Comparative Genomics of the Escherichia coli Strains АВ1157, АВ2463, АВ2494, and АВ1885


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Whole genome sequencing of the Escherichia coli strain АВ1157 and its mutants AB1885 uvrB5, AB2463 recA13, and AB2494 lexA1, which have deficient DNA repair, recombination, and mutagenesis systems, was performed. It was found that the genomes of the AB2463 recA13 and AB2494 lexA1 strains differ from the genome of ancestral strain in several hundred mutations which arose most probably in the course of a single treatment of AB1157 with N-methyl-N-nitro-N-nitrosoguanidine. At the same time, the genome of the strain AB1885 obtained after treatment with nitrous acid contained ten times fewer differences from its parent strain. Mutations in the AB2463 recA13 and AB2494 lexA1 genomes were predominantly represented by GC to AT transitions distributed randomly along the genomes, and their locations did not coincide in these strains. The effect of spontaneous mutations on the differences between the strains studied that appeared during the period from their isolation to the sequence experiments seems to be insignificant. Earlier known genetic and phenotypic traits are annotated on the molecular level.

Об авторах

G. Smirnov

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: smirngb@yandex.ru
Россия, Moscow, 119435

I. Bodoev

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: ivan-bodoev@yandex.ru
Россия, Moscow, 119435

A. Makarova

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: alenka130795@rambler.ru
Россия, Moscow, 119435

T. Butusova

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: tabutusova@gmail.com
Россия, Moscow, 119435

V. Veselovsky

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: djdf26@gmail.com
Россия, Moscow, 119435

A. Gulyaev

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: andrewgull87@gmail.com
Россия, Moscow, 119435

E. Shitikov

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: eshitikov@mail.ru
Россия, Moscow, 119435

E. Ilina

Laboratory of Molecular Genetics of Microorganisms, Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine
of the Federal Medical Biological Agency

Автор, ответственный за переписку.
Email: ilinaen@gmail.com
Россия, Moscow, 119435

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Allerton Press, Inc., 2019

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».