DFT Modeling of the Hydrogen Bonding System in Sampleite

T. L. Panikorovskii; Паникоровский Т. Л.; V. N. Yakovenchuk; Яковенчук В. Н.; Ya. A. Pakhomovsky; Пахомовский Я. А.; N. G. Konoplyova; Коноплёва Н. Г.; G. Yu. Ivanyuk; Иванюк Г. Ю.; A. A. Antonov; Антонов А. А.; V. V. Shilovskikh; Шиловских В. В.; S. V. Krivovichev; Кривовичев С. В.

doi:10.31857/S0869605523050052

DFT-моделирование системы водородных связей в самплеите

Авторы: Паникоровский Т.Л.¹^,2, Яковенчук В.Н.¹, Пахомовский Я.А.¹, Коноплёва Н.Г.¹, Иванюк Г.Ю.¹, Антонов А.А.¹, Шиловских В.В.³, Кривовичев С.В.¹^,2
Учреждения:
1. Кольский научный центр РАН
2. Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра кристаллографии
3. Санкт-Петербургский государственный университет, Ресурсный центр “Геомодель”
Выпуск: Том CLII, № 5 (2023)
Страницы: 83-99
Раздел: МИНЕРАЛОГИЧЕСКАЯ КРИСТАЛЛОГРАФИЯ
URL: https://journals.rcsi.science/0869-6055/article/view/148110
DOI: https://doi.org/10.31857/S0869605523050052
EDN: https://elibrary.ru/RXNCFN
ID: 148110

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация
Об авторах
Список литературы
Дополнительные файлы
Статистика

Аннотация

В статье приводится кристаллохимическое описание второй находки P2₁/n модификации самплеита NaCaCu₅(PO₄)₄Cl·5H₂O, сделанной на Кестёрском оловорудном месторождении. Образование минерала генетически связано с низкотемпературными процессами окисления первичных сульфидов меди, цинка и олова, а также с формированием более поздних Cu-, Zn-фосфатов, таких как батагаит, епифановит и сергейсмирновит. С помощью DFT-метода произведeн расчeт положений атомов водорода в структуре самплеита. В качестве оценки достоверности теоретических расчeтов проведено сравнение реального и теоретического ИК-спектров. Самплеит образовался на стадии гидротермального изменения сульфидных минералов Sn, Cu и Zn и сосуществовал с епифановитом NaCaCu₅(PO₄)₄[AsO₂(OH)₂]·7H₂O, который, несомненно, является более поздним, но имеет меньшую сложность (I_G,total), 474.24, чем самплеит 933.32 (бит/яч).

Ключевые слова

самплеит, кристаллическая структура, фосфат-арсенат меди, Кестёрское месторождение, водородная связь, DFT-моделирование

Список литературы

Антонов А.А. Получение синтетических аналогов минеральных видов – фосфатов – арсенатов меди: самплеита, лавендулана, епифановита. Термодинамический подход // Фундаментальные проблемы современного материаловедения. 2019. Т. 16(1). С. 78–83.
Кокунин М.В. Редкие минералы забытого месторождения // Отечественная геология. 2011. № 1. С. 72‒82.
Зубкова Н.В., Пущаровский Д.Ю., Сарп Х., Тит С.Дж., МакЛин Э.Дж. Кристаллическая структура зденекита, NaPbCu5(AsO4)4Cl·5H2O // Кристаллография. 2003. Т. 48. № 6. С. 1006–1011.
Зубкова Н.В. Сравнительная кристаллохимия новых и редких цирконосиликатов, силикатов щелочных и щелочноземельных элементов и минералов с изолированными тетраэдрическими и треугольными оксокомплексами. Автореферат … уч. ст. д.г.-м.н. Москва, 2012.
Павловский А.Б., Печенкин А.Г., Луговская И.Г. Геолого-промышленные типы месторождений полезных ископаемых. В сб.: Олово. М.: ВИМС, 2015. 52 с.
Паникоровский Т.Л., Кривовичев С.В., Яковенчук В.Н., Иванюк Г.Ю. Кристаллическая структура епифановита // ЗРМО. 2017. Т. 146. № 3. С. 39–50.
Яковенчук В.Н., Пахомовский Я.А., Коноплёва Н.Г., Паникоровский Т.Л., Михайлова Ю.А., Бочаров В.Н., Кривовичев С.В., Иванюк Г.Ю. Епифановит NaCaCu5(PO4)4[AsO2(OH)2]·7H2O – новый минерал из месторождения Кестёр (Саха-Якутия, Россия) // ЗРМО. 2017. Т. 146. № 3. С. 30–39.
Яковенчук В.Н., Пахомовский Я.А., Коноплёва Н.Г., Паникоровский Т.Л., Базай А.В., Михайлова Ю.А., Бочаров В.Н., Кривовичев С.В. Сергейсмирновит MgZn2(PO4)2·4H2O – новый минерал из месторождения Кестёр (Саха-Якутия, Россия) // Доклады РАН. Науки о земле. 2022. Т. 505(2). С. 165–169.