The First Attempt at Studying the Species Diversity of Fish in Lake Khanka Using DNA Barcoding Techniques


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Lake Khanka is the largest lake in the northeastern part of Asia, being a valuable part of the resources of freshwater fisheries. Lake Khanka has a low value of endemism owing to the recent origin and connection to large river systems of the Amur and Ussuri. The list of fish species present in the lake has been constantly updated owing to invasions that occur both unintentionally and because of the introduction of hydrobionts to maximize the potential of natural productivity. In this regard, the Lake Khanka is a suitable testing ground for the development and implementation of complex methods for monitoring species diversity. The cases of invasion have become more frequent in the lake recently. Moreover, the introduction of some fish species for stabilization of relationships among communities and exhaustive utilization of the natural productivity is now being carried out, which makes challenging the development and implementation of powerful techniques for monitoring of the local fauna species diversity. For the first time, we present a complex approach to the solution of that problem. We collected 64 fish specimens from 16 species representing four families of ray-finned fishes and analyzed their taxonomy and species diversity using both classic methods and DNA barcoding techniques. Specimens have been genotyped based on the mitochondrial Co-1 gene marker. The mean values of K2P-corrected intraspecific genetic distances were 0.15 ± 0.01%; the distances between different species within the same genera were 4.08 ± 0.01%. Phylogenetic analysis revealed monophyletic origin of all species clusters with high support (98–100% of bootstrap values). Thus, reciprocal complement of morphological and genetic techniques for the purpose of species delimitation and high effectiveness of DNA barcoding in application for documentation of species diversity in Lake Khanka has been demonstrated. New molecular genetic data generally are in agreement with taxonomic relationships previously shown for these fish taxa, but an additional investigation is required to verify the composition of genus Acheilognathus in Lake Khanka.

Ключевые слова

Об авторах

S. Turanov

Zhirmunsky Institute of Marine Biology, National Scientific Center of Marine Biology, Far Eastern Branch,
Russian Academy of Sciences; Department of Water Biological Resources and Aquaculture, Far Eastern State Technical Fisheries University

Автор, ответственный за переписку.
Email: sturcoal@mail.ru
Россия, Vladivostok, 690041; Vladivostok, 690087

Y. Kartavtsev

Zhirmunsky Institute of Marine Biology, National Scientific Center of Marine Biology, Far Eastern Branch,
Russian Academy of Sciences; Department of Biodiversity and Marine Bioresources, Far Eastern Federal University

Email: sturcoal@mail.ru
Россия, Vladivostok, 690041; Vladivostok, 690059

M. Shapovalov

Pacific Research Fisheries Centre

Email: sturcoal@mail.ru
Россия, Vladivostok, 690091

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2019

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».