-5-14-28
  38. Garg D., Muthu V., Sehgal I.S., et al. Coronavirus Disease (Covid-19) Associated Mucormycosis (CAM): Case Report and Systematic Review of Literature // Mycopathologia. 2021. Vol. 186, N 2. P. 289–298. doi: 10.1007/s11046-021-00528-2
  39. Ashour M.M., Abdelaziz T.T., Ashour D.M., et al. Imaging spectrum of acute invasive fungal rhino-orbital-cerebral sinusitis in COVID-19 patients: A case series and a review of literature // J Neuroradiol. 2021. Vol. 48, N 5. P. 319–324. doi: 10.1016/j.neurad.2021.05.007
  40. Brackin A.P., Hemmings S.J., Fisher M.C., Rhodes J. Fungal Genomics in Respiratory Medicine: What, How and When? // Mycopathologia. 2021. Vol. 186, N 5. P. 589–608. doi: 10.1007/s11046-021-00573-x
  41. Cadena J., Thompson G.R. 3rd, Patterson T.F. Aspergillosis: Epidemiology, Diagnosis, and Treatment // Infect Dis Clin North Am. 2021. Vol. 35, N 2. P. 415–434. doi: 10.1016/j.idc.2021.03.008
  42. Van de Veerdonk F.L., Brüggemann R.J.M., Vos S., et al. COVID-19-associated Aspergillus tracheobronchitis: the interplay between viral tropism, host defence, and fungal invasion // Lancet Respir Med. 2021. Vol. 9, N 7. P. 795–802. doi: 10.1016/S2213-2600(21)00138-7
  43. Wiederhold N.P. Emerging Fungal Infections: New Species, New Names, and Antifungal Resistance // Clin Chem. 2021. Vol. 68, N 1. P. 83–90. doi: 10.1093/clinchem/hvab217

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рис. 1. Результаты типирования штаммов, выделенных при бактериологическом исследования мокроты у больных COVID-19 в 2020 и 2021 гг.

Скачать (233KB)
3. Рис. 2. Результаты типирования грибов, выделенных при исследовании мокроты у больных COVID-19 в 2020 и 2021 гг.

Скачать (278KB)
4. Рис. 3. Возрастной состав пациентов с грибковыми осложнениями при COVID-19.

Скачать (211KB)
5. Рис. 4. Основные клинические симптомы коронавирусной инфекции, обусловленной SARS-CoV-2 и осложнённой присоединением грибковой микрофлоры.

Скачать (369KB)
6. Рис. 5. Патогенетическая терапия группы пациентов с грибковой флорой.

Скачать (319KB)

© Авдеева М.Г., Зотов С.В., Кулбужева М.И., Мошкова Д.Ю., Журавлева Е.В., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».