Genotype Diversity in the Local Arkhangelsk (Russia) Neisseria gonorrhoeae Population: Emergence Mechanisms and Relation with Antimicrobial Resistance


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

132 clinical isolates of N. gonorrhoeae collected in Arkhangelsk region during 2014–2016 were analyzed in accordance with the NG-MAST protocol (Neisseria gonorrhoeae Multi Antigen Sequence Typing). A diversity of the analyzed strains was represented by 53 NG-MAST sequence-types; 30 of them were new registered due to earlier unknown either porB and tbpB sequences or their combinations. Three pathways of the diversity formation are supposed: long-term circulation of some NG-MAST-types with sequential transmission via the “sexual chains” (40.1% of the total population); introduction of new molecular types (27.3%); appearance of point mutations in porB and tbpB genes with the emergence of previously unknown genotypic variants of N. gonorrhoeae (32.6%). Emerged NG-MAST types inherited the mutational profile in penA, ponA, rpsJ, gyrA, and parC genes followed by conservation of antimicrobial resistance in the local N. gonorrhoeae population, whereas these determinants do not play a significant role in contemporary gonococci molecular evolution.

Об авторах

A. Kubanov

State Research Center of Dermatovenerology and Cosmetology

Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Moscow, 107076

K. Baryshkov

Arkhangelsk Clinical Dermatovenerologic Dispensary

Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Arkhangelsk, 163045

A. Chestkov

State Research Center of Dermatovenerology and Cosmetology

Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Moscow, 107076

B. Shaskolskiy

Engelhardt Institute of Molecular Biology

Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Moscow, 119991

D. Gryadunov

Engelhardt Institute of Molecular Biology

Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Moscow, 119991

D. Deryabin

State Research Center of Dermatovenerology and Cosmetology

Автор, ответственный за переписку.
Email: dgderyabin@yandex.ru
Россия, Moscow, 107076

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Allerton Press, Inc., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».